Binuclear metallohydrolases

Chemical Reviews

Volumn 96, Issue 7, 1996, Pages 2435-2458

  Wilcox, Dean E ^a,b,c,d,e  

^a Dartmouth College   (United States)

^b University of California ^*

^c UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^d Dept Def Natl Def Sci and Eng

^e DARTMOUTH COLLEGE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001431264     PISSN: 00092665     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/cr950043b     Document Type: Article

References (273)

1. Jencks, W. P. Catalysis in Chemistry and Enzymology; McGraw-Hill: New York, 1969.
2. Walsh, C. Enzymatic Reaction Mechanisms; W. H. Freeman: San Francisco, 1979.
3. Fersht, A. Enzyme Structure and Mechanism, 2nd ed.; W. H. Freeman: New York, 1985.
4. Christianson, D. W.; Lipscomb, W. N. Acc. Chem. Res. 1989, 22, 62-69.
5. Mathews, B. W. Acc. Chem. Res. 1988, 21, 333-340.
6. Karlin, K. D. Science 1993, 261, 701-708.
7. Vallee, B. L.; Auld, D. S. Biochemistry 1993, 32, 6493-6500.
8. Fenton, D. E.; Okawa, H. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1993, 1349-1357.
9. Knowles, J. R. Annu. Rev. Biochem. 1980, 49, 877-919.
10. Andrews, R. K.; Blakeley, R. L.; Zerner, B. Adv. Inorg. Biochem. 1984, 6, 245-283.
11. Andrews, R. W.; Blakeley, R. L.; Zerner, B. In The Bioinorganic Chemistry of Nickel; Lancaster, J. R., Jr., Ed.; VCH: New York, 1988; pp 141-165.
12. Hausinger, R. P. Biochemistry of Nickel; Plenum: New York, 1993.
13. Mobley, H. L. T.; Island, M. D.; Hausinger, R. P. Microbiol. Rev. 1995, 59, 451-480.
14. Sumner, J. B. J. Biol. Chem. 1926, 69, 435-441.
15. Dixon, N. E.; Gazzola, C.; Blakeley, R. L.; Zerner, B. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 4131-4133.
16. Dixon, N. E.; Gazzola, C.; Watters, J. J.; Blakeley, R. L.; Zerner, B. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 4130-4131.
17. Clark, P. A.; Wilcox, D. E. Inorg. Chem. 1989, 28, 1326-1333.
18. Clark, P. A.; Wilcox, D. E.; Scott, R. A. Inorg. Chem. 1990, 29, 579-581.
19. Finnegan, M. G.; Kowal, A. T.; Werth, M. T.; Clark, P. A.; Wilcox, D. E.; Johnson, M. K. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4030-4032.
20. Wang, S.; Lee, M. H.; Hausinger, R. P.; Clark, P. A.; Wilcox, D. E.; Scott, R. A. Inorg. Chem 1994, 33, 1589-1593.
21. Jabri, E.; Carr, M. B.; Hausinger, R. P.; Karplus, P. A. Science 1995, 268, 998-1004.
22. Takishima, K.; Suga, T.; Mamiya, G. Eur. J. Biochem. 1988, 175, 151-165.
23. Sumner, J. B. In The Enzymes; Sumner, J. B., Myrbäck, K., Eds.; Academic: New York, 1951; Vol. 1, pp 873-892, and references therein.
24. Ambrose, J. F.; Kistiakowsky, G. B.; Kridl, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1950, 72, 317-321.
25. Kistiakowsky, G. B.; Mangelsdorf, P. C., Jr.; Rosenberg, A. J.; Shaw, W. H. R. J. Am. Chem. Soc. 1952, 74, 5015-5020.
