The excited electronic states of adenine-guanine stacked dimers in aqueous solution: A PCM/TD-DFT study

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 12, Issue 19, 2010, Pages 4934-4948

  Santoro, Fabrizio ^a   Barone, Vincenzo ^b   Lami, Alessandro ^c,d   Improta, Roberto ^c,d  

^a AREA DELLA RICERCA   (Italy)

^b SCUOLA NORMALE SUPERIORE   (Italy)

^c CNR   (Italy)

^d UNIVERSITY OF NAPLES FEDERICO II   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84961986693     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b925108a     Document Type: Article

References (98)

1. J. D. Watson F. H. C. Crick Nature 1953 171 737 738
2. J. D. Watson F. H. C. Crick Nature 1953 171 964 967
3. F. Meselson F. W. Stahl Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1958 44 671 682
4. I. Tinoco Jr. J. Am. Chem. Soc. 1960 82 4785
5. A. Rich I. Tinoco Jr. J. Am. Chem. Soc. 1960 82 6409 6411
6. L. B. Clark G. G. Peschel I. Tinoco Jr. J. Phys. Chem. 1965 69 3615 3618
7. M. Y. Warshaw I. Tinoco Jr. J. Mol. Biol. 1965 13 54 77
8. M. Y. Warshaw C. A. Bush I. Tinoco Jr. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1965 18 633 688
9. C. A. Bush I. Tinoco Jr. J. Mol. Biol. 1967 23 601 604
10. M. Y. Warshaw I. Tinoco Jr. J. Mol. Biol. 1966 20 29 38
11. J. Eisinger M. Guéron R. G. Shulman T. Yamane Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1966 55 1015
12. D. L. Miller M. A. Weinstock J. Am. Acad. Dermatol. 1994 30 774
13. K. H. Kraemer Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1997 94 11
14. Y. Matsumura H. M. Ananthaswamy Front. Biosci. 2002 7 d765 83
15. T. M. Nordlund Photochem. Photobiol. 2007 83 625 636
16. D. Porathi G. Cuniberti R. Di Felice Top. Curr. Chem. 2004 237 183 227
17. C. E. Crespo-Hernández B. Cohen P. M. Hare B. Kohler Chem. Rev. 2004 104 1977
18. C. T. Middleton K. de La Harpe C. Su Y. K. Law C. E. Crespo-Hernadez B. Kohler Annu. Rev. Phys. Chem. 2009 60 217 47
19. C. E. Crespo-Hernández B. Cohen B. Kohler Nature 2005 436 1141
20. C. E. Crespo-Hernández B. Cohen B. Kohler Nature 2006 441 E8
21. D. Markovitsi F. Talbot T. Gustavsson D. Onidas E. Lazzarotto S. Marguet Nature 2006 441 E7
22. D. Markovitsi T. Gustavsson F. Talbot Photochem. Photobiol. Sci. 2007 6 717
23. D. Onidas T. Gustavsson E. Lazzarotto D. Markovitsi J. Phys. Chem. B 2007 111 9644
24. D. Markovitsi D. Onidas T. Gustavsson F. Talbot E. Lazzarotto J. Am. Chem. Soc. 2005 127 17130 17131
25. N. K. Schwalb F. Temps Science 2008 322 243 245
26. T. Takaya C. Su K. de La Harpe C. E. Crespo-Hernńdez B. Kohler Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 10285 10290
27. F.-A. Miannay A. Banyasz T. Gustavsson D. Markovitsi J. Am. Chem. Soc. 2007 129 14574 14575
