Laser photo CIDNP technique as a versatile tool for structural analysis of inter- and intramolecular protein-carbohydrate interactions

ACS Symposium Series

Volumn 930, Issue , 2006, Pages 81-113

  Siebert, Hans Christian ^a   Tajkhorshid, Emad ^b   Vliegenthart, Johannes F G ^c   Von Der Lieth, Claus Wilhelm ^d   André, Sabine ^a   Gabius, Hans Joachim ^a  

^a UNIVERSITY OF MUNICH   (Germany)

^b UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

^c UTRECHT UNIVERSITY   (Netherlands)

^d GERMAN CANCER RESEARCH CENTER DKFZ   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 36949000457     PISSN: 00976156     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: None     Document Type: Conference Paper

References (78)

1. Gabius, H.-J.; Gabius, S. (eds.) Glycosciences: Status and Perspectives. 1997. Chapman & Hall, Weinheim-London.
2. von der Lieth, C.-W.; Siebert, H.-C; Kozár, T.; Burchert, M.; Frank, M.; Gilleron, M.; Kaltner, H.; Kayser, G.; Tajkhorshid, E.; Bovin, N. V.; Vliegenthart, J. F. G.; Gabius, H.-J. Acta Anat. 1998, 161, 91.
3. Reuter, G.; Gabius, H.-J. Cell. Mol. Life Sci. 1999, 59, 368.
4. Wormald, M. R.; Dwek, R. A. Structure 1999, 7, 155.
5. Gabius, H.-J.; André, S.; Kaltner, H.; Siebert, H.-C. Biochim. Biophys. Acta 2002, 1572, 165.
6. Gabius, H.-J.; Siebert, H.-C.; André, S.; Jiménez-Barbero, J.; Rüdiger H. ChemBioChem 2004, 5, 740.
7. André, S.; Unverzagt, C.; Kojima, S. ; Dong, X. ; Fink, C. ; Kayser, K.; Gabius, H.-J. Bioconjugate Chem. 1997, 8, 845.
8. Unverzagt, C. ; André, S.; Seifert, J.; Kojima, S.; Fink, C.; Srikrishna, G.; Freeze, H. H.; Kayser, K. & Gabius, H.-J. J. Med. Chem. 2002, 45, 478.
9. André, S.; Unverzagt, C.; Kojima, S.; Frank, M.; Seifert, J.; Fink, C.; Kayser, K.; von der Lieth, C.-W.; Gabius, H.-J. Eur. J. Biochem. 2004, 271, 118.
10. Kaptein, R.; Dijkstra, K.; Nicolay, K. Nature 1978, 274, 293.
11. Kaptein, R. In: "Biological Magnetic Resonance." 1982, 4 (Berliner, L. J. ed.) New York, Plenum Press., 145.
12. Broadhurst, R. W.; Dobson, C. M.; Höre, P. J.; Radford, S. E.; Rees, M. L. Biochemistry 1991, 30, 405.
13. Hore, P. J.; Broadhurst, R. W. Progr. NMR Spectrosc. 1993, 25, 345.
14. Siebert, H.-C.; Tajkhorshid, E.; von der Lieth, C.-W.; Kleineidam, R. G.; Kruse, S.; Schauer, R.; Kaptein, R.; Gabius, H.-J.; Vliegenthart, J. F. G. J. Mol. Model. 1996, 2, 446.
15. Tajkhorshid, E.; Siebert, H.-C.; Burchert, M.; Kaltner, H.; Kayser, G.; von der Lieth, C.-W.; Kaptein, R; Vliegenthart, J. F. G.; Gabius, H.-J. J. Mol. Model. 1997, 3, 325.
16. Siebert, H.-C.; Lu, S.-Y.; Frank, M.; Kramer, J.; Wechselberger, R.; Joosten; J., André, S.; Rittenhouse-Olson, K.; Roy, R.; von der Lieth, C-W.; Kaptein, R.; Vliegenthart, J. F. G.; Heck, A. J. R.; Gabius, H.-J. Biochemistry 2002, 41, 9707.
