Structural, dynamic properties of key residues in Aβ amyloidogenesis: Implications of an important role of nanosecond timescale dynamics

ChemBioChem

Volumn 8, Issue 11, 2007, Pages 1251-1254

  Lim, Kwang Hun ^a   Henderson, Ginger L ^a   Jha, Abhishek ^b   Louhivuori, Martti ^c  

^a EAST CAROLINA UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF CHICAGO   (United States)

^c UNIVERSITY OF HELSINKI   (Finland)

Author keywords

Amyloidogenesis; Beta amyloid peptides; NMR spectroscopy; Protein folding

Indexed keywords

AMYLOID A PROTEIN; AMYLOID BETA PROTEIN[1-42];

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CARBOXY TERMINAL SEQUENCE; MOLECULAR DYNAMICS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN AGGREGATION; PROTEIN FUNCTION; PROTEIN INTERACTION; PROTEIN STRUCTURE; PROTEIN SYNTHESIS; PROTEOMICS; TIME;

AMINO ACID SEQUENCE; AMYLOID BETA-PROTEIN; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; MOLECULAR SEQUENCE DATA; OXIDATION-REDUCTION; PEPTIDE FRAGMENTS; PROTEIN CONFORMATION; TIME FACTORS;

EID: 34547397537     PISSN: 14394227     EISSN: 14397633     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbic.200700194     Document Type: Article

References (46)

