Water dynamics in the hydration layer around proteins and micelles

Chemical Reviews

Volumn 105, Issue 9, 2005, Pages 3197-3219

  Bagchi, Biman ^a,b  

^a INDIAN INSTITUTE OF SCIENCE   (India)

^b JAWAHARLAL NEHRU CENTRE FOR ADVANCED SCIENTIFIC RESEARCH   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHEMICAL RELAXATION; COMPUTER SIMULATION; HYDRATION; HYDROPHOBICITY; MATHEMATICAL MODELS; MICELLES; MOLECULAR SPECTROSCOPY; MOLECULAR VIBRATIONS; PROTEINS; SURFACE PHENOMENA; WATER;

HYDRATION LAYER; SOLVATION DYNAMICS; VIBRATIONAL RELAXATION; WATER DYNAMICS;

MOLECULAR DYNAMICS;

DNA; PROTEIN; WATER;

ANIMAL; CHEMISTRY; HUMAN; MICELLE; REVIEW; SOLUBILITY; SPECTROSCOPY;

ANIMALS; DNA; HUMANS; MICELLES; PROTEINS; SOLUBILITY; SPECTRUM ANALYSIS; WATER;

EID: 25444514520     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr020661+     Document Type: Review

References (282)

1. See papers in Hydration processes in biological and macromolecular systems. Faraday Discuss. 1996, 103.
2. Pratt, L. R.; Pohorille, A. Chem. Rev. 2002, 102, 2671.
3. Benjamin, I. Chem. Rev. 1996, 96, 1449.
4. Nandi, N.; Bhattacharyya, K.; Bagchi, B. Chem. Rev. 2000, 100, 2013.
5. Halle, B. Philos. Trans. R. Soc. London B 2004, 359, 1207.
6. Cho, C. H.; Singh, S.; Robinson, G. W. Faraday Discuss. 1996, 103, 19.
7. Bagchi, B. Annu. Rep. Prog. Chem. Sect. C 2003, 99, 127.
8. Bagchi, B.; Biswas, R. Adv. Chem. Phys. 1999, 109, 207.
9. Biswas, R.; Bagchi, B. Acc. Chem. Res. 1998, 31, 181.
10. Heitele, H. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1993, 32, 359.
11. Bagchi, B.; Oxtoby, D. W.; Fleming, G. R. Chem. Phys. 1984, 86, 257.
12. van der Zwan, G.; Hynes, J. T. J. Phys. Chem. 1985, 89, 4181.
13. Maroncelli, M. J. Mol. Liq. 1993, 57, 1.
14. Friedman, H. L.; Reineri, F. O.; Resat, H. In Molecular Liquids; Teixeira-Diaz, J., Ed.; NATO-ASI Series; Kluwer Academic Publishers: Amsterdam, 1993; p 183.
15. Stratt, R. M.; Maroncelli, M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12981.
16. Fleming, G. R.; Wolynes, P. G. Phys. Today 1990, May, 36.
17. Barbara, P. F.; Jarzeba, W. Adv. Photochem. 1990, 15, 1.
18. Barbara, P. F.; Jarzeba, W. Acc. Chem. Res. 1988, 21, 195.
19. Maroncelli, M.; MacInnis, J.; Fleming, G. R. Science 1989, 243, 1674.
20. Bagchi, B. Annu. Rev. Phys. Chem. 1989, 40, 115.
21. Rossky, P. J.; Simon, J. D. Nature (London) 1994, 370, 263.
22. Fleming, G. R.; Cho, M. Annu. Rev. Phys. Chem. 1996, 47, 109.
23. Fleming, G. R.; Joo, T.; Cho, M. Adv. Chem. Phys. 1997, 101, 141.
24. Rossky, P. J.; Schnitker, J. J. Phys. Chem. 1988, 92, 4277.
25. Pal, S. K.; Peon, J.; Bagchi, B.; Zewail, A. H. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 12376.
26. Bagchi, B.; Chandra, A. Adv. Chem. Phys. 1991, 80, 1.
27. Bagchi, B.; Biswas, R. Adv. Chem. Phys. 1999, 109, 207.
28. Bhattacharyya, K.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 10603.
29. Nandi, N.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. 1996, 100, 13914.
30. Gregory, R. B., Ed. Protein-Solvent Interactions; Marcel Dekker: New York, 1995.
31. Robinson, G. W., Singh, S. B., Evans, M. W., Ed. Water in Biology, Chemistry and Physics; World Scientific: Singapore, 1996; Chapter 7.