26. Kistiakowsky, G. B.; Rosenberg, A. J. J. Am. Chem. Soc. 1952, 74, 5020-5025.
27. Kistiakowsky, G. B.; Shaw, W. H. R. J. Am. Chem. Soc. 1953, 75, 866-871.
28. Dixon, N. E.; Blakeley, R. L.; Zerner, B. Can. J. Biochem. 1980, 58, 481-488.
29. Dixon, N. E.; Hinds, J. A.; Fihelly, A. K.; Gazzola, C.; Winzor, D. J.; Blakeley, R. L.; Zerner, B. Can. J. Biochem. 1980, 58, 1323-1334.
30. Dixon, N. E.; Riddles, P. W.; Gazzola, C.; Blakeley, R. L.; Zerner, B. Can. J. Biochem. 1980, 58, 1335-1344.
31. Andrews, R. K.; Dexter, A.; Blakeley, R. L.; Zerner, B. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 7124-7125.
32. Riddles, P. W.; Andrews, R. K.; Blakeley, R. L.; Zerner, B. Biochim. Biophys. Acta 1983, 743, 115-120.
33. Dixon, N. E.; Gazzola, C.; Asher, C. J.; Lee, D. S. W.; Blakeley, R. L.; Zerner, B. Can. J. Biochem. 1980, 58, 474-480.
34. Blakeley, R. L.; Dixon, N. E.; Zerner, B. Biochim. Biophys. Acta 1983, 744, 219-229.
35. Todd, M. J.; Hausinger, R. P. J. Biol. Chem. 1987, 262, 5963-5967.
36. Todd, M. J.; Hausinger, R. P. J. Biol. Chem. 1989, 264, 15835-15842.
37. Todd, M. J.; Hausinger, R. P. J. Biol. Chem. 1991, 266, 10260-10267.
38. Todd, M. J.; Hausinger, R. P. J. Biol. Chem 1991, 266, 24327-24331.
39. Martin, P. R.; Hausinger, R. P. J. Biol. Chem. 1992, 267, 20024-20027.
40. Mulrooney, S. B.; Hausinger, R. P. J. Bacteriol. 1990, 172, 5837-5843.
41. Alagna, L.; Hasnain, S. S.; Piggott, B.; Williams, D. J. Biochem. J. 1984, 220, 591-595.
42. Day, E. P.; Peterson, J.; Sendova, M. S.; Todd, M. J.; Hausinger, R. P. Inorg. Chem. 1993, 32, 634-638.
43. Alvarez, M. L. Ph.D. Thesis, Dartmouth College, Hanover, NH, 1994.
44. Nagarajam, K.; Fishbein, W. N. Fed. Proc. Fed. Am. Soc. Exp. Biol. 1977, 36, 700.
45. Clark, P. A. Ph.D. Thesis, Dartmouth College, Hanover, NH, 1989.
46. Colpas, G. J.; Maroney, M. J.; Bagyinka, C.; Kumar, M.; Willis, W. S.; Suib, S. L.; Baidya, N.; Mascharak, P. K. Inorg. Chem. 1991, 30, 920-928.
47. Park, I.-S.; Michel, L. O.; Pearson, M. A.; Jabri, E.; Karplus, P. A.; Wang, S.; Dong, J.; Scott, R. A.; Koehler, B. P.; Johnson, M. K.; Hausinger, R. P. J. Biol. Chem., in press.
48. King, G. J.; Zerner, B. Inorg. Chim. Acta, in press.
49. Park, I.-S.; Hausinger, R. P. Biochemistry 1996, 35, 5345-5352.
50. Park, I.-S.; Hausinger, R. P. Science 1995, 267, 1156-1158.
51. Hartman, F. C.; Harpel, M. R. Annu. Rev. Biochem. 1994, 63, 197-234, and references therein.
52. Moncrief, M. B. C.; Hom, L. G.; Jabri, E.; Karplus, P. A.; Hausinger, R. P. Protein Sci. 1995, 4, 2234-2236.
53. Park, I.-S.; Hausinger, R. P. Protein Sci. 1993, 2, 1034-1041.
54. Jabri, E.; Karplus, P. A. Biochemistry 1996, 35, 10616-10626.
55. Herzfeld, A.; Raper, S. M. Biochem. J. 1976, 153, 469-478.