17. Arnusch, C.-J.; André, S.; Valentini, P.; Lensch, M.; Russwurm, R.; Siebert, H.-C.; Fischer, M. J. E.; Gabius, H.-J.; Pieters, R. J. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 1437.
18. Mok, K. H.; Hore, P. J. Methods 2004, 34, 75.
19. Morozova, O. B.; Yurkovskaya, A. V.; Sagdeev, R. Z.; Mok, K. H.; Hore, P. J. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 15355.
20. Siebert, H.-C.; Adar, R.; Arango, R.; Burchert, M.; Kaltner, H.; Kayser, G.; Tajkhorshid, E.; von der Lieth, C.-W.; Kaptein, R.; Sharon, N.; Vliegenthart, J. F. G.; Gabius, H.-J. Eur. J. Biochem. 1997, 249, 27.
21. Villalobo, A.; Gabius, H.-J. Acta Anat. 1998, 161, 110.
22. Kaltner, H. ; Stiersdorfer, B. Acta Anat. 1998, 161, 162.
23. Gabius, H.-J. Anat. Histol. Embryol. 2001, 30, 3.
24. Rüdiger, H.; Gabius, H.-J. Glycoconjugate J. 2001, 18, 589.
25. Gabius, H.-J., Gabius, S. (eds.) Lectins and Glycobiology 1993; Springer Verlag, Heidelberg - New York.
26. Gabius, H.-J. Biochimie 2001, 83, 659.
27. Manning, J. C.; Seyrek, K.; Kaltner, H.; André, S.; Sinowatz, F.; Gabius, H.-J. Histol. Histopathol. 2004, 19, 1043.
28. Gabius, H.-J. Eur. J. Biochem. 1997, 243, 543.
29. Solis, D.; Jiménez-Barbero, J.; Kaltner, H.; Romero, A.; Siebert, H.-C.; von der Lieth, C.-W.; Gabius, H.-J. Cells Tissues Organs 2001, 168, 5.
30. Shionyu-Mitsuyama, C.; Shirai, T.; Ishida, H.; Yamane, T. Protein Eng. 2003, 16, 467.
31. Sujatha, M. S. ; Baiaji, P. V. Proteins 2004, 55, 44.
32. Kopitz, J.; von Reitzenstein, C.; André, S.; Kalmer, H.; Uhl, J.; Ehemann, V.; Cantz, M.; Gabius, H.-J. J. Biol. Chem. 2001, 276, 35917.
33. Camby, I.; Belot, N.; Lefranc, F.; Sadeghi, N.; de Launoit, Y., Kaltner, H., Musette, S.; Darro, F.; Danguy, A.; Salmon, I.; Gabius, H.-J.; Kiss, R. J. Neuropathol. Exp. Neurol. 2002, 61, 585.
34. Rappl G.; Abken, H.; Muche, J. M.; Sterry, W.; Tilgen, W.; André, S.; Kaltner, H.; Ugurel, S.; Gabius, H.-J.; Reinhold, U. Leukemia 2002, 16, 840.
35. Lahm, H.; André, S.; Hoeflich, A.; Kaltner, H.; Siebert, H.-C.; Sordat, B.; von der Lieth, C.-W.; Wolf, E.; Gabius, H.-J. Glycoconjugate J. 2004, 20, 227.
36. Siebert, H.-C.; André, S.; Lu, S.-Y.; Frank, M.; Kaltner; van Kuik, J.-A.; Korchagina, E.-Y.; Bovin, N.; Tajkhorshid, E.; Kaptein, R.; Vliegenthart, J. F. G.; von der Lieth, C.-W.; Jiménez-Barbero, J.; Kopitz, J.; Gabius, H.-J. Biochemistry 2003, 42, 14762.
37. Siebert, H.-C.; von der Lieth, C.-W.; Kaptein, R.; Beintema, J. J.; Dijkstra, K.; van Nuland, N.; Soedjanaatmadja, U. M. S.; Rice, A.; Vliegenthart, J. F. G.; Wright, C. S.; Gabius, H.-J. Proteins 1997, 28, 268.
