SCOPUS 정보 검색 플랫폼

Volumn 17, Issue 34, 2015, Pages 22217-22226

Structural and functional insights into the conductive pili of Geobacter sulfurreducens revealed in molecular dynamics simulations

(3) Feliciano, G T a Steidl, R J b Reguera, G b

a SÃO PAULO STATE UNIVERSITY UNESP (Brazil)

b Department of Microbiology and Molecular Genetics Michigan State University ^* (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACID; BACTERIAL PROTEIN;

CHEMISTRY; CYTOLOGY; ELECTRIC CONDUCTIVITY; ELECTRON TRANSPORT; FIMBRIA; GEOBACTER; METABOLISM; MOLECULAR DYNAMICS; PROTEIN CONFORMATION; STATIC ELECTRICITY;

AMINO ACIDS; BACTERIAL PROTEINS; ELECTRIC CONDUCTIVITY; ELECTRON TRANSPORT; FIMBRIAE, BACTERIAL; GEOBACTER; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; PROTEIN CONFORMATION; STATIC ELECTRICITY;

EID: 84939803262 PISSN: 14639076 EISSN: None Source Type: Journal
DOI: 10.1039/c5cp03432a Document Type: Article

Times cited : (84)

References (54)

1
- 21344461500
- G. Reguera K. D. McCarthy T. Mehta J. S. Nicoll M. T. Tuominen D. R. Lovley Nature 2005 435 1098 1101
- (2005) Nature , vol.435 , pp. 1098-1101
- Reguera, G.¹ McCarthy, K.D.² Mehta, T.³ Nicoll, J.S.⁴ Tuominen, M.T.⁵ Lovley, D.R.⁶

2
- 80053080692
- D. L. Cologgi S. Lampa-Pastirk A. M. Speers S. D. Kelly G. Reguera Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 15248 15252
- (2011) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.108 , pp. 15248-15252
- Cologgi, D.L.¹ Lampa-Pastirk, S.² Speers, A.M.³ Kelly, S.D.⁴ Reguera, G.⁵

3
- 84885601452
- P. N. Reardon K. T. Mueller J. Biol. Chem. 2013 288 29260 29266
- (2013) J. Biol. Chem. , vol.288 , pp. 29260-29266
- Reardon, P.N.¹ Mueller, K.T.²

4
- 33751014053
- G. Reguera K. P. Nevin J. S. Nicoll S. F. Covalla T. L. Woodard D. R. Lovley Appl. Environ. Microbiol. 2006 72 7345 7348
- (2006) Appl. Environ. Microbiol. , vol.72 , pp. 7345-7348
- Reguera, G.¹ Nevin, K.P.² Nicoll, J.S.³ Covalla, S.F.⁴ Woodard, T.L.⁵ Lovley, D.R.⁶

5
- 33947400655
- G. Reguera R. B. Pollina J. S. Nicoll D. R. Lovley J. Bacteriol. 2007 189 2125 2127
- (2007) J. Bacteriol. , vol.189 , pp. 2125-2127
- Reguera, G.¹ Pollina, R.B.² Nicoll, J.S.³ Lovley, D.R.⁴

6
- 33747872707
- L. Craig N. Volkmann A. S. Arvai M. E. Pique M. Yeager E. H. Egelman J. A. Tainer Mol. Cell 2006 23 651 662
- (2006) Mol. Cell , vol.23 , pp. 651-662
- Craig, L.¹ Volkmann, N.² Arvai, A.S.³ Pique, M.E.⁴ Yeager, M.⁵ Egelman, E.H.⁶ Tainer, J.A.⁷

7
- 42649085698
- V. Pelicic Mol. Microbiol. 2008 68 827 837
- (2008) Mol. Microbiol. , vol.68 , pp. 827-837
- Pelicic, V.¹

8
- 84864771239
- G. T. Feliciano A. J. R. da Silva G. Reguera E. Artacho J. Phys. Chem. A 2012 116 8023 8030
- (2012) J. Phys. Chem. A , vol.116 , pp. 8023-8030
- Feliciano, G.T.¹ Da Silva, A.J.R.² Reguera, G.³ Artacho, E.⁴

