Crystal structure of the ribonucleotide reductase R2 mutant that accumulates a μ-1,2-peroxodiiron(III) intermediate during oxygen activation

Journal of the American Chemical Society

Volumn 122, Issue 14, 2000, Pages 3255-3261

  Voegtli, Walter C ^a   Khidekel, Nelly ^a   Baldwin, Jeffrey ^b   Ley, Brenda A ^b   Bollinger Jr , J Martin ^b   Rosenzweig, Amy C ^a  

^a NORTHWESTERN UNIVERSITY   (United States)

^b PENNSYLVANIA STATE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

IRON COMPLEX; OXYGEN; RIBONUCLEOTIDE REDUCTASE;

ARTICLE; CRYSTAL STRUCTURE; ENZYME STRUCTURE; ESCHERICHIA COLI; NONHUMAN; PROTEIN PURIFICATION; REACTION ANALYSIS;

EID: 0034639904     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja991839l     Document Type: Article

References (53)

1. Nordlund, P.; Eklund, H. Curr. Op. Struct. Biol. 1995, 5, 758-766.
2. Sjöberg. B.-M. Struct. Bonding 1997, 88, 139-173.
3. Wallar, B. J.: Lipscomb, J. D. Chem. Rev. 1996, 96, 2625-2657.
4. Liu, K. E.: Wang. D.; Huynh, B. H.; Edmondson, D. E.: Salifoglou, A.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 7465-7466.
5. Liu, K. E.; Valentine, A. M.: Wang, D.: Huynh. B. H.; Edmondson, D. E.; Salifoglou. A.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10174-10185.
6. Valentine, A. M.; Stahl, S. S.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 3876-3887.
7. Lee, S.-K.: Fox, B. G.: Froland, W. A.; Lipscomb, J. D.; Münck, E. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 6450-6451.
8. Lee, S.-K.; Nesheim, J. C.: Lipscomb, J. D. J. Biol. Chem. 1993, 268, 21569-21577.
9. Shu, L.; Nesheim, J. C.; Kauffmann, K.; Münck, E.; Lipscomb, J. D.; Que, L., Jr. Science 1997, 275, 515-518.
10. Bollinger. J. M., Jr.; Edmnndson. D. E.; Huynh, H.; Filley, J.; Norton, J. R.; Stubbe. J. Science 1991, 253, 292-298.
11. Tong. W. H.; Chen, S.; Lloyd, S. G.; Edmondson, D. E.; Huynh, B. H.; Stubbe, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2107-2108.
12. Sturgeon, B. E.; Burdi, D.; Chen, S.; Huynh, B.-H.; Edmondson. D. E.; Stubbe. J.; Hoffman, B. H. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7551-7557.
13. Willems, J. P.; Lee, H.-I.; Burdi, D.; Doan, P. E.; Stubbe. J.; Hoffman, B. M. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 9816-9824.
14. Riggs-Gelasco, P. J.; Shu. L.; Chen, S.; Burdi, D.; Huynh, B. H.; Que. L., Jr.; Stubbe, J. J. Am. Chem. Soc. 1998, 720, 849-860.
15. Bollinger, J. M., Jr.; Tong. W. H.; Ravi, N.; Huynh, B. H.; Etimondson, D. E.; Stubbe, J. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 8015-8023.
16. Andersson, M. E.; Höghom. M.; Rinaldo-Matthis. A.; Andersson, K. K.; Sjöberg, B.-M.; Nordlund, P. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 2346-2352.
17. Lange, S. J.; Que, L., Jr. Curr. Op. Chem. Biol. 1998, 2, 159-172.
18. Stubhe, J.; Riggs-Gelasco. P. Trends Biochem. Sci. 1998, 23, 438-443.
19. Ekiund, H.; Eriksson, M.; Uhlin. U.; Nordlund. P.; Logan. D. Biol. Chem. 1997, 378, 821-825.
20. Huynh, B. H.; Bollinger, J. M., Jr.: Edmondson, D. E. In Spectrascopic Methods in Bioinorganic Chemistry; ACS Symp. Ser. No. 692: Solomon. E. I., Hodgson. K. O., Eds.; American Chemical Society: Washington, DC, 1998; pp 403-422.
21. Moënne-Loccoz. P.; Baldwin, J.; Ley, B. A.: Loehr, T. M.: Bollinger, J. M., Jr. Biochemistry 1998, 37, 14659-14663.
22. Baldwin, J.; Krebs. C.; Ley, B. A.; Edmondson, D. E., Huynh, B. H.; Bollinger, J. M., Jr. Manuscript in preparation.
