Quantitative spatial analysis of the mouse brain lipidome by pressurized liquid extraction surface analysis

Analytical Chemistry

Volumn 87, Issue 3, 2015, Pages 1749-1756

  Almeida, Reinaldo ^a   Berzina, Zane ^a   Arnspang, Eva C ^a,c   Baumgart, Jan ^b   Vogt, Johannes ^b   Nitsch, Robert ^b   Ejsing, Christer S ^a  

^a UNIVERSITY OF SOUTHERN DENMARK   (Denmark)

^b JOHANNES GUTENBERG UNIVERSITY   (Germany)

^c AARHUS UNIVERSITY   (Denmark)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BRAIN; BRAIN MAPPING; LIQUIDS; MAMMALS; MASS SPECTROMETRY; ORGANIC SOLVENTS; SOLVENT EXTRACTION; SURFACE ANALYSIS; TISSUE; TISSUE ENGINEERING;

EXTRACTION SOLVENTS; FOURIER TRANSFORM MASS SPECTROMETRY; FRAGMENTATION ANALYSIS; NANO-ELECTROSPRAY IONIZATIONS; PRESSURIZED LIQUID EXTRACTION; SHOTGUN LIPIDOMICS; SPATIAL RESOLUTION; STRUCTURAL CHARACTERIZATION;

EXTRACTION;

LIPID;

ANIMAL; BRAIN; C57BL MOUSE; DEVICES; FLUORESCENCE MICROSCOPY; INFRARED SPECTROSCOPY; LIQUID LIQUID EXTRACTION; MALE; MASS SPECTROMETRY; METABOLISM; MOUSE; PRESSURE;

ANIMALS; BRAIN; LIPIDS; LIQUID-LIQUID EXTRACTION; MALE; MASS SPECTROMETRY; MICE; MICE, INBRED C57BL; MICROSCOPY, FLUORESCENCE; PRESSURE; SPECTROSCOPY, FOURIER TRANSFORM INFRARED;

EID: 84922237422     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac503627z     Document Type: Article

References (44)

