Displacement of the tyrosyl radical cofactor in ribonucleotide reductase obtained by single-crystal high-field EPR and 1.4-Å x-ray data

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 100, Issue 6, 2003, Pages 3209-3214

  Högbom, Martin ^a   Galander, Marcus ^b   Andersson, Martin ^a   Kolberg, Matthias ^b,c   Hofbauer, Wulf ^b,d   Lassmann, Günter ^b,e   Nordlund, Pär ^a   Lendzian, Friedhelm ^b  

^a STOCKHOLM UNIVERSITY   (Sweden)

^b TECHNISCHE UNIVERSITÄT BERLIN   (Germany)

^c UNIVERSITY OF OSLO   (Norway)

^d Department of Molecular Biology and Genetics   (United States)

^e MAX PLANCK INSTITUTE FOR CHEMICAL ENERGY CONVERSION   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE; TYROSINE;

ARTICLE; CRYSTAL STRUCTURE; DNA SYNTHESIS; ELECTRON SPIN RESONANCE; ENZYME SUBSTRATE COMPLEX; ESCHERICHIA COLI; NONHUMAN; OXIDATION; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN STRUCTURE; RADICAL REACTION; REDUCTION; STRUCTURE ANALYSIS; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

CRYSTALLOGRAPHY, X-RAY; ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; ELECTROSTATICS; ESCHERICHIA COLI; FREE RADICALS; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR STRUCTURE; PROTEIN CONFORMATION; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASES; TYROSINE;

ESCHERICHIA COLI; NEGIBACTERIA;

EID: 0037452887     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.0536684100     Document Type: Article

References (43)

