Highly-sensitive amplification-free analysis of multiple miRNAs by capillary electrophoresis

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 2, 2015, Pages 1404-1410

  Wegman, David W ^a   Ghasemi, Farhad ^a   Khorshidi, Anna ^b   Yang, Burton B ^b   Liu, Stanley K ^c   Yousef, George M ^d   Krylov, Sergey N ^a  

^a YORK UNIVERSITY   (Canada)

^b UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

^c DEPARTMENT OF RADIATION ONCOLOGY   (Canada)

^d ST MICHAEL'S HOSPITAL   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CAPILLARY ELECTROPHORESIS; ELECTROPHORESIS;

CLINICAL USE; COST PROHIBITIVE; DIRECT QUANTITATIVE ANALYSIS; FULLY AUTOMATED; HYBRIDIZATION ASSAY; ISOTACHOPHORESIS; MICRORNAS; PRE-CONCENTRATION TECHNIQUES;

RNA;

MICRORNA; TUMOR MARKER;

CAPILLARY ELECTROPHORESIS; EQUIPMENT DESIGN; GENETICS; HUMAN; ISOTACHOPHORESIS; NEOPLASM; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; PROCEDURES; TUMOR CELL LINE;

CELL LINE, TUMOR; ELECTROPHORESIS, CAPILLARY; EQUIPMENT DESIGN; HUMANS; ISOTACHOPHORESIS; MICRORNAS; NEOPLASMS; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; TUMOR MARKERS, BIOLOGICAL;

EID: 84922441973     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac504406s     Document Type: Article

References (39)

