Universal drag tag for direct quantitative analysis of multiple microRNAs

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 13, 2013, Pages 6518-6523

  Wegman, David W ^a   Cherney, Leonid T ^a   Yousef, George M ^b   Krylov, Sergey N ^a  

^a YORK UNIVERSITY   (Canada)

^b ST MICHAEL'S HOSPITAL   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACCURATE MEASUREMENT; BIOLOGICAL SAMPLES; DIFFERENTIAL MOBILITY; DIRECT QUANTITATIVE ANALYSIS; DNA-BINDING PROTEIN; EXPERIMENTAL DATUM; MICRORNA (MIRNA); SIMULTANEOUS ANALYSIS;

AMINO ACIDS; CAPILLARY ELECTROPHORESIS; DRAG; PEPTIDES; SEPARATION;

RNA;

MICRORNA;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CAPILLARY ELECTROPHORESIS; CELL STRAIN MCF 7; CHEMISTRY; DNA PROBE; GENETICS; HUMAN; METHODOLOGY; MOLECULAR GENETICS; PHYSIOLOGY; PROTEIN BINDING;

AMINO ACID SEQUENCE; DNA PROBES; ELECTROPHORESIS, CAPILLARY; HUMANS; MCF-7 CELLS; MICRORNAS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; PROTEIN BINDING;

EID: 84880014188     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac401185g     Document Type: Article

References (33)

