Cation-π interactions of bare and coordinatively saturated metal ions: Contrasting structural and energetic characteristics

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 39, 2007, Pages 11546-11553

  Reddy, A Srinivas ^a   Zipse, Hendrik ^b   Sastry, G Narahari ^a,b  

^a INDIAN INSTITUTE OF CHEMICAL TECHNOLOGY   (India)

^b UNIVERSITY OF MUNICH   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BENZENE; HYDRATION; MOLECULAR MODELING; MOLECULAR STRUCTURE; QUANTUM THEORY;

ENERGETIC CHARACTERISTICS; GEOMETRICAL PARAMETERS; MODEL SYSTEMS; STRUCTURAL PARAMETERS;

METAL IONS;

EID: 35348997369     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp075768l     Document Type: Article

References (48)

1. (a) Suelter, C. Science 1970, 168, 789.
2. (b) McRee, D. E. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 8.
3. (a) Agranoff, D. D.; Krishna, S. Mol. Microbiol. 1998, 28, 403.
4. (b) Pyle, A. M. J. Biol. Inorg. Chem. 2002, 7, 679.
5. (c) Masson, E.; Schlosser, M. Org. Lett. 2005, 7, 1923.
6. (a) Dougherty, D. A.; Stauffer, D. A. Science 1990, 250, 1558.
7. (b) Kumpf, R. A.; Dougherty, D. A. Science 1998, 261, 1708.
8. (c) Ma, J. C.; Dougherty, D. A. Chem. Rev. 1997, 97, 1303.
9. Chaturvedi, U. C.; Shrivastava, R. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2005, 43, 105.
10. Zhu, W.; Luo, X.; Puah, G M.; Tan, X.; Shen, J.; Gu, J.; Chen, K.; Jiang, H. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 4008.
11. (a) Tsuzuki, S.; Uchimaru, T.; Mikami, M. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 10414.
12. (b) Quinonero, D.; Garau, C.; Frontera, A.; Ballester, P.; Costa, A.; Deya, P. M. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 4632.
13. Reddy, A. S.; Sastry, G. N. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 8893.
14. (a) Munoz, J.; Sponer, J.; Hobza, P.; Orozco, M.; Luque, F. J. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6051.
15. (b) Gu, J.; Leszczynski, J. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 10366.
16. (a) Wall, S. L. D.; Meadows, E. S.; Barbour, L. J.; Gokel, G. W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2000, 97, 6271.
17. (b) Hu, J.; Barbour, L. J.; Gokel, G. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 5121.
18. (a) Ruan, C.; Rodgers, M. T. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 14600.
19. (b) Ryzhov, V.; Dunbar, R. C. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2000, 11, 1037.
20. (c) Amicangelo, J. C.; Armentrout, P. B. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 11420.
21. (a) Biot, C.; Wintjens, R.; Rooman, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6220.
22. (b) McFail-Isom, L.; Shui, X.; Williams, L. D. Biochemistry 1998, 37, 17105.
23. (c) DeVos, A. M.; Ultsch, M.; Kosssiakoff, A. A. Science 1992, 255, 306.
24. (a) Hong, B. H.; Bae, S. C.; Lee, C.-W.; Jeong, S.; Kim, K. S. Science 2001, 294, 348.
25. (b) Kim, K. S.; Tarakeshwar, P.; Lee, J. Y. Chem. Rev. 2000, 100, 4145.
26. Reddy, A. S.; Vijay, D.; Sastry, G. M.; Sastry, G. N. J Phys. Chem. B 2006, 110, 2479.
27. Vijay, D.; Sastry, G. N. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 10148.
28. (a) Priyakumar, U. D.; Sastry, G. N. Tetrahedron Lett. 2003, 44, 6043.
29. (b) Priyakumar, U. D.; Punnagai, M.; Krishnamohan, G. P.; Sastry, G. N. Tetrahedron 2004, 60, 3037.
30. Wouters, J. Protein Sci 1998, 7, 2472.
31. Crowley, P. B.; Golovin, A. Proteins: Struct., Funct., Boinf. 2005, 59, 231.
32. (a) Reddy, A. S.; Sastry, G. M.; Sastry, G. N. Proteins: Struct., Funct., Boinf. 2007, 67, 1179.
33. (b) Reddy, A. S.; Vijay, D.; Sastry, G. M.; Sastry, G. N. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 10206.
34. Chelli, R.; Procacci, P. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 10204.
35. Chipot, C.; Maigret, B.; Pearlman, D. A.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2998.
36. Gallivan, J. P.; Dougherty, D. A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 870.
37. Vaden, T. D.; Lisy, M. J. Chem. Phys. 2004, 120, 721.
38. Adamo, C.; Berthier, G.; Savinelli, R. Theor. Chem. Acc. 2004, 111, 176.
39. (b) Xu, Y.; Shen, J.; Zhu, W.; Luo, X.; Chen, K.; Jiang, H. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 5945.
40. Boys, S. F.; Bernardi, R. Mol. Phys. 1979, 19, 553.
41. De Visser, S. P.; Kumar, D.; Danovich, M.; Nevo, N.; Danovich, D.; Sharma, P. K.; Wu, W.; Shaik, S. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 8510.
42. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision A.1; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
43. (a) Sponer, J.; Leszczynski, J.; Hobza, P. J. Comput. Chem. 1996, 17, 841.
44. (b) Kristyan, S.; Pulay, P.; Chem. Phys. Lett. 1994, 229, 175.
45. (c) Hobza, P.; Sponer, J.; Reschel, T. J. Comput. Chem. 1995, 16, 1315.
46. Feller, D. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 7558.
47. Gotch, A. J.; Zwier, T. S. J. Chem. Phys. 1992, 96, 3388.
48. Cabarcos, O. M.; Weinheimer, C. J.; Lisy, J. M. J. Chem. Phys. 1999, 110, 8429.