1. van Meer, G. EMBO J. 2005, 24, 3159-3165
2. Lingwood, D.; Simons, K. Science (New York, N.Y.) 2010, 327, 46-50
3. Panáková, D.; Sprong, H.; Marois, E.; Thiele, C.; Eaton, S. Nature 2005, 435, 58-65
4. Fung, Y.-C. Biomechanics, 2 ed.; Springer: New York, 1993; Vol. 9, pp 155-155.
5. Wymann, M. P.; Schneiter, R. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008, 9, 162-176
6. Tarasov, K.; Stefanko, A.; Casanovas, A.; Surma, M. a.; Berzina, Z.; Hannibal-Bach, H. K.; Ekroos, K.; Ejsing, C. S. Mol. BioSyst. 2014, 10, 1364-1376
7. Han, X.; Yang, K.; Gross, R. W. Mass Spectrom. Rev. 2012, 31, 134-178
8. Harkewicz, R.; Dennis, E. A. Annu. Rev. Biochem. 2011, 80, 301-325
9. Blanksby, S. J.; Mitchell, T. W. Annu. Rev. Anal. Chem. 2010, 3, 433-465
10. Hermansson, M.; Uphoff, A.; Käkelä, R.; Somerharju, P. Anal. Chem. 2005, 77, 2166-2175
11. Quehenberger, O.; Armando, A. M.; Brown, A. H.; Milne, S. B.; Myers, D. S.; Merrill, A. H.; Bandyopadhyay, S.; Jones, K. N.; Kelly, S.; Shaner, R. L.; Sullards, C. M.; Wang, E.; Murphy, R. C.; Barkley, R. M.; Leiker, T. J.; Raetz, C. R. H.; Guan, Z.; Laird, G. M.; Six, D. a.; Russell, D. W.; McDonald, J. G.; Subramaniam, S.; Fahy, E.; Dennis, E. a. J. Lipid Res. 2010, 51, 3299-3305
12. Ejsing, C. S.; Sampaio, J. L.; Surendranath, V.; Duchoslav, E.; Ekroos, K.; Klemm, R. W.; Simons, K.; Shevchenko, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 2136-2141
13. Klose, C.; Surma, M. a.; Gerl, M. J.; Meyenhofer, F.; Shevchenko, A.; Simons, K. PLoS One 2012, 7, e35063-e35063
14. Schwudke, D.; Oegema, J.; Burton, L.; Entchev, E.; Hannich, J. T.; Ejsing, C. S.; Kurzchalia, T.; Shevchenko, A. Anal. Chem. 2006, 78, 585-595
15. Bligh, E. G.; Dyer, W. J. Can. J. Biochem. Physiol. 1959, 37, 911-917
16. Folch, J.; Lees, M.; Sloane-Stanley, G. H. J. Biol. Chem. 1957, 226, 497-509
17. Matyash, V.; Liebisch, G.; Kurzchalia, T. V.; Shevchenko, A.; Schwudke, D. J. Lipid Res. 2008, 49, 1137-1146
18. Klemm, R. W.; Ejsing, C. S.; Surma, M. a.; Kaiser, H.-J.; Gerl, M. J.; Sampaio, J. L.; de Robillard, Q.; Ferguson, C.; Proszynski, T. J.; Shevchenko, A.; Simons, K. J. Cell Biol. 2009, 185, 601-612
19. Takamori, S.; Holt, M.; Stenius, K.; Lemke, E. a.; Grønborg, M.; Riedel, D.; Urlaub, H.; Schenck, S.; Brügger, B.; Ringler, P.; Müller, S. a.; Rammner, B.; Gräter, F.; Hub, J. S.; De Groot, B. L.; Mieskes, G.; Moriyama, Y.; Klingauf, J.; Grubmüller, H.; Heuser, J.; Wieland, F.; Jahn, R. Cell 2006, 127, 831-846
20. Ishida, Y.; Nakanishi, O.; Hirao, S.; Tsuge, S.; Urabe, J.; Sekino, T.; Nakanishi, M.; Kimoto, T.; Ohtani, H. Anal. Chem. 2003, 75, 4514-4518
21. Jackson, S. N.; Wang, H.-Y. J.; Woods, A. S. Anal. Chem. 2005, 77, 4523-4527
22. Passarelli, M. K.; Winograd, N. Biochim. Biophys. Acta 2011, 1811, 976-990
23. Sjövall, P.; Lausmaa, J.; Johansson, B. Anal. Chem. 2004, 76, 4271-4278
24. Touboul, D.; Kollmer, F.; Niehuis, E.; Brunelle, A.; Laprévote, O. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2005, 16, 1608-1618
25. Takáts, Z.; Wiseman, J. M.; Gologan, B.; Cooks, R. G. Science (New York, N.Y.) 2004, 306, 471-473
26. Wiseman, J. M.; Puolitaival, S. M.; Takáts, Z.; Cooks, R. G.; Caprioli, R. M. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 2005, 44, 7094-7097
27. Veloso, A.; Astigarraga, E.; Barreda-Gómez, G.; Manuel, I.; Ferrer, I.; Giralt, M. T.; Ochoa, B.; Fresnedo, O.; Rodríguez-Puertas, R.; Fernández, J. a. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011, 22, 329-338
28. Lanekoff, I.; Thomas, M.; Laskin, J. Anal. Chem. 2014, 86, 1872-1880
29. Trede, D.; Schiffler, S.; Becker, M.; Wirtz, S.; Steinhorst, K.; Strehlow, J.; Aichler, M.; Kobarg, J. H.; Oetjen, J.; Dyatlov, A.; Heldmann, S.; Walch, A.; Thiele, H.; Maass, P.; Alexandrov, T. Anal. Chem. 2012, 84, 6079-6087
30. Berry, K. a. Z.; Li, B.; Reynolds, S. D.; Barkley, R. M.; Gijón, M. a.; Hankin, J. a.; Henson, P. M.; Murphy, R. C. J. Lipid Res. 2011, 52, 1551-1560
31. Anderson, D. M. G.; Ablonczy, Z.; Koutalos, Y.; Spraggins, J.; Crouch, R. K.; Caprioli, R. M.; Schey, K. L. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2014, 25, 1394-1403
32. Stauber, J. Bioanalysis 2012, 4, 2095-2098
33. Roach, P. J.; Laskin, J.; Laskin, A. Analyst 2010, 135, 2233-2236
34. Van Berkel, G. J.; Pasilis, S. P.; Ovchinnikova, O. J. Mass Spectrom. 2008, 43, 1161-1180
35. Kertesz, V.; Van Berkel, G. J. J. Mass Spectrom. 2010, 45, 252-260
36. Blatherwick, E. Q.; Van Berkel, G. J.; Pickup, K.; Johansson, M. K.; Beaudoin, M.-E.; Cole, R. O.; Day, J. M.; Iverson, S.; Wilson, I. D.; Scrivens, J. H.; Weston, D. J. Xenobiotica 2011, 41, 720-734
37. Stegemann, C.; Drozdov, I.; Shalhoub, J.; Humphries, J.; Ladroue, C.; Didangelos, A.; Baumert, M.; Allen, M.; Davies, A. H.; Monaco, C.; Smith, A.; Xu, Q.; Mayr, M. Circ.: Cardiovasc. Genet. 2011, 4, 232-242
38. Ejsing, C. S.; Duchoslav, E.; Sampaio, J.; Simons, K.; Bonner, R.; Thiele, C.; Ekroos, K.; Shevchenko, A. Anal. Chem. 2006, 78, 6202-6214
39. Zech, T.; Ejsing, C. S.; Gaus, K.; de Wet, B.; Shevchenko, A.; Simons, K.; Harder, T. EMBO J. 2009, 28, 466-476
40. Schroeder, M. J.; Shabanowitz, J.; Schwartz, J. C.; Hunt, D. F.; Coon, J. J. Anal. Chem. 2004, 76, 3590-3598
41. Husen, P.; Tarasov, K.; Katafiasz, M.; Sokol, E.; Vogt, J.; Baumgart, J.; Nitsch, R.; Ekroos, K.; Ejsing, C. S. PLoS One 2013, 8, e79736-e79736
42. Schuhmann, K.; Almeida, R.; Baumert, M.; Herzog, R.; Bornstein, S. R.; Shevchenko, A. J. Mass Spectrom. 2012, 47, 96-104
43. Han, X.; Yang, K.; Gross, R. W. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2008, 22, 2115-2124
44. Chan, R. B.; Oliveira, T. G.; Cortes, E. P.; Honig, L. S.; Duff, K. E.; Small, S. a.; Wenk, M. R.; Shui, G.; Di Paolo, G. J. Biol. Chem. 2012, 287, 2678-2688