38. Siebert, H.-C.; André, S.; Asensio, J. L.; Cañada, F. J.; Dong, X.; Espinosa, J.-F.; Frank, M.; Gilleron, M.; Kaltner, H.; Kozár, T.; Bovin, N. V.; von der Liem, C.-W.; Vliegenthart, J. F. G.; JiménezBarbero, J.; Gabius, H.-J. ChemBioChem 2000, 1, 181.
39. Siebert, H.-C.; André, S.; Vliegenthart, J. F. G.; Gabius, H.-J.; Minch, M. J. J. Biomol. NMR 2003, 25, 197.
40. Siebert, H.-C.; Jiménez-Barbero, J.; André, S.; Kaltner, H.; Gabius, H.-J. Meth Enzymol. 2003, 362, 449.
41. He, L.; André, S.; Siebert, H.-C.; Helmholz, H.; Niemeyer, B.; Gabius, H.-J. Biophys. J. 2003, 85, 511.
42. Galelli, A.; Truffa-Bachi, P. J. Immunol. 1993, 151, 1821.
43. Coker, A. R.; Purvis, A.; Baker, D.; Pepys; M. B.; Wood, S. P. FEBS Lett. 2000, 473, 199.
44. Noursadeghi, M.; Bickerstaff, M. C. M.; Gallimore, J. R.; Herbert, J.; Cohen, J.; Pepys, M. B. Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2000, 97, 14584.
45. Gillmore, J. D.; Winston L. Hutchinson, W. L.; Herbert, J.; Bybee, A.; Mitchell, D. A.; Hasserjian, R. P.; Yamamura, K.-I.; Suzuki, M.; Sabin, C. A.; Pepys, M. B. Immunology, 2004, 112, 255.
46. Kilpatrick, D. C. Biochim. Biophys. Acta 2002, 1572, 401.
47. Cambi, A.; Figdor, C. G. Curr. Opin. Cell Biol. 2003, 15, 539.
48. van Kooyk, Y.; Geijtenbeek, T. B. H. Nature Rev. Immunol. 2003, 3, 697.
49. Emsley, J.; White, H. E.; O'Hare, B. P.; Oliva, G.; Srinivasan, N.; Tickle, I. J.; Blundell, T. L.;Pepys, M. B.; Wood, S. P. Nature 1994, 367, 338.
50. Loveless, R. W.; Floyd-O'SuIlivan, G.; Raynes, J.-G.; Yuen, C.-T.; Feizi, T. EMBO J. 1992, 11, 813.
51. Pepys, M. B.; Rademacher, T. W.; Amatayakul-Chantler, S.; Williams, P.; Noble, G. E.; Hutchinson, W. L.; Hawkins, P. N.; Nelson, S. R.; Gallimore, J. R.; Herbert, J.; Hutton, T.; Dwek, R. A. Proc Natl Acad Sci USA 1994, 91, 5602.
52. Gabius, H.-J. Adv. Drug Deliv. Rev. 2004, 56, 421.
53. Siebert, H.-C.; André, S.; Reuter, G.; Gabius, H.-J.; Kaptein, R., Vliegenthart, J. F. G. FEBS Lett. 1995, 371, 13.
54. Erbel, P. J. A.; Karimi-Nejad, Y.; De Beer, T.; Boelens, R.; Kamerling, J. P.; Vliegenthart, J. F. G. Eur. J. Biochem. 1999, 260, 490.
55. Erbel, P. J. A., Karimi-Nejad, Y., Van Kuik, J. A., Boelens, R., Kamerling, J. P., Vliegenthart, J. F. G. Biochemistry 2000, 39, 6012.
56. Erbel, P. J.; Haseley, S. R.; Kamerling, J. P.; Vliegenthart; J. F. G. Biochem. J. 2002, 364, 485.
57. Lapthom, A. J.; Harris, D. C.; Littlejohn, A.; Lustbader, J. W.; Canfield, R. E.; Machin, K. J.; Morgan, F. J.; Isaacs, N. W. Nature 1994, 369, 455.
58. Wu, H.; Lustbader, J. W.; Liu, Y.; Canfield, R. E.; Hendrickson, W. A. Structure 1994, 2, 545.
59. Blithe, D. L.; Richards, R. G.; Skarulis, M. C. Endocrinology 1991, 129, 2257.
60. Blithe, D. L.; Iles, R. K. Endocrinology 1995, 136, 903.
61. Wyss, D. F.; Wagner, G. Curr. Opin. Biotechnol. 1996, 7, 409.
