Multiplexed electrochemical DNA sensor for single-nucleotide polymorphism typing by using oligonucleotide-incorporated nonfouling surfaces

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 19, 2010, Pages 6703-6706

  Wan, Ying ^a,b   Lao, Ruojun ^a,b   Liu, Gang ^a,b   Song, Shiping ^a,b   Wang, Lihua ^a,b   Li, Di ^a,b   Fan, Chunhai ^a,b  

^a SHANGHAI INSTITUTE OF APPLIED PHYSICS   (China)

^b SHANGHAI INSTITUTE OF MEASUREMENT AND TESTING TECHNOLOGY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; MULTIPLEXING; OLIGONUCLEOTIDES; POLYMORPHISM; PROBES; SENSORS;

AMPEROMETRIC; BIOTIN MOIETY; ELECTROCHEMICAL DNA SENSOR; GOLD ELECTRODES; NONFOULING; NONFOULING SURFACES; SINGLE-NUCLEOTIDE POLYMORPHISMS; TEMPLATED;

GENES;

EID: 77952514708     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp100871u     Document Type: Article

References (37)

1. Rafalski, A. Curr. Opin. Plant Biol. 2002, 5, 94
2. Vignal, A.; Milan, D.; SanCristobal, M.; Eggen, A. Genet., Sel., Evol. 2002, 34, 275
3. Gray, I. C.; Campbell, D. A.; Spurr, N. K. Hum. Mol. Genet. 2000, 9, 2403
4. Cargill, M.; Altshuler, D.; Ireland, J.; Sklar, P.; Ardlie, K.; Patil, N.; Lane, C. R.; Lim, E. P.; Kalyanaraman, N.; Nemesh, J. Nat. Genet. 1999, 22, 231
5. Landegren, U.; Nilsson, M.; Kwok, P. Y. Genome Res. 1998, 8, 769
6. Gut, I. G. Hum. Mut. 2001, 17, 475
7. Ng, J. K. K.; Liu, W. T. Anal. Bioanal. Chem. 2006, 386, 427
8. Chen, Y.; Shortreed, M. R.; Olivier, M.; Smith, L. M. Anal. Chem. 2005, 77, 2400
9. Ho-Pun-Cheung, A.; Choblet, S.; Colineau, T.; Abaibou, H.; Zsoldos, D.; Brengel-Pesce, K.; Grenier, J.; Cleuziat, P.; Lopez-Crapez, E. Lab. Invest. 2006, 86, 304
10. Vreeland, W. N.; Meagher, R. J.; Barron, A. E. Genet. Anal.-Biomol. Eng. 1999, 14, 187
11. Chen, J.; Iannone, M. A.; Li, M. S.; Taylor, J. D.; Rivers, P.; Nelsen, A. J.; Slentz-Kesler, K. A.; Roses, A.; Weiner, M. P. A microsphere-based assay for multiplexed single nucleotide polymorphism analysis using single base chain extension; Cold Spring Harbor Laboratory Press: Cold Spring Harbor, NY, 2000; Vol. 10, p 549.
12. Taton, T. A.; Mirkin, C. A.; Letsinger, R. L. Science 2000, 289, 1757
13. Zhong, X. B.; Reynolds, R.; Kidd, J. R.; Kidd, K. K.; Jenison, R.; Marlar, R. A.; Ward, D. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 11559
14. Li, J.; Chu, X.; Liu, Y.; Jiang, J. H.; He, Z.; Zhang, Z.; Shen, G.; Yu, R. Q. Nucleic Acids Res. 2005, 33, e168
15. Wu, Z. S.; Jiang, J. H.; Shen, G. L.; Yu, R. Q. Hum. Mut. 2007, 28, 630
16. Xu, C.; Zhou, Y. F.; Deng, J. Y.; Deng, X.; Guo, Y. C.; Cui, Z. Q.; Zhang, Z. P.; Wei, H. P.; Bi, L. J.; Zhang, X. E. Biosens. Bioelectron. 2008, 24, 818
17. Zhang, H.; Yang, X. H.; Wang, K. M.; Tan, W. H.; Li, H. M.; Zuo, X. B.; Wen, H. H. Biosens. Bioelectron. 2008, 23, 945
18. Kwok, P. Y. Hum Mut. 2002, 19, 315
19. Patolsky, F.; Lichtenstein, A.; Willner, I. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 253
20. Boon, E. M.; Ceres, D. M.; Drummond, T. G.; Hill, M. G.; Barton, J. K. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 1318
21. Sato, S.; Maeda, Y.; Nojima, T.; Kondo, H.; Takenaka, S. SNP analysis by using ferrocenyl naphthalene diimide (FND)-based electrochemical hybridization assay (EHA) Nucleic Acid Res. Suppl. 2003, 3) 169-170
22. Patolsky, F.; Lichtenstein, A.; Willner, I. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 5194
23. Li, Y.; Wark, A. W.; Lee, H. J.; Corn, R. M. Anal. Chem. 2006, 78, 3158
24. Wang, J. Chem.-Eur. J. 1999, 5, 1681
25. Wang, J.; Liu, G. D.; Merkoci, A. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 3214
26. Drummond, T. G.; Hill, M. G.; Barton, J. K. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 1192
27. Fan, C. H.; Plaxco, K. W.; Heeger, A. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 9134
28. Zhang, J.; Song, S. P.; Zhang, L. Y.; Wang, L. H.; Wu, H. P.; Pan, D.; Fan, C. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 8575
29. Lao, R.; Song, S.; Wu, H.; Wang, L.; Zhang, Z.; He, L.; Fan, C. Anal. Chem. 2005, 77, 6475
30. Wan, Y.; Zhang, J.; Liu, G.; Pan, D.; Wang, L.; Song, S.; Fan, C. Biosens. Bioelectron. 2009, 24, 1209
31. Kelley, S. O.; Boon, E. M.; Barton, J. K.; Jackson, N. M.; Hill, M. G. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 4830
32. Inouye, M.; Ikeda, R.; Takase, M.; Tsuri, T.; Chiba, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 11606
33. Lubin, A. A.; Lai, R. Y.; Baker, B. R.; Heeger, A. J.; Plaxco, K. W. Anal. Chem. 2006, 78, 5671
34. Xiao, Y.; Lou, X. H.; Uzawa, T.; Plakos, K. J. I.; Plaxco, K. W.; Soh, H. T. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 15311
35. Zhang, J.; Lao, R.; Song, S.; Yan, Z.; Fan, C. Anal. Chem. 2008, 80, 9029
36. Holtz, B.; Wang, Y.; Zhu, X.-Y.; Guo, A. Proteomics 2007, 7, 1771
37. Cha, T.-W.; Guo, A.; Zhu, X.-Y. Proteomics 2005, 5, 416