Tyrosine kinase drug discovery: What can be learned from solved crystal structures?

Arkivoc

Volumn 2006, Issue 8, 2006, Pages 38-49

  Moretti, Loris ^a   Tchernin, Laura ^a   Scapozza, Leonardo ^a  

^a UNIVERSITY OF GENEVA   (Switzerland)

Author keywords

Inhibitor minimal requirements and conserved ligand kinase interactions; Ligand core; Molecular modelling; Tyrosine kinase ligands

Indexed keywords

EID: 33744464486     PISSN: 14246376     EISSN: 14246376     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (25)

1. Robinson, D.R.; Wu, Y.M.; Lin, S.F. Oncogene 2000, 19, 5548.
2. Hunter, T. Cell 2000, 100, 113.
3. Blume-Jensen, P.; Hunter, T. Nature 2001, 411, 355.
4. Huse, M.; Kuriyan, J. Cell 2002, 109, 275.
5. Hubbard, S. R. EMBO J. 1997, 16, 5572.
6. Druker, B. J.; Tamura, S.; Buchdunger, E.; Ohno, S.; Segal, G. M.; Fanning, S.; Zimmermann, J.; Lydon, N. B. Nature Med. 1996, 2, 561.
7. Sawyers, C. L.; Hochhaus, A.; Feldman, E.; Goldman, J. M.; Miller, C. B.; Ottmann, O. G.; Schiffer, C. A.; Talpaz, M.; Guilhot, F.; Deininger, M. W.; Fischer, T.; O'Brien, S. G.; Stone, R. M.; Gambacorti-Passerini, C. B.; Russell, N. H.; Reiffers, J. J.; Shea, T. C.; Chapuis, B.; Coutre, S.; Tura, S.; Morra, E.; Larson, R. A.; Saven, A.; Peschel, C.; Gratwohl, A.; Mandelli, F.; Ben-Am, M.; Gathmann, I.; Capdeville, R.; Paquette, R. L., Druker, B. J. Blood 2002, 99, 3530.
8. Holtz, M. S.; Slovak, M. L.; Zhang, F.; Sawyers, C. L.; Forman, S. J.; Bhatia, R. Blood 2002, 99, 3792.
9. Hubbard, S. R.; Wei, L.; Ellis, L.; Hendrickson, W. A.; Nature 1994, 372, 746.
10. Harris, P. A.; Cheung, M.; Hunter, R. N. 3rd; Brown, M. L.; Veal, J. M.; Nolte, R. T.; Wang, L.; Liu, W.; Crosby, R. M.; Johnson, J. H.; Epperly, A. H.; Kumar, R.; Luttrell, D. K.; Stafford, J. A. J Med Chem. 2005, 48, 1610.
11. Stamos, J.; Sliwkowski, M. X.; Eigenbrot, C. J Biol Chem. 2002, 277, 46265.
12. Wood, E. R.; Truesdale, A. T.; McDonald, O. B.; Yuan, D.; Hassell, A.; Dickerson, S. H.; Ellis, B.; Pennisi, C.; Horne, E.; Lackey, K.; Alligood, K. J.; Rusnak, D. W.; Gilmer, T. M.; Shewchuk, L. Cancer Res. 2004, 64, 6652.
13. Nagar, B.; Hantschel, O.; Young, M. A.; Scheffzek, K.; Veach, D.; Bornmann, W.; Clarkson, B.; Superti-Furga, G.; Kuriyan, J. Cell 2003, 112, 859.
14. Mohammadi, M.; Froum, S.; Hamby, J. M.; Schroeder, M. C.; Panek, R. L.; Lu, G. H.; Eliseenkova, A. V.; Green, D.; Schlessinger, J.; Hubbard, S. R. EMBO J. 1998, 17, 5896.
15. Nagar, B.; Bornmann, W. G.; Pellicena, P.; Schindler, T.; Veach, D. R.; Miller, W. T.; Clarkson, B.; Kuriyan, J. Cancer Res. 2002, 62, 4236.
16. Zhu, X.; Kim, J. L.; Newcomb, J. R.; Rose, P. E.; Stover, D. R.; Toledo, L. M.; Zhao, H.; Morgenstern, K. A. Structure Fold Des. 1999, 7, 651.
17. Meggio, F.; Donella Deana, A.; Ruzzene, M.; Brunati, A. M.; Cesaro, L.; Guerra, B.; Meyer, T.; Mett, H.; Fabbro, D.; Furet, P.; Dobrowolska, G.; Pinna, L. A. Eur. J. Biochem. 1995, 234, 317.
18. Schiering, N.; Knapp, S.; Marconi M.; Flocco, M. M.; Cui, J.; Perego, R.; Rusconi, L.; Cristiani, C. PNAS 2003, 100, 12654.
19. Mol, C. D.; Dougan, D. R.; Schneider, T. R.; Skene, R. J.; Kraus, M. L.; Scheibe, D. N.; Snell, G. P.; Zou, H.; Sang, B. C.; Wilson, K. P. J. Biol. Chem. 2004, 279, 31655.
20. Atwell, S.; Adams, J. M.; Badger, J.; Buchanan, M. D.; Feil, I. K.; Froning, K. J.; Gao, X.; Hendle, J.; Keegan, K.; Leon, B. C.; Muller-Dieckmann, H. J.; Nienaber, V. L.; Noland, B. W.; Post, K.; Rajashankar, K. R.; Ramos, A.; Russell, M.; Burley, S. K.; Buchanan, S. G. J Biol Chem. 2004, 279, 55827.
21. Mohammadi, M.; McMahon, G.; Sun, L.; Tang, C.; Hirth, P.; Yeh, B. K.; Hubbard, S. R.; Schlessinger, J. Science 1997, 276, 955.
22. Sicheri, F.; Moarefi, I.; Kuriyan, J. Nature 1997, 385, 602.
23. Vulpetti, A.; Bosotti, R. Farmaco 2004, 59, 759.
24. Manning, G.; Whyte, D. B.; Martinez, R.; Hunter, T.; Sudarsanam, S. Science 2002, 298, 1912.
25. Pickover, C. A. Science 1984, 223, 181.