62. Matzuk, M. M.; Boime, I. J. Cell. Biol. 1988, 106, 1049.
63. van Zuylen, C. W. E. M.; De Beer, T.; Rademaker, G. J.; Haverkamp, J.; Thomas-Oates, J. E.; Hard, K.; Kamerling, J. P.; Vliegenthart, J. F. G. Eur. J. Biochem. 1995, 231, 754.
64. De Beer, T.; Van Zuylen, C. W. E. M.; Leeflang, B. R.; Hard, K.; Boelens, R.; Kaptein, R.; Kamerling, J. P.; Vliegenthart, J. F. G. Eur. J. Biochem. 1996, 241, 229.
65. van Zuylen, C. W. E. M.; Kamerling, J. P.; Vliegenthart, J. F. G. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1997, 232, 117.
66. Thijssen-van Zuylen, C. W. E. M.; De Beer, T.; Leeflang, B. R.; Boelens, R.; Kaptein, R.; Kamerling, J. P.; Vliegenthart, J. F. G. Biochemistry 1998, 37, 1933.
67. Siebert, H.-C.; Reuter, G.; Schauer, R.; von der Lieth, C.-W.; Dabrowski, J. Biochemistry 1992, 31, 6962.
68. Siebert, H.-C.; Gilleron, M.; Kaltner, H.; von der Lieth, C.-W.; Kozár, T.; Bovin, N. V.; Korchagina, E. Y.; Vliegenthart, J. F. G.; Gabius, H.-J. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1996, 219, 205.
69. Siebert, H.-C.; von der Lieth, C.-W.; Dong, X.; Reuter, G.; Schauer, R.; Gabius, H.-J.; Vliegenthart, J. F. G. Glycobiology 1996, 6, 561.
70. Gilleron, M.; Siebert, H.-C.; Kaltner, H.; von der Lieth, C.-W.; Kozár, T.; Halkes, K. M.; Korchagina, E. Y.; Bovin, N. V.; Gabius, H.-J.; Vliegenthart, J. F. G. Eur. J. Biochem. 1998, 252, 416.
71. Siebert, H.-C.; Kaptein, R.; Beintema, J. J.; Soedjanaatmadja, U. M. S.; Wright, C. S.; Rice, A.; Kleineidam, R. G.; Kruse, S.; Schauer, R.; Pouwels, P. J. W.; Kamerling, J. P.; Gabius, H.-J.; Vliegenthart, J. F. G. Glycoconjugate J. 1997, 14, 531.
72. Rüdiger, H.; Siebert, H.-C.; Soils, D.; Jiménez-Barbero, J.; Romero, A.; von der Lieth, C.-W.; Díaz-Mauriflo, T.; Gabius, H.-J. Curr. Med. Chem. 2000, 7,389.
73. Asensio, J. L.; Siebert, H.-C.; von der Lieth, C.-W.; Laynes, J.; Bruix, M.; Soedjanaatmadja, U. M. S.; Beintema, J. J.; Cañada, F. J.; Gabius, H.-J.; Jiménez-Barbero, J. Proteins 2000, 40, 218.
74. Asensio, J. L.; Cañada, F. J.; Siebert, H.-C.; Laynez, J.; Povìda, A.; Nieto, P. M.; Soedjanaatmadja, U. M. S.; Gabius, H.-J., Jiménez-Barbero, J. Chem. Biol. 2000, 7, 529.
75. Liao, D.; Kapadia, G.; Ahmed, H.; Vasta, G. R.; Herzberg, O. Proc. Natl. Acad Sci. USA 1994, 91, 1428.
76. Bourne, Y.; Bolgiano, B.; Liao, D.; Strecker, G.; Cantau, P.; Herzberg, O.; Feizi, T.; Cambillau, C. Nature Struct. Biol. 1994, 1, 863.
77. Lopez-Lucendo, M. F.; Solis, D.; André, S.; Hirabayashi, J.; Kasai, K.; Kaltner, H.; Gabius, H.-J.; Romero, A. J. Mol. Biol. 2004, 343, 957.
78. André, S.; Kaltner, H.; Lensch, M.; Russwurm, R.; Siebert, H.-C., Tajkhorshid, E.; Heck, A. J. R.; von Knebel-Doeberitz, M.; Gabius, H.-J.; Kopitz J. Int. J. Cancer, 2005, 114, 46.