1. Visone, R.; Rassenti, L. Z.; Veronese, A.; Taccioli, C.; Costinean, S.; Aguda, B. D.; Volinia, S.; Ferracin, M.; Palatini, J.; Balatti, V.; Alder, H.; Negrini, M.; Kipps, T. J.; Croce, C. M. Blood 2009, 114, 3872-3879
2. Calin, G. A.; Dumitru, C. D.; Shimizu, M.; Bichi, R.; Zupo, S.; Noch, E.; Aldler, H.; Rattan, S.; Keating, M.; Rai, K.; Rassenti, L.; Kipps, T.; Negrini, M.; Bullrich, F.; Croce, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 15524-15529
3. Iorio, M. V.; Ferracin, M.; Liu, C.-G.; Veronese, A.; Spizzo, R.; Sabbioni, S.; Magri, E.; Pedriali, M.; Fabbri, M.; Campiglio, M.; Menard, S.; Palazzo, J. P.; Rosenberg, A.; Musiani, P.; Volinia, S.; Nenci, I.; Calin, G. A.; Querzoli, P.; Negrini, M.; Croce, C. M. Cancer Res. 2005, 65, 7065-7070
4. Lu, J.; Getz, G.; Miska, E. A.; Alvarez-Saavedra, E.; Lamb, J.; Peck, D.; Sweet-Cordero, A.; Ebert, B. L.; Mak, R. H.; Ferrando, A. A.; Downing, J. R.; Jacks, T.; Horvitz, H. R.; Golub, T. R. Nature 2005, 435, 834-838
5. Chow, T.-f. F.; Youssef, Y. M.; Lianidou, E.; Romaschin, A. D. R.; Honey, J.; Stewart, R.; Pace, K. T.; Yousef, G. M. Clin. Biochem. 2010, 43, 150-158
6. Schetter, A. J.; Leung, S. Y.; Sohn, J. J.; Zanetti, K. A.; Bowman, E. D.; Yanaihara, N.; Yuen, S. T.; Chan, T. L.; Kwong, D. L. W.; Au, G. K. H.; Liu, C.-G.; Calin, G. A.; Croce, C. M.; Harris, C. C. JAMA, J. Am. Med. Assoc. 2008, 299, 425-436
7. Yanaihara, N.; Caplen, N.; Bowman, E.; Seike, M.; Kumamoto, K.; Yi, M.; Stephens, R. M.; Okamoto, A.; Yokota, J.; Tanaka, T.; Calin, G. A.; Liu, C.-G.; Croce, C. M.; Harris, C. C. Cancer Cell 2006, 9, 189-198
8. Mar-Aguilar, F.; Luna-Aguirre, C. M.; Moreno-Rocha, J. C.; Araiza-Chavez, J.; Trevino, V.; Rodriguez-Padilla, C.; Resendez-Perez, D. Asia-Pac. J. Clin. Oncol. 2013, 9, 53-59
9. Wegman, D. W.; Krylov, S. N. TrAC, Trends Anal. Chem. 2013, 44, 121-130
10. Lao, K.; Xu, N. L.; Yeung, V.; Chen, C.; Livak, K. J.; Straus, N. A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2006, 343, 85-89
11. Fang, S.; Lee, H. J.; Wark, A. W.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14044-14046
12. Liu, C.-G.; Calin, G. A.; Meloon, B.; Gamliel, N.; Sevignani, C.; Ferracin, M.; Dumitru, C. D.; Shimizu, M.; Zupo, S.; Dono, M.; Alder, H.; Bullrich, F.; Negrini, M.; Croce, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 9740-9744
13. Morin, R. D.; O'Connor, M. D.; Griffith, M.; Kuchenbauer, F.; Delaney, A.; Prabhu, A.-L.; Zhao, Y.; McDonald, H.; Zeng, T.; Hirst, M.; Eaves, C. J.; Marra, M. A. Genome Res. 2008, 18, 610-621
14. Ohtsuka, E.; Nishikawa, S.; Fukumoto, R.; Tanaka, S.; Markham, A. F.; Ikehara, M.; Sugiura, M. Eur. J. Biochem. 1977, 81, 285-291
15. McLaughlin, L. W.; Romaniuk, E.; Romaniuk, P. J.; Neilson, T. Eur. J. Biochem. 1982, 125, 639-643
16. Weiss, E. A.; Gilmartin, G. M.; Nevins, J. R. EMBO J. 1991, 10, 215-219
17. Zhang, G.-J.; Chua, J. H.; Chee, R.-E.; Agarwal, A.; Wong, S. M. Biosens. Bioelectron. 2009, 24, 2504-2508
18. Cissell, K. A.; Rahimi, Y.; Shrestha, S.; Hunt, E. A.; Deo, S. K. Anal. Chem. 2008, 80, 2319-2325
19. Neely, L. A.; Patel, S.; Garver, J.; Gallo, M.; Hackett, M.; McLaughlin, S.; Nadel, M.; Harris, J.; Gullans, S.; Rooke, J. Nat. Methods 2006, 3, 41-46
20. Bahga, S. S.; Santiago, J. G. Analyst 2013, 138, 735-754
21. Garcia-Schwarz, G.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2012, 84, 6366-6369
22. Khan, N.; Cheng, J.; Pezacki, J. P.; Berezovski, M. V. Anal. Chem. 2011, 83, 6196-6201
23. Wegman, D. W.; Krylov, S. N. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 10335-10339
24. Heller, C.; Slater, G. W.; Mayer, P.; Dovichi, N.; Pinto, D.; Viovy, J.-L.; Drouin, G. J. Chromatogr., A 1998, 806, 113-121
25. Zhang, H.; Li, X.-F.; Le, X. C. J. Am. Chem. Soc. 2007, 130, 34-35
26. Dodgson, B. J.; Mazouchi, A.; Wegman, D. W.; Gradinaru, C. C.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2012, 84, 5470-5474
27. Castoldi, M.; Schmidt, S.; Benes, V.; Noerholm, M.; Kulozik, A. E.; Hentze, M. W.; Muckenthaler, M. U. RNA 2006, 12, 913-920
28. Jiang, R.-M.; Chang, Y.-S.; Chen, S.-J.; Chen, J.-H.; Chen, H.-C.; Chang, P.-L. J. Chromatogr., A 2011, 1218, 2604-2610
29. Meagher, R. J.; McCormick, L. C.; Haynes, R. D.; Won, J.-I.; Lin, J. S.; Slater, G. W.; Barron, A. E. Electrophoresis 2006, 27, 1702-1712
30. Cherney, L. T.; Krylov, S. N. Analyst 2013, 138, 553-558
31. Desruisseaux, C.; Long, D.; Drouin, G.; Slater, G. W. Macromolecules 2001, 34, 44-52
32. Meagher, R. J.; Won, J.-I.; McCormick, L. C.; Nedelcu, S.; Bertrand, M. M.; Bertram, J. L.; Drouin, G.; Barron, A. E.; Slater, G. W. Electrophoresis 2005, 26, 331-350
33. Kanoatov, M.; Retif, C.; Cherney, L. T.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2012, 84, 149-154