9
- 41949117894
- L. Craig J. Li Curr. Opin. Struct. Biol. 2008 18 267 277
- (2008) Curr. Opin. Struct. Biol. , vol.18 , pp. 267-277
- Craig, L.¹ Li, J.²

10
- 0242500928
- Y.-g. K. Shin M. D. Newton S. S. Isied J. Am. Chem. Soc. 2003 125 3722 3732
- (2003) J. Am. Chem. Soc. , vol.125 , pp. 3722-3732
- Shin, Y.-G.K.¹ Newton, M.D.² Isied, S.S.³

11
- 84555178484
- J. P. Veazey G. Reguera S. H. Tessmer Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2011 84 060901
- (2011) Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. , vol.84 , pp. 060901
- Veazey, J.P.¹ Reguera, G.² Tessmer, S.H.³

12
- 84926177674
- N. S. Malvankar S. E. Yalcin M. T. Tuominen D. R. Lovley Nat. Nanotechnol. 2014 9 1012 1017
- (2014) Nat. Nanotechnol. , vol.9 , pp. 1012-1017
- Malvankar, N.S.¹ Yalcin, S.E.² Tuominen, M.T.³ Lovley, D.R.⁴

13
- 80052557316
- N. S. Malvankar M. Vargas K. P. Nevin A. E. Franks C. Leang B. C. Kim K. Inoue T. Mester S. F. Covalla J. P. Johnson V. M. Rotello M. T. Tuominen D. R. Lovley Nat. Nanotechnol. 2011 6 573 579
- (2011) Nat. Nanotechnol. , vol.6 , pp. 573-579
- Malvankar, N.S.¹ Vargas, M.² Nevin, K.P.³ Franks, A.E.⁴ Leang, C.⁵ Kim, B.C.⁶ Inoue, K.⁷ Mester, T.⁸ Covalla, S.F.⁹ Johnson, J.P.¹⁰ Rotello, V.M.¹¹ Tuominen, M.T.¹² Lovley, D.R.¹³

14
- 84881109235
- P. S. Bonanni D. Massazza J. P. Busalmen Phys. Chem. Chem. Phys. 2013 15 10300 10306
- (2013) Phys. Chem. Chem. Phys. , vol.15 , pp. 10300-10306
- Bonanni, P.S.¹ Massazza, D.² Busalmen, J.P.³

15
- 84929494201
- N. S. Malvankar M. Vargas K. Nevin P. L. Tremblay K. Evans-Lutterodt D. Nykypanchuk E. Martz M. T. Tuominen D. R. Lovley mBio 2015 6 e00084
- (2015) MBio , vol.6 , pp. e00084
- Malvankar, N.S.¹ Vargas, M.² Nevin, K.³ Tremblay, P.L.⁴ Evans-Lutterodt, K.⁵ Nykypanchuk, D.⁶ Martz, E.⁷ Tuominen, M.T.⁸ Lovley, D.R.⁹

16
- 84924858277
- H. Yan C. Chuang A. Zhugayevych S. Tretiak F. W. Dahlquist G. C. Bazan Adv. Mater. 2015 27 1908 1911
- (2015) Adv. Mater. , vol.27 , pp. 1908-1911
- Yan, H.¹ Chuang, C.² Zhugayevych, A.³ Tretiak, S.⁴ Dahlquist, F.W.⁵ Bazan, G.C.⁶

17
- 2442589577
- L. Craig M. E. Pique J. A. Tainer Nat. Rev. Microbiol. 2004 2 363 378
- (2004) Nat. Rev. Microbiol. , vol.2 , pp. 363-378
- Craig, L.¹ Pique, M.E.² Tainer, J.A.³

18
- 56849116199
- G. Launay T. Simonson BMC Bioinf. 2008 9 427
- (2008) BMC Bioinf. , vol.9 , pp. 427
- Launay, G.¹ Simonson, T.²

19
- 0042386609
- P. Aloy H. Ceulemans A. Stark R. B. Russell J. Mol. Biol. 2003 332 989 998
- (2003) J. Mol. Biol. , vol.332 , pp. 989-998
- Aloy, P.¹ Ceulemans, H.² Stark, A.³ Russell, R.B.⁴