23. -1.
24. Nesheim, J. C.; Lipscomb. J. D. Biochemistry 1996, 35, 10240-10247.
25. Broadwater, J.; Achim, C.; Munck, E.; Fox. B. G. Biochemistry 1999, 18, 12197-12204.
26. Nordlund, P.: Sjoberg, B.-M.; Eklund, H. Nature 1990, 345, 593-598.
27. Logan, D. T.; Su. X.-D.; Åberg. A.; Regnstrom, K.; Hajdu. J.; Eklund, H.; Nordlund, P. Structure 1996, 4, 1053-1064.
28. Rosenzweig, A. C.; Frederick, C. A.; Lippard, S. J.; Nordlund, P. Nature 1993, 366, 537-543.
29. Rosenzweig, A. C.; Nordlund, P.; Takahara, P. M.; Frederick, C. A.; Lippard, S. J. Chem. Biol. 1995, 2, 409-418.
30. Elango, N.; Radhakrishnan, R.: Froland, W. A.; Wallar, B. J.; Earhart, C. A.; Lipscomb. J. D.; Ohlendorf, D. H. Protein Sci. 1997, 6, 556-568.
31. Lindqvist, Y.; Huang, W.; Schneider. G.: Shanklin. J. EMBO J. 1996, 15, 4081-4092.
32. Bollinger, J. M., Jr.; Krebs, C.: Vicol, A.; Chen, S.; Ley. B. A.; Edmondson. D. E.; Huynh. B. H. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 1094-1095.
33. Parkin, S. E.: Ctien. S.; Ley. B. A.; Mangravite, L., Edmondson, D. E.; Huynh. B. H.; Bullinger, J. M., Jr. Biochmistry 1998, 37, 1124-1130.
34. Nordlund, P.; Uhlin, U.: Westergren, C.: Joelson, T.; Sjöherg. B.-M.; Eklund, H. FEBS Lett. 1989, 258, 251-254.
35. Vicol, A.; Ley, B. A.; Bollmger, J. M., Jr. Unpublished results.
36. Otwinowski, Z.: Minor. W. Methods Enzynol. 1997, 276, 307-326.
37. Brünger. A. T. X-PLOR Version 3.1 Manual: A system for X-ray crystallography and NMR; Yale University Press: New Haven. CT. 1993.
38. Brünger, A. T.: Adams, P. D.; Clore, G. M.; DeLano, W. L.; Gros. P.; Grosse-Kunstleve, R. W.; Jiang. J.-S.: Kuszevvski, J.; Nilges, M.; Pannu, N. S.; Read, R. J.; Rice, L. M.; Simonson. T.; Warren, G. L. Acta Crystallogr. 1998, D54, 905-921.
39. Nordlund, P.: Eklund, H. J. Mol. Biol. 1993, 231, 123-164.
40. Jones, T. A.; Zou, J.-Y.: Cowan, S. W.; Kjeldgaard, M. Acta Crystallogr. 1991, A47, 110-119.
41. Laskowski, R. A. J. Appl. Crystallogr. 1993, 26, 283-291.
42. Esnouf, R. M. J. Mol. Graphics Model. 1997, 15, 132-134.
43. Kraulis, P. J. J. Appl. Crystallogr. 1991, 24, 946-950.
44. Dunietz, B. D.; Beachy, M. D.; Cao, Y.; Whittington, D. A.; Lippard, S. J.; Friesner, R. A. J. Am. Chem. Soc. In press.
45. Pulver, S. C.; Froland. W. A.: Lipscomb. J. D.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 387-395.
46. Pulver, S. C; Tong, W. H.; Bollinger, J. M., Jr.; Stubbe. J.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Snc. 1995, 117, 12664-12678.
47. Yang, Y.-S.; Baldwin, J.: Ley. B. A.: Bollinger. J. M., Jr.: Solomon, E. I. Unpublished results.
48. Sieghahn, P. E. M.: Crabtree. R. H. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3103-3113.
49. Brunold, T. C.: Tamura. N.; Kitajima, N.; Moro-oka, Y.; Solomon, E. I. J. Am, Chem. Soc. 1998, 120, 3074-3090.
50. Lee, S.-K.; Lipscomb, J. D. Biochemistry 1999, 38, 4423-4432.
51. Bender, C. J.: Sahlin, M.; Babcock, G. T.; Barry, B. A.; Chandrashekar, T. K.; Salowe, S. P.; Stubbe, J.; Lind.ström, B.; Petersson, L.; Ehrenberg, A.; Sjöberg. B.-M. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8076-8083.
52. Backes, G.: Sahlin, M.; Sjöberg, B.-M.; Loehr, T. M.; Sanders-Loehr, J. Biochemistry 1989, 28, 1923-1929.
53. Burdi, D.; Willems, J.-P.; Riggs-Gelasco. P.: Antholine, W. E.; Stubbe, J.: Hoffman, B. M. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 12910-12919.