-
3
-
-
47749152941
-
-
Sudarsan, N.; Lee, E. R.; Weinberg, Z.; Moy, R. H.; Kim, J. N.; Link, K. H.; Breaker, R. R. Science 2008, 321, 411
-
(2008)
Science
, vol.321
, pp. 411
-
-
Sudarsan, N.1
Lee, E.R.2
Weinberg, Z.3
Moy, R.H.4
Kim, J.N.5
Link, K.H.6
Breaker, R.R.7
-
4
-
-
33750712046
-
-
Gilbert, S. D.; Mediatore, S. J.; Batey, R. T. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 14214
-
(2006)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.128
, pp. 14214
-
-
Gilbert, S.D.1
Mediatore, S.J.2
Batey, R.T.3
-
5
-
-
66349133602
-
-
Gilbert, S. D.; Reyes, F. E.; Edwards, A. L.; Batey, R. T. Structure 2009, 17, 857
-
(2009)
Structure
, vol.17
, pp. 857
-
-
Gilbert, S.D.1
Reyes, F.E.2
Edwards, A.L.3
Batey, R.T.4
-
6
-
-
71449108155
-
-
Smith, K. D.; Lipchock, S. V.; Ames, T. D.; Wang, J.; Breaker, R. R.; Strobel, S. A. Nat. Struct. Mol. Biol. 2009, 16, 1218
-
(2009)
Nat. Struct. Mol. Biol.
, vol.16
, pp. 1218
-
-
Smith, K.D.1
Lipchock, S.V.2
Ames, T.D.3
Wang, J.4
Breaker, R.R.5
Strobel, S.A.6
-
7
-
-
34247181095
-
-
Roth, A.; Winkler, W. C.; Requlski, E. E.; Lee, B. W.; Lim, J.; Jona, I.; Barrick, J. E.; Ritwik, A.; Kim, J. N.; Welz, R.; Iwata-Reuyl, D.; Breaker, R. R. Nat. Struct. Mol. Biol. 2007, 14, 308
-
(2007)
Nat. Struct. Mol. Biol.
, vol.14
, pp. 308
-
-
Roth, A.1
Winkler, W.C.2
Requlski, E.E.3
Lee, B.W.4
Lim, J.5
Jona, I.6
Barrick, J.E.7
Ritwik, A.8
Kim, J.N.9
Welz, R.10
Iwata-Reuyl, D.11
Breaker, R.R.12
-
8
-
-
84879103214
-
-
Liberman, J. A.; Salim, M.; Krucinska, J.; Wedekind, J. E. Nat. Chem. Biol. 2013, 9, 353
-
(2013)
Nat. Chem. Biol.
, vol.9
, pp. 353
-
-
Liberman, J.A.1
Salim, M.2
Krucinska, J.3
Wedekind, J.E.4
-
9
-
-
9244225713
-
-
Batey, R. T.; Gilbert, S. D.; Montange, R. K. Nature 2004, 18, 411
-
(2004)
Nature
, vol.18
, pp. 411
-
-
Batey, R.T.1
Gilbert, S.D.2
Montange, R.K.3
-
10
-
-
5044234799
-
-
Mandal, M.; Lee, M.; Barrick, J. E.; Weinberg, Z.; Emilsson, G. M.; Ruzzo, W. L.; Breaker, R. R. Science 2004, 306, 275
-
(2004)
Science
, vol.306
, pp. 275
-
-
Mandal, M.1
Lee, M.2
Barrick, J.E.3
Weinberg, Z.4
Emilsson, G.M.5
Ruzzo, W.L.6
Breaker, R.R.7
-
11
-
-
55249114833
-
-
Serganov, A.; Huang, L.; Patel, D. J. Nature 2008, 455, 1263
-
(2008)
Nature
, vol.455
, pp. 1263
-
-
Serganov, A.1
Huang, L.2
Patel, D.J.3
-
12
-
-
78649970557
-
-
Huang, L.; Serganov, A.; Patel, D. J. Mol. Cell 2010, 40, 774
-
(2010)
Mol. Cell
, vol.40
, pp. 774
-
-
Huang, L.1
Serganov, A.2
Patel, D.J.3
-
13
-
-
0042320361
-
-
Winkler, W. C.; Nahvi, A.; Sudarsan, N.; Barrick, J. E.; Breaker, R. R. Nat. Struct. Mol. Biol. 2003, 10, 701
-
(2003)
Nat. Struct. Mol. Biol.
