DnsID in MyCompoundID for Rapid Identification of Dansylated Amine- and Phenol-Containing Metabolites in LC-MS-Based Metabolomics

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 19, 2015, Pages 9838-9845

  Huan, Tao ^a   Wu, Yiman ^a   Tang, Chenqu ^a   Lin, Guohui ^a   Li, Liang ^a  

^a UNIVERSITY OF ALBERTA   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHEMICAL DETECTION; CHROMATOGRAPHY; ISOMERS; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; METABOLITES; PHENOLS; STANDARDS;

ANALYTICAL CHALLENGE; ANALYTICAL PERFORMANCE; AUTOMATED IDENTIFICATION; ENABLING TECHNOLOGIES; EXPERIMENTAL CONDITIONS; LIQUID CHROMATOGRAPHY-MASS SPECTROMETRY; METABOLITE IDENTIFICATION; PERFORMANCE CHEMICALS;

BIOMOLECULES;

AMINE; DANSYL CHLORIDE; PHENOL;

ECONOMICS; HUMAN; LIQUID CHROMATOGRAPHY; METABOLISM; METABOLOME; METABOLOMICS; PROCEDURES; TANDEM MASS SPECTROMETRY; TIME; URINALYSIS; URINE;

AMINES; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; DANSYL COMPOUNDS; HUMANS; METABOLOME; METABOLOMICS; PHENOL; TANDEM MASS SPECTROMETRY; TIME FACTORS; URINALYSIS;

EID: 84942903311     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.analchem.5b02282     Document Type: Article

References (46)