32. Teeter, M. M. Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 577.
33. Neidle, S. Proc. Med. Chem. 1979, 16, 151.
34. Chaires, J. B.; Herrera, J. E.; Waring, M. Biochemistry 1990, 29, 2538.
35. Janin, J. Structure 1999, 7, R278.
36. Mukherjee, A.; Bagchi, B. Chem. Phys. Lett. 2005, 404, 409.
37. Otting, G.; Liepinsh, E.; Wüthrich, K. Science 1991, 254, 974.
38. Modig, K.; Liepinsch, E.; Otting, G.; Halle, B. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 102.
39. Nandi, N.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 10954.
40. http://romano.physics.wisc.edu/winokur/SNS/SNS_wrkshp.htm#a08.
41. Bruce, C. D.; Senapati, S.; Berkowitz, M. L.; Perera, L.; Forbes, M. D. E. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 10902.
42. Mukherjee, A.; Bagchi, B. Phys. Chem. Commun. 2003, 6, 28.
43. Balasubramanian, S.; Pal, S.; Bagchi, B. Phys. Rev. Lett. 2002, 89, 115505.
44. Pal, S.; Balasubramanian, S.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 5194.
45. Pal, S.; Balasubramanian, S.; Bagchi, B. Phys. Rev. E 2003, 67, 061502.
46. Luzar, A.; Chandler, D. Phys. Rev. Lett. 1996, 76, 928.
47. Luzar, A.; Chandler, D. Nature (London) 1996, 379, 53.
48. Luzar, A. J. Chem. Phys. 2000, 113, 10663.
49. Chandra, A. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 768.
50. Tarek, M.; Tobias, D. J. Phys. Rev. Lett. 2002, 88, 138101-1.
51. Tarek, M.; Tobias, D. J. Biophys. J. 2000, 79, 3244.
52. Rahman, A.; Stillinger, F. H. J. Chem. Phys. 1971, 55, 3336.
53. Bandyopadhyay, S.; Chakraborty, S.; Balasubramanian, S.; Pal, S.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. B. 2004, 108, 12608.
54. Stillinger, F. H. Adv. Chem. Phys. 1975, 31, 1.
55. Rapaport, D. C. Mol. Phys. 1983, 50, 1151.
56. Starr, F. W.; Nielsen, J. K.; Stanley, H. E. Phys. Rev. E 2000, 62, 579.
57. Woutersen, S.; Emmerichs, U.; Bakker, H. J. Science 1997, 278, 658.
58. Roy, S.; Bagchi, B. J. Chem. Phys. 1993, 99, 9938.
59. Heinzinger; Palinkas, K. In The Chemical Physics of Solvation; Dogonadze, R. R., et. al., Eds.; Elsevier: New York, 1985; Vol. 1.
60. The simulation of bulk water contained 256 molecules of the SPC/E type at a temperature of 300 K and a density of 1.02 g/cm3.
61. Barthel, J.; Buchner, R. Pure. Appl. Chem. 1991, 63, 1473.
62. Kindt, J. T.; Schmuttenmaer, C. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 10373.
63. Hasted, J. B.; Husain, S. K.; Frescura, F. A. M.; Birch, R. Chem. Phys. Lett. 1985, 118, 622.
64. Grant, E. H.; McClean, V. E. R.; Nightingale, N. R. V.; Sheppard, R. J.; Chapman, M. J. Bioelectromagnetics 1986, 7, 151.
