Structural insights into the molecular basis responsible for the effects of immobilization on the kinetic parameters of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase from trypanosoma cruzi and human

Journal of the Brazilian Chemical Society

Volumn 21, Issue 10, 2010, Pages 1845-1853

  Guido, Rafael V C ^a   Cardoso, Carmen L ^a   De Moraes, Marcela C ^b   Andricopulo, Adriano D ^a   Cass, Quezia B ^b   Oliva, Glaucius ^a  

^a UNIVERSITY OF SÃO PAULO   (Brazil)

^b FEDERAL UNIVERSITY OF SÃO CARLOS   (Brazil)

Author keywords

Drug design; Enzymes; Immobilized enzymes reactors; Kinetic parameters; Structural analysis

Indexed keywords

EID: 77958067493     PISSN: 01035053     EISSN: 16784790     Source Type: Journal    
DOI: 10.1590/S0103-50532010001000008     Document Type: Article

References (43)

1. Guido, R. V. C.; Oliva, G.; Andricopulo, A. D.; Curr. Med. Chem. 2008, 15, 37.
2. Nie, Y. L.; Wang, W. H.; Chromatographia 2009, 69, S5.
3. Girelli, A. M.; Mattei, E.; J. Chromatogr. B 2005, 819, 3.
4. Marinov, I.; Gabrovska, K.; Velichkova, J.; Godjevargova, T.; Int. J. Biol. Macromol. 2009, 44, 215.
5. Vasileva, N.; Godjevargova, T.; Ivanova, D.; Gabrovska, K.; Int. J. Biol. Macromol. 2009, 44, 190.
6. Bartolini, M.; Greig, N. H.; Yu, Q. S.; Andrisano, V.; J. Chromatogr. A 2009, 1216, 2730.
7. O'Malley, S. M.; Xie, X.; Frutos, A. G.; J. Biomol. Screen. 2007, 12, 117.
8. Sharlow, E. R.; Leimgruber, S.; Yellow-Duke, A.; Barrett, R.; Wang, Q. J.; Lazo, J. S.; Nat. Protoc. 2008, 3, 1350.
9. Guido, R. V. C.; Oliva, G.; Curr. Top. Med. Chem. 2009, 9, 824.
10. Molyneux, D. H.; Adv. Parasitol. 2006, 61, 1.
11. WHO Control of Chagas Disease; World Health Organization: Geneva, Switzerland 2002; p. 1.
12. Bakker, B. M.; Mensonides, F. I.; Teusink, B.; van Hoek, P.; Michels, P. A.; Westerhoff, H. V.; Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 2087.
13. Verlinde, C. L.; Hannaert, V.; Blonski, C.; Willson, M.; Perie, J. J.; Fothergill-Gilmore, L. A.; Opperdoes, F. R.; Gelb, M. H.; Hol, W. G.; Michels, P. A.; Drug Resist. Updat. 2001, 4, 50.
14. Cáceres, A. J.; Michels, P. A. M.; Hannaert, V.; Mol. Biochem. Parasitol. 2010, 169, 50.
15. Aronov, A. M.; Suresh, S.; Buckner, F. S.; Van Voorhis, W. C.; Verlinde, C. L.; Opperdoes, F. R.; Hol, W. G.; Gelb, M. H.; Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1999, 96, 4273
16. Aronov, A. M.; Verlinde, C. L.; Hol, W. G.; Gelb, M. H.; J. Med. Chem. 1998, 41, 4790
17. Bressi, J. C.; Verlinde, C. L. M. J.; Aronov, A. M.; Shaw, M. L.; Shin, S. S.; Nguyen, L. N.; Suresh, S.; Buckner, F. S.; Van Voorhis, W. C.; Kuntz, I. D.; Hol, W. G.; Gelb, M. H.; J. Med. Chem. 2001, 44, 2080.
18. Guido, R. V. C.; Balliano, T. L.; Andricopulo, A. D.; Oliva, G.; Lett. Drug Discov. Des. 2009, 6, 210.