, vol.10
, pp. 701
-
-
Winkler, W.C.1
Nahvi, A.2
Sudarsan, N.3
Barrick, J.E.4
Breaker, R.R.5
-
14
-
-
62249156218
-
-
Serganov, A.; Huang, L.; Patel, D. J. Nature 2009, 458, 233
-
(2009)
Nature
, vol.458
, pp. 233
-
-
Serganov, A.1
Huang, L.2
Patel, D.J.3
-
15
-
-
38849197858
-
-
Gilbert, S. D.; Rambo, R. P.; Van Tyne, D.; Batey, R. T. Nat. Struct. Mol. Biol. 2008, 15, 177
-
(2008)
Nat. Struct. Mol. Biol.
, vol.15
, pp. 177
-
-
Gilbert, S.D.1
Rambo, R.P.2
Van Tyne, D.3
Batey, R.T.4
-
16
-
-
80054074740
-
-
Trausch, J. J.; Ceres, P.; Reyes, F. E.; Batey, R. T. Structure 2011, 19, 1413
-
(2011)
Structure
, vol.19
, pp. 1413
-
-
Trausch, J.J.1
Ceres, P.2
Reyes, F.E.3
Batey, R.T.4
-
18
-
-
34247181095
-
-
Roth, A.; Winkler, W. C.; Regulski, E. E.; Lee, B. W.; Lim, J.; Jona, I.; Barrick, J. E.; Ritwik, A.; Kim, J. N.; Welz, R.; Iwata-Reuyl, D.; Breaker, R. R. Nat. Struct. Mol. Biol. 2007, 14, 308
-
(2007)
Nat. Struct. Mol. Biol.
, vol.14
, pp. 308
-
-
Roth, A.1
Winkler, W.C.2
Regulski, E.E.3
Lee, B.W.4
Lim, J.5
Jona, I.6
Barrick, J.E.7
Ritwik, A.8
Kim, J.N.9
Welz, R.10
Iwata-Reuyl, D.11
Breaker, R.R.12
-
19
-
-
84879103214
-
-
Liberman, J. A.; Salim, M.; Krucinska, J.; Wedekind, J. E. Nat. Chem. Biol. 2013, 9, 353
-
(2013)
Nat. Chem. Biol.
, vol.9
, pp. 353
-
-
Liberman, J.A.1
Salim, M.2
Krucinska, J.3
Wedekind, J.E.4
-
20
-
-
69349104590
-
-
Wakeman, C. A.; Ramesh, A.; Winkler, W. C. J. Mol. Biol. 2009, 392, 723
-
(2009)
J. Mol. Biol.
, vol.392
, pp. 723
-
-
Wakeman, C.A.1
Ramesh, A.2
Winkler, W.C.3
-
21
-
-
0037206833
-
-
Winkler, W.; Nahvi, A.; Breaker, R. R. Nature 2002, 419, 952
-
(2002)
Nature
, vol.419
, pp. 952
-
-
Winkler, W.1
Nahvi, A.2
Breaker, R.R.3
-
22
-
-
2342511433
-
-
Barrick, J. E.; Corbino, K. A.; Winkler, W. C.; Nahvi, A.; Mandal, M.; Collins, J.; Lee, M.; Roth, A.; Sudarsan, N.; Jona, I.; Wickiser, J. K.; Breaker, R. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004, 101, 6421
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.101
, pp. 6421
-
-
Barrick, J.E.1
Corbino, K.A.2
Winkler, W.C.3
Nahvi, A.4
Mandal, M.5
Collins, J.6
Lee, M.7
Roth, A.8
Sudarsan, N.9
Jona, I.10
Wickiser, J.K.11
Breaker, R.R.12
-
23
-
-
18744396047
-
-
Mironov, A. S.; Gusarov, I.; Rafikov, R.; Lopez, L. E.; Shatalin, K.; Kreneva, R. A.; Perumov, D. A.; Nudler, E. Cell 2002, 111, 747
-
(2002)
Cell
, vol.111
, pp. 747
-
-
Mironov, A.S.1
Gusarov, I.2
Rafikov, R.3
Lopez, L.E.4
Shatalin, K.5
Kreneva, R.A.6
Perumov, D.A.7
Nudler, E.8
-
24
-
-
84855846639
-
-
Baker, J. L.; Sudarsan, N.; Weinberg, Z.; Roth, A.; Stockbridge, R. B.; Breaker, R. R. Science 2012, 335, 233
-
(2012)
Science
, vol.335
, pp. 233
-
-