20
- 84858122862
- A. Nurisso A. Daina R. C. Walker Methods Mol. Biol. 2012 857 137 173
- (2012) Methods Mol. Biol. , vol.857 , pp. 137-173
- Nurisso, A.¹ Daina, A.² Walker, R.C.³

21
- 46249092554
- B. Hess C. Kutzner D. van der Spoel E. Lindahl J. Chem. Theory Comput. 2008 4 435 447
- (2008) J. Chem. Theory Comput. , vol.4 , pp. 435-447
- Hess, B.¹ Kutzner, C.² Van Der Spoel, D.³ Lindahl, E.⁴

22
- 34547241687
- C. Kutzner D. van der Spoel M. Fechner E. Lindahl U. W. Schmitt B. L. de Groot H. Grubmuller J. Comput. Chem. 2007 28 2075 2084
- (2007) J. Comput. Chem. , vol.28 , pp. 2075-2084
- Kutzner, C.¹ Van Der Spoel, D.² Fechner, M.³ Lindahl, E.⁴ Schmitt, U.W.⁵ De Groot, B.L.⁶ Grubmuller, H.⁷

23
- 27344454932
- D. Van Der Spoel E. Lindahl B. Hess G. Groenhof A. E. Mark H. J. Berendsen J. Comput. Chem. 2005 26 1701 1718
- (2005) J. Comput. Chem. , vol.26 , pp. 1701-1718
- Van Der Spoel, D.¹ Lindahl, E.² Hess, B.³ Groenhof, G.⁴ Mark, A.E.⁵ Berendsen, H.J.⁶

24
- 32144432437
- K. Arnold L. Bordoli J. Kopp T. Schwede Bioinformatics 2006 22 195 201
- (2006) Bioinformatics , vol.22 , pp. 195-201
- Arnold, K.¹ Bordoli, L.² Kopp, J.³ Schwede, T.⁴

25
- 61449229355
- L. Bordoli F. Kiefer K. Arnold P. Benkert J. Battey T. Schwede Nat. Protoc. 2008 4 1 13
- (2008) Nat. Protoc. , vol.4 , pp. 1-13
- Bordoli, L.¹ Kiefer, F.² Arnold, K.³ Benkert, P.⁴ Battey, J.⁵ Schwede, T.⁶

26
- 33748518255
- V. Hornak R. Abel A. Okur B. Strockbine A. Roitberg C. Simmerling Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2006 65 712 725
- (2006) Proteins: Struct., Funct., Bioinf. , vol.65 , pp. 712-725
- Hornak, V.¹ Abel, R.² Okur, A.³ Strockbine, B.⁴ Roitberg, A.⁵ Simmerling, C.⁶

27
- 0004016501
- W. L. Jorgensen J. Chandrasekhar J. D. Madura R. W. Impey M. L. Klein J. Chem. Phys. 1983 79 926
- (1983) J. Chem. Phys. , vol.79 , pp. 926
- Jorgensen, W.L.¹ Chandrasekhar, J.² Madura, J.D.³ Impey, R.W.⁴ Klein, M.L.⁵

28
- 0000388705
- B. Hess H. Bekker H. J. C. Berendsen J. G. E. M. Fraaije J. Comput. Chem. 1997 18 1463 1472
- (1997) J. Comput. Chem. , vol.18 , pp. 1463-1472
- Hess, B.¹ Bekker, H.² Berendsen, H.J.C.³ Fraaije, J.G.E.M.⁴

29
- 0029878720
- 27-38
- W. Humphrey A. Dalke K. Schulten J. Mol. Graphics 1996 14 33 38
- (1996) J. Mol. Graphics , vol.14 , pp. 33-38
- Humphrey, W.¹ Dalke, A.² Schulten, K.³

30
- 33645941402
- W. L. Jorgensen J. Tirado-Rives J. Am. Chem. Soc. 1988 110 1657
- (1988) J. Am. Chem. Soc. , vol.110 , pp. 1657
- Jorgensen, W.L.¹ Tirado-Rives, J.²