65. Barthel, J.; Buchner, R.; Eberspacher, P. N.; Musterer, M.; Stauber, J.; Wurm, B. J. Mol. Liq. 1998, 78, 83.
66. Barr, C.; Buchner, R.; Kunz, W. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 2906.
67. Palase, S.; Schilling, L.; Miller, R. J. D.; Staver, R.; Lotshaw, W. T. J. Phys. Chem. 1994, 98, 6308.
68. Guillot, B. J. Chem. Phys. 1991, 95, 1543.
69. Guillot, B. J. Mol. Liq. 2002, 101, 219.
70. Neumann, M. J. Chem. Phys. 1985, 82, 5663.
71. Neumann, M. J. Chem. Phys. 1988, 85, 1567.
72. Pollack, E. L.; Alder, B. J. Annu. Rev. Phys. Chem. 1981, 32, 311.
73. Neumann, M.; Steinhauser, O. Chem. Phys. Lett. 1983, 102, 508.
74. Neumann, M.; Steinhauser, O. Chem. Phys. Lett 1984, 106, 563.
75. Neumann, M. Chem. Phys. 1983, 79, 465.
76. Neumann, M.; Steinhauser, O.; Pawley, G. S. Mol. Phys. 1984, 52, 97.
77. Rick, S. W.; Stuart, S. J.; Berne, B. J. J. Chem. Phys. 1994, 101, 6141.
78. Benjamin, I. Chem. Phys. Lett. 1998, 287, 480.
79. Ellison, W. J.; Lamakaouchi, K.; Moreau, J.-M. J. Mol. Liq. 1996, 68, 171.
80. Chandra, A.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. 1990, 94, 3152.
81. Kirkwood, J. G.; Shumaker, J. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1952, 38, 855.
82. Kirkwood, J. G.; Shumaker, J. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1952, 38, 863.
83. Hasted, J. B.; Husain, S. K.; Frescura, F. A. M.; Birch, J. R. Infrared Phys. 1987, 27, 11.
84. Afsar, M. N.; Hasted, J. B. Infrared Phys. 1978, 18, 835.
85. Hale, G. M.; Querry, M. R. Appl. Opt. 1973, 12, 555.
86. Bertie, J. E.; Ahmed, K. M.; Eysel, H. H. J. Phys. Chem. 1989, 93, 2210.
87. Nandi, N.; Roy, S.; Bagchi, B. J. Chem. Phys. 1995, 102, 1390.
88. Deak, J. C.; Reha, S. T.; Iwaki, L. K.; Dlott, D. D. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 4866.
89. Wang, Z. H.; Pakoulev, A.; Pang, Y.; Dlott, D. D. Chem. Phys. Lett. 2000, 378, 281.
90. Rey, R.; Møller, K. B.; Hynes, J. T. Chem. Rev. 2004, 104, 1915.
91. Møller, K. B.; Rey, R.; Hynes, J. T. Femtochemistry and Femtobiology; Martin, M. M., Hynes, J. T., Eds.; Elsevier: Paris, 2004; p 177.
92. Rey, R.; Møller, K. B.; Hynes, J. T. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 11993.
93. Rey, R.; Hynes, J. T. J. Chem. Phys. 1996, 104, 2356.
94. Elsaesser, T., Bakker, H. J., Eds. Ultrafast H-Bonding Dynamics and Proton-Transfer Processes in the Condensed Phase; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 2002.
95. Nienhauys, H.; Woutersen, S.; Santen, R. A.; Bakker, H. J. J. Chem. Phys. 1999, 111, 1494.
96. Lock, A. J.; Bakker, H. J. J. Chem. Phys. 2002, 117, 1708.
97. Ohmine, I.; Tanaka, H. Chem. Rev. 1993, 93, 2545.
98. Ohmine, I. J. Phys. Chem. 1995, 99, 6767.
99. Ohmine, I.; Saito, S. Acc. Chem. Res. 1999, 32, 741.
100. Nibbering, E. T. J.; Elsaesser, T. Chem. Rev. 2004, 104, 1887.
101. Elsaesser, T.; Heyme, K.; Huse, N.; Nibbering, E. T. J. Femtochemistry and Femtobiology; Martin, M. M., Hynes, J. T., Eds.; Elsevier: Paris, 2004; p 157.
