Structural characterization of the fusion-active complex of severe acute respiratory syndrome (SARS) coronavirus

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 101, Issue 23, 2004, Pages 8709-8714

  Ingallinella, Paolo ^a   Bianchi, Elisabetta ^a   Finotto, Marco ^a   Cantoni, Giovanna ^a   Eckert, Debra M ^b,c   Supekar, Vinit M ^a   Bruckmann, Chiara ^a   Carfi, Andrea ^a   Pessi, Antonello ^a  

^a IRBM   (Italy)

^b MERCK RESEARCH LABORATORIES   (United States)

^c UNIVERSITY OF UTAH SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ENVELOPE PROTEIN; HYBRID PROTEIN;

ARTICLE; COMPLEX FORMATION; FUSION GENE; GEL PERMEATION CHROMATOGRAPHY; HEPTAD REPEAT; HOST CELL; MOLECULAR STABILITY; NONHUMAN; NUCLEOTIDE REPEAT; POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN DEGRADATION; PROTEIN DOMAIN; PROTEIN STABILITY; SARS CORONAVIRUS; STRUCTURE ANALYSIS; VIRUS MORPHOLOGY;

AMINO ACID SEQUENCE; BINDING SITES; HUMANS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PEPTIDE MAPPING; RECOMBINANT FUSION PROTEINS; REPETITIVE SEQUENCES, AMINO ACID; SARS VIRUS; SEQUENCE HOMOLOGY, AMINO ACID; VIRAL FUSION PROTEINS;

CORONAVIRUS; RNA VIRUSES; SARS CORONAVIRUS;

EID: 2942525214     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.0402753101     Document Type: Article

References (73)

