Quencher-free fluorescent method for homogeneously sensitive detection of micrornas in human lung tissues

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 22, 2014, Pages 11410-11416

  Zhu, Guichi ^a   Liang, Li ^b   Zhang, Chun Yang ^a  

^a SHENZHEN INSTITUTES OF ADVANCED TECHNOLOGY   (China)

^b PEKING UNIVERSITY THIRD HOSPITAL   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL ORGANS; DIAGNOSIS; DISEASES; DNA; FLUORESCENCE; HISTOLOGY; PROBES; QUENCHING; RECYCLING; RESPIRATORY SYSTEM; SIGNAL DETECTION; TISSUE; TISSUE ENGINEERING;

BIOLOGICAL FUNCTIONS; CLINICAL DIAGNOSIS; ENHANCED FLUORESCENCE; FLUORESCENT METHODS; NON SMALL CELL LUNG CANCER; SENSITIVE DETECTION; SIGNAL AMPLIFICATIONS; STACKING INTERACTION;

RNA;

2 AMINOPURINE; FLUORESCENT DYE; MICRORNA;

CHEMISTRY; FLUORESCENCE; HUMAN; LUNG; METABOLISM;

2-AMINOPURINE; FLUORESCENCE; FLUORESCENT DYES; HUMANS; LUNG; MICRORNAS;

EID: 84922574771     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac503365z     Document Type: Article

References (51)