102. Lawrence, C. P.; Skinner, J. L. J. Chem. Phys. 2003, 118, 264.
103. Oxtoby, D. W. Adu. Chem. Phys. 1979, 40, 1.
104. Kubo, R. J. Math. Phys. 1963, 4, 174.
105. Jimenez, R.; Fleming, G. R.; Kumar, P. V.; Maroncelli, M. Nature (London) 1994, 369, 471.
106. Maroncelli, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1988, 89, 5044.
107. Hsu, C. P.; Song, X.; Marcus, R. A. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 2546.
108. Silva, C.; Walhout, P. K.; Yokoyama, K.; Barbara, P. Phys. Rev. Lett. 1998, 80, 1086.
109. Alfano, J. C.; Walhout, P. K.; Kimura, Y.; Barbara, P. F. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5996.
110. Kummrow, A.; Emde, M. F.; Baltuska, A.; Pshenichnikov, M. S.; Wiersma, D. A. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 4172.
111. Bratos, S.; Leickman, J.-C. Chem. Phys. Lett. 1998, 261, 117.
112. Kimura, Y.; Alfano, J. C.; Walhout, P. K.; Barbara, P. F. J. Phys. Chem. 1994, 98, 3450.
113. Jarzeba, W.; Walker, G. C.; Johnson, A. E.; Kahlow, M. A.; Barbara, P. F. J. Phys. Chem. 1998, 92, 7039.
114. Zolotov, B.; Gan, A.; Feinberg, B. D.; Huppert, D. Chem. Phys. Lett. 1997, 265, 418.
115. Schwartz, B.; Rossky, P. J. J. Chem. Phys. 1994, 101, 6902.
116. Schwartz, B.; Rossky, P. J. J. Chem. Phys. 1994, 101, 6917.
117. Schwartz, B.; Rossky, P. J. Phys. Rev. Lett. 1994, 72, 3282.
118. Barnett, R. B.; Landman, U.; Nitzan, A. J. Chem. Phys. 1989, 90, 4413.
119. Bernett, R. B.; Landman, U.; Nitzan, A. Phys. Rev. Lett. 1991, 67, 1011.
120. Neria, E.; Nitzan, A. J. Chem. Phys. 1989, 90, 4413.
121. Staib, A.; Borgis, D. J. Chem. Phys. 1995, 103, 2642.
122. Muino, P. L.; Callis, P. R. J. Chem. Phys. 1994, 100, 4093.
123. Roy, S.; Bagchi, B. J. Chem. Phys. 1993, 99, 9938.
124. Roy, S.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. 1994, 98, 9207.
125. Cho, M.; Yu, J. Y.; Joo, T.; Nagasawa, Y.; Passino, S. A.; Fleming, G. R.; J. Phys. Chem. 1996, 100, 11944.
126. Passino, S.; Nagasawa, Y.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1997, 107, 6094.
127. de Boeij, W. P.; Pshenichnikov, M. S.; Wiersma, D. A. Annu. Rev. Phys. Chem. 1998, 49, 99.
128. Lang, M. J.; Jordanides, X. J.; Song, X.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1999, 110, 5884.
129. Jordanides, X. J.; Lang, M. J.; Song, X.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 7995.
130. Song, X.; Chandler, D. J. Chem. Phys. 1998, 108, 2594.
131. Pethig, R. Annu. Rev. Phys. Chem. 1992, 43, 177.
132. 19. Cheng, X.; Schoenborn, B. P. J. Mol. Biol. 1991, 220, 381.
