Conical intersections in solution: A QM/MM study using floating occupation semiempirical configuration interaction wave functions

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 107, Issue 19, 2003, Pages 3822-3830

  Toniolo, A ^a   Granucci, G ^b   Martínez, Todd J ^a  

^a UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

^b UNIVERSITY OF PISA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHROMOPHORES; COMPOSITION EFFECTS; ELECTRONIC STRUCTURE; HYDRATION; MOLECULAR DYNAMICS; QUANTUM THEORY; SOLVENTS; SURFACE TOPOGRAPHY;

CONICAL INTERSECTIONS; FLOATING; MOLECULAR MECHANICAL METHOD; QUANTUM MECHANICAL METHOD;

PHOTOCHEMICAL REACTIONS;

EID: 0038390595     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp022468p     Document Type: Article

References (77)

1. Klessinger, M.; Michl, J. Excited States and Photochemistry of Organic Molecules; VCH Publishers: New York, 1995.
2. Yarkony, D. R. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 6277.
3. Robb, M. A.; Bernardi, F.; Olivucci, M. Pure Appl. Chem. 1995, 67, 783.
4. Celani, P.; Ottani, S.; Olivucci, M.; Bernardi, F.; Robb, M. A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 10141.
5. Manaa, M. R.; Yarkony, D. R. J. Am. Chem. Soc. 1994; 116, 11444.
6. Vreven, T.; Bernardi, F.; Garavelli, M.; Olivucci, M.; Robb, M. A.; Schlegel, H. B. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 12687.
7. Smith, B. R.; Bearpark, M. J.; Robb, M. A.; Bernardi, F.; Olivucci, M. Chem. Phys. Lett. 1995, 242, 27.
8. Ben-Nun, M.; Martínez, T. J. Chem. Phys. Lett. 1998, 298, 57.
9. Ben-Nun, M.; Quenneville, J.; Martinez, T. J. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 5161.
10. Quenneville, J.; Ben-Nun, M.; Martínez, T. J. J. Photochem. Photobiol. 2001, 144A, 229.
11. Martínez, T. J. Chem. Phys. Lett. 1997, 272, 139.
12. Marx, D.; Doltsinis, N. L. Phys. Rev. Lett. 2002, 88, 166402.
13. Warshel, A.; Levitt, M. J. Mol. Biol. 1976, 103, 227.
14. Gao, J. L. Acc. Chem. Res. 1996, 29, 298.
15. Field, M. J.; Bash, P. A.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1990, 11, 700.
16. Kairys, V.; Jensen, J. H. J. Phys. Chem. 2000, 104, 6656.
17. Philipp, D. M.; Friesner, R. A. J. Comput. Chem. 1999, 20, 1468.
18. Bryce, R. A.; Buesnel, R.; Hillier, I. H.; Burton, N. A. Chem. Phys. Lett. 1997, 279, 367.
19. Stanton, R. V.; Little, L. R.; Merz, K. M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 17344.
20. Singh, U. C.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1986, 7, 718.
21. Rothlisberger, U.; Carloni, P.; Doclo, K.; Parrinello, M. J. Biol. Inorg. Chem. 2000, 5, 236.
22. Hayashi, S.; Ohmine, I. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 10678.
23. Cui, Q.; Elstner, M.; Kaxiras, E.; Frauenheim, T.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 569.
24. Kerdcharoen, T.; Morokuma, K. Chem. Phys. Lett. 2002, 355, 257.
25. Vreven, T.; Menucci, B.; da Silva, C. O.; Morokuma, K.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 2001, 115, 62.
26. Thompson, M. A.; Schenter, G. K. J. Phys. Chem. 1995, 99, 6374.
27. Thompson, M. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 14492.
28. Lobaugh, J.; Rossky, P. J. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 899.
29. Gao, J. L.; Byun, K. Theor. Chem. Acc. 1997, 96, 151.
30. Luzhkov, V.; Warshel, A. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4491.
31. Dupuis, M.; Aida, M.; Kawashima, Y.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 2002, 117, 1242.
32. Dupuis, M.; Kawashima, Y.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 2002, 117, 1256.
33. Kongsted, J.; Osted, A.; Mikkelsen, K. V.; Christiansen, O. Mol. Phys. 2002, 100, 1813.
34. Kawashima, Y.; Dupuis, M.; Hirao, K. J. Chem. Phys. 2002, 117, 248.
35. Poulsen, T. D.; Kongsted, J.; Osted, A.; Ogilby, P. R.; Mikkelsen, K. V. J. Chem. Phys. 2001, 115, 2393.
