Development of high-performance chemical isotope labeling LC-MS for profiling the human fecal metabolome

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 2, 2015, Pages 829-836

  Xu, Wei ^a   Chen, Deying ^a   Wang, Nan ^a,b   Zhang, Ting ^a   Zhou, Ruokun ^b   Huan, Tao ^b   Lu, Yingfeng ^a   Su, Xiaoling ^a   Xie, Qing ^a   Li, Liang ^a,b   Li, Lanjuan ^a  

^a ZHEJIANG UNIVERSITY   (China)

^b UNIVERSITY OF ALBERTA   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACETONITRILE; BIOMOLECULES; CHEMICAL ANALYSIS; CHEMICAL EQUIPMENT; CHROMATOGRAPHY; ISOTOPES; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETERS; MASS SPECTROMETRY; METABOLITES; ORGANIC SOLVENTS; PHENOLS;

EXTRACTION SOLVENTS; LIQUID CHROMATOGRAPHY-MASS SPECTROMETRY; METABOLIC INFORMATION; PERFORMANCE CHEMICALS; PUTATIVE METABOLITES; SEPARATION EFFICIENCY; STANDARD LIBRARIES; TIME-OF-FLIGHT MASS SPECTROMETERS;

EXTRACTION;

DANSYL CHLORIDE;

ADULT; CHEMISTRY; FECES; FEMALE; HUMAN; INFANT; ISOTOPE LABELING; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MALE; MASS SPECTROMETRY; METABOLOME; METABOLOMICS; NEWBORN; PROCEDURES;

ADULT; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; DANSYL COMPOUNDS; FECES; FEMALE; HUMANS; INFANT; INFANT, NEWBORN; ISOTOPE LABELING; MALE; MASS SPECTROMETRY; METABOLOME; METABOLOMICS;

EID: 84922439721     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac503619q     Document Type: Review

References (36)

