Colorimetric detection of sequence-specific microRNA based on duplex-specific nuclease-assisted nanoparticle amplification

Analyst

Volumn 140, Issue 18, 2015, Pages 6306-6312

  Wang, Qian ^a   Li, Ru Dong ^a   Yin, Bin Cheng ^a   Ye, Bang Ce ^a  

^a EAST CHINA UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; ENDONUCLEASE; GOLD; METAL NANOPARTICLE; MICRORNA;

ANIMAL; ANOMURA; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COLORIMETRY; CONFORMATION; ENZYME SPECIFICITY; ENZYMOLOGY; FEASIBILITY STUDY; GENETICS; HUMAN; LIMIT OF DETECTION; METABOLISM; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PROCEDURES; TUMOR CELL LINE;

ANIMALS; ANOMURA; BASE SEQUENCE; CELL LINE, TUMOR; COLORIMETRY; DNA; ENDONUCLEASES; FEASIBILITY STUDIES; GOLD; HUMANS; LIMIT OF DETECTION; METAL NANOPARTICLES; MICRORNAS; MODELS, MOLECULAR; NUCLEIC ACID CONFORMATION; SUBSTRATE SPECIFICITY;

EID: 84940118711     PISSN: 00032654     EISSN: 13645528     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c5an01350j     Document Type: Article

References (46)

