Artificial ribonucleases

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 4, Issue 1, 2006, Pages 15-25

  Niittymäki, Teija ^a   Lönnberg, Harri ^a  

^a UNIVERSITY OF TURKU   (Finland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CATALYSTS; CHEMICAL BONDS; ENZYMES; ESTERS; HYDROLYSIS; NUCLEIC ACIDS;

BIOORGANIC CHEMISTS; MAN-MADE CATALYSTS; PHOSPHODIESTER BONDS; RNA-CLEAVING ENZYMES;

RNA;

METAL; OLIGONUCLEOTIDE; RIBONUCLEASE;

ARTICLE; CATALYSIS; ENZYME SPECIFICITY; METHODOLOGY; MOLECULAR MIMICRY; PROTEIN ENGINEERING; SYNTHESIS;

CATALYSIS; METALS; MOLECULAR MIMICRY; OLIGONUCLEOTIDES; PROTEIN ENGINEERING; RIBONUCLEASES; SUBSTRATE SPECIFICITY;

EID: 33645654103     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b509022a     Document Type: Article

References (114)

1. A. J. Kirby Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1996 35 707
2. H. M. Frankfort H. D. Robertson Cold Spring Harbor Monogr. Ser. 1982 14 359
3. Y. Takagi Y. Ikeda K. Taira Top. Curr. Chem. 2004 232 213
4. B. N. Trawick A. T. Daniher J. K. Bashkin Chem. Rev. 1998 98 939
5. S. T. Crooke Annu. Rev. Med. 2004 55 61
6. H. Nakamura Y. Oda S. Iwai H. Inoue E. Ohtsuka S. Kanaga S. Kimura C. Katsuda K. Katayanagi K. Morikawa H. Miyashiro M. Ikehara Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88 11535
7. M. M. Mangos K.-L. Min E. Viazovkina A. Galarneau M. I. Elzagheid M. A. Parniak M. J. Damha J. Am. Chem. Soc. 2003 125 654
8. D. M. Perrault E. V. Anslyn Angew. Chem., Int. Ed. 1997 36 432
9. M. Oivanen S. Kuusela H. Lönnberg Chem. Rev. 1998 98 961
10. H. Lönnberg R. Strömberg A. Williams Org. Biomol. Chem. 2004 2 2165
11. D. A. Usher A. H. McHale Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1976 73 1149
12. U. Kaukinen L. Bielecki S. Mikkola R. W. Adamiak H. Lönnberg J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 2001 1024
13. K. A. Kolasa J. R. Morrow A. P. Sharma Inorg. Chem. 1993 32 3983
14. F. H. Westheimer Acc. Chem. Res. 1968 1 70
15. U. Kaukinen T. Venäläinen H. Lönnberg M. Peräkylä Org. Biomol. Chem. 2003 1 2439
16. M. Komiyama J. Biochem. 1995 118 665
17. R. Häner J. Hall Antisense Nucleic Acid Drug Dev. 1997 7 423
18. M. Komiyama J. Sumaoka Curr. Opin. Chem. Biol. 1998 2 751
19. J. A. Cowan Curr. Opin. Chem. Biol. 2001 5 634
20. R. Häner Chimia 2001 55 1035
21. M. Komiyama J. Sumaoka A. Kuzuya Y. Yamamoto Methods Enzymol. 2001 341 455
22. M. Zenkova N. Beloglazova V. Silnikov V. Vlassov R. Giege Methods Enzymol. 2001 341 468
23. J. R. Morrow O. Iranzo Curr. Opin. Chem. Biol. 2004 8 192
24. E. Kimura Curr. Opin. Chem. Biol. 2000 4 207