28. C. E. Crespo-Hernández K. de La Harpe B. Kohler J. Am. Chem. Soc. 2008 130 10844 10845
29. T. Schultz E. Samoylova W. Radloff I. V. Hertel A. L. Sobolewski W. Domcke Science 2004 306 1765 1768
30. N. Schwalb F. Temps J. Am. Chem. Soc. 2007 129 9272 9273
31. A. L. Sobolewski W. Domcke C. Hattig Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 17903 17906
32. S. Tonzani G. C. Schatz J. Am. Chem. Soc. 2008 130 7607 7612
33. A. W. Lange J. M. Herbert J. Am. Chem. Soc. 2009 131 3913 3922
34. E. R. Bittner J. Chem. Phys. 2006 125 094909
35. E. B. Starikov Philos. Mag. Lett. 2003 83 699 708
36. E. B. Starikov G. Cuniberti S. Tanaka J. Phys. Chem. B 2009 113 10428 10435
37. L. Serrano-Andrés M. Merchán A. C. Borin Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 8691
38. L. Serrano-Andrés M. Merchán A. C. Borin Chem.-Eur. J. 2006 12 6559
39. L. Blancafort J. Am. Chem. Soc. 2006 128 210 219
40. S. Perun A. L. Sobolewski W. Domcke J. Am. Chem. Soc. 2005 127 6257 6265
41. L. Serrano-Andrés M. Merchán A. C. Borin J. Am. Chem. Soc. 2008 130 2473
42. S. Yamazaki W. Domcke J. Phys. Chem. A 2008 112 7090 7097
43. M. K. Shukla J. Leszczynski J. Phys. Chem. B 2008 112 5139 5152
44. G. Olaso-González M. Merchán L. Serrano-Andrés J. Am. Chem. Soc. 2009 131 4368 4377
45. F. Santoro V. Barone T. Gustavsson R. Improta J. Am. Chem. Soc. 2006 128 16312
46. T. Gustavsson A. Banyasz E. Lazzarotto D. Markovitsi G. Scalmani M. J. Frisch V. Barone R. Improta J. Am. Chem. Soc. 2006 128 607
47. R. Improta V. Barone J. Am. Chem. Soc. 2004 126 14320
48. Y. Mercier F. Santoro M. Reguero R. Improta J. Phys. Chem. B 2008 112 10769 10772
49. V. Karunakaran K. Kleinermanns R. Improta S. A. Kovalenko J. Am. Chem. Soc. 2009 131 5839 5850
50. R. Improta F. Santoro V. Barone A. Lami J. Phys. Chem. A 2009 113 15346
51. R. Improta V. Barone A. Lami F. Santoro J. Phys. Chem. B 2009 113 14491 14503
52. F. Santoro V. Barone R. Improta Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 9931
53. R. Improta Phys. Chem. Chem. Phys. 2008 10 2656 2664
54. F. Santoro V. Barone R. Improta ChemPhysChem 2008 9 2531 2537
55. F. Santoro V. Barone R. Improta J. Am. Chem. Soc. 2009 131 15232 15245
56. Recent Advances in Density Functional Methods, ed., M. E. Casida, and, D. P. Chong, World Scientific, Singapore, 1995, vol. 1
57. C. Adamo V. Barone J. Chem. Phys. 1999 110 6158
58. M. Ernzerhof G. E. Scuseria J. Chem. Phys. 1999 110 5029
59. C. Adamo G. E. Scuseria V. Barone J. Chem. Phys. 1999 111 2889
60. Y. Zhao D. G. Truhlar Acc. Chem. Res. 2008 41 157 167
61. Y. Zhao N. E. Schultz D. G. Truhlar J. Chem. Theory Comput. 2006 2 364
62. T. Yanai D. B. Tew N. C. Handy Chem. Phys. Lett. 2004 393 51
63. Y. Tawada T. Tsuneda S. Yanagisawa T. Yanai K. Hirao J. Chem. Phys. 2004 120 8425