1. Peiris, J. S., Yuen, K. Y., Osterhaus, A. D. & Stohr, K. (2003) N. Engl. J. Med. 349, 2431-2441.
2. Drosten, C., Gunther, S., Preiser, W., van der Werf, S., Brodt, H.-R., Becker, S., Rabenau, H., Panning, M., Kolesnikova, L., Fouchier, R. A. M., et al. (2003) N. Engl. J. Med. 348, 1967-1976.
3. Eickmann, M., Becker, S., Klenk, H. D., Doerr, H. W., Stadler, K., Censini, S., Guidotti, S., Masignani, V., Scarselli, M., Mora, M., et al. (2003) Science 302, 1504-1505.
4. Stadler, K., Masignani, V., Eickman, M., Becker, S., Abrugnani, S., Klenk, H.-D. & Rappuoli, R. (2003) Nat. Rev. Microbiol. 1, 209-218.
5. Peiris, J., Lai, S., Poon, L., Guan, Y., Yam, L., Lim, W., Nicholls, J., Yee, W., Yan, W. & Cheung, M. (2003) Lancet 361, 1319-1325.
6. Ksiazek, T. G., Erdman, D., Goldsmith, C. S., Zaki, S. R., Peret, T., Emery, S., Tong, S., Urbani, C., Comer, J. A., Lim, W., et al. (2003) N. Engl. J. Med. 348, 1953-1966.
7. Kuiken, T., Fouchier, R. A. M., Schutten, M., Rimmelzwaan, G. F., van Amerongen, G., van Riel, D., Laman, J. D., de Jong, T., van Doornum, G. & Lim, W. (2003) Lancet 362, 263-270.
8. Marra, M. A., Jones, S. J. M., Astell, C. R., Holt, R. A., Brooks-Wilson, A., Butterfield, Y. S. N., Khattra, J., Asano, J. K., Barber, S. A., Chan, S. Y., et al. (2003) Science 300, 1399-1404.
9. Rota, P. A., Oberste, M. S., Monroe, S. S., Nix, W. A., Campagnoli, R., Icenogle, J. P., Penaranda, S., Bankamp, B., Maher, K., Chen, M.-H., et al. (2003) Science 300, 1394-1399.
10. Holmes, K. V. (2001) in Fields Virology, eds. Fields, B., Howley, P. M., Griffin, D. E., Lamb, R. A., Martin, M. A., Roizman, B., Straus, S. E. & Knipe, D. M. (Lippincott Williams and Wilkins, New York), 4th Ed., Vol. 1, pp. 1187-1203.
11. Lai, M. M. C. & Holmes, K. V. (2001) Fields Virology (Lippincott Williams and Wilkins, New York), eds. Fields, B., Howley, P. M., Griffin, D. E., Lamb, R. A., Martin, M. A., Roizman, B., Straus, S. E. & Knipe, D. M. (Lippincott Williams and Wilkins, New York), 4th Ed., Vol. 1, pp. 1163-1185.
12. Delmas, B. & Laude, H. (1990) J. Virol. 64, 5367-5375.
13. Xiao, X., Chakraborti, S., Dimitrov, A. S., Gramatikoff, K. & Dimitrov, D. S. (2003) Biochem. Biophys. Res. Commun. 312, 1159-1164.
14. Taguchi, F. (1995) J. Virol. 69, 7260-7263.
15. Li, W., Moore, M. J., Vasilieva, N., Sui, J., Wong, S. K., Berne, M. A., Somasundaran, M., Sullivan, J. L., Luzuriaga, K., Greenough, T. C., et al. (2003) Nature 426, 450-454.
16. Wong, S. K., Li, W., Moore, M. J., Choe, H. & Farzan, M. (2003) J. Biol. Chem.
17. Dimitrov, D. S. (2003) Cell 115, 652-653.
18. de Groot, R. J., Luytjes, W., Horzinek, M. C., van der Zeijst, B. A., Spaan, W. J. & Lenstra, J. A. (1987) J. Mol. Biol. 196, 963-966.
19. Yoo, D. W., Parker, M. D. & Babiuk, L. A. (1991) Virology 180, 395-399.
20. de Groot, R. J., Van Leen, R. W., Dalderup, M. J., Vennema, H., Horzinek, M. C. & Spaan, W. J. (1989) Virology 171, 493-502.
21. Taguchi, F. (1993) J. Virol. 67, 1195-1202.
22. Bos, E. C. W., Heijnen, L., Luytjes, W. & Spaan, W. J. M. (1995) Virology 214, 453-463.
23. Hingley, S. T., Leparc-Goffart, I. & Weiss, S. R. (1998) J. Virol. 72, 1606-1609.
24. Stauber, R., Pfleiderera, M. & Siddell, S. (1993) J. Gen. Virol. 74, 183-191.
25. Bosch, B. J., van der Zee, R., de Haan, C. A. M. & Rottier, P. J. M. (2003) J. Virol. 77, 8801-8811.
26. Bullough, P. A., Hughson, F. M., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1994) Nature 371, 37-43.
27. Colman, P. M. & Lawrence, M. C. (2003) Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4, 309-319.
28. Chen, J., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 8967-8972.
29. Chan, D. C., Fass, D., Berger, J. M. & Kim, P. S. (1997) Cell 89, 263-273.
30. Weissenhorn, W., Wharton, S. A., Calder, L. J., Earl, P. L., Moss, B., Aliprandis, E., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1996) EMBO J. 15, 1507-1514.
31. Malashkevich, V. N., Chan, D. C., Chutkowski, C. T. & Kim, P. S. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 9134-9139.
32. Yang, Z. N., Mueser, T. C., Kaufman, J., Stahl, S. J., Wingfield, P. T. & Hyde, C. C. (1999) J. Struct. Biol. 126, 131-144.
33. Fass, D., Harrison, S. C. & Kim, P. S. (1996) Nat. Struct. Biol 3, 465-469.
34. Malashkevich, V. N., Schneider, B. J., McNally, M. L., Milhollen, M. A., Pang, J. X. & Kim, P. S. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 2662-2667.