133. Nandi, N.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 8217.
134. Cohn, E. J. Annu. Rev. Biochem. 1935, 4, 93.
135. Oncley, J. L. Chem. Rev. 1942, 30, 433.
136. Jacobson, B. J. Am. Chem. Soc. 1955, 77, 2919.
137. Dachwitz, E.; Parak, F.; Stockhausen, M. Ber. Bunsen-Ges. Phys. Chem. 1989, 93, 1454.
138. Boresch, S.; Höchtl, P.; Steinhauser, O. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 8743.
139. Mashimo, S.; Kuwabara, S.; Yagihara, S.; Higasi, K. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6337.
140. Mittleman, D. M.; Nuss, M. C.; Colvin, V. L. Chem. Phys. Lett. 1997, 275, 332.
141. D'Angelo, M.; Fioretto, D.; Onori, G.; Palmieri, L.; Santucci, A. Phys. Rev. E 1996, 54, 993.
142. D'Angelo, M.; Fioretto, D.; Onori, G.; Palmieri, L.; Santucci, A. Phys. Rev. E 1995, 52, 4620.
143. Wüthich, K.; Billeter, M.; Güntert, P.; Luginbühl, P.; Riek, R.; Wider, G. Faraday Discuss. 1996, 103, 245.
144. Halle, B.; Andersson, T.; Forsen, S.; Lindman, B. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 500.
145. Halle, B. Mol. Phys. 1984, 53, 1427.
146. Halle, B. Mol. Phys. 1985, 56, 209.
147. Denisov, V. P.; Jonsson, B.-H.; Halle, B. Nat. Struct. Biol. 1999, 6, 253.
148. Danisov, V. P.; Halle, B. Faraday Discuss. 1996, 103, 227.
149. Koenig, S. H.; Schillinger, W. E. J. Biol. Chem. 1969, 244, 3283.
150. Polnaszek, C. F.; Bryant, R. G. J. Chem. Phys. 1984, 81, 4038.
151. Polnaszek, C. F.; Bryant, R. G. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 428.
152. Bryant, R. G. Annu. Rev. Biomol. Struct. 1996, 25, 29.
153. Bryant, R. G. Annu. Rev. Phys. Chem. 1978, 29, 167.
154. Halle, B. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12372.
155. Wong, M.; Thomas, J. K.; Novak, T. J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 4730.
156. Cola, D. D.; Deriu, A.; Sampoli, M.; Torcini, A. J. Chem. Phys. 1996, 104, 4223.
157. Russo, D.; Baglioni, P.; Peroni, E.; Teixeira, J. Chem. Phys. 2003, 292, 235.
158. Russo, D.; Hura, G.; Head-Gordon, T. Biophys. J. 2004, 86, 1852.
159. Tarek, M.; Neumann, D. A.; Tobias, D. J. Chem. Phys. 2003, 292, 435.
160. Paciaroni, A.; Orecchini, A.; Cinelli, S.; Onori, G.; Lechner, R. E.; Pieper, J. Chem. Phys. 2003, 292, 397.
161. Haywar, J. A.; Daniel, R. M.; Finney, J. L.; Smith, J. C. Chem. Phys. 2003, 292, 389.
162. Harpham, M. R.; Ladanyi, B. M.; Levinger, N. E.; Herwig, K. W. J. Chem. Phys. 2004, 121, 7855.
163. Khoshtariya, D. E.; Hansen, E.; Leecharoen, R.; Walker, G. C. J. Mol. Liq. 2003, 105, 13.
164. Careri, G.; Giansanti, A.; Gratton, G. Biopolimers 1979, 18, 1187.
165. Careri, G. Prog. Biophys. Mol. Biol. 1998, 70, 223.
166. Levstik, A.; Filipic, C.; Kutnja, Z.; Careri, G.; Consolini, G.; Bruni, F. Phys. Rev. E. 1999, 60, 7604.
167. Zanni, M. T.; Hochstrasser, R. M. Curr. Opin. Struct. Biol. 2001, 11, 516.
168. Lim, M.; Hamm, P.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 15315.
169. Pal, S. K.; Peon, J.; Zewail, A. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 1763.
170. Peon, J.; Pal, S. K.; Zewail, A. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 10964.
171. Pal, S. K.; Zewail, A. H. Chem. Rev. 2004, 104, 2099.
172. Mandal, D.; Sen, S.; Sukul, D.; Bhattacharyya, K.; Mandal, A. K.; Banetjee, R.; Roy, S. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 10741.