31
- 84875592758
- S. Pronk S. Pall R. Schulz P. Larsson P. Bjelkmar R. Apostolov M. R. Shirts J. C. Smith P. M. Kasson D. van der Spoel B. Hess E. Lindahl Bioinformatics 2013 29 845 854
- (2013) Bioinformatics , vol.29 , pp. 845-854
- Pronk, S.¹ Pall, S.² Schulz, R.³ Larsson, P.⁴ Bjelkmar, P.⁵ Apostolov, R.⁶ Shirts, M.R.⁷ Smith, J.C.⁸ Kasson, P.M.⁹ Van Der Spoel, D.¹⁰ Hess, B.¹¹ Lindahl, E.¹²

32
- 0028050079
- F. Caccavo, Jr. D. J. Lonergan D. R. Lovley M. Davis J. F. Stolz M. J. McInerney Appl. Environ. Microbiol. 1994 60 3752 3759
- (1994) Appl. Environ. Microbiol. , vol.60 , pp. 3752-3759
- Caccavo, Jr.F.¹ Lonergan, D.J.² Lovley, D.R.³ Davis, M.⁴ Stolz, J.F.⁵ McInerney, M.J.⁶

33
- 0035407383
- M. V. Coppi C. Leang S. J. Sandler D. R. Lovley Appl. Environ. Microbiol. 2001 67 3180 3187
- (2001) Appl. Environ. Microbiol. , vol.67 , pp. 3180-3187
- Coppi, M.V.¹ Leang, C.² Sandler, S.J.³ Lovley, D.R.⁴

34
- 84855754203
- A. M. Speers G. Reguera Appl. Environ. Microbiol. 2012 78 437 444
- (2012) Appl. Environ. Microbiol. , vol.78 , pp. 437-444
- Speers, A.M.¹ Reguera, G.²

35
- 21144443141
- B. C. Kim C. Leang Y. H. Ding R. H. Glaven M. V. Coppi D. R. Lovley J. Bacteriol. 2005 187 4505 4513
- (2005) J. Bacteriol. , vol.187 , pp. 4505-4513
- Kim, B.C.¹ Leang, C.² Ding, Y.H.³ Glaven, R.H.⁴ Coppi, M.V.⁵ Lovley, D.R.⁶

36
- 33847670407
- L. L. Stookey Anal. Chem. 1970 42 779 781
- (1970) Anal. Chem. , vol.42 , pp. 779-781
- Stookey, L.L.¹

37
- 32044458157
- J. B. McKinlay J. G. Zeikus C. Vieille Appl. Environ. Microbiol. 2005 71 6651 6656
- (2005) Appl. Environ. Microbiol. , vol.71 , pp. 6651-6656
- McKinlay, J.B.¹ Zeikus, J.G.² Vieille, C.³

38
- 84876911425
- J. L. Baker N. Biais F. Tama PLoS Comput. Biol. 2013 9 e1003032
- (2013) PLoS Comput. Biol. , vol.9 , pp. e1003032
- Baker, J.L.¹ Biais, N.² Tama, F.³

39
- 77954907406
- N. Biais D. L. Higashi J. Brujić M. So M. P. Sheetz Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 11358 11363
- (2010) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.107 , pp. 11358-11363
- Biais, N.¹ Higashi, D.L.² Brujić, J.³ So, M.⁴ Sheetz, M.P.⁵

40
- 43849113277
- M. Cordes A. Kottgen C. Jasper O. Jacques H. Boudebous B. Giese Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 3461 3463
- (2008) Angew. Chem., Int. Ed. , vol.47 , pp. 3461-3463
- Cordes, M.¹ Kottgen, A.² Jasper, C.³ Jacques, O.⁴ Boudebous, H.⁵ Giese, B.⁶

41
- 46449093308
- C. Shih A. K. Museth M. Abrahamsson A. M. Blanco-Rodriguez A. J. Di Bilio J. Sudhamsu B. R. Crane K. L. Ronayne M. Towrie A. Vlcek, Jr. J. H. Richards J. R. Winkler H. B. Gray Science 2008 320 1760 1762
- (2008) Science , vol.320 , pp. 1760-1762
- Shih, C.¹ Museth, A.K.² Abrahamsson, M.³ Blanco-Rodriguez, A.M.⁴ Di Bilio, A.J.⁵ Sudhamsu, J.⁶ Crane, B.R.⁷ Ronayne, K.L.⁸ Towrie, M.⁹ Vlcek, A.¹⁰ Richards, J.H.¹¹ Winkler, J.R.¹² Gray, H.B.¹³