36. Hayashi, S.; Tajkorshid, E.; Pebay-Peyroula, E.; Royant, A.; Landau, E. M.; Navarro, J.; Schulten, K. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 10124.
37. Rajamani, R.; Gao, J. J. Comput. Chem. 2002, 23.
38. Vreven, T.; Morokuma, K. J. Chem. Phys. 2000, 113, 2969.
39. Grabo, T.; Petersilka, M.; Gross, E. K. U. J. Mol. Struct (THEOCHEM) 2000, 501, 353.
40. Docken, K. K.; Hinze, J. J. Chem. Phys. 1972, 57, 4928.
41. Roos, B. O. The Complete Active Space Self-Consistent Field Method and its Applications in Electronic Structure Calculations. In Advances in Chemical Physics: Ab Initio Methods in Quantum Chemistry II; Lawley, K. P., Ed.; John Wiley and Sons Ltd.: New York, 1987; p 399.
42. Garavelli, M.; Frabboni, B.; Fato, M.; Celani, P.; Bernardi, F.; Robb, M. A.; Oluvicci, M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 1537.
43. Ben-Nun, M.; Martínez, T. J. J. Chem. Phys. 1998, 108, 7244.
44. Granucci, G.; Persico, M.; Toniolo, A. J. Chem. Phys. 2001, 114, 10608.
45. Tully, J. C. J. Chem. Phys. 1990, 93, 1061.
46. Granucci, G.; Toniolo, A. Chem. Phys. Lett. 2000, 325, 79.
47. Hunt, W. J.; Goddard, W. A., III. Chem. Phys. Lett. 1969, 3, 414.
48. Bone, R. G. A.; Pulay, P. Int. J. Quantum Chem. 1993, 45, 133.
49. Toniolo, A.; Ben-Nun, M.; Martinez, T. J. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 4679.
50. Persico, M.; Granucci, G.; Inglese, S.; Laino, T.; Toniolo, A. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2003, 621, 119.
51. Dewar, M. J. S.; Liotard, D. A. J. Mol. Struct (THEOCHEM) 1990, 65, 123.
52. Segal, G. A. Semiempirical methods of electronic structure calculation; Plenum Press: New York, 1977.
53. Hinchliffe, A. Modelling molecular structures; J. Wiley: Chichester, 1994.
54. Stewart, J. J. P. MOPAC2000; Fujitsu Limited: Tokyo, Japan, 1999.
55. Bearpark, M. J.; Robb, M. A.; Schlegel, H. B. Chem. Phys. Lett. 1994, 223, 269.
56. Dewar, M. J. S.; Zoebisch, E. G.; Healy, E. F.; Stewart, J. J. P. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3902.
57. Weiner, S. J.; Kollmann, P. A.; Case, D. A.; Singh, U. C.; Ghio, C.; Alagona, G.; Profeta, S.; Weiner, P. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 765.
58. Dang, L. X.; Pettitt, B. M. J. Phys. Chem. 1987, 91, 3349.
59. Antes, I.; Thiel, W. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 9290.
60. Zimmer, M. Chem. Rev. 2002, 102, 759.
61. Weber, W.; Helms, V.; McCammon, J. A.; Langhoff, P. W. Proc. Natl. Acad. Sci. 1999, 96, 6177.
62. Olsen, S.; Manohar, L.; Martinez, T. J. Work in progress.
63. Litvinenko, K. L.; Webber, N. M.; Meech, S. R. Chem. Phys. Lett. 2001, 346, 47.
64. Pellequer, J.-L.; Wager-Smith, K. A.; Kay, S. A.; Getzoff, E. D. Proc. Natl. Acad. Sci. 1998, 95, 5884.
65. Ryan, W. L.; Gordon, D. J.; Levy, D. H. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6194.
66. Hoff, W. D.; Devreese, B.; Fokkens, R.; Nugteren-Roodzant, I.; Van Beeumen, J. J.; Nibbering, N.; Hellingwerf, K. J. Biochemistry 1996, 35, 1274.
67. Baca, M.; Borgstahl, G. E. O.; Boissinot, M.; Burke, P. M.; Williams, D. R.; Slater, K. A.; Getzoff, E. D. Biochemistry 1994, 33, 14369.
68. Ben-Nun, M.; Martínez, T. J. Chem. Phys. 2000, 259, 237.
69. Ben-Nun, M.; Molnar, F.; Schulten, K.; Martinez, T. J. Proc. Natl. Acad. Sci. 2002, 99, 1769.
70. Atchity, G. J.; Xantheas, S. S.; Ruedenberg, K. J. Chem. Phys. 1991, 95, 1862.
71. Yarkony, D. R. J. Chem. Phys. 2001, 114, 2601.
72. Matsika, S.; Yarkony, D. R. J. Chem. Phys. 2001, 115, 5066.
73. Thompson, M. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 11341.
74. Hillier, I. H. J. Mol. Struct (THEOCHEM) 1999, 463, 45.
75. Stern, H. A.; Kaminski, G. A.; Banks, J. L.; Zhou, R.; Berne, B. J.; Friesner, R. A. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 4730.
76. Molnar, F.; Ben-Nun, M.; Martínez, T. J.; Schulten, K. J. Mol. Struct (THEOCHEM) 2000, 506, 169.
77. Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graph. 1996, 14, 33.