Electron and hole transfer induced by thermal annealing of crystalline DNA X-Irradiated at 4 K

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 104, Issue 32, 2000, Pages 7845-7851

  Debije, Michael G ^a   Bernhard, William A ^a  

^a UNIVERSITY OF ROCHESTER MEDICAL CENTER   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANNEALING; CHARGE TRANSFER; CONFORMATIONS; CRYSTALLINE MATERIALS; ELECTRON TRANSPORT PROPERTIES; ELECTRON TRAPS; ELECTRON TUNNELING; FREE RADICALS; HOLE TRAPS; MOLECULAR DYNAMICS; PROTONS; THERMAL EFFECTS;

ELECTRON TRANSFER; HOLE TRANSFER; OLIGODEOXYNUCLEOTIDES; PROTON TRANSFER;

DNA;

EID: 0034245511     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp000988j     Document Type: Article

References (68)

1. Debije, M. G.; Milano, M. T.; Bernhard, W. A. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1999, 38, 2752-2756.
2. Debije, M. G.; Bernhard, W. A. Radiat. Res. 1999, 152, 583-589.
3. Debije, M. G.; Strickler, M. D.; Bernhard, W. A. Radiat. Res. 2000, 154, 163-170.
4. Razskazovskii, Y.; Swarts, S.; Falcone, J.; Taylor, C; Sevilla, M. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 1460-7.
5. Jortner, J.; Bixon, M.; Langenbacher, T.; Michel-Beyerle, M. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 12759-12765.
6. Meggers, E.; Kusch, D.; Spichty, M.; Wille, U.; Giese, B. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1998, 37, 460-462.
7. Meggers, E.; Michel-Beyerle, M. E.; Giese, B. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 12950-12955.
8. Bixon, M.; Giese, B.; Wessely, S.; Langenbacher, T.; Michel-Bayerle, M. E.; Jortner, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 11713-11716.
9. Henderson, P. T.; Jones, D.; Hampikian, G.; Kan, Y.; Schuster, G. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 8353-8358.
10. Ly, D.; Sanil, L.; Schuster, G. B. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9400-9410.
11. Bernhard, W. A.; Debije, M. G.; Milano, M. T.; Razskazovskiy, Y. Proceedings Eleventh International Congress of Radiation Research, Vol. 2; Moriarty, M., Mothersill, C., Seymour, C., Edington, M., Ward, J. F., Fry, R. J. M., Eds.; Allen Press Inc.: Lawrence, KS, 2000; pp 321-324.
12. Steenken, S. Chem. Rev. 1989, 89, 503-520.
13. Steenken, S. Free Rad. Res. Commun. 1992, 16, 349-379.
14. Steenken, S. Biol. Chem. 1997, 378, 1293-1297.
15. Lewis, F. D.; Liu, X.; Miller, S. E.; Wasielewski, M. R. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9746-9747.
16. Grinstaff, M. W. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1999, 38, 3629-3635.
17. Mercer, K. R.; Bernhard, W. A. J. Magn. Reson. 1987, 74, 66-71.
18. Milano, M. T.; Hu, G. G.; Williams, L. D.; Bernhard, W. A. Radiat. Res. 1998, 150, 101-114.
19. Saenger, W. Principles of Nucleic Acid Structure; Springer-Verlag: New York, 1984.
20. Giese, B.; Wesseley, S.; Spormann, M.; Lindemann, U.; Meggers, E.; Michel-Beyerle, M. E. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1999, 38, 996-998.
21. Yan, M.; Becker, D.; Summerfield, S.; Renke, P.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. 1992, 96, 1983-1989.
22. Melvin, T.; Cunniffe, S. M. T.; O'Neill, P.; Parker, A. W.; Roldan-Arojna, T. Nucl. Acids Res. 1998, 26, 4935-4942.
23. Hiittermann, J.; Voit, K.; Oloff, H.; Köhnlein, W.; Gräslund, A.; Rupprecht, A. Faraday Discuss. Chem. Soc. 1984, 78, 135-149.
24. Steenken, S.; Jovanovic, S. V. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 617-618.
25. Cullis, P. M.; Evans, P.; Malone, M. E. Chem. Commun. 1996, 985-986.
26. Sevilla, M.; Becker, D.; Van, M.; Summerfield, S. J. Phys. Chem. 1991, 95, 3409-15.
27. Bernhard, W. A. Free Rad. Res. Commun. 1989, 6, 93-94.