1. Kim, V. N.; Han, J.; Siomi, M. C. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2009, 10, 126-139
2. Krol, J.; Loedige, I.; Filipowicz, W. Nat. Rev. Genet. 2010, 11, 597-610
3. Calin, G. A.; Croce, C. M. Nat. Rev. Cancer 2006, 6, 857-866
4. Bartel, D. P. Cell 2004, 116, 281-297
5. Bartel, D. P.; Chen, C. Z. Nat. Rev. Genet. 2004, 5, 396-400
6. Yanaihara, N.; Caplen, N.; Bowman, E.; Seike, M.; Kumamoto, K.; Yi, M.; Stephens, R. M.; Okamoto, A.; Yokota, J.; Tanaka, T.; Calin, G. A.; Liu, C. G.; Croce, C. M.; Harris, C. C. Cancer Cell 2006, 9, 189-198
7. Pope, C. A.; Burnett, R. T.; Thun, M. J.; Calle, E. E.; Krewski, D.; Kazuhiko, I.; Thurston, G. D. JAMA, J. Am. Med. Assoc. 2002, 287, 1132-1141
8. Murakami1, Y.; Yasuda, T.; Saigo, K.; Urashima, T.; Toyoda, H.; Okanoue, T.; Shimotohno, K. Oncogene 2006, 25, 2537-2545
9. Iorio, M. V.; Ferracin, M.; Liu, C. G.; Veronese, A.; Spizzo, R.; Sabbioni, S.; Magri, E.; Pedriali, M.; Fabbri, M.; Campiglio, M.; Menard, S.; Palazzo, J. P.; Rosenberg, A.; Musiani, P.; Volinia, S.; Nenci, I.; Calin, G. A.; Querzoli, P.; Negrini, M.; Croce, C. M. Cancer Res. 2005, 65, 7065-7070
10. Tsujiura, M.; Ichikawa, D.; Komatsu, S.; Shiozaki, A.; Takeshita, H.; Kosuga, T.; Konishi, H.; Morimura, R.; Deguchi, K.; Fujiwara, H.; Okamoto, K.; Otsuji, E. Br. J. Cancer 2010, 102, 1174-1179
11. Raymond, C. K.; Roberts, B. S.; Garrett-Engele, P.; Lim, L. P.; Johnson, J. M. RNA 2005, 11, 1737-1744
12. Bartels, C. L.; Tsongalis, G. J. Clin. Chem. 2009, 55, 623-631
13. Jemal, A.; Bray, F.; Center, M. M.; Ferlay, J.; Ward, E.; Forman, D. Ca-Cancer J. Clin. 2011, 61, 69-90
14. Boeri, M.; Verri, C.; Conte, D.; Roz, L.; Modena, P.; Facchinetti, F.; Calabro, E.; Croce, C. M.; Pastorino, U.; Sozzi, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011, 108, 3713-3718
15. Chin, L. J.; Ratner, E.; Leng, S.; Zhai, R.; Nallur, S.; Babar, I.; Muller, R. U.; Straka, E.; Su, L.; Burki, E. A.; Crowell, R. E.; Patel, R.; Kulkarni, T.; Homer, R.; Zelterman, D.; Kidd, K. K.; Zhu, Y.; Christiani, D. C.; Belinsky, S. A.; Slack, F. J.; Weidhaas, J. B. Cancer Res. 2008, 68, 8535-8540
16. Lagos-Quintana, M.; Rauhut, R.; Lendeckel, W.; Tuschl, T. Science 2001, 294, 853-858
17. Thomson, J. M.; Parker, J.; Perou, C. M.; Hammond, S. M. Nat. Methods 2004, 1, 47-53
18. Lee, J.; Cho, H.; Jung, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 8662-8665
19. Chen, C.; Ridzon, D. A.; Broomer, A. J.; Zhou, Z.; Lee, D. H.; Nguyen, J. T.; Barbisin, M.; Xu, N. L.; Mahuvakar, V. R.; Andersen, M. R.; Lao, K. Q.; Livak, K. J.; Guegler, K. J. Nucleic Acids Res. 2005, 33, e179
20. Li, J.; Yao, B.; Huang, H.; Wang, Z.; Sun, C.; Fan, Y.; Chang, Q.; Li, S.; Wang, X.; Xi, J. Anal. Chem. 2009, 81, 5446-5451
21. Cheng, Y.; Zhang, X.; Li, Z.; Jiao, X.; Wang, Y.; Zhang, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 3268-3272
22. Li, Y.; Liang, L.; Zhang, C. Y. Anal. Chem. 2013, 85, 11174-11179
23. Jia, H.; Li, Z.; Liu, C.; Cheng, Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 5498-5501
24. Zhang, Y.; Zhang, C. Y. Anal. Chem. 2012, 84, 224-231
25. Wang, G. L.; Zhang, C. Y. Anal. Chem. 2012, 84, 7037-7042
26. Duan, R.; Zuo, X.; Wang, S.; Quan, X.; Chen, D.; Chen, Z.; Jiang, L.; Fan, C.; Xia, F. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 4604-4607
27. Gao, Z.; Yang, Z. Anal. Chem. 2006, 78, 1470-1477
28. Wang, J.; Yi, X.; Tang, H.; Han, H.; Wu, M.; Zhou, F. Anal. Chem. 2012, 84, 6400-6406
29. Fang, S.; Lee, H. J.; Wark, A. W.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14044-14046
30. Shi, C.; Liu, Q.; Ma, C.; Zhong, W. Anal. Chem. 2014, 86, 336-339
31. Liu, H.; Li, L.; Duan, L.; Wang, X.; Xie, Y.; Tong, L.; Wang, Q.; Tang, B. Anal. Chem. 2013, 85, 7941-7947
32. Zhang, P.; Zhang, J.; Wang, C.; Liu, C.; Wang, H.; Li, Z. Anal. Chem. 2014, 86, 1076-1082
33. Cheng, Y.; Lei, J.; Chen, Y.; Ju, H. Biosens. Bioelectron. 2014, 51, 431-436
34. Ren, Y.; Deng, H.; Shen, W.; Gao, Z. Anal. Chem. 2013, 85, 4784-4789
35. Ryoo, S. R.; Lee, J.; Yeo, J.; Na, H. K.; Kim, Y. K.; Jang, H.; Lee, J. H.; Han, S. W.; Lee, Y.; Kim, V. N.; Min, D. H. ACS Nano 2013, 7, 5882-5891
36. Sowers, L. C.; Fazakerly, G.. V.; Eritja, R.; Kaplan, B. E.; Goodman, M. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1986, 83, 5434-5438
37. Jean, J. M.; Hall, K. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001, 98, 37-41
38. Mitsis, P. G.; Kwagh, J. G. Nucleic Acids Res. 1999, 27, 3057-3063
39. Xu, Q.; Cao, A.; Zhang, L.; Zhang, C. Y. Anal. Chem. 2012, 84, 10845-10851
40. Marti, A. A.; Jockusch, S.; Li, Z.; Ju, J.; Turro, N. J. Nucleic Acids Res. 2006, 34, e50
41. Eritja, R.; Kaplan, B. E.; Mhaskar, D.; Sowers, L. C.; Petruska, J.; Goodman, M. F. Nucleic Acids Res. 1986, 14, 5869-5885
42. Xu, D. G.; Evans, K. O.; Nordlund, T. M. Biochemistry 1994, 33, 9592-9599
43. Feng, K. J.; Kong, R. M.; Wang, H.; Zhang, S. F.; Qu, F. L. Biosens. Bioelectron. 2012, 38, 121-125
44. Hartig, J. S.; Grune, I.; Najafi-Shoushtari, S. H.; Famulok, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 722-726
45. Baker, M. B.; Bao, G.; Searles, C. D. Nucleic Acids Res. 2012, 40, e13
46. Harcourt, E. M.; Kool, E. T. Nucleic Acids Res. 2012, 40, e65
47. Esquela-Kerscher, A.; Slack, F. J. Nat. Rev. Cancer 2006, 6, 259-269
48. Kumar, M. S.; Erkeland, S. J.; Pester, R. E.; Chen, C. Y.; Ebert, M. S.; Sharp, P. A.; Jacks, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008, 105, 3903-3908
49. Johnson, S. M.; Grosshans, H.; Shingara, J.; Byrom, M.; Jarvis, R.; Cheng, A.; Labourier, E.; Reinert, K. L.; Brown, D.; Slack, F. J. Cell 2005, 120, 635-647
50. Takamizawa, J.; Konishi, H.; Yanagisawa, K.; Tomida, S.; Osada, H.; Endoh, H.; Harano, T.; Yatabe, Y.; Nagino, M.; Nimura, Y.; Mitsudomi, T.; Takahashi, T. Cancer Res. 2004, 64, 3753-3756
51. Karube, Y.; Tanaka, H.; Osada, H.; Tomida, S.; Tatematsu, Y.; Yanagisawa, K.; Yatabe, Y.; Takamizawa, J.; Miyoshi, S.; Mitsudomi, T.; Takahashi, T. Cancer Sci. 2005, 96, 111-115