42
- 32044443628
- N. Ashkenasy W. S. Horne M. R. Ghadiri Small 2006 2 99 102
- (2006) Small , vol.2 , pp. 99-102
- Ashkenasy, N.¹ Horne, W.S.² Ghadiri, M.R.³

43
- 67650563880
- C. Wittekindt M. Schwarz T. Friedrich T. Koslowski J. Am. Chem. Soc. 2009 131 8134 8140
- (2009) J. Am. Chem. Soc. , vol.131 , pp. 8134-8140
- Wittekindt, C.¹ Schwarz, M.² Friedrich, T.³ Koslowski, T.⁴

44
- 84939786123
- E. Marsili J. Sun D. R. Bond Electroanalysis 2010 22
- (2010) Electroanalysis , pp. 22
- Marsili, E.¹ Sun, J.² Bond, D.R.³

45
- 0032546782
- G. B. McGaughey M. Gagné A. K. Rappé J. Biol. Chem. 1998 273 15458 15463
- (1998) J. Biol. Chem. , vol.273 , pp. 15458-15463
- McGaughey, G.B.¹ Gagné, M.² Rappé, A.K.³

46
- 0037197928
- J. L. Bredas J. P. Calbert D. A. da Silva Filho J. Cornil Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 5804 5809
- (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.99 , pp. 5804-5809
- Bredas, J.L.¹ Calbert, J.P.² Da Silva Filho, D.A.³ Cornil, J.⁴

47
- 57549111042
- B. Giese M. Graber M. Cordes Curr. Opin. Chem. Biol. 2008 12 755 759
- (2008) Curr. Opin. Chem. Biol. , vol.12 , pp. 755-759
- Giese, B.¹ Graber, M.² Cordes, M.³

48
- 84862202391
- C. R. Martinez B. L. Iverson Chem. Sci. 2012 3 2191 2201
- (2012) Chem. Sci. , vol.3 , pp. 2191-2201
- Martinez, C.R.¹ Iverson, B.L.²

49
- 67649586806
- S. Y. Reece D. G. Nocera Annu. Rev. Biochem. 2009 78 673 699
- (2009) Annu. Rev. Biochem. , vol.78 , pp. 673-699
- Reece, S.Y.¹ Nocera, D.G.²

50
- 0038208381
- J. Stubbe D. G. Nocera C. S. Yee M. C. Chang Chem. Rev. 2003 103 2167 2201
- (2003) Chem. Rev. , vol.103 , pp. 2167-2201
- Stubbe, J.¹ Nocera, D.G.² Yee, C.S.³ Chang, M.C.⁴

51
- 84880037294
- M. Vargas N. S. Malvankar P. L. Tremblay C. Leang J. A. Smith P. Patel O. Synoeyenbos-West K. P. Nevin D. R. Lovley mBio 2013 4 e00105 e00113
- (2013) MBio , vol.4 , pp. e00105-e00113
- Vargas, M.¹ Malvankar, N.S.² Tremblay, P.L.³ Leang, C.⁴ Smith, J.A.⁵ Patel, P.⁶ Synoeyenbos-West, O.⁷ Nevin, K.P.⁸ Lovley, D.R.⁹

52
- 0036381958
- X. Chen P. S. Stewart Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002 59 718 720
- (2002) Appl. Microbiol. Biotechnol. , vol.59 , pp. 718-720
- Chen, X.¹ Stewart, P.S.²

53
- 77955659296
- H. C. Flemming J. Wingender Nat. Rev. Microbiol. 2010 8 623 633
- (2010) Nat. Rev. Microbiol. , vol.8 , pp. 623-633
- Flemming, H.C.¹ Wingender, J.²

54
- 2542485557
- T. Durkop B. M. Kim M. S. Fuhrer J. Phys.: Condens. Matter 2004 16 R553 R580
- (2004) J. Phys.: Condens. Matter , vol.16 , pp. R553-R580
- Durkop, T.¹ Kim, B.M.² Fuhrer, M.S.³

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.