25. R. R. Breaker G. F. Joyce Chem. Biol. 1994 1 223
26. S. K. Silverman Org. Biomol. Chem. 2004 2 2701
27. H. Åström N. H. Williams R. Strömberg Org. Biomol. Chem. 2003 1 1461
28. H. Åström R. Strömberg Org. Biomol. Chem. 2004 2 1901
29. T. Niittymäki U. Kaukinen P. Virta S. Mikkola H. Lönnberg Bioconjugate Chem. 2004 15 174
30. T. Niittymäki H. Lönnberg Bioconjugate Chem. 2004 15 1275
31. J. J. Butzow G. L. Eichhorn Biopolymers 1965 3 95
32. G. L. Eichhorn E. Tarien J. J. Buzow Biochemistry 1971 10 2014
33. G. L. Eichhorn J. J. Butzow Biopolymers 1965 3 79
34. J. R. Morrow L. A. Buttrey V. M. Shelton K. A. Berback J. Am. Chem. Soc. 1992 114 1903
35. K. Matsumura M. Endo M. Komiyama Chem. Commun. 1994 2019
36. S. Kuusela H. Lönnberg, H. J. Phys. Org. Chem. 1993 6 347
37. J. Hall D. Hüsken U. Pieles H. E. Moser R. Häner Chem. Biol. 1994 1 185
38. D. Magda R. A. Miller J. L. Sessler B. L. Iverson J. Am. Chem. Soc. 1994 116 7439
39. D. Magda S. Crofts A. Lin D. Miles M. Wright J. L. Sessler J. Am. Chem. Soc. 1997 119 2293
40. D. Magda M. Wright S. Crofts A. Lin J. L. Sessler J. Am. Chem. Soc. 1997 119 6947
41. J. Hall D. Hüsken R. Häner Nucleic Acids Res. 1996 24 3522
42. R. Häner J. Hall A. Pfützer D. Hüsken Pure Appl. Chem. 1998 70 111
43. J. K. Bashkin E. I. Frolova U. Sampath J. Am. Chem. Soc. 1994 116 5981
44. A. T. Daniher J. K. Bashkin Chem. Commun. 1998 1077
45. W. C. Putnam J. K. Bashkin Chem. Commun. 2000 767
46. B. N. Trawick T. A. Osiek J. K. Bashkin Bioconjugate Chem. 2001 12 900
47. H. Inoue T. Furukawa T. Tamura A. Kamada E. Ohtsuka Nucleosides, Nucleotides Nucleic Acids 2001 20 833
48. H. Inoue T. Furukawa M. Shimizu T. Tamura M. Matsui E. Ohtsuka Chem. Commun. 1999 45
49. S. Sakamoto T. Tamura T. Furukawa Y. Komatsu E. Ohtsuka M. Kitamura H. Inoue Nucleic Acids Res. 2003 31 1416
50. W. C. Putnam A. T. Daniher B. N. Trawick J. K. Bashkin Nucleic Acids Res. 2001 29 2199
51. B. Linkletter J. Chin Angew. Chem., Int. Ed. 1995 37 472
52. H. Irving D. Mellor J. Chem. Soc. 1962 5222
53. A. Whitney G. Gavory S. Balasubramanian Chem. Commun. 2003 36
54. J. Hovinen A. Guzaev E. Azhayeva A. Azhayev H. Lönnberg J. Org. Chem. 1995 60 2205
55. M. Kodama E. Kimura J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1977 2269
56. E. Kimura M. Kikuchi H. Kitamura T. Koike Chem. Eur. J. 1999 5 3113
57. S. Matsuda A. Ishikubo A. Kuzuya M. Yashiro M. Komiyama Angew. Chem., Int. Ed. 1998 37 3284
58. M. Komiyama Y. Matsumoto H. Takahashi T. Shiiba H. Tsuzuki H. Yajima M. Yashiro J. Sumaoka J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1998 691