19. Guido, R. V. C.; Castilho, M. S.; Mota, S. G. R.; Oliva, G.; Andricopulo, A. D.; QSAR Comb. Sci. 2008, 27, 768.
20. Guido, R. V. C.; Oliva, G.; Montanari, C. A.; Andricopulo, A. D.; J. Chem. Inf. Model. 2008, 48, 918
21. Van Calenbergh, S.; Verlinde, C. L. M. J.; Soenens, J.; De Bruyn, A.; Callens, M.; Blaton, N. M.; Peeters, O. M.; Rozenskik, J.; Hol, W. G.; Herdewijn, P.; J. Med. Chem. 1995, 38, 3838
22. Verlinde, C. L.; Callens, M.; Van Calenbergh, S.; Van Aerschot, A.; Herdewijn, P.; Hannaert, V.; Michels, P. A.; Opperdoes, F. R.; Hol, W. G.; J. Med. Chem. 1994, 37, 3605.
23. Cardoso, C. L.; de Moraes, M. C.; Guido, R. V.; Oliva, G.; Andricopulo, A. D.; Wainer, I. W.; Cass, Q. B.; Analyst 2008, 133, 93.
24. Cardoso, C. L.; Lima, V. V.; Zottis, A.; Oliva, G.; Andricopulo, A. D.; Wainer, I. W.; Moaddel, R.; Cass, Q. B.; J. Chromatogr. A 2006, 1120, 151.
25. Berendsen, W. R.; Lapin, A.; Reuss, M.; Biotechnol. Prog. 2006, 22, 1305.
26. Clark, D. S.; Bailey, J. E.; Biotechnol. Bioeng. 2002, 79, 539
27. Moaddel, R.; Wainer, I. W.; J. Pharm. Biomed. Anal. 2007, 43, 399.
28. Christopoulos, A.; Nat. Rev. Drug Discov. 2002, 1, 198.
29. Mateo, C.; Palomo, J. M.; Fernandez-Lorente, G.; Guisan, J. M.; Fernandez-Lafuente, R.; Enzyme Microb. Technol. 2007, 40, 1451.
30. Souza, D. H.; Garratt, R. C.; Araujo, A. P.; Guimaraes, B. G.; Jesus, W. D.; Michels, P. A.; Hannaert, V.; Oliva, G.; FEBS Lett. 1998, 424, 131
31. Pereira, J. M.; Severino, R. P.; Vieira, P. C.; Fernandes, J. B.; da Silva, M. F.; Zottis, A.; Andricopulo, A. D.; Oliva, G.; Correa, A. G.; Bioorg. Med. Chem. 2008, 16, 8889.
32. Gabrovska, K.; Marinov, I.; Godjevargova, T.; Portaccio, M.; Lepore, M.; Grano, V.; Diano, N.; Mita, D. G.; Int. J. Biol. Macromol. 2008, 43, 339.
33. Ismail, S. A.; Park, H. W.; Acta Crystallogr. D Biol. Crystallogr. 2005, 61, 1508.
34. Castilho, M. S.; Pavao, F.; Oliva, G.; Ladame, S.; Willson, M.; Perie, J.; Biochemistry 2003, 42, 7143.
35. Pavao, F.; Castilho, M. S.; Pupo, M. T.; Dias, R. L.; Correa, A. G.; Fernandes, J. B.; da Silva, M. F.; Mafezoli, J.; Vieira, P. C.; Oliva, G.; FEBS Lett. 2002, 520, 13.
36. Monsan, P.; Durand, G.; Biochim. Biophys. Acta 1978, 523, 477.
37. Nagradova, N. K.; Biochemistry (Moscow) 2001, 66, 1067.
38. Gerstein, M.; Lesk, A. M.; Chothia, C.; Biochemistry 1994, 33, 6739.
39. Teague, S. J.; Nat. Rev. Drug Discov. 2003, 2, 527.
40. Skarzynski, T.; Wonacott, A. J.; J. Mol. Biol. 1988, 203, 1097.
41. Yun, M.; Park, C. G.; Kim, J. Y.; Park, H. W.; Biochemistry 2000, 39, 10702.
42. Shen, Y. Q.; Li, J.; Song, S. Y.; Lin, Z. J.; J. Struct. Biol. 2000, 130, 1.
43. Keating, K. S.; Flores, S. C.; Gerstein, M. B.; Kuhn, L. A.; Protein Sci. 2009, 18, 359.