1. Logan, D. T., Su, X.-D., Aberg, A., Regnström, K., Hajdu, J., Eklund, H. & Nordlund, P. (1996) Structure (London) 4, 1053-1064.
2. Nordlund, P. & Eklund, H. (1993) J. Mol. Biol. 232, 123-164.
3. Eklund, H., Uhlin, U., Färnegardh, M., Logan, D. T. & Nordlund, P. (2001) Prog. Biophys. Mol. Biol. 77, 177-268.
4. Stubbe, J. & Riggs-Gelasco, P. (1998) Trends Biochem. Sci. 23, 438-443.
5. Stubbe, J. & van der Donk, W. A. (1998) Chem. Rev. (Washington, D.C.) 98, 705-762.
6. Siegbahn, P. E. M. (1998) J. Am. Chem. Soc. 120, 8417-8429.
7. Mao, S. S., Holler, T. P., Yu, G. X., Bollinger, J. M., Jr., Booker, S., Johnston, M. I. & Stubbe, J. (1992) Biochemistry 31, 9733-9743.
8. Sjöberg, B.-M. (1997) Struct. Bonding (Berlin) 88, 139-173.
9. Siegbahn, P. E. M., Eriksson, L. Himo, F. & Pavlov, M. (1998) J. Phys. Chem. B 102, 10622-10629.
10. Andersson, K. K. & Gräslund, A. (1995) Adv. Inorg. Chem. 43, 359-408.
11. Gerfen, G. S., Bellew, B. F., Un, S., Bollinger, J. M., Jr., Stubbe, J., Griffin, R. G. & Singel, D. J. (1993) J. Am. Chem. Soc. 115, 6420-6421.
12. van Dam, P. J., Willems, J.-P., Schmidt, P. P., Pötsch, S., Barra, A.-L., Hagen, W. R., Hoffman, B. M., Andersson, K. K. & Gräslund, A. (1998) J. Am. Chem. Soc. 120, 5080-5085.
13. Allard, P., Barra, A.-L., Andersson, K. K., Schmidt, P. P., Atta, M. & Gräslund, A. (1996) J. Am. Chem. Soc. 118, 895-896.
14. Bleifuss, G., Kolberg, M., Pötsch, S., Hofbauer, W., Bittl, R., Lubitz, W., Gräslund, A., Lassmann, G. & Lendzian, F. (2001) Biochemistry 40, 15362-15368.
15. Un, S., Gerez, C., Elleingand, E. & Fontecave, M. (2001) J. Am. Chem. Soc. 123, 3048-3054.
16. Atkin, C. L., Thelander, L., Reichard, P. & Lang, G. (1973) J. Biol. Chem. 248, 7464-7472.
17. Sahlin, M., Sjöberg, B.-M., Backers, G., Loehr, T. & Sanders-Loehr, J. (1990) Biochem. Biophys. Res. Commun. 167, 813-818.
18. Sjöberg, B.-M., Hahne, S., Karlsson, M., Jörnvall, H., Göransson, M. & Uhlin, B. E. (1986) J. Biol. Chem. 261, 5658-5662.
19. Sjöberg, B. M., Karlsson, M. & Jörnvall, H. (1987) J. Biol. Chem. 262, 9736-9743.
20. Nordlund, P., Uhlin, U., Westergren, C., Joelsen, T., Sjöberg, B.-M. & Eklund, H. (1989) FEBS Lett. 258, 251-254.
21. Otwinowski, Z. (1993) in Proceedings of the CCP4 Study Weekend: Data Collection and Processing, eds. Sawyer, L., Isaacs, N. & Bailey, S. [Science and Engineering Council (SERC) Daresbury Laboratory, Daresbury, U.K.].
22. Brünger, A. T. Adams, P. D., Clore, G. M., DeLano, W. L., Gros, P., Grosse-Kunstleve, R. W., Jiang, J. S., Kuszewski, J., Nilges, M., Pannu, N. S., et al. (1998) Acta Crystallogr. D. 54, 905-921.
23. Perrakis, A., Sixma, T. K., Wilson, K. S. & Limzin, V. S. (1997)Acta Crystallogr. D. 53, 448-455.
24. Stesmans, A. & VanGorp, G. (1989) Rev. Sci. Instrum. 60, 2949-2952.
25. Lendzian, F., Sahlin, M., MacMillan, F., Bittl, R., Fiege, R., Pötsch, S., Sjöberg, B.-M., Gräslund, A., Lubitz, W. & Lassmann, G. (1996) J. Am. Chem. Soc. 118, 8111-8120.
26. Press, W. H., Teukolsky, S. A., Vetterling, W. T. & Flannery, B. P. (1992) Numerical Recipes in C (Cambridge Univ. Press, Cambridge, U.K.), 2nd Ed.
27. Nordlund, P., Sjöberg, B.-M. & Eklund, H. (1990) Nature 345, 593-598.
28. Nordlund, P. (1990) Ph.D. thesis (Swedish Univ. of Agricultural Sciences, Uppsala).
29. Ivancich, A., Mazza, G. & Desbois, A. (2001) Biochemistry 40, 6860-6866.
30. Bennati, M., Farrer, C. T., Bryant, J. A., Inati, S. J., Weis, V., Gerfen, G. J., Riggs-Gelasco, P., Stubbe, J. & Griffin, R. G. (1999) J. Magn. Reson. 138, 232-243.
31. Gurbiel, R. J., Bolin, J. T., Ronco, A. E., Mortenson, L. & Hoffman, B. M. (1991) J. Magn. Reson. 91, 227-240.
32. Hofbauer, W., Zouni, A., Bittl, R., Kern, J., Orth, P., Lendzian, F., Fromme, P., Witt, H. T. & Lubitz, W. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 6623-6628.
33. Fasanella, E. L. & Gordy, W. (1969) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 62, 299-304.
34. Mezzetti, A., Maniero, A. L., Brustolon, M., Giacometti, G. & Brunel, L. C. (1999) J. Phys. Chem. A 103, 9636-9643.
35. Andersson, M. E., Högbom, M., Rinaldo-Matthis, A., Andersson, K. K., Sjöberg, B.-M. & Nordlund, P. (1999) J. Am. Chem. Soc. 121, 2346-2352.
36. Miller, M. A., Gobena, F. T., Kauffmann, K., Münck, E., Que, L., Jr., & Stankovich, M. T. (1999) J. Am. Chem. Soc. 121, 1096-1097.
37. Engström, M., Himo, F., Gräslund, A., Minaev, B., Vahtras, O. & Agren, H. (2000) J. Phys. Chem. A 104, 5149-5153.
38. Hoganson, C. W., Sahlin, M., Sjöberg, B.-M. & Babcock, G. T. (1996) J. Am. Chem. Soc. 118, 4672-4679.
39. Himo, F., Gräslund, A. & Eriksson, L. A. (1997) Biophys. J. 72, 1556-1567.
40. Uhlin, U. & Eklund, H. (1994) Nature 370, 533-539.
41. Ekberg, M., Sahlin, M., Eriksson, M. & Sjöberg, B.-M. (1996) J. Biol. Chem. 271, 20655-20659.
42. Baldwin, J., Krebs, K., Ley, B. A., Edmondson, D. E., Huynh, B. H. & Bollinger, J. M., Jr. (2000) J. Am. Chem. Soc. 122, 12195-12206.
43. Högbom, M., Andersson, M. E. & Nordlund, P. (2001) J. Biol. Inorg. Chem. 6, 315-323.