Structural characterization of the SARS-coronavirus spike S fusion protein core

Journal of Biological Chemistry

Volumn 279, Issue 20, 2004, Pages 20836-20849

  Tripet, Brian ^a   Howard, Megan W ^a   Jobling, Michael ^a   Holmes, Randall K ^a   Holmes, Kathryn V ^a   Hodges, Robert S ^a  

^a UNIVERSITY OF COLORADO   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL ORGANS; CARBOHYDRATES; CELL MEMBRANES; CHEMICAL BONDS; CONFORMATIONS; MOLECULAR STRUCTURE; VIRUSES;

CONFORMATIONAL CHANGES; DISULFIDE BRIDGES; ECTODOMAIN; FUSION PROTEINS;

PROTEINS;

GLYCOPROTEIN; HYBRID PROTEIN; PROTEIN S; SPIKE S GLYCOPROTEIN; UNCLASSIFIED DRUG; VIRUS PROTEIN;

ALPHA HELIX; ANIMAL CELL; ARTICLE; COMPLEX FORMATION; CONFORMATIONAL TRANSITION; DISULFIDE BOND; HEPTAD REPEAT REGION; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN DOMAIN; PROTEIN ISOLATION; PROTEIN STRUCTURE; SARS CORONAVIRUS; SEVERE ACUTE RESPIRATORY SYNDROME; TANDEM REPEAT; VIRUS CELL INTERACTION;

AMINO ACID SEQUENCE; BASE SEQUENCE; CIRCULAR DICHROISM; DNA PRIMERS; ESCHERICHIA COLI; HEMAGGLUTININS, VIRAL; MEMBRANE GLYCOPROTEINS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; MOLECULAR WEIGHT; PEPTIDE FRAGMENTS; PROTEIN CONFORMATION; RESTRICTION MAPPING; SARS VIRUS; VIRAL ENVELOPE PROTEINS;

ANIMALIA; CORONAVIRUS; RNA VIRUSES; SARS CORONAVIRUS;

EID: 2442698802     PISSN: 00219258     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1074/jbc.M400759200     Document Type: Article

References (68)