Baker, J.L.1
Sudarsan, N.2
Weinberg, Z.3
Roth, A.4
Stockbridge, R.B.5
Breaker, R.R.6
-
25
-
-
84888090803
-
-
Li, S.; Smilth, K. D.; Davis, J. H.; Gordon, P. B.; Breaker, R. R.; Strobel, S. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013, 110, 19018
-
(2013)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.110
, pp. 19018
-
-
Li, S.1
Smilth, K.D.2
Davis, J.H.3
Gordon, P.B.4
Breaker, R.R.5
Strobel, S.A.6
-
26
-
-
84861920270
-
-
Ren, A.; Rajashankar, K. R.; Patel, D. J. Nature 2012, 486, 85
-
(2012)
Nature
, vol.486
, pp. 85
-
-
Ren, A.1
Rajashankar, K.R.2
Patel, D.J.3
-
28
-
-
24044512145
-
-
Samples, C. R.; Howard, T.; Raushel, F. M.; DeRose, V. J. Biochemistry 2005, 44, 11005
-
(2005)
Biochemistry
, vol.44
, pp. 11005
-
-
Samples, C.R.1
Howard, T.2
Raushel, F.M.3
Derose, V.J.4
-
30
-
-
0030849184
-
-
Hermann, T.; Auffinger, P.; Scott, W. G.; Westhof, E. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 3421
-
(1997)
Nucleic Acids Res.
, vol.25
, pp. 3421
-
-
Hermann, T.1
Auffinger, P.2
Scott, W.G.3
Westhof, E.4
-
31
-
-
3142681567
-
-
Cama, E.; Pethe, S.; Boucher, J. L.; Han, S.; Emig, F. A.; Ash, D. E.; Viola, R. E.; Mansuy, D.; Christianson, D. W. Biochemistry 2004, 43, 8987
-
(2004)
Biochemistry
, vol.43
, pp. 8987
-
-
Cama, E.1
Pethe, S.2
Boucher, J.L.3
Han, S.4
Emig, F.A.5
Ash, D.E.6
Viola, R.E.7
Mansuy, D.8
Christianson, D.W.9
-
32
-
-
0346848867
-
-
Suarez, D.; Diaz, N.; Merz, K. M., Jr. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 15324
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.125
, pp. 15324
-
-
Suarez, D.1
Diaz, N.2
Merz, K.M.3
-
33
-
-
0028957740
-
-
Salminen, T.; Kapyla, J.; Heikinheimo, P.; Kankare, J.; Goldman, A.; Heinonen, J.; Baykov, A. A.; Cooperman, B. S.; Lahti, R. Biochemistry 1995, 34, 782
-
(1995)
Biochemistry
, vol.34
, pp. 782
-
-
Salminen, T.1
Kapyla, J.2
Heikinheimo, P.3
Kankare, J.4
Goldman, A.5
Heinonen, J.6
Baykov, A.A.7
Cooperman, B.S.8
Lahti, R.9
-
35
-
-
34548353962
-
-
Oliva, R.; Tramontano, A.; Cavallo, L. RNA 2007, 13, 1427
-
(2007)
RNA
, vol.13
, pp. 1427
-
-
Oliva, R.1
Tramontano, A.2
Cavallo, L.3
-
36
-
-
84893276782
-
-
Chawla, M.; Abdel-Azeim, S.; Oliva, R.; Cavallo, L. Nucleic Acids Res. 2014, 42, 714
-
(2014)
Nucleic Acids Res.
, vol.42
, pp. 714
-
-
Chawla, M.1
Abdel-Azeim, S.2
Oliva, R.3
Cavallo, L.4
-
37
-
-
77952819729
-
-
Version 09.D1; Gaussian, Inc. Wallingford, CT
-
Gaussian, Version 09.D1; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2009.
-
(2009)
Gaussian
-
-
-
40
-
-
0345491105
-
-
Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1988, 37, 785
-
(1988)
Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys.
