Gene expression as an indicator of the molecular response and toxicity in the bacterium Shewanella oneidensis and the water flea Daphnia magna exposed to functionalized gold nanoparticles

Environmental Science: Nano

Volumn 2, Issue 6, 2015, Pages 615-629

  Qiu, T A ^a   Bozich, J S ^b   Lohse, S E ^c   Vartanian, A M ^c   Jacob, L M ^c   Meyer, B M ^a   Gunsolus, I L ^a   Niemuth, N J ^b   Murphy, C J ^c   Haynes, C L ^a   Klaper, R D ^b  

^a University of Minnesota   (United States)

^b UNIVERSITY OF WISCONSIN MILWAUKEE   (United States)

^c UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84948682687     PISSN: 20518153     EISSN: 20518161     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5en00037h     Document Type: Article

References (82)

1. A. S. Arico P. Bruce B. Scrosati J.-M. Tarascon W. van Schalkwijk Nat. Mater. 2005 4 366 377
2. J. Xie G. Liu H. S. Eden H. Ai X. Chen Acc. Chem. Res. 2011 44 883 892
3. M. M. Pendergast E. M. V. Hoek Energy Environ. Sci. 2011 4 1946 1971
4. A. Nel T. Xia L. Madler N. Li Science 2006 311 622 627
5. Y. Pan S. Neuss A. Leifert M. Fischler F. Wen U. Simon G. Schmid W. Brandau W. Jahnen-Dechent Small 2007 3 1941 1949
6. A. Albanese P. S. Tang W. C. Chan Annu. Rev. Biomed. Eng. 2012 14 1 16
7. D. A. Arndt M. Moua J. Chen R. D. Klaper Environ. Sci. Technol. 2013 47 9444 9452
8. R. Klaper D. Arndt K. Setyowati J. Chen F. Goetz Aquat. Toxicol. 2010 100 211 217
9. R. Klaper J. Crago J. Barr D. Arndt K. Setyowati J. Chen Environ. Pollut. 2009 157 1152 1156
10. B. D. Chithrani A. A. Ghazani W. C. Chan Nano Lett. 2006 6 662 668
11. H. Yang C. Liu D. Yang H. Zhang Z. Xi J. Appl. Toxicol. 2009 29 69 78
12. K. L. Aillon Y. Xie N. El-Gendy C. J. Berkland M. L. Forrest Adv. Drug Delivery Rev. 2009 61 457 466
13. J. S. Bozich S. E. Lohse M. D. Torelli C. J. Murphy R. J. Hamers R. D. Klaper Environ. Sci.: Nano 2014 1 260 270
14. A. M. El Badawy R. G. Silva B. Morris K. G. Scheckel M. T. Suidan T. M. Tolaymat Environ. Sci. Technol. 2010 45 283 287
15. C. He Y. Hu L. Yin C. Tang C. Yin Biomaterials 2010 31 3657 3666
16. N. M. Schaeublin L. K. Braydich-Stolle A. M. Schrand J. M. Miller J. Hutchison J. J. Schlager S. M. Hussain Nanoscale 2011 3 410 420
17. A. Verma F. Stellacci Small 2010 6 12 21
18. G. A. Dominguez S. E. Lohse M. D. Torelli C. J. Murphy R. J. Hamers G. Orr R. D. Klaper Aquat. Toxicol. 2015 162 1 9
19. A. Albanese W. C. W. Chan ACS Nano 2011 5 5478 5489
20. N. Lewinski V. Colvin R. Drezek Small 2008 4 26 49
21. N. Khlebtsov L. Dykman Chem. Soc. Rev. 2011 40 1647 1671
22. C.-W. Lam J. T. James R. McCluskey S. Arepalli R. L. Hunter Crit. Rev. Toxicol. 2006 36 189 217
23. E. Fröhlich Int. J. Nanomed. 2012 7 5577 5591
24. S. K. Sohaebuddin P. T. Thevenot D. Baker J. W. Eaton L. Tang Part. Fibre Toxicol. 2010 7 22
