Improvements to direct quantitative analysis of multiple microRNAs facilitating faster analysis

Analytical Chemistry

Volumn 85, Issue 21, 2013, Pages 10062-10066

  Ghasemi, Farhad ^a   Wegman, David W ^a   Kanoatov, Mirzo ^a   Yang, Burton B ^b   Liu, Stanley K ^c   Yousef, George M ^d   Krylov, Sergey N ^a  

^a YORK UNIVERSITY   (Canada)

^b UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

^c DEPARTMENT OF RADIATION ONCOLOGY   (Canada)

^d ST MICHAEL'S HOSPITAL   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CANCER DIAGNOSTICS; DIAGNOSTIC TECHNIQUES; DIRECT QUANTITATIVE ANALYSIS; HYBRIDIZATION ASSAY; HYBRIDIZATION PROBE; PURIFICATION PROCEDURES; SIMULTANEOUS ANALYSIS; TECHNICAL LIMITATIONS;

CAPILLARY ELECTROPHORESIS; PROBES; PURIFICATION;

RNA;

BIOLOGICAL MARKER; MICRORNA;

ARTICLE; CAPILLARY ELECTROPHORESIS; CHEMISTRY; DNA PROBE; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; METHODOLOGY; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION;

BIOLOGICAL MARKERS; CHROMATOGRAPHY, HIGH PRESSURE LIQUID; DNA PROBES; ELECTROPHORESIS, CAPILLARY; MICRORNAS; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION;

EID: 84887630458     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac402812f     Document Type: Article

References (22)

1. Visone, R.; Rassenti, L. Z.; Veronese, A.; Taccioli, C.; Costinean, S.; Aguda, B. D.; Volinia, S.; Ferracin, M.; Palatini, J.; Balatti, V.; Alder, H.; Negrini, M.; Kipps, T. J.; Croce, C. M. Blood 2009, 114, 3872-3879
2. Calin, G. A.; Dumitru, C. D.; Shimizu, M.; Bichi, R.; Zupo, S.; Noch, E.; Aldler, H.; Rattan, S.; Keating, M.; Rai, K.; Rassenti, L.; Kipps, T.; Negrini, M.; Bullrich, F.; Croce, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002, 99, 15524-15529
3. Iorio, M. V.; Ferracin, M.; Liu, C.-G.; Veronese, A.; Spizzo, R.; Sabbioni, S.; Magri, E.; Pedriali, M.; Fabbri, M.; Campiglio, M.; Menard, S.; Palazzo, J. P.; Rosenberg, A.; Musiani, P.; Volinia, S.; Nenci, I.; Calin, G. A.; Querzoli, P.; Negrini, M.; Croce, C. M. Cancer Res. 2005, 65, 7065-7070
4. Lu, J.; Getz, G.; Miska, E. A.; Alvarez-Saavedra, E.; Lamb, J.; Peck, D.; Sweet-Cordero, A.; Ebert, B. L.; Mak, R. H.; Ferrando, A. A.; Downing, J. R.; Jacks, T.; Horvitz, H. R.; Golub, T. R. Nature 2005, 435, 834-838
5. Youssef, Y. M.; White, N. M.; Grigull, J.; Krizova, A.; Samy, C.; Mejia-Guerrero, S.; Evans, A.; Yousef, G. M. Eur. Urol. 2001, 59, 721-730
6. Lao, K.; Xu, N. L.; Yeung, V.; Chen, C.; Livak, K. J.; Straus, N. A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2006, 343, 85-89
7. Liu, C.-G.; Calin, G. A.; Meloon, B.; Gamliel, N.; Sevignani, C.; Ferracin, M.; Dumitru, C. D.; Shimizu, M.; Zupo, S.; Dono, M.; Alder, H.; Bullrich, F.; Negrini, M.; Croce, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 9740-9744
8. Fang, S.; Lee, H. J.; Wark, A. W.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14044-14046
9. Morin, R. D.; O'Connor, M. D.; Griffith, M.; Kuchenbauer, F.; Delaney, A.; Prabhu, A.-L.; Zhao, Y.; McDonald, H.; Zeng, T.; Hirst, M.; Eaves, C. J.; Marra, M. A. Genome Res. 2008, 18, 610-621
10. Ohtsuka, E.; Nishikawa, S.; Fukumoto, R.; Tanaka, S.; Markham, A. F.; Ikehara, M.; Sugiura, M. Eur. J. Biochem. 1977, 81, 285-291
11. McLaughlin, L. W.; Romaniuk, E.; Romaniuk, P. J.; Neilson, T. Eur. J. Biochem. 1982, 125, 639-643
12. Weiss, E. A.; Gilmartin, G. M.; Nevins, J. R. EMBO J. 1991, 10, 215-219
13. Wegman, D. W.; Krylov, S. N. TrAC Trends Anal. Chem. 2013, 44, 121-130
14. Zhang, G.-J.; Chua, J. H.; Chee, R.-E.; Agarwal, A.; Wong, S. M. Biosens. Bioelectron. 2009, 24, 2504-2508
15. Cissell, K. A.; Rahimi, Y.; Shrestha, S.; Hunt, E. A.; Deo, S. K. Anal. Chem. 2008, 80, 2319-2325
16. Neely, L. A.; Patel, S.; Garver, J.; Gallo, M.; Hackett, M.; McLaughlin, S.; Nadel, M.; Harris, J.; Gullans, S.; Rooke, J. Nat. Methods 2006, 3, 41-46
17. Bahga, S. S.; Santiago, J. G. Analyst 2013, 138, 735-754
18. Garcia-Schwarz, G.; Santiago, J. G. Anal. Chem. 2012, 84, 6366-6369
19. Khan, N.; Cheng, J.; Pezacki, J. P.; Berezovski, M. V. Anal. Chem. 2011, 83, 6196-6201
20. Wegman, D. W.; Krylov, S. N. Angew. Chem., Int. Ed. 2011, 50, 10335-10339
21. Wegman, D. W.; Cherney, L. T.; Yousef, G. M.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2013, 85, 6518-6523
22. Dodgson, B. J.; Mazouchi, A.; Wegman, D. W.; Gradinaru, C. C.; Krylov, S. N. Anal. Chem. 2012, 84, 5470-5474