Molecular architecture of heparin and heparan sulfate: Recent developments in solution structural studies

Pure and Applied Chemistry

Volumn 84, Issue 1, 2012, Pages 65-76

  Mulloy, Barbara ^a   Khan, Sanaullah ^b   Perkins, Stephen J ^b  

^a NATIONAL INSTITUTE FOR BIOLOGICAL STANDARDS AND CONTROL   (United Kingdom)

^b UNIVERSITY COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

Author keywords

Analytical ultracentrifugation; Heparan sulfate; Heparin; NMR spectroscopy; X ray scattering

Indexed keywords

CENTRIFUGATION; GLUCOSE; HYDRAULIC STRUCTURES; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PEPTIDES; SULFUR COMPOUNDS;

3D STRUCTURE; ANALYTICAL ULTRACENTRIFUGATION; CHEMOKINES; COMPLEX STRUCTURE; CYTOKINES; EXTRACELLULAR PROTEINS; GLYCOSAMINOGLYCANS; GROWTH FACTOR; HEPARAN SULFATES; HEPARIN; INTERNAL DYNAMICS; MOLECULAR ARCHITECTURE; MORPHOGENS; NEW STUDY; OVERALL-MODEL; PHYSIOLOGICAL FUNCTIONS; PROTEIN-BINDING; PYRANOSE; RELATIVE DEGREES; STRUCTURAL STUDIES;

POLYSACCHARIDES;

EID: 84930482695     PISSN: 00334545     EISSN: 13653075     Source Type: Journal    
DOI: 10.1351/PAC-CON-11-10-27     Document Type: Article

References (65)