, vol.37
, pp. 785
-
-
Lee, C.1
Yang, W.2
Parr, R.G.3
-
41
-
-
77951680464
-
-
Grimme, S.; Antony, J.; Ehrlich, S.; Krieg, H. J. Chem. Phys. 2010, 132, 154104
-
(2010)
J. Chem. Phys.
, vol.132
, pp. 154104
-
-
Grimme, S.1
Antony, J.2
Ehrlich, S.3
Krieg, H.4
-
42
-
-
0001470765
-
-
Godbout, N. D.; Salahub, R.; Andzelm, J.; Wimmer, E. Can. J. Chem. 1992, 70, 560
-
(1992)
Can. J. Chem.
, vol.70
, pp. 560
-
-
Godbout, N.D.1
Salahub, R.2
Andzelm, J.3
Wimmer, E.4
-
44
-
-
84962349001
-
-
Cossi, M.; Rega, N.; Scalmani, G.; Barone, V. J. Comput. Chem. 2003, 24, 669
-
(2003)
J. Comput. Chem.
, vol.24
, pp. 669
-
-
Cossi, M.1
Rega, N.2
Scalmani, G.3
Barone, V.4
-
46
-
-
36448999709
-
-
Kaupp, M.; Schleyer, P. V.; Stoll, H.; Preuss, H. J. Chem. Phys. 1991, 94, 1360
-
(1991)
J. Chem. Phys.
, vol.94
, pp. 1360
-
-
Kaupp, M.1
Schleyer, P.V.2
Stoll, H.3
Preuss, H.4
-
47
-
-
15344345714
-
-
VandeVondele, J. K. M.; Mohamed, F.; Parrinello, M.; Chassaing, T.; Hutter, J. J. Comp. Phys. Comm. 2005, 167, 103
-
(2005)
J. Comp. Phys. Comm.
, vol.167
, pp. 103
-
-
Vandevondele, J.K.M.1
Mohamed, F.2
Parrinello, M.3
Chassaing, T.4
Hutter, J.5
-
48
-
-
4243943295
-
-
Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865
-
(1996)
Phys. Rev. Lett.
, vol.77
, pp. 3865
-
-
Perdew, J.P.1
Burke, K.2
Ernzerhof, M.3
-
49
-
-
0000160164
-
-
Goedecker, S.; Teter, M.; Hutter, J. Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1996, 54, 1703
-
(1996)
Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys.
, vol.54
, pp. 1703
-
-
Goedecker, S.1
Teter, M.2
Hutter, J.3
-
50
-
-
33846086933
-
-
Bussi, G.; Donadio, D.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 2007, 126, 014101-1
-
(2007)
J. Chem. Phys.
, vol.126
, pp. 014101-014111
-
-
Bussi, G.1
Donadio, D.2
Parrinello, M.3
-
52
-
-
68949219495
-
-
Bryantsev, V. S.; Diallo, M. S.; Goddard, W. A., III J. Phys. Chem. A 2009, 113, 9559
-
(2009)
J. Phys. Chem. A
, vol.113
, pp. 9559
-
-
Bryantsev, V.S.1
Diallo, M.S.2
Goddard, W.A.3
-
55
-
-
4043137165
-
-
Sponer, J.; Jurecka, P.; Hobza, P. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 10142
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.126
, pp. 10142
-
-
Sponer, J.1
Jurecka, P.2
Hobza, P.3
-
56
-
-
33644844986
-
-
Oliva, R.; Cavallo, L.; Tramontano, A. Nucleic Acids Res. 2006, 34, 865
-
(2006)
Nucleic Acids Res.
, vol.34
, pp. 865
-
-
Oliva, R.1
Cavallo, L.2
Tramontano, A.3
-
57
-
-
0035853044
-
-
Heikinheimo, P.; Tuominen, V.; Ahonen, A. K.; Teplyakov, A.; Cooperman, B. S.; Baykov, A. A.; Lahti, R.; Goldman, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001, 98, 3121
-
(2001)
Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
, vol.98
, pp. 3121
-
-
Heikinheimo, P.1
Tuominen, V.2
Ahonen, A.K.3
Teplyakov, A.4
Cooperman, B.S.5
Baykov, A.A.6
Lahti, R.7
Goldman, A.8
|