1. C. M. Dobson, Nature 2003, 426, 884-890.
2. F. Chiti, C. M. Dobson, Annu. Rev. Biochem. 2006, 75, 333-366.
3. F. Chiti, M. Stefani, N. Taddei, G. Ramponi, C. M. Dobson, Nature 2003, 424, 805-808.
4. M. López de la Paz, L. Serrano, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2004, 101, 87-92.
5. C. Wurth, N. K. Guimard, M. H. Hecht, J. Mol. Biol. 2002, 319, 1279-1290.
6. A. P. Pawar, K. F. DuBay, J. Zurdo, F. Chiti, M. Vendruscolo, C. M. Dobson, J. Mol. Biol. 2005, 350, 379-392.
7. A. M. Fernandez-Escamilla, F. Rousseau, J. Schymkowitz, L. Serrano, Nat. Biotechnol. 2004, 22, 1302-1306.
8. T. Luhrs, C. Ritter, M. Adrian, D. Riek-Loher, B. Bohrmann, H. Dobeli, D. Schubert, R. Riek, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 17342-17347.
9. N. A. Whittemore, R. Mishra, I. Kheterpal, A. D. Williams, R. Wetzel, E. H. Serpersu, Biochemistry 2005, 44, 4434-4441.
10. A. T. Petkova, Y. Ishii, J. J. Balbach, O. N. Antzutkin, R. D. Leapman, F. Delaglio, R. Tycko, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 16742-16747.
11. C. Hilbich, B. Kisters-Woike, J. Reed, C. L. Masters, K. Beyreuther, J. Mol. Biol. 1991, 218, 149-163.
12. C. Hilbich, B. Kisters-Woike, J. Reed, C. L. Masters, K. Beyreuther, J. Mol. Biol. 1992, 228, 460-473.
13. S. J. Wood, R. Wetzel, J. D. Martin, M. R. Hurle, Biochemistry 1995, 34, 724-730.
14. M. S. Wolfe, Nat. Rev. Drug Discovery 2002, 1, 859-866.
15. S. Narayanan, B. Reif, Biochemistry 2005, 44, 1444-1452.
16. J. R. Tolman, J. M. Flanagan, M. A. Kennedy, J. H. Prestegard, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 9279-9283.
17. N. Tjandra, A. Bax, Science 1997, 278, 1111-1114.
18. H. J. Dyson, P. E. Wright, Chem. Rev. 2004, 104, 3607-3622.
19. J. Klein-Seetharaman, M. Oikawa, S. B. Grimshaw, J. Wirmer, E. Duchardt, T. Ueda, T. Imoto, L. J. Smith, C. M. Dobson, H. Schwalbe, Science 2002, 295, 1719-1722.
20. G. W. Plattt, V. J. McParland, A. P. Kalverda, S. W. Homans, S. E. Radford, J. Mol. Biol. 2005, 346, 279-294.
21. R. Bussell, D. Eliezer, J. Biol. Chem. 2001, 276, 45996-46003.
22. D. Shortle, M. S. Ackerman, Science 2001, 293, 487-489.
23. R. Mohana-Borges, N. K. Goto, G. J. A. Kroon, H. J. Dyson, P. E. Wright, J. Mol. Biol. 2004, 340, 1131-1142.
24. P. Bernado, C. W. Bertoncini, C. Griesinger, M. Zweckstetter, M. Blackledge, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 17968-17969.
25. J. Wirmer, C. Schlorb, J. Klein-Seetharaman, R. Hirano, T. Ueda, T. Imoto, H. Schwalbe, Angew. Chem. 2004, 116, 5904-5909;
26. Angew. Chem. Int. Ed. 2004, 43, 5780-5785.
27. S. A. Dames, R. Aregger, N. Vajpai, P. Bernado, M. Blackledge, S. Grzesiek, J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 13508-13514.
28. Y. L. Yan, C. Y. Wang, J. Mol. Biol. 2006, 364, 853-862.
29. J. Danielsson, A. Andersson, J. Jarvet, A. Graslund, Magn. Reson. Chem. 2006, 44, S114-S121.
30. K. H. Lim, ChemBioChem 2006, 7, 1662-1666.
31. R. Tycko, F. J. Blanco, Y. Ishii, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9340-9341.
32. A. K. Jha, A. Colubri, K. F. Freed, T. R. Sosnick, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 13099-13104.
33. M. Zweckstetter, A. Bax, J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3791-3792.
34. M. Hennig, W. Bermel, A. Spencer, C. M. Dobson, L. J. Smith, H. Schwalbe, J. Mol. Biol. 1999, 288, 705-723.
35. L. J. Smith, K. A. Bolin, H. Schwalbe, M. W. MacArthur, J. M. Thornton, C. M. Dobson, J. Mol. Biol. 1996, 255, 494-506.
36. L. M. Hou, H. Y. Shao, Y. B. Zhang, H. Li, N. K. Menon, E. B. Neuhaus, J. M. Brewer, I. J. L. Byeon, D. G. Ray, M. P. Vitek, T. Iwashita, R. A. Makula, A. B. Przybyla, M. G. Zagorski, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1992-2005.
37. S. Meier, S. Guthe, T. Kiefhaber, S. Grzesiek, J. Mol. Biol. 2004, 344, 1051-1069.
38. R. Riek, P. Guntert, H. Dobeli, B. Wipf, K. Wuthrich, Eur. J. Biochem. 2001, 268, 5930-5936.
39. M. Torok, S. Milton, R. Kayed, P. Wu, T. McIntire, C. G. Glabe, R. Langen, J. Biol. Chem. 2002, 277, 40810-40815.
40. D. B. Teplow, N. D. Lazo, G. Bitan, S. Bernstein, T. Wyttenbach, M. T. Bowers, A. Baumketner, J. E. Shea, B. Urbane, L. Cruz, J. Borreguero, H. E. Stanley, Acc. Chem. Res. 2006, 39, 635-645.
41. J. D. Harper, P. T. Lansbury, Annu. Rev. Biochem. 1997, 66, 385-407.
42. L. M. Hou, I. Kang, R. E. Marchant, M. G. Zagorski, J. Biol. Chem. 2002, 277, 40173-40176.
43. A. D. Williams, E. Portelius, I. Kheterpal, J. T. Guo, K. D. Cook, Y. Xu, R. Wetzel, J. Mol. Biol. 2004, 335, 833-842.
44. A. Morimoto, K. Irie, K. Murakami, Y. Masuda, H. Ohigashi, M. Nagao, H. Fukuda, T. Shimizu, T. Shirasawa, J. Biol. Chem. 2004, 279, 52781-52788.
45. W. B. Stine, K. N. Dahlgren, G. A. Krafft, M. J. LaDu, J. Biol. Chem. 2003, 278, 11612-11622.
46. M. Ottiger, F. Delaglio, J. L. Marquardt, N. Tjandra, A. Bax, J. Magn. Reson. 1998, 134, 365-369.