173. Guha, S.; Sahu, K.; Roy, D.; Mondal, S. K.; Roy, S.; Bhattacharyya, K. Biochemistry 2005, 44, 8940.
174. Pierce, D. W.; Boxer, S. G. J. Phys. Chem. 1992, 96, 5560.
175. Baskhin, J. S.; McLendon, G.; Mukamel, S.; Marohn, J. J. Phys. Chem. 1990, 94, 4757.
176. Bhattacharyya, K. Acc. Chem. Res. 2003, 36, 95.
177. Pal, S. K.; Sukul, D.; Mandal, D.; Sen, S.; Bhattacharyya, K. Chem. Phys. Lett. 2000, 327, 91.
178. Mandal, D.; Sen, S.; Tahara, T.; Bhattacharyya, K. Chem. Phys. Lett. 2002, 359, 77.
179. Sen, S.; Dutta, P.; Mukherjee, S.; Bhattacharyya, K. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 7745.
180. Pal, S. K.; Mandal, D.; Sukul, D.; Bhattacharyya, K. Chem. Phys. Lett. 1999, 312, 178.
181. Sen, S.; Sukul, D.; Dutta, P.; Bhattacharyya, K. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 6017.
182. Pal, S. K.; Sukul, D.; Mandal, D.; Bhattacharyya, K. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 4529.
183. Sen, S.; Sukul, D.; Dutta, P.; Bhattacharyya, K. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 3763.
184. Dutta, P.; Sen, S.; Mukherjee, S.; Bhattacharyya, K. Chem. Phys. Lett. 2002, 359, 15.
185. Levinger, N. E. Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 2000, 5, 118.
186. Bhattacharyya, K.; Hara, K.; Kometani, N.; Yozu, Y.; Kajimoto, O. Chem. Phys. Lett. 2002, 361, 136.
187. Toptygin, D.; Svodva, J.; Konopasek, I.; Brand, L. J. Chem. Phys. 1992, 96, 7919.
188. Ware, W. R. J. Phys. Chem. B. 1993, 103, 563.
189. James, D.; Ware, W. R. Chem. Phys. Lett. 1985, 120, 485.
190. Vajda, S.; Jimenez, R.; Rosenthal, S. J.; Fidler, V.; Fleming, G. R.; Castner, E.W., Jr. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 1995, 91, 867.
191. Sarkar, N.; Datta, A.; Das, S.; Bhattacharyya, K. J. Phys. Chem. 1996, 100, 15483.
192. Datta, A.; Mandal, D.; Pal, S. K.; Bhattacharyya, K. J. Mol. Liq. 1998, 77, 121.
193. Paradies, H. H. J. Phys. Chem. 1980, 84, 599.
194. Berr, S.; Caponetti, E.; Jones, R. R. M.; Johnson, J. S.; Magid, L. J. J. Phys. Chem. 1986, 90, 5766.
195. Paradies, H. H. J. Phys. Chem. 1980, 84, 599.
196. Berr, S. S. J. Phys. Chem. 1987, 91, 4760.
197. Berr, S. S.; Coleman, M. J.; Jones, R. R. M.; Johnson, J. S. J. J. Phys. Chem. 1986, 90, 5766.
198. Phillies, G. D. J.; Yambert, J. E. Langmuir 1996, 12, 3431.
199. Phillies, G. D. J.; Hunt, R. H.; Strang, K.; Sushkin, N. Langmuir 1995, 11, 3408.
200. Telgmann, T.; Kaatze, U. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 7758.
201. Willard, D. M.; Riter, R. E.; Levinger, N. E. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 4151.
202. Riter, R. E.; Undiks, E. P.; Levinger, N. E. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6062.
203. Riter, R. E.; Willard, D. M.; Levinger, N. E. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2705.
204. Riter, R. E.; Undiks, E. P.; Kimmel, J. R.; Pant, D. D.; Levinger, N. E. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 7931.