25. M. Heinlaan A. Ivask I. Blinova H.-C. Dubourguier A. Kahru Chemosphere 2008 71 1308 1316
26. H. Sanderson M. Thomsen Bull. Environ. Contam. Toxicol. 2007 79 331 335
27. D. R. Moore R. L. Breton D. B. MacDonald Environ. Toxicol. Chem. 2003 22 1799 1809
28. A. A. Shvedova A. Pietroiusti B. Fadeel V. E. Kagan Toxicol. Appl. Pharmacol. 2012 261 121 133
29. B. J. Marquis S. A. Love K. L. Braun C. L. Haynes Analyst 2009 134 425 439
30. A. Manke L. Wang Y. Rojanasakul BioMed Res. Int. 2013 2013 942916
31. E. J. Park K. Park Toxicol. Lett. 2009 184 18 25
32. R. Klaper D. Arndt J. Bozich G. Dominguez Analyst 2014 139 882 895
33. F. Gottschalk T. Sonderer R. W. Scholz B. Nowack Environ. Sci. Technol. 2009 43 9216 9222
34. A. Valavanidis T. Vlahogianni M. Dassenakis M. Scoullos Ecotoxicol. Environ. Saf. 2006 64 178 189
35. R. Franco R. Sanchez-Olea E. M. Reyes-Reyes M. I. Panayiotidis Mutat. Res., Genet. Toxicol. Environ. Mutagen. 2009 674 3 22
36. T. Finkel N. J. Holbrook Nature 2000 408 239 247
37. J. Ryan and L. Hightower, Stress-Inducible Cellular Responses, Springer, 1996, pp. 411-424
38. C. G. Kilty J. Keenan M. Shaw Expert Opin. Drug Saf. 2007 6 2 207 215
39. C. Eason K. O'Halloran Toxicology 2002 181 517 521
40. N. J. Niemuth R. Jordan J. Crago C. Blanksma R. Johnson R. D. Klaper Environ. Toxicol. Chem. 2014 34 2 291 296
41. G. T. Ankley K. M. Jensen M. D. Kahl J. J. Korte E. A. Makynen Environ. Toxicol. Chem. 2001 20 1276 1290
42. S. M. Johns M. D. Kane N. D. Denslow K. H. Watanabe E. F. Orlando D. L. Villeneuve G. T. Ankley M. S. Sepúlveda Environ. Toxicol. Chem. 2009 28 873 880
43. J. S. Garvey, Preprints of Papers Presented at National Meeting, Division of Water, Air and Waste Chemistry, American Chemical Society, (USA), 1988
44. M. Fischbach E. Sabbioni P. Bromley Cell Biol. Toxicol. 1993 9 177 188
45. H. H. Hau J. A. Gralnick Annu. Rev. Microbiol. 2007 61 237 258
46. R. Gulati Hydrobiologia 1978 59 101 112
47. N. R. Jana L. Gearheart C. J. Murphy Langmuir 2001 17 6782 6786
48. T. K. Sau C. J. Murphy J. Am. Chem. Soc. 2004 126 8648 8649
49. D. A. Giljohann D. S. Seferos W. L. Daniel M. D. Massich P. C. Patel C. A. Mirkin Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 3280 3294
50. S. F. Sweeney G. H. Woehrle J. E. Hutchison J. Am. Chem. Soc. 2006 128 3190 3197
51. J. A. Yang S. E. Lohse C. J. Murphy Small 2014 10 1642 1651
52. C. J. Ackerson P. D. Jadzinsky R. D. Kornberg J. Am. Chem. Soc. 2005 127 6550 6551
53. M. D. Torelli R. A. Putans Y. Tan S. E. Lohse C. J. Murphy R. J. Hamers ACS Appl. Mater. Interfaces 2015 7 1720 1725
54. EPA, Standard operating procedure for moderately hard reconstituted water, SoBran, Dayton, OH, USA, 2003
55. S. Zhao R. D. Fernald J. Comput. Biol. 2005 12 1047 1064
56. L.-H. Heckmann P. Sorensen P. Krogh J. Sorensen BMC Bioinf. 2011 12 250
