Description of non-covalent interactions in SCC-DFTB methods

Journal of Computational Chemistry

Volumn 38, Issue 10, 2017, Pages 688-697

  Miriyala, Vijay Madhav ^a   Řezáč, Jan ^a  

^a INSTITUTE OF ORGANIC CHEMISTRY AND BIOCHEMISTRY   (Czech Republic)

Author keywords

density functional tight binding; DFTB3; dispersion correction; hydrogen bonding correction; non covalent interactions

Indexed keywords

BINDING ENERGY; DISPERSIONS;

DENSITY FUNCTIONAL TIGHT BINDINGS; DFTB3; DISPERSION CORRECTION; INTERACTION ENERGY DECOMPOSITION; LATEST DEVELOPMENT; MONOPOLE APPROXIMATION; NON-COVALENT INTERACTION; SELF CONSISTENT CHARGES;

HYDROGEN BONDS;

EID: 85010651895     PISSN: 01928651     EISSN: 1096987X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jcc.24725     Document Type: Article

References (49)

1. M. Elstner, D. Porezag, G. Jungnickel, J. Elsner, M. Haugk, T. Frauenheim, S. Suhai, G. Seifert, Phys. Rev. B 1998, 58, 7260.
2. M. Elstner, P. Hobza, T. Frauenheim, S. Suhai, E. Kaxiras, J. Chem. Phys. 2001, 114, 5149.
3. Q. Wu, W. Yang, J. Chem. Phys. 2002, 116, 515.
4. B. Martin, T. Clark, Int. J. Quantum Chem. 2006, 106, 1208.
5. J. P. McNamara, I. H. Hillier, Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 2362.
6. C. A. Morgado, J. P. McNamara, I. H. Hillier, N. A. Burton, M. A. Vincent, J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 1656.
7. J. Řezáč, J. Fanfrlík, D. Salahub, P. Hobza, J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 1749.
8. S. Grimme, J. Antony, S. Ehrlich, H. Krieg, J. Chem. Phys. 2010, 132, 154104.
9. J. Řezáč, P. Hobza, J. Chem. Theory Comput. 2012, 8, 141.
10. S. Grimme, Angew. Chem. Int. Ed. 2013, 52, 6306.
11. M. Elstner, J. Phys. Chem. A 2007, 111, 5614.
12. Yang, H. Yu, D. York, Q. Cui, M. Elstner, J. Phys. Chem. A 2007, 111, 10861.
13. J. J. P. Stewart, J. Mol. Model. 2007, 13, 1173.
14. P. Jurečka, J. Šponer, J. Černý, P. Hobza, Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 1985.
15. M. Korth, M. Pitoňák, J. Řezáč, P. Hobza, J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 344.
16. M. Korth, J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 3808.
17. M. Gaus, A. Goez, M. Elstner, J. Chem. Theory Comput. 2013, 9, 338.
18. M. Gaus, Q. Cui, M. Elstner, J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 931.
19. M. Isegawa, L. Fiedler, H. R. Leverentz, Y. Wang, S. Nachimuthu, J. Gao, D. G. Truhlar, J. Chem. Theory Comput. 2013, 9, 33.
20. R. Chelli, P. Procacci, J. Chem. Phys. 2002, 117, 9175.
21. D. M. York, W. Yang, J. Chem. Phys. 1996, 104, 159.
22. T. J. Giese, D. M. York, Theor. Chem. Acc. 2012, 131, 1145.
23. T. J. Giese, D. M. York, J. Chem. Phys. 2005, 123, 164108.
24. S. Kaminski, T. J. Giese, M. Gaus, D. M. York, M. Elstner, J. Phys. Chem. A 2012, 116, 9131.
25. A. S. Christensen, M. Elstner, Q. Cui, J. Chem. Phys. 2015, 143, 084123.
