Chemically modulating the photophysics of the GFP chromophore

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 6, 2011, Pages 1571-1577

  Conyard, Jamie ^a   Kondo, Minako ^a   Heisler, Ismael A ^a   Jones, Garth ^a   Baldridge, Anthony ^b   Tolbert, Laren M ^b   Solntsev, Kyril M ^b   Meech, Stephen R ^a  

^a UNIVERSITY OF EAST ANGLIA   (United Kingdom)

^b GEORGIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALKYLATION; AMINO ACIDS; ELECTRONIC STRUCTURE; FLUORESCENCE; PROTEINS;

ALKYL SUBSTITUENT; BLUE SHIFT; DECAY KINETICS; ELECTRON-DONATING; ELECTRONIC SPECTRUM; FLUORESCENCE DECAYS; FLUORESCENT PROTEIN; HIGH SENSITIVITY; PH DEPENDENCE; PHOTOCHEMICAL PROPERTIES; PHOTOPHYSICAL; PHOTOPHYSICS; PLANAR STRUCTURE; RADIATIONLESS DECAY; RATIONAL DESIGN; RED SHIFT; SOLVENT VISCOSITY; STRONG ENHANCEMENT; ULTRA-FAST;

CHROMOPHORES;

EID: 79951518650     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp111593x     Document Type: Article

References (65)