59. S. Mikkola E. Stenman K. Nurmi E. Yousefi-Salakdeh R. Strömberg H. Lönnberg J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2 1999 1619
60. M. Yashiro A. Ishikubo M. Komiyama Chem. Commun. 1997 83
61. M. Komiyama S. Kina K. Matsumura J. Sumaoka S. Tobey V. M. Lynch E. Anslyn J. Am. Chem. Soc. 2002 124 13731
62. H. Ait-Haddou J. Sumaoka S. L. Wiskur J. F. Folmer-Andersen E. Anslyn Angew. Chem., Int. Ed. 2002 41 4014
63. Q. Wang S. Mikkola H. Lönnberg Chem. Biodiversity 2004 1 1316
64. M. J. Young J. Chin J. Am. Chem. Soc. 1995 117 10577
65. M. Komiyama T. Inokava K. Yoshinari Chem. Commun. 1995 77
66. M. Komiyama T. Inokava J. Biochem. 1994 116 719
67. M. Endo Y. Azuma Y. Saga A. Kuzuya G. Kawai M. Komiyama J. Org. Chem. 1997 62 846
68. J. C. Verheijen B. A. L. M. Deiman E. Yeheskiely G. A. van der Marel J. H. van Boom Angew. Chem., Int. Ed. 2000 39 369
69. R. T. Raines Chem. Rev. 1998 98 1045
70. V. Vlassov T. Abramova R. Giege V. Silnikov Antisense Nucleic Acid Drug Dev. 1997 7 39
71. L. Yurchenko V. Silnikov T. Godovikova G. Shishkin J.-J. Toulme V. Vlassov Nucleosides Nucleotides 1997 16 1721
72. N. G. Beloglazova N. N. Polushin V. N. Silnikov M. A. Zenkova V. V. Vlassov Dokl. Akad. Nauk 1999 369 827
73. N. G. Beloglazova V. N. Silnikov M. A. Zenkova V. V. Vlassov FEBS Lett. 2000 481 277
74. N. G. Beloglazova A. Yu. Epanchintsev V. N. Silnikov M. A. Zenkova V. V. Vlassov Mol. Biol., Engl. Ed. 2002 36 731
75. I. Y. Garipova V. N. Silnikov Russ. Chem. Bull. 2002 51 1112
76. N. G. Beloglazova M. M. Fabani M. A. Zenkova E. V. Bichenkova N. N. Polushin V. V. Silnikov K. T. Douglas V. V. Vlassov Nucleic Acids Res. 2004 32 3887
77. B. Verbeure C. J. Lacey M. Froeyen J. Rozenski P. Herdewijn Bioconjugate Chem. 2002 13 333
78. M. A. Reynolds T. A. Beck P. B. Say D. A. Schwartz B. P. Dwyer W. J. Daily M. M. Vaghefi M. D. Metzler R. E. Klem L. J. Arnold, Jr. Nucleic Acids Res. 1996 24 760
79. K. Ushijima H. Takaku Biochim. Biophys. Acta 1998 1379 217
80. N. L. Mironova D. V. Pyshnyi E. M. Ivanova M. A. Zenkova H. J. Gross V. V. Vlassov Nucleic Acids Res. 2004 32 1928
81. N. L. Mironova D. V. Pyshnyi E. M. Ivanova V. F. Zarytova M. A. Zenkova H. J. Gross V. V. Vlassov Russ. Chem. Bull. 2002 51 1177
82. N. L. Mironova Y. I. Boutorine D. V. Pyshnyi E. M. Ivanova M. A. Zenkova V. V. Vlassov Nucleosides, Nucleotides Nucleic Acids 2004 23 885
83. E. Riguet S. Tripathi B. Chaubey J. Desire V. N. Pandey J.-L. Decout J. Med. Chem. 2004 47 4806
84. H.-Y. Mei A. A. Galan N. S. Halim D. P. Mack D. W. Moreland K. B. Sanders H. N. Truong A. W. Czarnik Bioorg. Med. Chem. Lett. 1995 5 2755