64. S. Miertu E. Scrocco J. Tomasi Chem. Phys. 1981 55 117
65. J. Tomasi B. Mennucci R. Cammi Chem. Rev. 2005 105 2999
66. R. Improta C. Benzi V. Barone J. Am. Chem. Soc. 2001 123 12568
67. R. Improta V. Barone K. N. Kudin G. E. Scuseria J. Am. Chem. Soc. 2001 123 3311
68. R. Improta F. Mele O. Crescenzi C. Benzi V. Barone J. Am. Chem. Soc. 2002 124 7857
69. E. Langella R. Improta V. Barone J. Am. Chem. Soc. 2002 124 11531
70. M. Cossi N. Rega G. Scalmani V. Barone J. Chem. Phys. 2001 114 5691
71. M. Cossi V. Barone J. Chem. Phys. 2001 115 4708
72. R. Cammi S. Corni B. Mennucci J. Tomasi J. Chem. Phys. 2005 122 104513
73. R. Improta V. Barone G. Scalmani M. J. Frisch J. Chem. Phys. 2006 125 54103
74. R. Improta M. J. Frisch G. Scalmani V. Barone J. Chem. Phys. 2007 127 74504
75. K. J. Jalkanen I. M. Degtyarenko R. M. Nieminen X. Cao L. A. Nafie F. Zhu L. D. Barron Theor. Chem. Acc. 2008 119 191 210
76. K. J. Jalkanen R. M. Nieminen K. Frimand J. Bohr H. Bohr R. C. Wade E. Tajkhorshid S. Suhai Chem. Phys. 2001 265 125 151
77. W.-G. Han K. J. Jalkanen M. Elstner S. Suhai J. Phys. Chem. B 1998 102 2587 2602
78. A. Holmén A. Broo B. Albinsson B. Nordén J. Am. Chem. Soc. 1997 119 12240
79. D. Onidas D. Markovitsi S. Marguet A. Sharonov T. Gustavsson J. Phys. Chem. B 2002 106 11367
80. M. J. Damha K. K. Ogilvie Biochemistry 1988 27 6403 6416
81. J. L. Sussman I. Barzilay M. Keren-Zur Y. Lapidot Biochim. Biophys. Acta, Nucleic Acids Protein Synth. 1973 308 189
82. C.-H. Lee F. S. Ezra N. S. Kondo S. S. Danyluk R. M. Sarma Biochemistry 1976 15 3627 3629
83. Z. Vokáová M. Budínský I. Rosenberg B. Schneider J. poner V. Sychrovský J. Phys. Chem. B 2009 113 1182 1191
84. V. Barone R. Improta N. Rega Acc. Chem. Res. 2008 41 605 616
85. A. Dreuw M. Head-Gordon Chem. Rev. 2005 105 4009
86. F. Santoro R. Improta A. Lami J. Bloino V. Barone J. Chem. Phys. 2007 126 084509
87. F. Santoro A. Lami R. Improta V. Barone J. Chem. Phys. 2007 126 184102
88. F. Santoro R. Improta A. Lami J. Bloino V. Barone J. Chem. Phys. 2008 128 224311
89. F. Santoro V. Barone Int. J. Quantum Chem. 2010 110 476 486
90. N. Lin F. Santoro X. Zhao A. Rizzo V. Barone J. Phys. Chem. A 2008 112 12401
91. N. Lin Y. Luo F. Santoro X. Zhao A. Rizzo Chem. Phys. Lett. 2008 464 144 149
92. N. Lin F. Santoro A. Rizzo Y. Luo X. Zhao V. Barone J. Phys. Chem. A 2009 113 4198 4207
93. L. A. Nafie Chem. Phys. 1996 205 309 322
94. M. Vargek T. B. Freedman E. Lee L. A. Nafie Chem. Phys. Lett. 1998 287 359 364
95. L. A. Nafie Theor. Chem. Acc. 2008 119 39 55
96. M. Rudolph J. Autschbach Chirality 2008 20 995 1008
97. M. J. Frisch et al., GAUSSIAN 09, Revision A.02, Gaussian Inc., Wallingford CT, 2009
98. X. Li Z. Cai M. D. Sevilla J. Phys. Chem. A 2002 106 1596 1603