35. Weissenhorn, W., Calder, L. J., Wharton, S. A., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95, 6032-6036.
36. Weissenhorn, W., Carfi, A., Lee, K. H., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1998) Mol. Cell 2, 605-616.
37. Kobe, B., Center, R. J., Kemp, B. E. & Poumbourios, P. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 4319-4324.
38. Malashkevich, V. N., Singh, M. & Kim, P. S. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 8502-8506.
39. Baker, K. A., Dutch, R. E., Lamb, R. A. & Jardetzky, T. S. (1999) Mol. Cell 3, 309-319.
40. Zhao, X., Singh, M., Malashkevich, V. N. & Kim, P. S. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97, 14172-14177.
41. Eckert, D. M. & Kim, P. S. (2001) Annu. Rev. Biochem. 70, 778-810.
42. Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1998) Cell 95, 871-874.
43. Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (2000) Annu. Rev. Biochem. 69, 531-569.
44. Chen, Y. H., Yang, J. T. & Chau, K. H. (1974) Biochemistry 13, 3350-3359.
45. Singh, M., Berger, B. & Kim, P. S. (1999) J. Mol. Biol. 290, 1031-1041.
46. Wolf, E., Kim, P. S. & Berger, B. (1997) Protein Sci. 6, 1179-1189.
47. Harbury, P. B., Kim, P. S. & Alber, T. (1994) Nature 371, 80-83.
48. Harbury, P. B., Zhang, T., Kim, P. S. & Alber, T. (1993) Science 262, 1401-1407.
49. Zhu, B. Y., Zhou, N. E., Semchuk, P. D., Kay, C. M. & Hodges, R. S. (1992) Int. J. Pept. Protein Res. 40, 171-179.
50. Eckert, D. M., Malashkevich, V. N. & Kim, P. S. (1998) J. Mol. Biol. 284, 859-865.
51. Suzuki, K., Hiroaki, H., Kohda, D. & Tanaka, T. (1998) Protein Eng. 11, 1051-1055.
52. Weissenhorn, W., Dessen, A., Harrison, S. C., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1997) Nature 387, 426-430.
53. Luo, Z. & Weiss, S. E. (1998) Virology 244, 483-494.
54. Lu, M., Blacklow, S. C. & Kim, P. S. (1995) Nat. Struct. Biol. 2, 1075-1082.
55. Carr, C. M. & Kim, P. S. (1993) Cell 73, 823-832.
56. Lee, N., Hui, D., Wu, A., Chan, P., Cameron, P., Joynt, G. M., Ahuja, A., Yung, M. Y., Leung, C. B., To, K. F., et al. (2003) N. Engl. J. Med. 348, 1986-1994.
57. Tsang, K. W., Ho, P. L., Ooi, G. C., Yee, W. K., Wang, T., Chan-Yeung, M., Lam, W. K., Seto, W. H., Yam, L. Y., Cheung, T. M., et al. (2003) N. Engl. J. Med. 348, 1977-1985.
58. Poutanen, S. M., Low, D. E., Henry, B., Finkelstein, S., Rose, D., Green, K., Tellier, R., Draker, R., Adachi, D., Ayers, M., et al. (2003) N. Engl. J. Med. 348, 1995-2005.
59. Chen, L., Gorman, J. J., McKimm-Breschkin, J., Lawrence, L. J., Tulloch, P. A., Smith, B. J., Colman, P. M. & Lawrence, M. C. (2001) Structure (London) 9, 255-266.
60. Root, M. J., Kay, M. S. & Kim, P. S. (2001) Science 291, 884-888.
61. Louis, J. M., Bewley, C. A. & Clore, G. M. (2001) J. Biol. Chem. 276, 29485-29489.
62. Bewley, C. A., Louis, J. M., Ghirlando, R. & Clore, G. M. (2002) J. Biol. Chem. 277, 14238-14245.
63. Lombardi, S., Massi, C., Indino, E., La Rosa, C., Mazzetti, P., Falcone, M. L., Rovero, P., Fissi, A., Pieroni, O., Bandecchi, P., et al. (1996) Virology 220, 274-284.
64. Eckert, D. M. & Kim, P. S. (2001) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 98, 11187-11192.
65. Eckert, D. M., Malashkevich, V. N., Hong, L. H., Carr, P. A. & Kim, P. S. (1999) Cell 99, 103-115.
66. Judice, J. K., Tom, J. Y., Huang, W., Wrin, T., Vennari, J., Petropoulos, C. J. & McDowell, R. S. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94, 13426-13430.
67. Joshi, S. B., Dutch, R. E. & Lamb, R. A. (1998) Virology 248, 20-34.
68. Lambert, D. M., Barney, S., Lambert, A. L., Guthrie, K., Medinas, R., Davis, D. E., Bucy, T., Erickson, J., Merutka, G. & Petteway, S. R., Jr. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 2186-2191.
69. Rapaport, D., Ovadia, M. & Shai, Y. (1995) EMBO J. 14, 5524-5531.
70. Yao, Q. & Compans, R. W. (1996) Virology 223, 103-112.
71. LaBonte, J., Lebbos, J. & Kirkpatrick, P. (2003) Nat. Rev. Drug Discovery 2, 345-346.
72. Liu, S., Xiao, G., Chen, Y., He, Y., Niu, J., Escalante, C. R., Xiong, H., Farmar, J., Debnath, A. S., Tien, P. & Jiang, S. (2004) Lancet 363, 938-947.
73. Tripet, B., Howard, M. W., Jobling, M., Holmes, R. K., Holmes, K. V. & Hodges, R. S. (2004) J. Biol. Chem. 279, 20836-20849.