Phosphoproteome profile of human lung cancer cell line A549

Molecular BioSystems

Volumn 7, Issue 2, 2011, Pages 472-479

  Yu, Guangchuang ^a   Xiao, Chuan Le ^a   Lu, Chun Hua ^a   Jia, Hai Tao ^a   Ge, Feng ^a   Wang, Wei ^b   Yin, Xing Feng ^a   Jia, Hong Ling ^a   He, Jian Xing ^b   He, Qing Yu ^a  

^a JINAN UNIVERSITY   (China)

^b GUANGZHOU MEDICAL UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PHOSPHOPROTEIN; PROTEOME; TUMOR PROTEIN;

ARTICLE; HUMAN; IMMUNOHISTOCHEMISTRY; LIQUID CHROMATOGRAPHY; LUNG TUMOR; METABOLISM; PATHOLOGY; PEPTIDE MAPPING; PHOSPHORYLATION; TANDEM MASS SPECTROMETRY; TUMOR CELL LINE; VALIDATION STUDY; WESTERN BLOTTING;

BLOTTING, WESTERN; CELL LINE, TUMOR; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; HUMANS; IMMUNOHISTOCHEMISTRY; LUNG NEOPLASMS; NEOPLASM PROTEINS; PEPTIDE MAPPING; PHOSPHOPROTEINS; PHOSPHORYLATION; PROTEOME; TANDEM MASS SPECTROMETRY;

EID: 78751665668     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0mb00055h     Document Type: Article

References (61)

