Structure of Escherichia coli ribonucleotide reductase R2 in space group P6122

Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography

Volumn 61, Issue 12, 2005, Pages 1649-1654

  Sommerhalter, Monika ^a   Saleh, Lana ^b   Bollinger Jr , J Martin ^b   Rosenzweig, Amy C ^a  

^a NORTHWESTERN UNIVERSITY   (United States)

^b PENNSYLVANIA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ESCHERICHIA COLI;

RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE R2 SUBUNIT;

ARTICLE; BINDING SITE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CRYSTALLIZATION; ENZYMOLOGY; ESCHERICHIA COLI; PROTEIN CONFORMATION; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

BINDING SITES; CRYSTALLIZATION; CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; ESCHERICHIA COLI; MODELS, MOLECULAR; PROTEIN CONFORMATION; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASES;

EID: 33644848547     PISSN: 09074449     EISSN: 13990047     Source Type: Journal    
DOI: 10.1107/S0907444905034062     Document Type: Article

References (43)

1. Andersson, M. E., Högbom, M., Rinaldo-Matthis, A., Andersson, K. K., Sjöberg, B.-M. & Nordlund, P. (1999). J. Am. Chem. Soc. 121, 2346-2352.
2. Atta, M., Nordlund, P., Aberg, A., Eklund, H. & Fontecave, M. (1992). J. Biol. Chem. 267, 20682-20688.
3. Brünger, A. T., Adams, P. D., Clore, G. M., DeLano, W. L., Gros, P., Grosse-Kunstleve, R. W., Jiang, J.-S., Kuszewski, J., Nilges, M., Pannu, N. S., Read, R. J., Rice, L. M., Simonson, T. & Warren, G. L. (1998). Acta Cryst. D54, 905-921.
4. Climent, I., Sjöberg, B.-M. & Huang, C. Y. (1992). Biochemistry, 31, 4801-4807.
5. Collaborative Computational Project, Number 4 (1994). Acta Cryst. D50, 760-763.
6. DeLano, W. L. (2002). The PyMOL Molecular Graphics System. San Carlos, CA, USA: DeLano Scientific.
7. Eklund, H., Uhlin, U., Färnegårdh, M., Logan, D. T. & Nordlund, P. (2001). Prog. Biophys. Mol. Biol. 77, 177-268.
8. Ge, J., Perlstein, D. L., Nguyen, H. H., Bar, G., Griffin, R. G. & Stubbe, J. (2001). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 98, 10067-10072.
9. Högbom, M., Andersson, M. E. & Nordlund, P. (2001). J. Biol. Inorg. Chem. 6, 315-323.
10. Högbom, M., Galander, M., Andersson, M., Kolberg, M., Hofbauer, W., Lassmann, G., Nordlund, P. & Lendzian, F. (2003). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 100, 3209-3214.
11. Högbom, M., Stenmark, P., Voevodskaya, N., McClarty, G., Gräslund, A. & Nordlund, P. (2004). Science, 305, 245-248.
12. Joelson, T., Uhlin, U., Eklund, H., Sjoberg, B. M., Hahne, S. & Karlsson, M. (1984). J. Biol. Chem. 259, 9076-9077.
13. Kabsch, W. (1993). J. Appl. Cryst. 26, 795-800.
14. Kantardjieff, K. A. & Rupp, B. (2003). Protein Sci. 12, 1865-1871.
15. Kauppi, B., Nielsen, B. B., Ramaswamy, S., Larsen, I. K., Thelander, M., Thelander, L. & Eklund, H. (1996). J. Mol. Biol. 262, 706-720.
16. Kleywegt, G. J. & Jones, T. A. (1994). Jnt CCP4/ESF-EACBM Newsl. Protein Crystallogr. 31, 9-14.
17. Laskowski, R. A. (1993). J. Appl. Cryst. 26, 283-291.
18. Logan, D. T., Su, X.-D., Åberg, A., Regnström, K., Hajdu, J., Eklund, H. & Nordlund, P. (1996). Structure, 4, 1053-1064.
19. Lycksell, P. O., Ingemarson, R., Davis, R., Gräslund, A. & Thelander, L. (1994). Biochemistry, 33, 2838-2842.
20. McRee, D. E. (1999). J. Struct. Biol. 125, 156-165.
21. Moënne-Loccoz, P., Baldwin, J., Ley, B. A., Loehr, T. M. & Bollinger, J. M. Jr (1998). Biochemistry, 37, 14659-14663.
22. Murshudov, G. N., Vagin, A. A. & Dodson, E. J. (1997). Acta Cryst. D53, 240-255.
23. Noodleman, L., Lovell, T., Han, W. G., Li, J. & Himo, F. (2004). Chem. Rev. 104, 459-508.
24. Nordlund, P. & Eklund, H. (1993). J. Mol. Biol. 231, 123-164.
25. Nordlund, P., Sjöberg, B.-M. & Eklund, H. (1990). Nature (London), 345, 593-598.
26. Nordlund, P., Uhlin, U., Westergren, C., Joelson, T., Sjöberg, B.-M. & Eklund, H. (1989). FEBS Lett. 258, 251-254.
27. Pierce, B. S., Elgren, T. E. & Hendrich, M. P. (2003). J. Am. Chem. Soc. 125, 8748-8759.
28. Pierce, B. S. & Hendrich, M. P. (2005). J. Am. Chem. Soc. 127, 3613-3623.
29. Powell, H. R. (1999). Acta Cryst. D55, 1690-1695.
30. Pulver, S. C., Tong, W. H., Bollinger, J. M. Jr, Stubbe, J. & Solomon, E. I. (1995). J. Am. Chem. Soc. 117, 12664-12678.
31. Reichard, P. (1993). Science, 260, 1773-1777.
32. Rubinson, K. A., Ladner, J. E., Tordova, M. & Gilliland, G. L. (2000). Acta Cryst. D56, 996-1001.
33. Sjöberg, B.-M. (1997). Struct. Bonding, 88, 139-173.
34. Sommerhalter, M., Lieberman, R. L. & Rosenzweig, A. C. (2005). Inorg. Chem. 44, 770-778.
35. Sommerhalter, M., Voegtli, W. C., Perlstein, D. L., Ge, J., Stubbe, J. & Rosenzweig, A. C. (2004). Biochemistry, 43, 7736-7742.
36. Strand, K. R., Karlsen, S. & Andersson, K. K. (2002). J. Biol. Chem. 277, 34229-34238.
37. Stubbe, J. & van der Donk, W. A. (1998). Chem. Rev. 98, 705-762.
38. Tong, W., Burdi, D., Riggs-Gelasco, P., Chen, S., Edmondson, D., Huynh, B. H., Stubbe, J., Han, S., Arvai, A. & Tainer, J. (1998). Biochemistry, 37, 5840-5848.
39. Tshuva, E. Y. & Lippard, S. J. (2004). Chem. Rev. 104, 987-1012.
40. Uhlin, U. & Eklund, H. (1994). Nature (London), 370, 533-539.
41. Vagin, A. & Teplyakov, A. (1997). J. Appl. Cryst. 30, 1022-1025.
42. Voegtli, W. C., Khidekel, N., Baldwin, J., Ley, B. A., Bollinger, J. M. Jr & Rosenzweig, A. C. (2000). J. Am. Chem. Soc. 122, 3255-3261.
43. Voegtli, W. C., Sommerhalter, M., Saleh, L., Baldwin, J., Bollinger, J. M. Jr & Rosenzweig, A. C. (2003). J. Am. Chem. Soc. 125, 15822-15830.