Phenotype-Guided Natural Products Discovery Using Cytological Profiling

Journal of Natural Products

Volumn 78, Issue 9, 2015, Pages 2242-2248

  Ochoa, Jessica L ^a   Bray, Walter M ^a   Lokey, R Scott ^a   Linington, Roger G ^a,b  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b SIMON FRASER UNIVERSITY   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTIMITOTIC AGENT; NATURAL PRODUCT; NOCAPYRONE B; NOCAPYRONE H; NOCAPYRONE L; PHENYLAHISTIN; PIPERAZINEDIONE; PLINABULIN; UNCLASSIFIED DRUG; XR 334; BIOLOGICAL PRODUCT; PIPERAZINE DERIVATIVE;

ARTICLE; CYTOLOGY; DRUG ISOLATION; DRUG MECHANISM; DRUG SCREENING; MITOSIS INHIBITION; NONHUMAN; PHENOTYPE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; SYNTHESIS;

BIOLOGICAL PRODUCTS; DIKETOPIPERAZINES; MOLECULAR STRUCTURE; PHENOTYPE; PIPERAZINES;

EID: 84942693550     PISSN: 01633864     EISSN: 15206025     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/acs.jnatprod.5b00455     Document Type: Article

References (31)

1. Saito, S.-Y. Prog. Mol. Subcell. Biol. 2009, 46, 187-219
2. Altmann, K.-H.; Gertsch, J. R. Nat. Prod. Rep. 2007, 24, 327-357 10.1039/b515619j
3. Feng, Y.; Mitchison, T. J.; Bender, A.; Young, D. W.; Tallarico, J. A. Nat. Rev. Drug Discovery 2009, 8, 567-578 10.1038/nrd2876
4. Mitchison, T. J. ChemBioChem 2005, 6, 33-39 10.1002/cbic.200400272
5. Sutherland, J. J.; Low, J.; Blosser, W.; Dowless, M.; Engler, T. A.; Stancato, L. F. Mol. Cancer Ther. 2011, 10, 242-254 10.1158/1535-7163.MCT-10-0720
6. Towne, D. L.; Nicholl, E. E.; Comess, K. M.; Galasinski, S. C.; Hajduk, P. J.; Abraham, V. C. J. Biomol. Screening 2012, 17, 1005-1017 10.1177/1087057112450050
7. Carpenter, A. E.; Jones, T. R.; Lamprecht, M. R.; Clarke, C.; Kang, I. H.; Friman, O.; Guertin, D. A.; Chang, J. H.; Lindquist, R. A.; Moffat, J.; Golland, P.; Sabatini, D. M. Genome Biol. 2006, 7, R100 10.1186/gb-2006-7-10-r100
8. Schulze, C. J.; Bray, W. M.; Woerhmann, M. H.; Stuart, J.; Lokey, R. S.; Linington, R. G. Chem. Biol. 2013, 20, 285-295 10.1016/j.chembiol.2012.12.007
9. Woehrmann, M. H.; Bray, W. M.; Durbin, J. K.; Nisam, S. C.; Michael, A. K.; Glassey, E.; Stuart, J. M.; Lokey, R. S. Mol. BioSyst. 2013, 9, 2604-2617 10.1039/c3mb70245f
10. Potts, M. B.; Kim, H. S.; Fisher, K. W.; Hu, Y.; Carrasco, Y. P.; Bulut, G. B.; Ou, Y.-H.; Herrera-Herrera, M. L.; Cubillos, F.; Mendiratta, S.; Xiao, G.; Hofree, M.; Ideker, T.; Xie, Y.; Huang, L. J.-S.; Lewis, R. E.; MacMillan, J. B.; White, M. A. Sci. Signaling 2013, 6, ra90 10.1126/scisignal.2004657
11. Lopez, A.; Parsons, A. B.; Nislow, C.; Giaever, G.; Boone, C. Prog. Drug. Res. 2008, 66, 239-271
12. Crawford, A. D.; Liekens, S.; Kamuhabwa, A. R.; Maes, J.; Munck, S.; Busson, R.; Rozenski, J.; Esguerra, C. V.; de Witte, P. A. M. PLoS One 2011, 6, e14694 10.1371/journal.pone.0014694
13. Kaestner, P.; Bastians, H. J. Cell. Biochem. 2010, 111, 258-265 10.1002/jcb.22721
14. Chan, K. S.; Koh, C.-G.; Li, H.-Y. Cell Death Dis. 2012, 3, e411 10.1038/cddis.2012.148
15. Roberge, M.; Cinel, B.; Anderson, H. J.; Lim, L.; Jiang, X.; Xu, L.; Bigg, C. M.; Kelly, M. T.; Andersen, R. J. Cancer Res. 2000, 60, 5052-5058