205. Lundgren, J. S.; Heitz, M. P.; Bright, F. V. Anal. Chem. 1995, 67, 3775.
206. Sarkar, N.; Das, K.; Datta, A.; Das, S.; Bhattacharyya, K. J. Phys. Chem. 1996, 100, 10523.
207. Shirota, H.; Horie, K. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 1437.
208. Jones, G.; Jackson, W. P., II; Choi, C. Y. J. Phys. Chem. 1985, 89, 294.
209. Mandal, D.; Datta, A.; Pal, S. K.; Bhattacharyya, K. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9070.
210. Demchenko, A. P.; Lodhokin, A. S. Eur. Biophys. J. 1988, 15, 569.
211. Chattopadhyay, A.; Mukherjee, S. Biochemistry 1993, 32, 3804.
212. Chattopadhyay, A.; Mukheijee, S.; Raghuraman, H. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 13002.
213. Behera, G. B.; Mishra, B. K.; Behera, P. K.; Panda, M. Adv. Colloid Interface Sci. 1999, 82, 1.
214. Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 6617.
215. Gu, W.; Schoenborn, B. P. Proteins Struct. Funct. Genet. 1995, 22, 20.
216. Rocchi, C.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1998, 57, 3315.
217. Marchi, M.; Sterpone, F.; Ceccarelli, M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 6787.
218. Geiger, A.; Rahman, A.; Stillinger, F. H. J. Chem. Phys. 1979, 70, 263.
219. Xu, H.; Berne, B. J. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 11929.
220. Bandyopadhyay, S.; Chakraborty, S.; Balasubramanian, S.; Bagchi, B. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 4071.
221. Makarov, V. A.; Feig, M.; Andrews, B. K.; Pettitt, B. M. Biophys. J. 1998, 75, 150.
222. Makarov, V.; Pettitt, B. M.; Feig, M. Acc. Chem. Res. 2002, 35, 376.
223. Pal, S.; Balasubramanian, S.; Bagchi, B. J. Chem. Phys. 2004, 120, 1912.
224. Borodin, O.; Bedrov, D.; Smith, G. D. Macromolecules 2002, 35, 2410.
225. Imai, S.; Shikata, T. Langmuir 1999, 15, 8388.
226. Paciaroni, A.; Bizzarri, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1999, 60, R2476.
227. Paciaroni, A.; Bizzari, A. R.; Cannistraro, S. Phys. Rev. E 1998, 57, R6277.
228. Joti, Y.; Kitao, A.; Go, N. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 8705.
229. Pal, S.; Balasubramanian, S.; Bagchi, B. J. Chem. Phys. 2002, 117, 2852.
230. Balasubramanian, S.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 12529.
231. Balasubramanian, S.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 3668.
232. Balasubramanian, S.; Pal, S.; Bagchi, B. Curr. Sci. 2003, 84, 428.
233. Balasubramanian, S.; Pal, S.; Bagchi, B. Curr. Sci. 2002, 82, 845.
234. Watanabe, K.; Klein, M. L. J. Phys. Chem. 1989, 93, 6897.
235. Watanabe, K.; Klein, M. L. J. Phys. Chem. 1991, 95, 4158.
236. Shelley, J.; Watanabe, K.; Klein, M. L. Int. J. Quantum Chem.: Quantum Biol. Symp. 1990, 17, 103.
237. Sprik, M.; Rothlisberger, U.; Klein, M. L. Mol. Phys. 1999, 97, 335.
238. MacKerell, A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 1846.
239. Senapati, S.; Chandra, A. J. Chem. Phys. 1999, 111, 1223.
240. Senapati, S.; Chandra, A. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 5106.
241. Pal, S.; Bagchi, B.; Balasubramanian, S. J. Phys. Chem. B. 2005, 109, 12879.
242. Ruffle, S.; Michalarias, I.; Li, J. C.; Ford, R. C. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 565.
243. Lee, S. H.; Rossky, P. J. J. Chem. Phys. 1996, 100, 3334.
244. Faeder, J.; Ladanyi, B. M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 11148.
245. 19. Faeder, J.; Ladanyi, B. M. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 1033.