26. A. S. Christensen, T. Kubař, Q. Cui, M. Elstner, Chem. Rev. 2016, 116, 5301.
27. J. G. Brandenburg, M. Hochheim, T. Bredow, S. Grimme, J. Phys. Chem. Lett. 2014, 5, 4275.
28. S. Grimme, S. Ehrlich, L. Goerigk, J. Comput. Chem. 2011, 32, 1456.
29. J. G. Brandenburg, S. Grimme, J. Phys. Chem. Lett. 2014, 5, 1785.
30. J. Řezáč, P. Hobza, Chem. Rev. 2016, 116, 5038.
31. J. Řezáč, K. E. Riley, P. Hobza, J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 2427.
32. A. J. May, F. R. Manby, J. Chem. Phys. 2004, 121, 4479.
33. V. S. Bryantsev, M. S. Diallo, A. C. T. van Duin, W. A. Goddard, J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 1016.
34. R. Sedlák, T. Janowski, M. Pitoňák, J. Řezáč, P. Pulay, P. Hobza, J. Chem. Theory Comput. 2013, 9, 3364.
35. S. Grimme, Chem. – Eur. J. 2012, 18, 9955.
36. H. L. Williams, C. F. Chabalowski, J. Phys. Chem. A 2001, 105, 646.
37. A. Heßelmann, G. Jansen, Chem. Phys. Lett. 2002, 357, 464.
38. A. J. Misquitta, K. Szalewicz, Chem. Phys. Lett. 2002, 357, 301.
39. G. Jansen, Wiley Interdiscip. Rev. Comput. Mol. Sci. 2014, 4, 127.
40. P. Su, H. Li, J. Chem. Phys. 2009, 131, 014102.
41. A. Heßelmann, G. Jansen, M. Schütz, J. Chem. Phys. 2005, 122, 014103.
42. H.-J. Werner, P. J. Knowles, G. Knizia, F. R. Manby, M. Schütz, P. Celani, W. Györffy, D. Kats, T. Korona, R. Lindh, A. Mitrushenkov, G. Rauhut, K. R. Shamasundar, T. B. Adler, R. D. Amos, A. Bernhardsson, A. Berning, D. L. Cooper, M. J. O. Deegan, A. J. Dobbyn, F. Eckert, E. Goll, C. Hampel, A. Hesselmann, G. Hetzer, T. Hrenar, G. Jansen, C. Köppl, Y. Liu, A. W. Lloyd, R. A. Mata, A. J. May, S. J. McNicholas, W. Meyer, M. E. Mura, A. Nicklass, D. P. O'Neill, P. Palmieri, D. Peng, K. Pflüger, R. Pitzer, M. Reiher, T. Shiozaki, H. Stoll, A. J. Stone, R. Tarroni, T. Thorsteinsson, M. Wang, MOLPRO, version 2015.1, a package of ab initio programs, 2015.
43. B. Aradi, B. Hourahine, T. Frauenheim, J. Phys. Chem. A 2007, 111, 5678.
44. J. Řezáč, J. Comput. Chem. 2016, 37, 1230.
45. Řezáč, J. Cuby 4, software framework for computational chemistry. Available at: http://cuby4.molecular.cz/ (accessed Oct 17, 2014).
46. TURBOMOLE, v6.6., University of Karlsruhe and Forschungszentrum Karlsruhe GmbH, 2014.
47. J. M. Turney, A. C. Simmonett, R. M. Parrish, E. G. Hohenstein, F. A. Evangelista, J. T. Fermann, B. J. Mintz, L. A. Burns, J. J. Wilke, M. L. Abrams, N. J. Russ, M. L. Leininger, C. L. Janssen, E. T. Seidl, W. D. Allen, H. F. Schaefer, R. A. King, E. F. Valeev, C. D. Sherrill, T. D. Crawford, Wiley Interdiscip. Rev. Comput. Mol. Sci. 2012, 2, 556.
48. H. J. Werner, P. J. Knowles, G. Knizia, F. R. Manby, M. Schütz, WIREs Comput. Mol. Sci. 2012, 2, 242.
49. M. W. Schmidt, K. K. Baldridge, J. A. Boatz, S. T. Elbert, M. S. Gordon, J. H. Jensen, S. Koseki, N. Matsunaga, K. A. Nguyen, S. Su, T. L. Windus, M. Dupuis, J. A. Montgomery, J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347.