The multiplicity, strength, and nature of the interaction of nucleobases with alkaline and alkaline earth metal cations: A density functional theory investigation

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 108, Issue 18, 2004, Pages 4008-4018

  Zhu, Weiliang ^a,b   Luo, Xiaomin ^b   Puah, Chum Mok ^a   Tan, Xiaojian ^b   Shen, Jianhua ^b   Gu, Jiande ^b   Chen, Kaixian ^b   Jiang, Hualiang ^b  

^a SINGAPORE POLYTECHNIC   (Singapore)

^b INSTITUTE OF GEOLOGY AND GEOPHYSICS   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALKALINE EARTH METAL CATIONS; HETEROATOMS; MULTIPLICITY; NUCLEOBASES;

BERYLLIUM COMPOUNDS; BINDING ENERGY; CALCIUM COMPOUNDS; DECOMPOSITION; ENZYMES; LITHIUM COMPOUNDS; MAGNESIUM COMPOUNDS; OPTIMIZATION; POSITIVE IONS; POTASSIUM COMPOUNDS; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; SODIUM COMPOUNDS; STRENGTH OF MATERIALS;

ALKALINE EARTH METAL ALLOYS;

EID: 2442671652     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp036911n     Document Type: Article

References (35)

1. Ma Jennifer, C.; Dougherty, D. A. Chem. Rev. 1997, 97, 1303.
2. Rulíšek, L.; Havlas, Z. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122 (42), 10428.
3. Kaim, W.; Schwederski, B. Bioinorganic Chemistry: Inorganic Elements in the Chemistry of Life; John Wiley & Sons: Chichester, UK, 1994.
4. Lippard, S. J.; Berg, J. M. Principles of Bioinorganic Chemistry; University Science Books: Mill Bailey, CA, 1994.
5. Del Bene, J. E. J. Phys. Chem. 1984, 88, 5927.
6. Basch, H.; Krauss, M.; Stevens, W. J. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 7265.
7. Lipinski, J. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 1989, 201, 87.
8. Hobza, P.; Sandorfy, C. J. Biomol. Struct. Dyn. 1985, 2, 1245.
9. Anwander, E. H. S.; Probst, M. M.; Rode, B. M. Biopolymers 1990, 29A, 757.
10. Sponer, J.; Sabat, M.; Burda, J. V.; Leszczynski, J.; Hobza, P. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 2528.
11. Sponer, J.; Burda, J. V.; Sabat, M.; Leszczynski, J.; Hobza, P. J. Phys. Chem. A. 1998, 102, 5951.
12. Hoyau, S.; Norrman, K.; McMahon, T. B.; Ohanessian, G. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 8864.
13. Cerda, B. A.; Wesdemiotis, C. J. Am. Chem. Soc., 1996, 118, 11884. Cerda, B. A.; Hoyau, S.; Ohanessian, G.; Wesdemiotis, C. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 2437.
14. Cerda, B. A.; Wesdemiotis, C. J. Am. Chem. Soc., 1996, 118, 11884. Cerda, B. A.; Hoyau, S.; Ohanessian, G.; Wesdemiotis, C. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 2437.
15. Burda, J. V.; Šponer, J.; Hobza, P. J. Phys. Chem. 1996, 100, 7250.
16. Russo, N.; Toscano, M.; Grand, A. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 4735.
17. Russo, N.; Toscano, M.; Grand, A. J. Am, Chem. Soc. 2001, 123, 10272.
18. Felder, C.; Jiang, H. L.; Zhu, W. L.; Chen, K. X.; Silman, I.; Botti. S. A.; Sussman, J. L. J. Phys. Chem. 2001, 105, 1326.
19. Parr, R. G.; Yang, W. Density-functional theory of atoms and molecules; Oxford University Press: Oxford, UK, 1989.
20. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
21. Dunbar, R. C. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 8067.
22. Zhu, W. L.; Jiang, H. L.; Puah, C. M.; Tan, X. J.; Chen, K. X.; Cao, Y.; Ji, R. Y. J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1999, 11, 2615.
23. Peschke, M.; Blades, A. T.; Kebarle, P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 1492.
24. Zhu, W. L.; Tan, X. J.; Puah, C. M.; Gu, J. D.; Jiang, H. L.; Chen, K. X.; Felder, C. E.; Silman, I.; Sussman, J. L. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 9573.
25. Peschke, M.; Blades, A. T.; Kebarle, P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 10440.
26. Kitaura, K.; Morokuma, K. Int. J. Quantum Chem. 1976, 10, 325.
27. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, O.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, J.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
28. Schmidt, M. W.; Baldridge, K. K.; Boatz, J. A.; Elbert, S. T.; Gordon, M. S.; Jensen, I. H.; Koseki, S.; Matsunaga, N.; Nguyen, K. A.; Su, S. J.; Windus, T. L.: Dupuis, M.; Montgomery, J. A. J. Comput. Chem., 1993, 14, 1347.
29. (a) Jiang, H. L.; Zhu, W. L.; Tan, X. J.; Chen, J. Z.; Zhai Y. F.; Liu, D. X.; Zhac, L.; Chen, K. X.; Ji, R. Y. Acta Chim. Sin. 1999, 57, 860
30. (b) Nicholas, J. B.; Hay, B. P.; Dixon, D. A. J. Phys. Chem. 1999, 103, 1394.
31. Tan, X. J.; Zhu W. L.; Cui, M.; Luo, X. M.; Gu, J. D.; Silman, J.; Sussman, J. L.; Jiang H. L.; Ji, R. Y.; Chen, K. X. Chem. Phys. Lett. 2001, 349, 113.
32. (a) Zhu, W. L.; Liu, T.; Shen, J. H.; Luo, X. M.; Tan, X. J.; Puah, C. M.; Jiang, H. L.; Chen, K. X. Chem. Phys. Lett. 2002, 366, 267.
33. (b) Zhu, W.; Tan, X.; Shen, J.; Luo, X.; Cheng, F.; Puah, C. M.; Ji, R.; Chen, K.; Jiang, H. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 2296.
34. Amunugama, R.; Rodgers, M. T. Int. J. Mass Spectrom. 2000, 195/196, 439.
35. Armentrout, P. B.; Rodgers, M. T. J. Phys. Chem. 2000, 104, 2238.