246. Faeder, J.; Albert, M. V.; Ladanyi, B. M. Langmuir 2003, 19, 2514.
247. Senapati, S.; Berkowitz, M. L. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 9768.
248. Senapati, S.; Berkowitz, M. L. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 12906.
249. Senapati, S.; Keiper, J. S.; DeSimone, J. M.; Wignall, G. D.; Melnichenko, Y. B.; Frielinghaus, H.; Berkowitz, M. L. Langmuir 2002, 18, 7371.
250. Salaniwal, S.; Cui, S.; Cochran, H. D.; Cummings, P. T. Ind. Eng. Chem. Res. 2000, 39, 4543.
251. Salaniwal, S.; Cui, S. T.; Cummings, P. T.; Cochran, H. D. Langmuir 1999, 15, 5188.
252. Allen, R.; Bandyopadyhyay, S.; Klein, M. L. Langmuir 2000, 16, 10547.
253. Linse, P. J. Chem. Phys. 1989, 90, 4992.
254. Jeffrey, G. A.; Saenger, G. A.W. Hydrogen Bonding in Biological Structures; Springer-Verlag: Berlin, 1991.
255. Halle, B. Mol. Phys. 1985, 56, 209.
256. Hummer, G.; Garcia, A. E.; Soumpasis, D. M. Faraday Discuss. 1996, 103, 175.
257. Grigolini, P.; Maestro, M. Chem. Phys. Lett. 1986, 127, 248.
258. Bagchi, B.; Bhattacharyya, S. Adv. Chem. Phys. 2001, 116, 67.
259. Bhattacharyya, S. M.; Wang, Z.; Zewail, A. H. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 13218.
260. Baron, L. D.; Wilson, G. Biochemistry 1997, 36, 13147.
261. Das, S. P. Phys. Rev. E 1999, 59, 3870.
262. Ginge, D.; Petsko, G. A. Biophys. Chem. 2003, 105, 667.
263. Demmel, F.; Doster, W.; Petry, W. Eur. Biophys. J 1997, 26, 327.
264. Diehl, M.; Doster, W.; Petry, W.; Schober, H. Biophys. J. 1997, 73, 2726.
265. Vitkup, D.; Ringe, D.; Petsko, G. A.; Karplus, M. Nat. Struct. Biol. 2000, 7, 34.
266. Lee, A. L.; Wand, A. J. Nature 2001, 411, 501.
267. Teeter, M. M.; Yamano, A.; Stec, B.; Mohanty, U. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 11242.
268. Haymet, A. D. J.; Silverstein, K. A. T.; Dill, K. A. Faraday Discuss. 1996, 103, 117.
269. Luzar, A. Faraday Discuss. 1996, 103, 29.
270. Dozier, W. D.; Drake, J. M.; Klafter, J. Phys. Rev. Lett. 1986, 56, 197.
271. Camacho, C. J.; Kimura, S. R.; DeLisi, C.; Vajda, S. Biophys. J. 2000, 78, 1094.
272. Rasmussen, B. F.; Stock, A. M.; Ringe, D.; Petsko, G. A. Nature (London) 1992, 357, 423.
273. Ferrand, M.; Dianoux, A. J.; Petry, W.; Zaccai, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 9668.
274. Angell, C. A. Chem. Rev. 2002, 102, 2627.
275. Angell, C. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 6675.
276. Angell, C. A. Nature (London) 1999, 398, 492.
277. Angell, C. A. Science 1995, 267, 1924.
278. Balasubramanian, S.; Bandyopadhyay, S.; Pal, S.; Bagchi, B. Curr. Sci. 2003, 85, 1571.
279. Martin, M., Hynes, J. T., Eds. Femtochemistry VI Proceedings; Elsevier: New York, 2004; p 213.
280. Ringe, D. Curr. Opn. Struct. Biol. 1995, 5, 825.
281. Zou, S.; Baskin, J. S.; Zewail, A. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 9625.
282. Liepinsh, E.; Otting, G.; Wüthrich, K. Nuclic Acids Res. 1992, 24, 6549.