1. Tsien, R. Y. Annu. Rev. Biochem. 1998, 67, 509
2. Miyawaki, A.; Sawano, A.; Kogure, T. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2003, S1
3. Frommer, W. B.; Davidson, M. W.; Campbell, R. E. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 2833
4. Day, R. N.; Davidson, M. W. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 2887
5. Remington, S. J. Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16, 714
6. Kent, K. P.; Childs, W.; Boxer, S. G. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 9664
7. Kent, K. P.; Oltrogge, L. M.; Boxer, S. G. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 15988
8. Miyawaki, A. Cell Struct. Funct. 2002, 27, 343
9. Miyawaki, A. Dev. Cell 2003, 4, 295
10. Chudakov, D. M.; Lukyanov, S.; Lukyanov, K. A. Trends Biotechnol. 2005, 23, 605
11. Kojima, S.; Ohkawa, H.; Hirano, T.; Maki, S.; Niwa, H.; Ohashi, M.; Inouye, S.; Tsuji, F. I. Tetrahedron Lett. 1998, 39, 5239
12. Niwa, H.; Inouye, S.; Hirano, T.; Matsuno, T.; Kojima, S.; Kubota, M.; Ohashi, M.; Tsuji, F. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 13617
13. Meech, S. R. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 2922
14. Tonge, P. J.; Meech, S. R. J. Photochem. Photobiol., A 2009, 205, 1
15. Voliani, V.; Bizzarri, R.; Nifosi, R.; Abbruzzetti, S.; Grandi, E.; Viappiani, C.; Beltram, F. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 10714
16. Bell, A. F.; He, X.; Wachter, R. M.; Tonge, P. J. Biochemistry 2000, 39, 4423
17. He, X.; Bell, A. F.; Tonge, P. J. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 6056
18. Litvinenko, K. L.; Webber, N. M.; Meech, S. R. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 2616
19. Mandal, D.; Tahara, T.; Meech, S. R. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 1102
20. Altoe, P.; Bernardi, F.; Garavelli, M.; Orlandi, G.; Negri, F. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 3952
21. Olsen, S.; Smith, S. C. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 2054
22. Voityuk, A. A.; MichelBeyerle, M. E.; Rosch, N. Chem. Phys. Lett. 1997, 272, 162
23. Weber, W.; Helms, V.; McCammon, J. A.; Langhoff, P. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 6177
24. Martin, M. E.; Negri, F.; Olivucci, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 5452
25. Olsen, S. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 1089
26. Olsen, S.; Lamothe, K.; Martinez, T. J. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1192
27. Toniolo, A.; Olsen, S.; Manohar, L.; Martinez, T. J. Faraday Discuss. 2004, 127, 149
28. Filippi, C.; Ziccheddu, M.; Buda, F. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 2074
29. Li, X.; Chung, L. W.; Mizuno, H.; Miyawaki, A.; Morokuma, K. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 1114
30. Matsuura, A.; Hayashi, T.; Sato, H.; Takahashi, A.; Sakurai, M. Chem. Phys. Lett. 2010, 484, 324
31. Liu, R. S. H.; Hammond, G. S. Chem. - Eur. J. 2001, 7, 4536
32. Maddalo, S. L.; Zimmer, M. Photochem. Photobiol. 2006, 82, 367
33. Baffour-Awuah, N. Y. A.; Zimmer, M. Chem. Phys. 2004, 303, 7
34. Toniolo, A.; Granucci, G.; Martinez, T. J. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 3822
35. Olsen, S.; Smith, S. C. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 8677
36. Dong, J.; Solntsev, K. M.; Poizat, O.; Tolbert, L. M. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 10084
37. Dong, J.; Solntsev, K. M.; Tolbert, L. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 12038
38. Solntsev, K. M.; Poizat, O.; Dong, J.; Rehault, J.; Lou, Y. B.; Burda, C.; Tolbert, L. M. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 2700
39. Petkova, I.; Dobrikov, G.; Banerji, N.; Duvanel, G.; Perez, R.; Dimitrov, V.; Nikolov, P.; Vauthey, E. J. Phys. Chem. A 2010, 114, 10
40. Habuchi, S.; Ando, R.; Dedecker, P.; Verheijen, W.; Mizuno, H.; Miyawaki, A.; Hofkens, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 9511
41. Piatkevich, K. D.; Verkhusha, V. V. Curr. Opin. Chem. Biol. 2010, 14, 23
42. Mizuno, H.; Mal, T. K.; Tong, K. I.; Ando, R.; Furuta, T.; Ikura, M.; Miyawakil, A. Mol. Cell 2003, 12, 1051
43. Shimozono, S.; Tsutsui, H.; Miyawaki, A. Biophys. J. 2009, 97, 1288
44. Bates, M.; Huang, B.; Dempsey, G. T.; Zhuang, X. W. Science 2007, 317, 1749
45. Patterson, G.; Davidson, M.; Manley, S.; Lippincott-Schwartz, J. Ann. Rev. Phys. Chem. 2010, 61, 345
46. Shroff, H.; Galbraith, C. G.; Galbraith, J. A.; Betzig, E. Nat. Methods 2008, 5, 417
47. Baldridge, A.; Kowalik, J.; Tolbert, L. M. Synthesis-Stuttgart 2010, 2424
48. Heisler, I. A.; Kondo, M.; Meech, S. R. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 1623
49. Stoner-Ma, D.; Melief, E. H.; Nappa, J.; Ronayne, K. L.; Tonge, P. J.; Meech, S. R. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 22009
50. Chattoraj, M.; King, B. A.; Bublitz, G. U.; Boxer, S. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 8362
51. Kogure, T.; Kawano, H.; Abe, Y.; Miyawaki, A. Methods 2008, 45, 223
52. Mandal, D.; Tahara, T.; Webber, N. M.; Meech, S. R. Chem. Phys. Lett. 2002, 358, 495
53. Horng, M. L.; Gardecki, J. A.; Papazyan, A.; Maroncelli, M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 17311
54. Gepshtein, R.; Huppert, D.; Agmon, N. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 4434
55. Benamotz, D.; Harris, C. B. J. Chem. Phys. 1987, 86, 5433
56. Prescott, M.; Ling, M.; Beddoe, T.; Oakley, A. J.; Dove, S.; Hoegh-Guldberg, O.; Devenish, R. J.; Rossjohn, J. Structure 2003, 11, 275
57. Wilmann, P. G.; Petersen, J.; Pettikiriarachchi, A.; Buckle, A. M.; Smith, S. C.; Olsen, S.; Perugini, M. A.; Devenish, R. J.; Prescott, M.; Rossjohn, J. J. Mol. Biol. 2005, 349, 223
58. Schuttrigkeit, T. A.; von Feilitzsch, T.; Kompa, C. K.; Lukyanov, K. A.; Savitsky, A. P.; Voityuk, A. A.; Michel-Beyerle, M. E. Chem. Phys. 2006, 323, 149
59. van der Meer, M. J.; Zhang, H.; Glasbeek, M. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2878
60. Espagne, A.; Paik, D. H.; Changenet-Barret, P.; Martin, M. M.; Zewail, A. H. ChemPhysChem 2006, 7, 1717
61. Stavrov, S. S.; Solntsev, K. M.; Tolbert, L. M.; Huppert, D. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1540
62. Glasbeek, M.; Zhang, H.; van der Meer, M. J. J. Mol. Liq. 2000, 86, 123
63. Kondo, M.; Heisler, I. A.; Meech, S. R. Faraday Discuss. 2010, 145, 185
64. Changenet, P.; Zhang, H.; van der Meer, M. J.; Glasbeek, M.; Plaza, P.; Martin, M. M. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 6716
65. Yang, J. S.; Huang, G. J.; Liu, Y. H.; Peng, S. M. Chem. Commun. 2008, 1344