1. Ding, T.; Schloss, P. D. Nature 2014, 509, 357
2. Costello, E. K.; Stagaman, K.; Dethlefsen, L.; Bohannan, B. J. M.; Relman, D. A. Science 2012, 336, 1255-1262
3. Kuczynski, J.; Lauber, C. L.; Walters, W. A.; Parfrey, L. W.; Clemente, J. C.; Gevers, D.; Knight, R. Nat. Rev. Genet. 2012, 13, 47-58
4. Blaser, M.; Bork, P.; Fraser, C.; Knight, R.; Wang, J. Nat. Rev. Microbiol. 2013, 11, 213-217
5. Turnbaugh, P. J.; Ley, R. E.; Hamady, M.; Fraser-Liggett, C. M.; Knight, R.; Gordon, J. I. Nature 2007, 449, 804-810
6. Huttenhower, C.; Gevers, D.; Knight, R.; Abubucker, S.; Badger, J. H.; Human Microbiome Project Consortium Nature 2012, 486, 207-214
7. Li, M.; Wang, B. H.; Zhang, M. H.; Rantalainen, M.; Wang, S. Y.; Zhou, H. K.; Zhang, Y.; Shen, J.; Pang, X. Y.; Zhang, M. L.; Wei, H.; Chen, Y.; Lu, H. F.; Zuo, J.; Su, M. M.; Qiu, Y. P.; Jia, W.; Xiao, C. N.; Smith, L. M.; Yang, S. L.; Holmes, E.; Tang, H. R.; Zhao, G. P.; Nicholson, J. K.; Li, L. J.; Zhao, L. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 2117-2122
8. Claesson, M. J.; Cusack, S.; O'Sullivan, O.; Greene-Diniz, R.; de Weerd, H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 4586-4591
9. Segata, N.; Haake, S. K.; Mannon, P.; Lemon, K. P.; Waldron, L.; Gevers, D.; Huttenhower, C.; Izard, J. Genome Biol. 2012, 13, 18
10. Jacobs, D. M.; Gaudier, E.; van Duynhoven, J.; Vaughan, E. E. Curr. Drug Metab. 2009, 10, 41-54
11. Marcobal, A.; Kashyap, P. C.; Nelson, T. A.; Aronov, P. A.; Donia, M. S.; Spormann, A.; Fischbach, M. A.; Sonnenburg, J. L. ISME J. 2013, 7, 1933-1943
12. Saric, J.; Wang, Y.; Li, J.; Coen, M.; Utzinger, J.; Marchesi, J. R.; Keiser, J.; Veselkov, K.; Lindon, J. C.; Nicholson, J. K.; Holmes, E. J. Proteome Res. 2008, 7, 352-360
13. Jansson, J.; Willing, B.; Lucio, M.; Fekete, A.; Dicksved, J.; Halfvarson, J.; Tysk, C.; Schmitt-Kopplin, P. PLoS One 2009, 4, 10
14. Chow, J.; Panasevich, M. R.; Alexander, D.; Boler, B. M. V.; Serao, M. C. R.; Faber, T. A.; Bauer, L. L.; Fahey, G. C. J. Proteome Res. 2014, 13, 2534-2542
15. Goedert, J. J.; Sampson, J. N.; Moore, S. C.; Xiao, Q.; Xiong, X.; Hayes, R. B.; Ahn, J.; Shi, J.; Sinha, R. Carcinogenesis 2014, 35, 2089-2096
16. Jump, R. L. P.; Polinkovsky, A.; Hurless, K.; Sitzlar, B.; Eckart, K.; Tomas, M.; Deshpande, A.; Nerandzic, M. M.; Donskey, C. J. PLoS One 2014, 9, e101267
17. Le Gall, G.; Noor, S. O.; Ridgway, K.; Scovell, L.; Jamieson, C.; Johnson, I. T.; Colquhoun, I. J.; Kemsley, E. K.; Narbad, A. J. Proteome Res. 2011, 10, 4208-4218
18. Cao, H. C.; Huang, H. J.; Xu, W.; Chen, D. Y.; Yu, J.; Li, J.; Li, L. J. Anal. Chim. Acta 2011, 691, 68-75
19. Zhao, Y. Y.; Zhang, L.; Long, F. Y.; Cheng, X. L.; Bai, X.; Wei, F.; Lin, R. C. Chem.-Biol. Interact. 2013, 201, 31-38
20. Girlanda, R.; Cheema, A. K.; Kaur, P.; Kwon, Y.; Li, A.; Guerra, J.; Matsumoto, C. S.; Zasloff, M.; Fishbein, T. M. Am. J. Transplant. 2012, 12, S18-S26
21. Russell, W. R.; Gratz, S. W.; Duncan, S. H.; Holtrop, G.; Ince, J.; Scobbie, L.; Duncan, G.; Johnstone, A. M.; Lobley, G. E.; Wallace, R. J.; Duthie, G. G.; Flint, H. J. Am. J. Clin. Nutr. 2011, 93, 1062-1072
22. Lampe, J. W.; Navarro, S. L.; Hullar, M. A. J.; Shojaie, A. Proc. Nutr. Soc. 2013, 72, 207-218
23. Calvani, R.; Brasili, E.; Pratico, G.; Capuani, G.; Tomassini, A.; Marini, F.; Sciubba, F.; Finamore, A.; Roselli, M.; Marzetti, E.; Miccheli, A. Exp. Gerontol. 2014, 49, 5-11
24. Gao, X. F.; Pujos-Guillot, E.; Martin, J. F.; Galan, P.; Juste, C.; Jia, W.; Sebedio, J. L. Anal. Biochem. 2009, 393, 163-175
25. Gao, X. F.; Pujos-Guillot, E.; Sebedio, J. L. Anal. Chem. 2010, 82, 6447-6456
26. Wu, J. F.; An, Y. P.; Yao, J. W.; Wang, Y. L.; Tang, H. R. Analyst 2010, 135, 1023-1030
27. Guo, K.; Li, L. Anal. Chem. 2009, 81, 3919-3932
28. Guo, K.; Li, L. Anal. Chem. 2011, 82, 8789-8793
29. Zhou, R.; Li, L. J. Proteomics 2014, in press
30. Peng, J.; Chen, Y. T.; Chen, C. L.; Li, L. Anal. Chem. 2014, 86, 6540-6547
31. Zhou, R. K.; Guo, K.; Li, L. Anal. Chem. 2014, 85, 11532-11539
32. Wu, Y.; Li, L. Anal. Chem. 2012, 84, 10723-10731
33. Zhou, R.; Tseng, C. L.; Huan, T.; Li, L. Anal. Chem. 2014, 86, 4675-4679
34. Huan, T.; Li, L. Anal. Chem. 2014, submitted
35. Li, L.; Li, R. H.; Zhou, J. J.; Zuniga, A.; Stanislaus, A. E.; Wu, Y. M.; Huan, T.; Zheng, J. M.; Shi, Y.; Wishart, D. S.; Lin, G. H. Anal. Chem. 2013, 85, 3401-3408
36. Guo, K.; Li, L. Anal. Chem. 2010, 82, 8789-8793