1. Smith, C. A.; O'Maille, G.; Want, E. J.; Qin, C.; Trauger, S. A.; Brandon, T. R.; Custodio, D. E.; Abagyan, R.; Siuzdak, G. Ther. Drug Monit. 2005, 27, 747-751 10.1097/01.ftd.0000179845.53213.39
2. Wishart, D. S.; Tzur, D.; Knox, C.; Eisner, R.; Guo, A. C.; Young, N.; Cheng, D.; Jewell, K.; Arndt, D.; Sawhney, S.; Fung, C.; Nikolai, L.; Lewis, M.; Coutouly, M. A.; Forsythe, I.; Tang, P.; Shrivastava, S.; Jeroncic, K.; Stothard, P.; Amegbey, G.; Block, D.; Hau, D. D.; Wagner, J.; Miniaci, J.; Clements, M.; Gebremedhin, M.; Guo, N.; Zhang, Y.; Duggan, G. E.; MacInnis, G. D.; Weljie, A. M.; Dowlatabadi, R.; Bamforth, F.; Clive, D.; Greiner, R.; Li, L.; Marrie, T.; Sykes, B. D.; Vogel, H. J.; Querengesser, L. Nucleic Acids Res. 2007, 35, D521-D526 10.1093/nar/gkl923
3. Horai, H.; Arita, M.; Kanaya, S.; Nihei, Y.; Ikeda, T.; Suwa, K.; Ojima, Y.; Tanaka, K.; Tanaka, S.; Aoshima, K.; Oda, Y.; Kakazu, Y.; Kusano, M.; Tohge, T.; Matsuda, F.; Sawada, Y.; Hirai, M. Y.; Nakanishi, H.; Ikeda, K.; Akimoto, N.; Maoka, T.; Takahashi, H.; Ara, T.; Sakurai, N.; Suzuki, H.; Shibata, D.; Neumann, S.; Iida, T.; Funatsu, K.; Matsuura, F.; Soga, T.; Taguchi, R.; Saito, K.; Nishioka, T. J. Mass Spectrom. 2010, 45, 703-714 10.1002/jms.1777
4. Li, L.; Li, R. H.; Zhou, J. J.; Zuniga, A.; Stanislaus, A. E.; Wu, Y. M.; Huan, T.; Zheng, J. M.; Shi, Y.; Wishart, D. S.; Lin, G. H. Anal. Chem. 2013, 85, 3401-3408 10.1021/ac400099b
5. Weber, R. J. M.; Viant, M. R. Chemom. Intell. Lab. Syst. 2010, 104, 75-82 10.1016/j.chemolab.2010.04.010
6. Benton, H. P.; Ivanisevic, J.; Mahieu, N. G.; Kurczy, M. E.; Johnson, C. H.; Franco, L.; Rinehart, D.; Valentine, E.; Gowda, H.; Ubhi, B. K.; Tautenhahn, R.; Gieschen, A.; Fields, M. W.; Patti, G. J.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2015, 87, 884-891 10.1021/ac5025649
7. Guo, K.; Li, L. Anal. Chem. 2009, 81, 3919-3932 10.1021/ac900166a
8. Guo, K.; Bamforth, F.; Li, L. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 339-347 10.1007/s13361-010-0033-4
9. Boswell, P. G.; Schellenberg, J. R.; Carr, P. W.; Cohen, J. D.; Hegeman, A. D. J. Chromatogr. A 2011, 1218, 6732-6741 10.1016/j.chroma.2011.07.105
10. Cao, M. S.; Fraser, K.; Huege, J.; Featonby, T.; Rasmussen, S.; Jones, C. Metabolomics 2015, 11, 696-706 10.1007/s11306-014-0727-x
11. Creek, D. J.; Jankevics, A.; Breitling, R.; Watson, D. G.; Barrett, M. P.; Burgess, K. E. V. Anal. Chem. 2011, 83, 8703-8710 10.1021/ac2021823
12. Hagiwara, T.; Saito, S.; Ujiie, Y.; Imai, K.; Kakuta, M.; Kadota, K.; Terada, T.; Sumikoshi, K.; Shimizu, K.; Nishi, T. Bioinformation 2010, 5, 255-258 10.6026/97320630005255
13. Sumner, L. W.; Amberg, A.; Barrett, D.; Beale, M. H.; Beger, R.; Daykin, C. A.; Fan, T. W. M.; Fiehn, O.; Goodacre, R.; Griffin, J. L.; Hankemeier, T.; Hardy, N.; Harnly, J.; Higashi, R.; Kopka, J.; Lane, A. N.; Lindon, J. C.; Marriott, P.; Nicholls, A. W.; Reily, M. D.; Thaden, J. J.; Viant, M. R. Metabolomics 2007, 3, 211-221 10.1007/s11306-007-0082-2
14. Guo, K.; Li, L. Anal. Chem. 2010, 82, 8789-8793 10.1021/ac102146g
15. Wu, Y.; Li, L. Anal. Chem. 2012, 84, 10723-10731 10.1021/ac3025625
16. Zheng, J. M.; Dixon, R. A.; Li, L. Anal. Chem. 2012, 84, 10802-10811 10.1021/ac3028307
17. Wu, Y.; Li, L. Anal. Chem. 2013, 85, 5755-5763 10.1021/ac400330z
18. Zhou, R. K.; Guo, K.; Li, L. Anal. Chem. 2013, 85, 11532-11539 10.1021/ac403000n
19. Zhou, R.; Tseng, C. L.; Huan, T.; Li, L. Anal. Chem. 2014, 86, 4675-4679 10.1021/ac5009089
