Solvation dynamics in protein environments studied by photon echo spectroscopy

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 103, Issue 37, 1999, Pages 7995-8005

  Jordanides, Xanthipe J ^a   Lang, Matthew J ^a   Song, Xueyu ^a   Fleming, Graham R ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000405834     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9910993     Document Type: Article

References (64)

1. Fleming, G. R.; Cho, M. Annu. Rev. Phys. Chem. 1996, 47, 109 is a comprehensive review of solvation dynamics.
2. For a reivew of optical Kerr, dielectric, and Stoke shift measurements used to probe solvation dynamics refer to: Castner, E. W., Jr.; Maroncelli, M. J. Mol. Liq. 1998, 77, 1.
3. For a recent review of solvation dynamics studied using photon echo spectroscopy refer to: de Boeij, W. P.; Pshenichnikov, M. S.; Wiersma, D. A. Annu. Rev. Phys. Chem. 1998, 49, 99.
4. Roy, S.; Bagchi, B. J. Chem. Phys. 1993, 99, 9938.
5. Rainen, F. O.; Resat, H.; Baw-Ching, P.; Hirata, F.; Friedman, H. L. J. Chem. Phys. 1994, 100, 1477.
6. Song, X. Y.; Chandler, D.; Marcus, R. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 11954.
7. Song, X. Y.; Chandler, D. J. Chem. Phys. 1998, 108, 2594.
8. Stratt, R. M.; Maroncelli, M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12981.
9. Gehlen, J. N.; Marchi, M.; Chandler, D. Science 1994, 263, 499.
10. Schulten, K.; Tesch, M. Chem. Phys. 1991, 158, 421.
11. Kohen, A.; Klinman, J. P. Acc. Chem. Res. 1998, 31, 397.
12. Rector, K. D.; Rella, C. W.; Hill, J. R.; Kwok, A. S.; Sligar, S. G.; Chien, E. Y. T.; Dlott, D. D.; Fayer, M. D. J. Phys. Chem. B. 1997, 101, 1468.
13. Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A. 1993, 90, 8302.
14. Lang, M. J.; Jordanides, X. J.; Song, X.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1999, 110, 5584.
15. Jimenez, R.; Fleming, G. R.; Kumar, P. V.; Maroncelli, M. Nature 1994, 369, 471.
16. Nandi, N.; Bagchi, B. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 10954.
17. Joo, T. H.; Jia, Y. W.; Yu, J. Y.; Jonas, D. M.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2399.
18. Jimenez, R.; Dikshit, S. N.; Bradforth, S. E.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 6825.
19. Groot, M. L.; Yu, J. Y.; Agarwal, R.; Norris, J. R.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 5923.
20. Homoelle, B. J.; Edington, M. D.; Diffey, W. M.; Beck, W. F. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3044.
21. Fraga, E.; Loppnow, G. R. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 7659.
22. Brooks, C. L.; Karplus, M.; Pettitt, B. M. Proteins: A Theoretical Perspective of Dynamics, Structure, and Thermodynamics; J. Wiley: New York, 1988.
23. King, G.; Lee, F. S.; Warshel, A. J. Chem. Phys. 1991, 95, 4366.
24. Smith, P. E.; Brunne, R. M.; Mark, A. E.; Van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. 1993, 97, 2009.
25. Simonson, T.; Brooks, C. L. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 8452.
26. Laogun, A. A. J. Mol. Liq. 1986, 32, 111.
27. Miura, N.; Asaka, N.; Shinyashiki, N.; Mashimo, S. Biopolymers 1994, 34, 357.
28. Amo, Y.; Karube, I. Biosens. Bioelectron. 1997, 12, 953.
29. Bonincontro, A.; Francesco, A. D.; Onori, G. Chem. Phys. Lett. 1999, 301, 189.