1. Drosten, C., Gunther, S., Preiser, W., van der Werf, S., Brodt, H. R., Becker, S., Rabenau, H., Panning, M., Kolesnikova, L., Fouchier, R. A., Berger, A., Burguiere, A. M., Cinatl, J., Eickmann, M., Escriou, N., Grywna, K., Kramme, S., Manuguerra, J. C., Muller, S., Rickerts, V., Sturmer, M., Vieth, S., Klenk, H. D., Osterhaus, A. D., Schmitz, H. & Doerr, H. W. (2003) N. Engl. J. Med. 348, 1967-1976
2. Ksiazek, T. G., Erdman, D., Goldsmith, C. S., Zaki, S. R., Peret, T., Emery, S., Tong, S., Urbani, C., Comer, J. A., Lim, W., Rollin, P. E., Dowell, S. F., Ling, A. E., Humphrey, C. D., Shieh, W. J., Guarner, J., Paddock, C. D., Rota, P., Fields, B., DeRisi, J., Yang, J. Y., Cox, N., Hughes, J. M., LeDuc, J. W., Bellini, W. J. & Anderson, L. J. (2003) N. Engl. J. Med. 348, 1953-1966
3. Peiris, J. S., Lai, S. T., Poon, L. L., Guan, Y., Yam, L. Y., Lim, W., Nicholls, J., Yee, W. K., Yan, W. W., Cheung, M. T., Cheng, V. C., Chan, K. H., Tsang, D. N., Yung, R. W., Ng, T. K. & Yuen, K. Y. (2003) Lancet 361, 1319-1325
4. Poon, L. L., Wong, O. K., Luk, W., Yuen, K. Y., Peiris, J. S. & Guan, Y. (2003) Clin. Chem. 49, 953-955
5. El-Sahly, H. M., Atmar, R. L., Glezen, W. P. & Greenberg, S. B. (2000) Clin. Infect. Dis. 31, 96-100
6. Folz, R. J. & Elkordy, M. A. (1999) Chest 115, 901-905
7. Holmes, K. V. (2001) in Fields Virology (Knipe, D. M. & Howley, P. M., eds) 4th Ed., pp. 1187-1203, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia
8. McIntosh, K. (1974) Curr. Top. Microbiol. Immunol. 63, 85-129
9. Martina, B. E., Haagmans, B. L., Kuiken, T., Fouchier, R. A., Rimmelzwaan, G. F., Van Amerongen, G., Peiris, J. S., Lim, W. & Osterhaus, A. D. (2003) Nature 425, 915
10. Guan, Y., Zheng, B. J., He, Y. Q., Liu, X. L., Zhuang, Z. X., Cheung, C. L., Luo, S. W., Li, P. H., Zhang, L. J., Guan, Y. J., Butt, K. M., Wong, K. L., Chan, K. W., Lim, W., Shortridge, K. F., Yuen, K. Y., Peiris, J. S. & Poon, L. L. (2003) Science 302, 276-278
11. Bos, E. C., Heijnen, L., Luytjes, W. & Spaan, W. J. (1995) Virology 214, 453-463
12. De Groot, R. J., Van Leen, R. W., Dalderup, M. J., Vennema, H., Horzinek, M. C. & Spaan, W. J. (1989) Virology 171, 493-502
13. Luo, Z. & Weiss, S. R. (1998) Virology 244, 483-494
14. Spaan, W., Cavanagh, D. & Horzinek, M. C. (1988) J. Gen. Virol. 69, 2939-2952
15. Frana, M. F., Behnke, J. N., Sturman, L. S. & Holmes, K. V. (1985) J. Virol. 56, 912-920
16. Sturman, L. S., Ricard, C. S. & Holmes, K. V. (1985) J. Virol. 56, 904-911
17. Cavanagh, D., Davis, P. J., Darbyshire, J. H. & Peters, R. W. (1986) J. Gen. Virol. 67, 1435-1442
18. Taguchi, F. (1995) J. Virol. 69, 7260-7263
19. Bosch, B. J., van der Zee, R., de Haan, C. A. & Rottier, P. J. (2003) J. Virol. 77, 8801-8811
20. Luo, Z., Matthews, A. M. & Weiss, S. R. (1999) J. Virol. 73, 8152-8159
21. Matsuyama, S. & Taguchi, F. (2002) J. Virol. 76, 11819-11826
22. Taguchi, F. & Matsuyama, S. (2002) J. Virol. 76, 950-958
23. Zelus, B. D., Schickli, J. H., Blau, D. M., Weiss, S. R. & Holmes, K. V. (2003) J. Virol. 77, 830-840
24. Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1998) Cell 95, 871-874
25. Baker, K. A., Dutch, R. E., Lamb, R. A. & Jardetzky, T. S. (1999) Mol. Cell 3, 309-319
26. Chan, D. C., Fass, D., Berger, J. M. & Kim, P. S. (1997) Cell 89, 263-273
27. Caffrey, M., Cai, M., Kaufman, J., Stahl, S. J., Wingfield, P. T., Covell, D. G., Gronenborn, A. M. & Clore, G. M. (1998) EMBO J. 17, 4572-4584
28. Fass, D., Harrison, S. C. & Kim, P. S. (1996) Nat. Struct. Biol. 3, 465-469
29. Kobe, B., Center, R. J., Kemp, B. E. & Poumbourios, P. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 96, 4319-4324
30. Malashkevich, V. N., Chan, D. C., Chutkowski, C. T. & Kim, P. S. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 95, 9134-9139
31. Malashkevich, V. N., Schneider, B. J., McNally, M. L., Milhollen, M. A., Pang, J. X. & Kim, P. S. (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 96, 2662-2667
32. Weissenhorn, W., Dessen, A., Harrison, S. C., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1997) Nature 387, 426-430