20. Shortreed, M. R.; Lamos, S. M.; Frey, B. L.; Phillips, M. F.; Patel, M.; Belshaw, P. J.; Smith, L. M. Anal. Chem. 2006, 78, 6398-6403 10.1021/ac0607008
21. Tsukamoto, Y.; Santa, T.; Yoshida, H.; Miyano, H.; Fukushima, T.; Hirayama, K.; Imai, K.; Funatsu, T. Biomed. Chromatogr. 2006, 20, 358-364 10.1002/bmc.574
22. Yang, W. C.; Mirzaei, H.; Liu, X. P.; Regnier, F. E. Anal. Chem. 2006, 78, 4702-4708 10.1021/ac0600510
23. Abello, N.; Geurink, P. P.; van der Toorn, M.; van Oosterhout, A. J. M.; Lugtenburg, J.; van der Marel, G. A.; Kerstjens, H. A. M.; Postma, D. S.; Overkleeft, H. S.; Bischoff, R. Anal. Chem. 2008, 80, 9171-9180 10.1021/ac801215c
24. Yang, W. C.; Regnier, F. E.; Adamec, J. Electrophoresis 2008, 29, 4549-4560 10.1002/elps.200800156
25. Yang, W. C.; Regnier, F. E.; Sliva, D.; Adamec, J. J. Chromatogr. B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2008, 870, 233-240 10.1016/j.jchromb.2008.06.026
26. Armenta, J. M.; Cortes, D. F.; Pisciotta, J. M.; Shuman, J. L.; Blakeslee, K.; Rasoloson, D.; Ogunbiyi, O.; Sullivan, D. J.; Shulaev, V. Anal. Chem. 2010, 82, 548-558 10.1021/ac901790q
27. Huang, Y. Q.; Liu, J. Q.; Gong, H. Y.; Yang, J.; Li, Y. S.; Feng, Y. Q. Analyst 2011, 136, 1515-1522 10.1039/c0an00736f
28. Wang, H.; Wang, H. Y.; Zhang, L.; Zhang, J.; Guo, Y. L. Anal. Chim. Acta 2011, 690, 1-9 10.1016/j.aca.2011.02.017
29. Yuan, W.; Zhang, J. X.; Li, S. W.; Edwards, J. L. J. Proteome Res. 2011, 10, 5242-5250 10.1021/pr200815c
30. Dai, W. D.; Huang, Q.; Yin, P. Y.; Li, J.; Zhou, J.; Kong, H. W.; Zhao, C. X.; Lu, X.; Xu, G. W. Anal. Chem. 2012, 84, 10245-10251 10.1021/ac301984t
31. Mazzotti, F.; Benabdelkamel, H.; Di Donna, L.; Athanassopoulos, C. M.; Napoli, A.; Sindona, G. J. Mass Spectrom. 2012, 47, 932-939 10.1002/jms.3005
32. Toyo'oka, T. J. Pharm. Biomed. Anal. 2012, 69, 174-184 10.1016/j.jpba.2012.04.018
33. Leng, J. P.; Wang, H. Y.; Zhang, L.; Zhang, J.; Wang, H.; Guo, Y. L. Anal. Chim. Acta 2013, 758, 114-121 10.1016/j.aca.2012.11.008
34. Tayyari, F.; Gowda, G. A. N.; Gu, H. W.; Raftery, D. Anal. Chem. 2013, 85, 8715-8721 10.1021/ac401712a
35. Zhang, S. J.; You, J. M.; Ning, S. J.; Song, C. H.; Suo, Y. R. J. Chromatogr. A 2013, 1280, 84-91 10.1016/j.chroma.2013.01.045
36. Mochizuki, T.; Todoroki, K.; Inoue, K.; Min, J. Z.; Toyo'oka, T. Anal. Chim. Acta 2014, 811, 51-59 10.1016/j.aca.2013.12.016
37. Li, S. F.; Jin, Y. B.; Tang, Z.; Lin, S. H.; Liu, H. X.; Jiang, Y. Y.; Cai, Z. W. Anal. Chim. Acta 2015, 864, 30-38 10.1016/j.aca.2015.01.044
38. Wu, M. H.; Xu, Y.; Fitch, W. L.; Zheng, M.; Merritt, R. E.; Shrager, J. B.; Zhang, W. R.; Dill, D. L.; Peltz, G.; Hoang, C. D. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2013, 27, 2091-2098 10.1002/rcm.6656
39. Guo, K.; Ji, C. J.; Li, L. Anal. Chem. 2007, 79, 8631-8638 10.1021/ac0704356
40. Huan, T.; Li, L. Anal. Chem. 2015, 87, 7011-7016 10.1021/acs.analchem.5b01434
41. Tang, Y.; Li, R.; Lin, G.; Li, L. Anal. Chem. 2014, 86, 3568-3574 10.1021/ac500109y
42. Yuan, M.; Breitkopf, S. B.; Yang, X. M.; Asara, J. M. Nat. Protoc. 2012, 7, 872-881 10.1038/nprot.2012.024
43. Wei, R.; Li, G. D.; Seymour, A. B. Anal. Chem. 2010, 82, 5527-5533 10.1021/ac100331b
44. Tsugawa, H.; Arita, M.; Kanazawa, M.; Ogiwara, A.; Bamba, T.; Fukusaki, E. Anal. Chem. 2013, 85, 5191-5199 10.1021/ac400515s
45. Xu, W.; Chen, D. Y.; Wang, N.; Zhang, T.; Zhou, R. K.; Huan, T.; Lu, Y. F.; Su, X. L.; Xie, Q.; Li, L.; Li, L. J. Anal. Chem. 2015, 87, 829-836 10.1021/ac503619q
46. Huan, T.; Li, L. Anal. Chem. 2015, 87, 1306-1313 10.1021/ac5039994