57. S. Wang W. Lu O. Tovmachenko U. S. Rai H. Yu P. C. Ray Chem. Phys. Lett. 2008 463 145 149
58. P. A. Rice B. H. Iglewski Rev. Infect. Dis. 1988 10 S277 S278
59. A. Martínez-Palomo, International Review of Cytology, Academic Press, 1970, vol. 29, pp. 29-75
60. C. M. Goodman C. D. McCusker T. Yilmaz V. M. Rotello Bioconjugate Chem. 2004 15 897 900
61. Z. V. Feng I. L. Gunsolus T. A. Qiu K. R. Hurley L. H. Nyberg H. Frew K. P. Johnson A. M. Vartanian L. M. Jacob S. E. Lohse M. D. Torelli R. J. Hamers C. J. Murphy C. L. Haynes Chem. Sci. 2015 10.1039/C5SC00792E
62. K. H. Jacobson I. L. Gunsolus T. R. Kuech J. M. Troiano E. S. Melby S. E. Lohse D. Hu W. B. Chrisler C. J. Murphy G. Orr F. M. Geiger C. L. Haynes J. A. Pedersen Environ. Sci. Technol. 2015 10.1021/acs.est.5b01841
63. Y. Y. Zhao Y. Tian Y. Cui W. W. Liu W. S. Ma X. Y. Jiang J. Am. Chem. Soc. 2010 132 12349 12356
64. S. Dalai S. Pakrashi R. S. Kumar N. Chandrasekaran A. Mukherjee Toxicol. Res. 2012 1 116 130
65. A. Kumar A. K. Pandey S. S. Singh R. Shanker A. Dhawan Chemosphere 2011 83 1124 1132
66. S. Schwerin B. Zeis T. Lamkemeyer R. J. Paul M. Koch J. Madlung C. Fladerer R. Pirow BMC Physiol. 2009 9 8
67. M. Ehrenberg J. L. McGrath Acta Biomater. 2005 1 305 315
68. P. Ruenraroengsak A. T. Florence J. Drug Targeting 2010 18 803 811
69. V. G. Walker Z. Li T. Hulderman D. Schwegler-Berry M. L. Kashon P. P. Simeonova Toxicol. Appl. Pharmacol. 2009 236 319 328
70. T. Mironava M. Hadjiargyrou M. Simon V. Jurukovski M. H. Rafailovich Nanotoxicology 2010 4 120 137
71. S. B. Farr T. Kogoma Microbiol. Rev. 1991 55 561 585
72. K. Chourey M. R. Thompson J. Morrell-Falvey N. C. VerBerkmoes S. D. Brown M. Shah J. Zhou M. Doktycz R. L. Hettich D. K. Thompson Appl. Environ. Microbiol. 2006 72 6331 6344
73. A. Ivask E. Suarez T. Patel D. Boren Z. Ji P. Holden D. Telesca R. Damoiseaux K. A. Bradley H. Godwin Environ. Sci. Technol. 2012 46 2398 2405
74. B. J. Paul W. Ross T. Gaal R. L. Gourse Annu. Rev. Genet. 2004 38 749 770
75. D. R. Crawford Y. H. Wang G. P. Schools J. Kochheiser K. J. A. Davies Free Radical Biol. Med. 1997 22 551 559
76. G. N. Basturea M. A. Zundel M. P. Deutscher RNA 2011 17 338 345
77. D. Hsu L.-M. Shih Y. C. Zee J. Bacteriol. 1994 176 4761 4765
78. M. P. Deutscher Nucleic Acids Res. 2006 34 659 666
79. M. Kuwano H. Taniguchi M. Ono H. Endo Y. Ohnishi Biochem. Biophys. Res. Commun. 1977 75 156 162
80. Z. Darzynkiewicz S. Bruno G. Delbino W. Gorczyca M. A. Hotz P. Lassota F. Traganos Cytometry 1992 13 795 808
81. S. D. Brown M. R. Thompson N. C. VerBerkmoes K. Chourey M. Shah J. Z. Zhou R. L. Hettich D. K. Thompson Mol. Cell. Proteomics 2006 5 1054 1071
82. K. Chourey M. R. Thompson J. Morrell-Falvey N. C. VerBerkmoes S. D. Brown M. Shah J. Z. Zhou M. Doktycz R. L. Hettich D. K. Thompson Appl. Environ. Microbiol. 2006 72 6331 6344