1. X. Tan F. Zhou J. Wan J. Hang Z. Chen B. Li C. Zhang K. Shao P. Jiang S. Shi X. Feng N. Lv Z. Wang Y. Ling X. Zhao D. Ding J. Sun M. Xiong J. He Cancer Biol. Ther. 2010 9 111 119
2. J. Su K. Lin C. Chien C. Tseng Y. Chen L. Chang S. Lin Life Sci. 2010 86 207 213
3. S. Rodriguez-Nieto M. Sanchez-Cespedes Carcinogenesis 2009 30 547 554
4. A. Yoshizawa J. Fukuoka S. Shimizu K. Shilo T. J. Franks S. M. Hewitt T. Fujii C. Cordon-Cardo J. Jen W. D. Travis Clin. Cancer Res. 2010 16 240 248
5. L. Guo Y. Zhou Y. Sun F. Zhang Eur. J. Cancer 2010 46 636 641
6. F. Ge C. L. Xiao X. F. Yin C. H. Lu H. L. Zeng Q. Y. He J. Proteomics 2010 73 1381 1390
7. T. S. Nühse A. Stensballe O. N. Jensen S. C. Peck Mol. Cell. Proteomics 2003 2 1234 1243
8. S. A. Beausoleil M. Jedrychowski D. Schwartz J. E. Elias J. Villén J. Li M. A. Cohn L. C. Cantley S. P. Gygi Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 12130 12135
9. J. C. Trinidad C. G. Specht A. Thalhammer R. Schoepfer A. L. Burlingame Mol. Cell. Proteomics 2006 5 914 922
10. A. Sano H. Nakamura Anal. Sci. 2004 20 565 566
11. T. E. Thingholm T. J. D. Jørgensen O. N. Jensen M. R. Larsen Nat. Protoc. 2006 1 1929 1935
12. A. M. Belu D. J. Graham D. G. Castner Biomaterials 2003 24 3635 3653
13. S. Yang X. Xiao W. Zhang L. Zhang W. Zhang B. Zhou G. Chen D. He BMC Cancer 2005 5 83
14. T. Okano T. Kondo T. Kakisaka K. Fujii M. Yamada H. Kato T. Nishimura A. Gemma S. Kudoh S. Hirohashi Proteomics 2006 6 3938 3948
15. L. De Petris M. Pernemalm G. Elmberger P. Bergman L. Orre R. Lewensohn J. Lehtio Proteome Sci. 2010 8 9
16. M. Matsuoka H. Igisu Y. Morimoto Environ. Health Perspect. 2003 111 509 512
17. A. Mattsson B. Jernström I. A. Cotgreave E. Bajak Chem.-Biol. Interact. 2009 177 40 47
18. H. G. Kim Y. P. Hwang H. G. Jeong Toxicol. Lett. 2009 187 28 34
19. D. N. Perkins D. J. C. Pappin D. M. Creasy J. S. Cottrell Electrophoresis 1999 20 3551 3567
20. J. V. Olsen B. Blagoev F. Gnad B. Macek C. Kumar P. Mortensen M. Mann Cell 2006 127 635 648
21. B. A. Ballif J. Villén S. A. Beausoleil D. Schwartz S. P. Gygi Mol. Cell. Proteomics 2004 3 1093 1101
22. M. O. Collins L. Yu M. P. Coba H. Husi I. Campuzano W. P. Blackstock J. S. Choudhary S. G. N. Grant J. Biol. Chem. 2005 280 5972 5982
23. S. Sui J. Wang B. Yang L. Song J. Zhang M. Chen J. Liu Z. Lu Y. Cai S. Chen W. Bi Y. Zhu F. He X. Qian Proteomics 2008 8 2024 2034
24. R. C. Gentleman V. J. Carey D. M. Bates B. Bolstad M. Dettling S. Dudoit B. Ellis L. Gautier Y. Ge J. Gentry K. Hornik T. Hothorn W. Huber S. Iacus R. Irizarry F. Leisch C. Li M. Maechler A. J. Rossini G. Sawitzki C. Smith G. Smyth L. Tierney J. Y. H. Yang J. Zhang GenomeBiology 2004 5 R80
25. G. Feng P. Du N. L. Krett M. Tessel S. Rosen W. A. Kibbe S. M. Lin BMC Res. Notes 2010 3 10 10
26. M. Khanna H. Van Bakel X. Tang J. A. Calarco T. Babak G. Guo A. Emili J. F. Greenblatt T. R. Hughes N. J. Krogan B. J. Blencowe RNA 2009 15 2174 2185
27. A. Sato S. Kishida T. Tanaka A. Kikuchi T. Kodama M. Asashima R. Nishinakamura Biochem. Biophys. Res. Commun. 2004 319 103 113
28. K. Tanabe K. Takei J. Cell Biol. 2009 185 939 948
29. J. Ostrowski K. Bomsztyk Br. J. Cancer 2003 89 1493 1501
30. Y. Zhang T. L. Jones S. E. Martin N. J. Caplen Y. Pommier J. Biol. Chem. 2009 284 18085 18095
31. M. Wu P. F. Wang J. S. Lee S. Martin-Brown L. Florens M. Washburn A. Shilatifard Mol. Cell. Biol. 2008 28 7337 7344
32. R. M. Tombes G. W. Krystal Biochim. Biophys. Acta, Mol. Cell Res. 1997 1355 281 292
33. R. Alpatov Y. Shi G. C. Munguba B. Moghimi J. Joo J. Bungert S. P. Sugrue Mol. Cell. Biol. 2008 28 1584 1595
34. T. Raemaekers K. Ribbeck J. Beaudouin W. Annaert M. Van Camp I. Stockmans N. Smets R. Bouillon J. Ellenberg G. Carmeliet J. Cell Biol. 2003 162 1017 1029
35. R. B. Chagpar P. H. Links M. C. Pastor L. A. Furber A. D. Hawrysh M. D. Chamberlain D. H. Anderson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 5471 5476
36. L. A. Pérez-Casellas X. Wang K. D. Howard M. W. Rehage D. D. Strong T. A. Linkhart Biochim. Biophys. Acta 2009 1789 78 87
37. G. Plasari A. Calabrese Y. Dusserre R. M. Gronostajski A. McNair L. Michalik N. Mermod Mol. Cell. Biol. 2009 29 6006 6017
38. J. C. Obenauer L. C. Cantley M. B. Yaffe Nucleic Acids Res. 2003 31 3635 3641
39. M. Lopez-Ramos R. Prudent V. Moucadel C. F. Sautel C. Barette L. Lafanechere L. Mouawad D. Grierson F. Schmidt J. Florent P. Filippakopoulos A. N. Bullock S. Knapp J. Reiser C. Cochet FASEB J. 2010 24 3171 3185
40. D. W. Litchfield Biochem. J. 2003 369 1 15
41. B. Guerra O. Issinger Curr. Med. Chem. 2008 15 1870 1886
42. P. Li J. Li E. Müller A. Otto R. Dietz R. von Harsdorf Mol. Cell 2002 10 247 258
43. Z. Hu E. S. Snitkin C. DeLisi Briefings Bioinf. 2008 9 317 325
44. Y. Assenov F. Ramírez S. Schelhorn T. Lengauer M. Albrecht Bioinformatics 2008 24 282 284
45. A. Barabasi Z. N. Oltvai Nat. Rev. Genet. 2004 5 101 113
46. E. Ravasz A. L. Somera D. A. Mongru Z. N. Oltvai A. Barabasi Science 2002 297 1551 1555
47. M. W. Hahn A. D. Kern Mol. Biol. Evol. 2005 22 803 806
48. H. Yu P. M. Kim E. Sprecher V. Trifonov M. Gerstein PLoS Comput. Biol. 2007 3 e59
49. C. Lin C. Chin H. Wu S. Chen C. Ho M. Ko Nucleic Acids Res. 2008 36 W438 W443
50. M. Overholtzer J. Zhang G. A. Smolen B. Muir W. Li D. C. Sgroi C. Deng J. S. Brugge D. A. Haber Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 12405 12410
51. B. Zhao L. Li K. Tumaneng C. Wang K. Guan Genes Dev. 2010 24 72 85
52. W. Haas B. K. Faherty S. A. Gerber J. E. Elias S. A. Beausoleil C. E. Bakalarski X. Li J. Villén S. P. Gygi Mol. Cell. Proteomics 2006 5 1326 1337
53. J. Wong A. Schwahn K. Downard BMC Bioinformatics 2009 10 244
54. X. Sun F. Ge C. Xiao X. Yin R. Ge L. Zhang Q. He J. Proteome Res. 2010 9 275 282
55. B. Macek I. Mijakovic J. V. Olsen F. Gnad C. Kumar P. R. Jensen M. Mann Mol. Cell. Proteomics 2007 6 697 707
56. P. Mortensen J. W. Gouw J. V. Olsen S. Ong K. T. G. Rigbolt J. Bunkenborg J. Cox L. J. Foster A. J. R. Heck B. Blagoev J. S. Andersen M. Mann J. Proteome Res. 2010 9 393 403
57. B. Macek F. Gnad B. Soufi C. Kumar J. V. Olsen I. Mijakovic M. Mann Mol. Cell. Proteomics 2008 7 299 307
58. J. C. Mellor I. Yanai K. H. Clodfelter J. Mintseris C. DeLisi Nucleic Acids Res. 2002 30 306 309
59. P. Shannon A. Markiel O. Ozier N. S. Baliga J. T. Wang D. Ramage N. Amin B. Schwikowski T. Ideker Genome Res. 2003 13 2498 2504
60. A. Cheng W. Huang Z. Chen F. Peng P. Zhang M. Li F. Li J. Li C. Li H. Yi B. Yi Z. Xiao Clin. Cancer Res. 2008 14 435 445
61. Y. Chang C. Wu K. Chang J. Yu Y. Chang P. Liao J. Proteome Res. 2009 8 5465 5474