28. Bernhard, W. A. In Tlie Early Effects of Radiation on DNA; Fielden, E. M., O'Neill, P., Eds.; Springer-Verlag: Berlin, Heidelberg, 1991; Vol. Ser. H 54, pp 141-54.
29. Wang, W.; Sevilla, M. Radiat. Res. 1994, 138, 9-17.
30. Bernhard, W. A. J. Phys. Chem. 1989, 93, 2187-2189.
31. Berman, H. M.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T. N.; Weissig, H.; Shindyalov, I. N.; Bourne, P. E. Nucl. Acids Res. 2000, 28, 235-242.
32. Brun, A. M.; Harriman, A. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 3656-3660.
33. Meade, T. J.; Kayyem, J. F. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1995, 34, 352-4.
34. Lewis, F. D.; Wu, W.; Zhang, Y.; Letsinger, R. L.; Greenfield, S. R.; Wasielewski, M. R. Science 1997, 277, 673-676.
35. Mozumder, A.; Magee, J. L. Radiat. Res. 1966, 28, 203-214.
36. Paretzke, H. G.; Turner, J. E.; Hamm, R. N.; Ritchie, R. H.; Wright, H. A. Radiat. Res. 1991, 127, 121-9.
37. Nikjoo, H.; Uehara, S.; Wilson, W.; Hoshi, M.; Goodhead, D. Int. J. Radiat. Biol. 1998, 73, 355.
38. Mroczka, N. E.; Bernhard, W. A. Radiat. Res. 1995, 144, 251-7.
39. Weiland, B.; Hüttermann, J. Int. J. Radiat. Biol. 1998, 74, 341-58.
40. Wang, W.; Yan, M.; Becker, D.; Sevilla, M. D. Radiat. Res. 1994, 137, 2-10.
41. Cullis, P. M.; Malone, M. E.; Merson-Davies, L. A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2775-2781.
42. Candeias, L. P.; Steenken, S. Chem. Eur. J. 2000, 6, 475-484.
43. Kim, S.-H.; Rich, A. J. Mol. Biol. 1969, 42, 87-95.
44. Close, D. M.; Nelson, W. H.; Bernhard, W. A. In Proceedings of the Ninth International Congress of Radiation Research; Chapman, J. D., Dewey, W. C., Whitmore, G. F., Eds.; Academic Press: San Diego, CA, 1991; p 396.
45. Parley, R. A.; Bernhard, W. A. Radiat. Res. 1975, 61, 47-54.
46. Bernhard, W. A. Adv. Radial. Biol. 1981, 9, 199-280.
47. Bernhard, W. A.; Hüttermann, J.; Close, D. M. Radiat. Res. 1987, 112, 54-61.
48. Bernhard, W. A.; Mercer, K. R. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6592-5.
49. Box, H. C. Top. Mol. Organ. Eng. 1991, 6, 409-26.
50. Close, D. M.; Bernhard, W. A. J. Chem. Phys. 1979, 70, 210-215.
51. Close, D. M.; Hole, E. O.; Sagstuen, E.; Nelson, W. H. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 6737-6744.
52. Nelson, W. H.; Sagstuen, E.; Hole, E. O.; Close, D. M. Radiat. Res. 1992, 131, 10-17.
53. Shui, X.; McFail-Isom, L.; Hu, G. G.; Williams, L. D. Biochemistry 1998, 57, 8341-8355.
54. Goodsell, D. G.; Grzeskowiak, K.; Dickerson, R. E. Biochemistry 1995, 34, 1022-1029.
55. Prive, G. G.; Yanagi, K.; Dickerson, R. E. J. Mol. Biol. 1991, 217, 177-199.
56. Wahl, M.; Rao, S.; Sundaralingam, M. Biophys. J. 1996, 70, 2857-2866.
57. Ramakrishnan, B.; Sundaralingam, M. Biochemistry 1993, 32, 11458-68.
58. Ban, C.; Sundaralingam, M. Biophys. J. 1996, 71, 1222-1227.
59. Bingman, C.; Li, X.; Zon, G.; Sundaralingam, M. Biochemistry 1992, 57, 12803-12812.
60. Tippin, D. B.; Sundaralingam, M. Acta Crystallogr. D 1996, 52, 997-1003.
61. Sadasivan, C.; Gautham, N. J. Mol. Biol. 1995, 248, 918-930.
62. Wang, A.; Quigley, G.; Kolpak, F.; Crawford, J.; van Boom, J.; van der Marel, G.; Rieh, A. Nature 1979, 282, 680-686.
63. Gessner, R. V.; Frederick, C. A.; Quigley, G. J.; Rieh, A.; Wang, A. H.-J. J. Biol. Chem. 1989, 264, 7921-7935.
64. Egli, M.; Williams, L. D.; Gao, Q.; Rich, A. Biochemistry 1991, 50, 11388-11402.
65. Crawford, J. L.; Kolpak, F. J.; Wang, A.; Quigley, G.; van Boom, J.; van der Marel, G.; Rieh, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1980, 77, 4016-4020.
66. Gatehouse, B. M.; Poppleton, B. J. Acta Crystallogr. B 1970, 26, 1761-1765.
67. Viswamitra, M. A.; Reddy, B. S.; Lin, G. H.-Y.; Sundaralingam, M. J. Am. Chem. Soc. 1971, 93, 4565-4573.
68. Bernhard, W. A.; Barnes, J.; Mercer, K. R.; Mroczka, N. Radiat. Res. 1994, 140, 199-214.