85. U. Scheffer A. Strick V. Ludwig S. Peter E. Kalden M. Göbel J. Am. Chem. Soc. 2005 127 2211
86. D. A. Konevetz I. E. Beck N. G. Beloglazova I. V. Sulimenkov V. N. Silnikov M. A. Zenkova G. V. Shiskin V. V. Vlassov Tetrahedron 1998 55 503
87. D. A. Konevetz N. L. Mironova I. E. Beck M. A. Zenkova G. V. Shishkin V. V. Vlassov V. N. Silnikov Russ. J. Bioorg. Chem. 2002 28 331
88. I. L. Kuznetsova M. A. Zenkova H. J. Gross V. V. Vlassov Nucleic Acids Res. 2005 33 1201
89. M. A. Podyminogin V. V. Vlassov R. Giege Nucleic Acids Res. 1993 21 5950
90. S. Fouace C. Gaudin S. Picard S. Corvaisier J. Renault B. Carboni B. Felden Nucleic Acids Res. 2004 32 151
91. V. Silnikov G. Zuber J. P. Behr R. Giege V. Vlassov Phosphorus, Sulfur Silicon Relat. Elem. 1996 110 277
92. K. Michaelis M. Kalesse Angew. Chem., Int. Ed. 1999 38 2243
93. M. V. Keck S. M. Hecht Biochemistry 1995 34 12029
94. A. Sreedhara A. Patwardhan J. A. Cowan Chem. Commun. 1999 1147
95. A. Sreedhara J. A. Cowan JBIC, J. Biol. Inorg. Chem. 2001 6 166
96. K. Kurz M. W. Göbel Helv. Chim. Acta 1996 79 1967
97. D. Husken G. Goodall M. J. J. Blommers W. Jahnke J. Hall R. Häner H. E. Moser Biochemistry 1996 35 16591
98. A. Kuzuya R. Mizoguchi F. Morisawa K. Machida M. Komiyama J. Am. Chem. Soc. 2002 124 6887
99. A. Kuzuya R. Mizoguchi T. Sasayama J.-M. Zhou M. Komiyama J. Am. Chem. Soc. 2004 126 1430
100. Y. Shi A. Kuzuya K. Machida M. Komiyama Tetrahedron Lett. 2004 45 3703
101. Y. Shi K. Machida A. Kuzuya M. Komiyama Bioconjugate Chem. 2005 16 306
102. A. Kuzuya K. Machida R. Mizoguchi M. Komiyama Bioconjugate Chem. 2002 13 365
103. A. Kuzuya K. Machida M. Komiyama Tetrahedron Lett. 2002 43 8249
104. S.-i. Nakano Y. Uotani K. Uenishi M. Fujii N. Sugimoto J. Am. Chem. Soc. 2005 127 518
105. L. Canaple D. Hüsken R. Häner Bioconjugate Chem. 2002 13 945
106. A. Kuzuya R. Mizoguchi F. Morisawa M. Komiyama Chem. Commun. 2003 770
107. K. Ushijima M. Shirakawa K. Kagoshima W.-S. Park N. Miyano-Kurosaki H. Takaku Bioorg. Med. Chem. 2001 9 2165
108. L. Petersen M. C. de Koning P. van Kuik-Romeijn J. Weterings C. J. Pol G. Platenburg M. Overhand G. A. van der Marel J. H. van Boom Bioconjugate Chem. 2004 15 576
109. H. H. Zepik S. A. Benner J. Org. Chem. 1999 64 8080
110. J. Smith K. Ariga E. V. Anslyn J. Am. Chem. Soc. 1993 115 362
111. D. M. Kneeland K. Ariga V. M. Lynch C. Y. Huang E. V. Anslyn J. Am. Chem. Soc. 1993 115 10042
112. V. Jubian R. P. Dixon A. D. Hamilton J. Am. Chem. Soc. 1992 114 1120
113. V. Jubian A. Veronese R. P. Dixon A. D. Hamilton Angew. Chem. 1995 34 1237
114. M.-S. Muche M. W. Göbel Angew. Chem., Int. Ed. 1996 35 2126