33. Weissenhorn, W., Carfi, A., Lee, K. H., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1998) Mol. Cell 2, 605-616
34. Tan, K., Liu, J., Wang, J., Shen, S. & Lu, M. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 94, 12303-12308
35. Yang, Z. N., Mueser, T. C., Kaufman, J., Stahl, S. J., Wingfield, P. T. & Hyde, C. C. (1999) J. Struct. Biol. 126, 131-144
36. Zhao, X., Singh, M., Malashkevich, V. N. & Kim, P. S. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 97, 14172-14177
37. Bewley, C. A., Louis, J. M., Ghirlando, R. & Clore, G. M. (2002) J. Biol. Chem. 277, 14238-14245
38. Ghosh, J. K., Peisajovich, S. G., Ovadia, M. & Shai, Y. (1998) J. Biol. Chem. 273, 27182-27190
39. Medinas, R. J., Lambert, D. M. & Tompkins, W. A. (2002) J. Virol. 76, 9079-9086
40. Pinon, J. D., Kelly, S. M., Price, N. C., Flanagan, J. U. & Brighty, D. W. (2003) J. Virol. 77, 3281-3290
41. Pritsker, M., Jones, P., Blumenthal, R. & Shai, Y. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 95, 7287-7292
42. Rapaport, D., Ovadia, M. & Shai, Y. (1995) EMBO J. 14, 5524-5531
43. Tomasi, M., Pasti, C., Manfrinato, C., Dallocchio, F. & Bellini, T. (2003) FEBS Lett. 536, 56-60
44. Yang, C. & Compans, R. W. (1997) J. Virol. 71, 8490-8496
45. Zhou, G., Ferrer, M., Chopra, R., Kapoor, T. M., Strassmaier, T., Weissenhorn, W., Skehel, J. J., Oprian, D., Schreiber, S. L., Harrison, S. C. & Wiley, D. C. (2000) Bioorg. Med. Chem. 8, 2219-2227
46. Young, J. K., Hicks, R. P., Wright, G. E. & Morrison, T. G. (1997) Virology 238, 291-304
47. Tripet, B., Wagschal, K., Lavigne, P., Mant, C. T. & Hodges, R. S. (2000) J. Mol. Biol. 300, 377-402
48. Tabor, S. & Richardson, C. C. (1985) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 82, 1074-1078
49. Zelus, B. D., Wessner, D. R., Williams, R. K., Pensiero, M. N., Phibbs, F. T., deSouza, M., Dveksler, G. S. & Holmes, K. V. (1998) J. Virol. 72, 7237-7244
50. Hayes, D. B., Laue, T. & Philo, J. (2003) Sedimentation Interpretation Program, Version 1.08, University of New Hampshire
51. Johnson, M. L., Correia, J. J., Yphantis, D. A. & Halvorson, H. R. (1981) Biophys. J. 36, 575-588
52. Semchuk, P. D., Monera, O. D., Kondejewski, L. H., Gannon, C., Daniels, L., Wilson, I. & Hodges, R. S. (1996) in Peptides: Chemistry, Structure and Biology (Kaumaya, P. T. P. & Hodges, R. S., eds) pp. 73-74, Mayflower Scientific Ltd., UK
53. Tripet, B. & Hodges, R. S. (2001) in Peptides: The Wave of the Future (Lebl, M. & Houghten, R. A., eds) pp. 365-366, American Peptide Society, San Diego, CA
54. Chen, L., German, J. J., McKimm-Breschkin, J., Lawrence, L. J., Tulloch, P. A., Smith, B. J., Colman, P. M. & Lawrence, M. C. (2001) Structure 9, 255-266
55. Yang, X., Farzan, M., Wyatt, R. & Sodroski, J. (2000) J. Virol. 74, 5716-5725
56. Yang, X., Florin, L., Farzan, M., Kolchinsky, P., Kwong, P. D., Sodroski, J. & Wyatt, R. (2000) J. Virol. 74, 4746-4754
57. Matthews, J. M., Young, T. F., Tucker, S. P. & Mackay, J. P. (2000) J. Virol. 74, 5911-5920
58. Weissenhorn, W., Calder, L. J., Wharton, S. A., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 95, 6032-6036
59. Gibbons, D. L., Ahn, A., Chatterjee, P. K. & Kielian, M. (2000) J. Virol. 74, 7772-7780
60. Bullough, P. A., Hughson, F. M., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1994) Nature 371, 37-43
61. Carr, C. M., Chaudhry, C. & Kim, P. S. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 94, 14306-14313
62. Watowich, S. J., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1994) Structure 2, 719-731
63. Wilson, I. A., Skehel, J. J. & Wiley, D. C. (1981) Nature 289, 366-373
64. Harbury, P. B., Zhang, T., Kim, P. S. & Alber, T. (1993) Science 262, 1401-1407
65. Kohn, W. D., Kay, C. M. & Hodges, R. S. (1998) J. Mol. Biol. 283, 993-1012, and references therein
66. Holtzer, M. E., Lovett, E. G., d'Avignon, D. A. & Holtzer, A. (1997) Biophys. J. 73, 1031-1041
67. Zhou, N. E., Kay, C. M. & Hodges, R. S. (1992) J. Biol. Chem. 267, 2664-2670
68. Zhou, N. E., Zhu, B. Y., Kay, C. M. & Hodges, R. S. (1992) Biopolymers 32, 419-426