1. D. P. Bartel Cell 2004 116 281 297
2. V. Ambros Nature 2004 431 350 355
3. B. David P Cell 2004 116 281 297
4. A. Esquela-Kerscher F. J. Slack Nat. Rev. Cancer 2006 6 259 269
5. G. A. Calin C. M. Croce Nat. Rev. Cancer 2006 6 857 866
6. A. Keller P. Leidinger A. Bauer A. Elsharawy J. Haas C. Backes A. Wendschlag N. Giese C. Tjaden K. Ott J. Werner T. Hackert K. Ruprecht H. Huwer J. Huebers G. Jacobs P. Rosenstiel H. Dommisch A. Schaefer J. Muller-Quernheim B. Wullich B. Keck N. Graf J. Reichrath B. Vogel A. Nebel S. U. Jager P. Staehler I. Amarantos V. Boisguerin C. Staehler M. Beier M. Scheffler M. W. Buchler J. Wischhusen S. F. Haeusler J. Dietl S. Hofmann H. P. Lenhof S. Schreiber H. A. Katus W. Rottbauer B. Meder J. D. Hoheisel A. Franke E. Meese Nat. Methods 2011 8 841 843
7. J. Lu G. Getz E. A. Miska E. Alvarez-Saavedra J. Lamb D. Peck A. Sweet-Cordero B. L. Ebert R. H. Mak A. A. Ferrando J. R. Downing T. Jacks H. R. Horvitz T. R. Golub Nature 2005 435 834 838
8. Z. Jin F. M. Selaru Y. Cheng T. Kan R. Agarwal Y. Mori A. V. Olaru J. Yang S. David J. P. Hamilton J. M. Abraham J. Harmon M. Duncan E. A. Montgomery S. J. Meltzer Oncogene 2011 30 1577 1585
9. P. S. Mitchell R. K. Parkin E. M. Kroh B. R. Fritz S. K. Wyman E. L. Pogosova-Agadjanyan A. Peterson J. Noteboom K. C. O'Briant A. Allen D. W. Lin N. Urban C. W. Drescher B. S. Knudsen D. L. Stirewalt R. Gentleman R. L. Vessella P. S. Nelson D. B. Martin M. Tewari Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 10513 10518
10. J. Chang E. Nicolas D. Marks C. Sander A. Lerro M. A. Buendia C. Xu W. S. Mason T. Moloshok R. Bort K. S. Zaret J. M. Taylor RNA Biol. 2004 1 106 113
11. E. K. Ng W. W. Chong H. Jin E. K. Lam V. Y. Shin J. Yu T. C. Poon S. S. Ng J. J. Sung Gut 2009 58 1375 1381
12. J. G. Hacia L. C. Brody M. S. Chee S. P. Fodor F. S. Collins Nat. Genet. 1996 14 441 447
13. F. S. Santiago A. V. Todd N. J. Hawkins R. L. Ward Mol. Cell. Probes 1997 11 33 38
14. C. Arenz Angew. Chem., Int. Ed. 2006 45 5048 5050
15. M. Lagos-Quintana R. Rauhut W. Lendeckel T. Tuschl Science 2001 294 853 858
16. A. Válóczi C. Hornyik N. Varga J. Burgyán S. Kauppinen Z. Havelda Nucleic Acids Res. 2004 32 e175
17. J. T. G. Pena C. Sohn-Lee S. H. Rouhanifard J. Ludwig M. Hafner A. Mihailovic C. Lim D. Holoch P. Berninger M. Zavolan T. Tuschl Nat. Methods 2009 6 139 141
18. J. Lu A. Tsourkas Nucleic Acids Res. 2009 37 e100
19. L. P. Lim N. C. Lau P. Garrett-Engele A. Grimson J. M. Schelter J. Castle D. P. Bartel P. S. Linsley J. M. Johnson Nature 2005 433 769 773
20. C. G. Liu G. A. Calin B. Meloon N. Gamliel C. Sevignani M. Ferracin C. D. Dumitru M. Shimizu S. Zupo M. Dono H. Alder F. Bullrich M. Negrini C. M. Croce Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 9740 9744
21. C. Chen D. A. Ridzon A. J. Broomer Z. Zhou D. H. Lee J. T. Nguyen M. Barbisin N. L. Xu V. R. Mahuvakar M. R. Andersen K. Q. Lao K. J. Livak K. J. Guegler Nucleic Acids Res. 2005 33 e179
22. C. K. Raymond B. S. Roberts P. Garrett-Engele L. P. Lim J. M. Johnson RNA 2005 11 1737 1744
23. R. Shi V. L. Chiang Biotechniques 2005 39 519 525
24. C. Y. Yu B. C. Yin B. C. Ye Chem. Commun. 2013 49 8247 8249
25. H. Jia Z. Li C. Liu Y. Cheng Angew. Chem., Int. Ed. 2010 49 5498 5501
26. B. C. Yin Y. Q. Liu B. C. Ye J. Am. Chem. Soc. 2012 134 5064 5067
27. Y. Zhang C. Y. Zhang Anal. Chem. 2012 84 224 231
28. R. Duan X. Zuo S. Wang X. Quan D. Chen Z. Chen L. Jiang C. Fan F. Xia J. Am. Chem. Soc. 2013 135 4604 4607
29. C. Li Z. Li H. Jia J. Yan Chem. Commun. 2011 47 2595 2597
30. Y. Zhang C.-y. Zhang Anal. Chem. 2011 84 224 231
31. X. P. Wang B. C. Yin P. Wang B. C. Ye Biosens. Bioelectron. 2013 42 131 135
32. D. A. Shagin D. V. Rebrikov V. B. Kozhemyako I. M. Altshuler A. S. Shcheglov P. A. Zhulidov E. A. Bogdanova D. B. Staroverov V. A. Rasskazov S. Lukyanov Genome Res. 2002 12 1935 1942
33. C. A. Mirkin R. L. Letsinger R. C. Mucic J. J. Storhoff Nature 1996 382 607 609
34. W. Xu X. Xue T. Li H. Zeng X. Liu Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 6849 6852
35. J. Liu Y. Lu Angew. Chem., Int. Ed. 2005 45 90 94
36. D. Li A. Wieckowska I. Willner Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 3927 3931
37. H. Li L. Rothberg Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 14036 14039
38. Y. Wang F. Yang X. Yang Biosens. Bioelectron. 2010 25 1994 1998
39. J. S. Lee P. A. Ulmann M. S. Han C. A. Mirkin Nano Lett. 2008 8 529 533
40. C. C. Huang Y. F. Huang Z. Cao W. Tan H. T. Chang Anal. Chem. 2005 77 5735 5741
41. R. Elghanian J. J. Storhoff R. C. Mucic R. L. Letsinger C. A. Mirkin Science 1997 277 1078 1081
42. J. J. Storhoff R. Elghanian R. C. Mucic C. A. Mirkin R. L. Letsinger J. Am. Chem. Soc. 1998 1959 1964
43. Y. Zu Z. Gao Anal. Chem. 2009 81 8523 8528
44. B. C. Yin Y. Q. Liu B. C. Ye Anal. Chem. 2013 85 11487 11493
45. C. Y. Yu B. C. Yin B. C. Ye Chem. Commun. 2013 49 8247 8249
46. F. T. Zhao Y. Zhou Y. X. Zhou Q. Yang L. Song X. J. Jiang Z. S. Jia Med. Sci. Monit. 2015 21 980 986