1. Iorio, M. V.; Ferracin, M.; Liu, C.-G.; Veronese, A.; Spizzo, R.; Sabbioni, S.; Magri, E.; Pedriali, M.; Fabbri, M.; Campiglio, M.; Menard, S.; Palazzo, J. P.; Rosenberg, A.; Musiani, P.; Volinia, S.; Nenci, I.; Calin, G. A.; Querzoli, P.; Negrini, M.; Croce, C. M. Cancer Res. 2005, 65, 7065-7070
2. Youssef, Y. M.; White, N. M.; Grigull, J.; Krizova, A.; Samy, C.; Mejia-Guerrero, S.; Evans, A.; Yousef, G. M. Eur. Urol. 2001, 9, 721-730
3. Liu, C.-G.; Calin, G. A.; Meloon, B.; Gamliel, N.; Sevignani, C.; Ferracin, M.; Dumitru, C. D.; Shimizu, M.; Zupo, S.; Dono, M.; Alder, H.; Bullrich, F.; Negrini, M.; Croce, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 9740-9744
4. Chevillet, J. R.; Kang, Q.; Ruf, I. K.; Briggs, H. A.; Vojtech, L. N.; Hughes, S. M.; Cheng, H. H.; Arroyo, J. D.; Meredith, E. K.; Gallichotte, E. N.; Pogosova-Agadjanyan, E. L.; Morrissey, C.; Stirewalt, D. L.; Hladik, F.; Yu, E. Y.; Higano, C. S.; Tewari, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2014, 111, 14888-14893
5. Ma, J.; Li, N.; Guarnera, M.; Jiang, F. Biomarker Insights 2013, 8, 127-136
6. Roskell, D. E.; Buley, I. D. BMJ 2004, 329, 244-245
7. Lao, K.; Xu, N. L.; Yeung, V.; Chen, C.; Livak, K. J.; Straus, N. A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2006, 343, 85-89
8. Morin, R. D.; O'Connor, M. D.; Griffith, M.; Kuchenbauer, F.; Delaney, A.; Prabhu, A.-L.; Zhao, Y.; McDonald, H.; Zeng, T.; Hirst, M.; Eaves, C. J.; Marra, M. A. Genome Res. 2008, 18, 610-621
9. Ohtsuka, E.; Nishikawa, S.; Fukumoto, R.; Tanaka, S.; Markham, A. F.; Ikehara, M.; Sugiura, M. Eur. J. Biochem. 1977, 81, 285-291
10. McLaughlin, L. W.; Romaniuk, E.; Romaniuk, P. J.; Neilson, T. Eur. J. Biochem. 1982, 125, 639-643
11. Weiss, E. A.; Gilmartin, G. M.; Nevins, J. R. EMBO J. 1991, 10, 215-219
12. Knutsen, E.; Fiskaa, T.; Ursvik, A.; Jørgensen, T. E.; Perander, M.; Lund, E.; Seternes, O. M.; Johansen, S. D.; Andreassen, M. PLoS One 2013, 8, e75813
13. Kolbert, C. P.; Feddersen, R. M.; Rakhshan, F.; Grill, D. E.; Simon, G.; Middha, S.; Jang, J. S.; Simon, V.; Schultz, D. A.; Zschunke, M.; Lingle, W.; Carr, J. M.; Thompson, E. A.; Oberg, A. L.; Eckloff, B. W.; Wieben, E. D.; Li, P.; Yang, P.; Jen, J. PLoS One 2013, 8, e52517
14. Geiss, G. K.; Bumgarner, R. E.; Birditt, B.; Dahl, T.; Dowidar, N.; Dunaway, D. L.; Fell, H. P.; Ferree, S.; George, R. D.; Grogan, T.; James, J. J.; Maysuria, M.; Mitton, J. D.; Oliveri, P.; Osborn, J. L.; Peng, T.; Ratcliffe, A. L.; Webster, P. J.; Davidson, E. H.; Hood, L. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 317-325
15. Zheng, W.; Chase, T. E.; He, L. Anal. Methods 2014, 6, 2399-2405
16. Zhang, P.; Zhang, J.; Wang, C.; Liu, C.; Wang, H.; Li, Z. Anal. Chem. 2013, 86, 1076-1082
17. Zhang, P.; Liu, Y.; Zhang, Y.; Liu, C.; Wang, Z.; Li, Z. Chem. Commun. 2013, 49, 10013-10015
18. Ho, S.-L.; Chan, H.-M.; Wong, R. N.-S.; Li, H.-W. Anal. Chim. Acta 2014, 823, 61-68
19. Ban, E.; Chae, D.-K.; Song, E. J. J. Chromatogr., A 2013, 1315, 195-199
20. Zhang, G.-J.; Chua, J. H.; Chee, R.-E.; Agarwal, A.; Wong, S. M. Biosens. Bioelectron. 2009, 24, 2504-2508
21. Cissell, K. A.; Rahimi, Y.; Shrestha, S.; Hunt, E. A.; Deo, S. K. Anal. Chem. 2008, 80, 2319-2325
22. Neely, L. A.; Patel, S.; Garver, J.; Gallo, M.; Hackett, M.; McLaughlin, S.; Nadel, M.; Harris, J.; Gullans, S.; Rooke, J. Nat. Methods 2006, 3, 41-46
23. Bahga, S. S.; Santiago, J. G. Analyst 2013, 138, 735-754
24. Garcia-Schwarz, G.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2012, 84, 6366-6369
25. Garcia-Schwarz, G.; Santiago, J. G. Angew. Chem., Int. Ed. 2013, 52, 11534-11537
26. Khan, N.; Cheng, J.; Pezacki, J. P.; Berezovski, M. V. Anal. Chem. 2011, 83, 6196-6201
27. Wegman, D. W.; Krylov, S. N. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 10335-10339
28. Ghasemi, F.; Wegman, D. W.; Kanoatov, M.; Yang, B. B.; Liu, S. K.; Yousef, G. M.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2013, 85, 10062-10066
29. Wegman, D. W.; Cherney, L. T.; Yousef, G. M.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2013, 85, 6518-6523
30. Dodgson, B. J.; Mazouchi, A.; Wegman, D. W.; Gradinaru, C. C.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2012, 84, 5470-5474
31. Bočker, P.; Gebauer, P.; Deml, M. J. Chromatogr., A 1981, 217, 209-224
32. Kaniansky, D.; Marak, J. J. Chromatogr., A 1990, 498, 191-204
33. Krivankova, L.; Gebauer, P.; Bocek, P. J. Chromatogr., A 1995, 16, 35-48
34. Rogacs, A.; Marshall, L. A.; Santiago, J. G. J. Chromatogr., A 2014, 1335, 105-120
35. Garcia-Schwarz, G.; Rogacs, A.; Bahga, S. S.; Santiago, J. G. J. Vis. Exp. 2012, 61, e3890
36. Soengas, M. S.; Gutiérrez, C.; Salas, M. J. Mol. Biol. 1995, 253, 517-529
37. Reinhoud, N. J.; Tjaden, U. R.; van der Greef, J. J. Chromatogr., A 1993, 641, 155-162
38. Tu, J.; Ge, Q.; Wang, S.; Wang, L.; Sun, B.; Yang, Q.; Bai, Y.; Lu, Z. BMC Genomics 2012, 13, 43
39. Wu, Q.; Wang, C.; Lu, Z.; Guo, L.; Ge, Q. Clin. Chim. Acta 2012, 413, 1058-1065