1. K. Sugahara, H. Kitagawa. IUBMB Life 54, 163 (2002).
2. C. L. Merry, M. Lyon, J. A. Deakin, J. J. Hopwood, J. T. Gallagher. J. Biol. Chem. 274, 18455 (1999).
3. M. Mobli, M. Nilsson, A. Almond. Glycoconjugate J. 25, 401 (2008).
4. D. R. Al, R. Wagenvoord, G. W. van Dedem, S. Beguin, H. C. Hemker. J. Thromb. Haemost. 1, 907 (2003).
5. K. L. Kramer. Semin. Cell Dev. Biol. 21, 631 (2010).
6. J. Kreuger, D. Spillmann, J. P. Li, U. Lindahl. J. Cell Biol. 174, 323 (2006).
7. B. Mulloy. An. Acad. Bras. Cienc. 77, 651 (2005).
8. E. Seyrek, P. Dubin. Adv. Colloid Interface Sci. 158, 119 (2010).
9. N. S. Gandhi, R. L. Mancera. Chem. Biol. Drug Des. 72, 455 (2008).
10. M. A. Skidmore, S. E. Guimond, T. R. Rudd, D. G. Fernig, J. E. Turnbull, E. A. Yates. Connect. Tissue Res. 49, 140 (2008).
11. D. R. Coombe, W. C. Kett. Cell Mol. Life Sci. 62, 410 (2005).
12. B. Mulloy, M. J. Forster. Glycobiology 10, 1147 (2000).
13. I. Capila, R. J. Linhardt. Angew. Chem., Int. Ed. 41, 391 (2002).
14. S. Khan, J. Gor, B. Mulloy, S. J. Perkins. J. Mol. Biol. 395, 504 (2010).
15. A. Imberty, H. Lortat-Jacob, S. Perez. Carbohydr. Res. 342, 430 (2007).
16. E. Gray, B. Mulloy, T. W. Barrowcliffe. Thromb. Haemost. 99, 807 (2008).
17. T. R. Rudd, M. A. Skidmore, M. Guerrini, M. Hricovini, A. K. Powell, G. Siligardi, E. A. Yates. Curr. Opin. Struct. Biol. 20, 567 (2010).
18. S. Nadanaka, H. Kitagawa. J. Biochem. 144, 7 (2008).
19. J. Sheng, R. Liu, Y. Xu, J. Liu. J. Biol. Chem. 286, 19768 (2011).
20. P. Carlsson, J. Presto, D. Spillmann, U. Lindahl, L. Kjellen. J. Biol. Chem. 283, 20008 (2008).
21. M. Warda, T. Toida, F. Zhang, P. Sun, E. Munoz, J. Xie, R. J. Linhardt. Glycoconjugate J. 23, 555 (2006).
22. A. Parra, N. Veraldi, M. Locatelli, M. Fini, L. Martini, G. Torri, L. Sangiorgi, A. Bisio. Glycobiology (2012). In press.
23. G. O. Staples, X. Shi, J. Zaia. J. Biol. Chem. 285, 18336 (2010).
24. M. Lyon, J. A. Deakin, J. T. Gallagher. J. Biol. Chem. 269, 11208 (1994).
25. J. Schlessinger, A. N. Plotnikov, O. A. Ibrahimi, A. V. Eliseenkova, B. K. Yeh, A. Yayon, R. J. Linhardt, M. Mohammadi. Mol. Cell 6, 743 (2000).
26. N. C. Smits, S. Kurup, A. L. Rops, G. B. ten Dam, L. F. Massuger, T. Hafmans, J. E. Turnbull, D. Spillmann, J. P. Li, S. J. Kennel, J. S. Wall, N. W. Shworak, P. N. Dekhuijzen, J. van der Vlag, T. H. van Kuppevelt. J. Biol. Chem. 285, 41143 (2010).
27. K. J. Murphy, C. L. Merry, M. Lyon, J. E. Thompson, I. S. Roberts, J. T. Gallagher. J. Biol. Chem. 279, 27239 (2004).
28. W. C. Lamanna, I. Kalus, M. Padva, R. J. Baldwin, C. L. Merry, T. Dierks. J. Biotechnol. 129, 290 (2007).
29. S. D. Rosen, H. Lemjabbar-Alaoui. Exp. Opin. Ther. Targets 14, 935 (2010).
30. B. Mulloy, M. J. Forster, C. Jones, D. B. Davies. Biochem. J. 293 (Pt. 3), 849 (1993).
31. B. Mulloy, R. J. Linhardt. Curr. Opin. Struct. Biol. 11, 623 (2001).
32. B. Mulloy, M. J. Forster, C. Jones, A. F. Drake, E. A. Johnson, D. B. Davies. Carbohydr. Res. 255, 1 (1994).
33. A. D. DiGabriele, I. Lax, D. I. Chen, C. M. Svahn, M. Jaye, J. Schlessinger, W. A. Hendrickson. Nature 393, 812 (1998).
34. J. Kreuger, M. Salmivirta, L. Sturiale, G. Gimenez-Gallego, U. Lindahl. J. Biol. Chem. 276, 30744 (2001).
35. T. R. Rudd, K. A. Uniewicz, A. Ori, S. E. Guimond, M. A. Skidmore, D. Gaudesi, R. Xu, J. E. Turnbull, M. Guerrini, G. Torri, G. Siligardi, M. C. Wilkinson, D. G. Fernig, E. A. Yates. Org. Biomol. Chem. 8, 5390 (2010).
36. R. Lucas, J. Angulo, P. M. Nieto, M. Martin-Lomas. Org. Biomol. Chem. 1, 2253 (2003).
37. J. Angulo, R. Ojeda, J. L. de Paz, R. Lucas, P. M. Nieto, R. M. Lozano, M. Redondo-Horcajo, G. Gimenez-Gallego, M. Martin-Lomas. ChemBioChem 5, 55 (2004).
38. J. Angulo, M. Hricovini, M. Gairi, M. Guerrini, J. L. de Paz, R. Ojeda, M. Martin-Lomas, P. M. Nieto. Glycobiology 15, 1008 (2005).
39. G. Gatti, B. Casu, A. S. Perlin. Biochem. Biophys. Res. Commun. 85, 14 (1978).
40. C. F. Becker, J. A. Guimaraes, H. Verli. Carbohydr. Res. 340, 1499 (2005).
41. H. Verli, J. A. Guimaraes. Carbohydr. Res. 339, 281 (2004).
42. L. Pol-Fachin, H. Verli. Carbohydr. Res. 343, 1435 (2008).
43. B. M. Sattelle, S. U. Hansen, J. Gardiner, A. Almond. J. Am. Chem. Soc. 132, 13132 (2010).
44. J. Angulo, P. M. Nieto, M. Martin-Lomas. Chem. Commun. 1512 (2003).
45. N. S. Gandhi, R. L. Mancera. Carbohydr. Res. 345, 689 (2010).
46. M. Forster, B. Mulloy. Biopolymers 33, 575 (1993).
47. B. M. Sattelle, S. U. Hansen, J. Gardiner, A. Almond. J. Am. Chem. Soc. 132, 13132 (2010).
48. M. Hricovini. Carbohydr. Res. 341, 2575 (2006).
49. M. Hricovini, F. Bizik. Carbohydr. Res. 342, 779 (2007).
50. M. Hricovini, E. Scholtzova, F. Bizik. Carbohydr. Res. 342, 1350 (2007).
51. M. Hricovini. J. Phys. Chem. B 115, 1503 (2011).
52. L. Jin, M. Hricovini, J. A. Deakin, M. Lyon, D. Uhrin. Glycobiology 19, 1185 (2009).
53. T. R. Rudd, S. E. Guimond, M. A. Skidmore, L. Duchesne, M. Guerrini, G. Torri, C. Cosentino, A. Brown, D. T. Clarke, J. E. Turnbull, D. G. Fernig, E. A. Yates. Glycobiology 17, 983 (2007).
54. E. Seyrek, P. L. Dubin, J. Henriksen. Biopolymers 86, 249 (2007).
55. B. Richard, R. Swanson, S. T. Olson. J. Biol. Chem. 284, 27054 (2009).
56. M. Guerrini, S. Elli, D. Gaudesi, G. Torri, B. Casu, P. Mourier, F. Herman, C. Boudier, M. Lorenz, C. Viskov. J. Med. Chem. 53, 8030 (2010).
57. M. Hricovini, M. Guerrini, G. Torri, B. Casu. Carbohydr. Res. 300, 69 (1997).
58. S. J. Perkins, R. Nan, K. Li, S. Khan, Y. Abe. Methods 54, 181 (2011).
59. S. J. Perkins, A. I. Okemefuna, R. Nan, K. Li, A. Bonner. J. R. Soc. Interface 6, Suppl. 5, S679 (2009).
60. G. Pavlov, S. Finet, K. Tatarenko, E. Korneeva, C. Ebel. Eur. Biophys. J. 32, 437 (2003).
61. S. J. Perkins, R. Nan, K. Li, S. Khan, Y. Abe. Methods 54, 181 (2011).
62. S. Khan, E. Rodriguez, R. Patel, J. Gor, B. Mulloy, S. J. Perkins. J. Biol. Chem. 286, 24842 (2011).
63. R. L. Stevens, R. Adachi. Immunol. Rev. 217, 155 (2007).
64. R. Liu, Y. Xu, M. Chen, M. Weiwer, X. Zhou, A. S. Bridges, P. L. DeAngelis, Q. Zhang, R. J. Linhardt, J. Liu. J. Biol. Chem. 285, 34240 (2010).
65. A. Varki, R. D. Cummings, J. D. Esko, H. H. Freeze, P. Stanley, J. D. Marth, C. R. Bertozzi, G.W. Hart, M. E. Etzler. Proteomics 9, 5398 (2009).