30. Harvey, S. C.; Hoekstra, P. J. Phys. Chem. 1972, 76, 2987.
31. Bone, S.; Pethig, R. J. Mol. Biol. 1982, 157, 571.
32. Careri, G. G. M.; Giansanti, A.; Rupley, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A. 1985, 82, 5342.
33. Fullerton, G. D.; Ord, V. A.; Cameron, I. L. Biochim. Biophys. Acta 1986, 869, 230.
34. Lioutas, T. S.; Baianu, I. C.; Steinberg, M. P. Arch. Biochem. Biophys. 1986, 247, 68.
35. Pethig, R. Annu. Rev. Phys. Chem. 1992, 43, 177.
36. Svergun, D. I.; Richard, S.; Koch, M. H. J.; Sayers, Z.; Kuprin, S.; Zaccai, G. Proc. Natl. Acad. Sci., U.S.A. 1998, 95, 2267.
37. Grant, E. H.; Sheppard, R. J.; South, G. P. Dielectric Behavior of Biological Molecules; Oxford: Clarendon, 1978.
38. Kepka, A. G.; Grossweiner, L. I. Photochem. Photobiol. 1973, 18, 49.
39. Baugher, J. F.; Grossweiner, L. I.; Lewis, C. J. J. Chem. Soc., Faraday Trans 2 1974, 70, 1389.
40. Chang, M. C.; Cross, A. J.; Fleming, G. R. J. Biomol. Struct. Dyn. 1983, 1, 299.
41. Cross, A. J.; Fleming, G. R. Biophys. J. 1983, 50, 507.
42. Joo, T.; Jia, Y.; Yu, J.-Y.; Lang, M. J.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1996, 104, 6089.
43. de Boeij, W. P.; Pshenichnikov, M. S.; Wiersma, D. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 11806.
44. Blake, C. F.; Koenig, D. F.; Mair, A. C.; North, A. T.; Phillips, D. C.; Sarma, V. R. Nature 1965, 206, 757.
45. Reed, M. K.; Armas, M. S.; Steinershepard, M. K.; Negus, D. K. Opt. Lett. 1995, 20, 605.
46. Ramanadham, M.; Sieker, L. C.; Jensen, L. H. Acta Crystallogr. Sect. B 1990, 46, 63.
47. See Figure 1 of Song, X. Y.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1993, 99, 7768 for a complete set of dielectric data of water.
48. Lee, B.; Richards, R. M. J. Mol. Biol. 1971, 55, 379.
49. Mukamel, S. Principles of Nonlinear Optical Spectroscopy; Oxford University Press: New York, 1995.
50. Cho, M.; Yu, J.-Y.; Nagasawa, Y.; Passino, S. A.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 11944.
51. Book, L. D.; Scherer, N. F. J. Chem. Phys. 1999, 111, 792.
52. Passino, S. A.; Nagasawa, Y.; Joo, T.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 101, 725.
53. Pierce, D. W.; Boxer, S. G. J. Phys. Chem. 1992, 96, 5560.
54. Vajda, S.; Jimenez, R.; Rosenthal, S. J.; Fidler, V.; Fleming, G. R.; Castner, E. W. J. Chem. Soc. Faraday Trans. 1995, 91, 867.
55. Sarkar, N.; Datta, A.; Das, S.; Bhattacharyya, K. J. Phys. Chem. 1996, 100, 15483.
56. Mittleman, D. M.; Nuss, M. C.; Colvin, V. L. Chem. Phys. Lett. 1997, 275, 332.
57. Riter, R. E.; Willard, D. M.; Levinger, N. E. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 2705.
58. Fowler, G. J. S.; Visschers, R. W.; Grief, G. G.; van Grondelle, R.; Hunter, C. N. Nature 1992, 355, 848.
59. Maroncelli, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1988, 89, 5044.
60. Brooks, C. L.; Karplus, M. J. Mol. Biol. 1989, 208, 159.
61. Ataka, M.; Tanaka, S. Biopolymers 1979, 18, 507.
62. Reynolds, L.; Gardecki, J. A.; Frankland, S. J. V.; Horng, M. L.; Maroncelli, M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 10337.
63. Mertz, E. L. Chem. Phys. Lett. 1996, 262, 27.
64. Mertz, E. L.; German, E. D.; Kuznetsov, A. M. Chem. Phys. 1997, 215, 355.