16. Laraia, L.; Stokes, J.; Emery, A.; McKenzie, G. J.; Venkitaraman, A. R.; Spring, D. R. ACS Med. Chem. Lett. 2014, 5, 598-603 10.1021/ml5000564
17. Hayashi, Y.; Takeno, H.; Chinen, T.; Muguruma, K.; Okuyama, K.; Taguchi, A.; Takayama, K.; Yakushiji, F.; Miura, M.; Usui, T.; Hayashi, Y. ACS Med. Chem. Lett. 2014, 5, 1094-1098 10.1021/ml5001883
18. AntiMarin Database; Blunt, J. W.; Munro, M. H. G.; Laatsch, H., Eds.; University of Canterbury: Christchurch, New Zealand, and University of Göttingen: Göttingen, Germany, 2006.
19. Bryans, J.; Charlton, P.; Chicarelli-Robinson, I.; Collins, M.; Faint, R.; Latham, C.; Shaw, I.; Trew, S. J. Antibiot. 1996, 49, 1014-1021 10.7164/antibiotics.49.1014
20. Hayashi, Y.; Yamazaki-Nakamura, Y.; Yakushiji, F. Chem. Pharm. Bull. 2013, 61, 889-901 10.1248/cpb.c13-00404
21. Loughlin, W. A.; Marshall, R. L.; Carreiro, A.; Elson, K. E. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2000, 10, 91-94 10.1016/S0960-894X(99)00634-4
22. Yamazaki, Y.; Tanaka, K.; Nicholson, B.; Deyanat-Yazdi, G.; Potts, B.; Yoshida, T.; Oda, A.; Kitagawa, T.; Orikasa, S.; Kiso, Y.; Yasui, H.; Akamatsu, M.; Chinen, T.; Usui, T.; Shinozaki, Y.; Yakushiji, F.; Miller, B. R.; Neuteboom, S.; Palladino, M.; Kanoh, K.; Lloyd, G. K.; Hayashi, Y. J. Med. Chem. 2012, 55, 1056-1071 10.1021/jm2009088
23. Mita, M. M.; Spear, M. A.; Yee, L. K.; Mita, A. C.; Heath, E. I.; Papadopoulos, K. P.; Federico, K. C.; Reich, S. D.; Romero, O.; Malburg, L.; Pilat, M.; Lloyd, G. K.; Neuteboom, S. T. C.; Cropp, G.; Ashton, E.; LoRusso, P. M. Clin. Cancer Res. 2010, 16, 5892-5899 10.1158/1078-0432.CCR-10-1096
24. Millward, M.; Mainwaring, P.; Mita, A.; Federico, K.; Lloyd, G. K.; Reddinger, N.; Nawrocki, S.; Mita, M.; Spear, M. A. Invest. New Drugs 2012, 30, 1065-1073 10.1007/s10637-011-9642-4
25. Lin, Z.; Torres, J. P.; Ammon, M. A.; Marett, L.; Teichert, R. W.; Reilly, C. A.; Kwan, J. C.; Hughen, R. W.; Flores, M.; Tianero, M. D.; Peraud, O.; Cox, J. E.; Light, A. R.; Villaraza, A. J. L.; Haygood, M. G.; Concepcion, G. P.; Olivera, B. M.; Schmidt, E. W. Chem. Biol. 2013, 20, 73-81 10.1016/j.chembiol.2012.10.019
26. Schneemann, I.; Ohlendorf, B.; Zinecker, H.; Nagel, K.; Wiese, J.; Imhoff, J. F. J. Nat. Prod. 2010, 73, 1444-1447 10.1021/np100312f
27. Wang, F.; Tian, X.; Huang, C.; Li, Q.; Zhang, S. J. Antibiot. 2011, 64, 189-192 10.1038/ja.2010.153
28. Subramanian, A.; Tamayo, P.; Mootha, V. K.; Mukherjee, S.; Ebert, B. L.; Gillette, M. A.; Paulovich, A.; Pomeroy, S. L.; Golub, T. R.; Lander, E. S.; Mesirov, J. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 15545-15550 10.1073/pnas.0506580102
29. Mootha, V. K.; Lindgren, C. M.; Eriksson, K.-F.; Subramanian, A.; Sihag, S.; Lehar, J.; Puigserver, P.; Carlsson, E.; Ridderstråle, M.; Laurila, E.; Houstis, N.; Daly, M. J.; Patterson, N.; Mesirov, J. P.; Golub, T. R.; Tamayo, P.; Spiegelman, B.; Lander, E. S.; Hirschhorn, J. N.; Altshuler, D.; Groop, L. C. Nat. Genet. 2003, 34, 267-273 10.1038/ng1180
30. de Hoon, M. J. L.; Imoto, S.; Nolan, J.; Miyano, S. Bioinformatics 2004, 20, 1453-1454 10.1093/bioinformatics/bth078
31. Saldanha, A. J. Bioinformatics 2004, 20, 3246-3248 10.1093/bioinformatics/bth349