56. Hirsch-Kolb, H.; Kolb, H. J.; Greenberg, D. M. J. Biol. Chem. 1971, 246, 395-401.
57. Harrel, D.; Sokolovsky, M. Eur. J. Biochem. 1972, 25, 102-108.
58. Green, S. M.; Ginsburg, A.; Lewis, M. S.; Hensley, P. J. Biol. Chem. 1991, 266, 21474-21481.
59. Kanyo, Z. F.; Chen, C.-Y.; Daghigh, F.; Ash, D. E.; Christianson, D. W. J. Mol. Biol. 1992, 224, 1175-1177.
60. Reczkowski, R. S.; Ash, D. E. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10992-10994.
61. Schlichter, C. P. Phys. Rev. 1955, 99, 479-480.
62. Khanglulov, S. V.; Pessiki, P. J.; Barynin, V. V.; Ash, D. E.; Dismukes, G. C. Biochemistry 1995, 34, 2015-2025.
63. Cavalli, R. C.; Burke, C. J.; Kawamoto, S.; Soprano, D. R.; Ash, D. E. Biochemistry 1994, 33, 10652-10657.
64. Reczkowski, R. S.; Ash, D. E. Arch. Biochem. Biophys. 1994, 312, 31-37.
65. Basolo, F.; Pearson, R. G. Mechanisms of Inorganic Reactions, 2nd ed.; John Wiley and Sons: New York, 1968; p 32.
66. Coll, M.; Knof, S. H.; Ohga, Y.; Messerschmidt, A.; Huber, R.; Moellering, H.; Rüssmann, L.; Schumacher, G. J. Mol. Biol. 1990, 214, 597-610.
67. Taylor, A. Trends Biochem. Sci. 1993, 18, 167-172.
68. Kim, H.; Lipscomb, W. N. Adv. Enzymol. 1994, 68, 153-213.
69. Van Wart, H. E.; Lin, S. H. Biochemistry 1981, 20, 5682-5689.
70. Prescott, J. M.; Wagner, F. W.; Holmquist, B.; Vallee, B. Biochemistry 1985, 24, 5350-5356.
71. Ben-Bassat, A.; Bauer, K.; Chang, S.-Y.; Myambo, K.; Boosman, A.; Chang, S. J. Bacteriol. 1987, 169, 751-757.
72. Carpenter, F. H.; Vahl, J. M. J. Biol. Chem. 1973, 248, 294-304.
73. Roderick, S. L.; Matthews, B. W. Biochemistry 1993, 32, 3907-3912.
74. Allen, M. P.; Yamada, A. H.; Carpenter, F. H. Biochemistry 1983, 22, 3778-3783.
75. Bayliss, M. E.; Prescott, J. M. Biochemistry 1986, 25, 8113-8117.
76. Burley, S. K.; David, P. R.; Taylor, A.; Lipscomb, W. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 6878-6882.
77. Burley, S. K.; David, P. R.; Sweet, R. M.; Taylor, A.; Lipscomb, W. N. J. Mol. Biol. 1992, 224, 113-140.
78. Kim, H.; Lipscomb, W. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 5006-5010.
79. Sträter, N.; Lipscomb, W. N. Biochemistry 1995, 34, 14792-14800.
80. Chevrier, B.; Schalk, C.; D'Orchymont, H.; Rondeau, J.; Moras, D.; Tarnus, C. Structure 1994, 2, 283-291.
81. Kim, H.; Lipscomb, W. N. Biochemistry 1993, 32, 8465-8478.
82. Sträter, N.; Lipscomb, W. N. Biochemistry 1995, 34, 9200-9210.
83. Antanaitis, B. C.; Aisen, P. Adv. Inorg. Biochem 1983, 5, 111-136.
84. Doi, K.; Antanaitis, B. C.; Aisen, P. Struct. Bonding 1988, 70, 1-26.
85. Que, L., Jr.; True, A. E. Prog. Inorg. Chem. 1990, 38, 97-200.
86. Vincent, J. B.; Olivier-Lilley, G. L.; Averill, B. A. Chem. Rev. 1990, 90, 1447-1467.
87. Chen, T. T.; Bazer, F. W.; Cetorelli, J. J.; Pollard, W. E.; Roberts, R. M. J. Biol. Chem. 1973, 248, 8560-8566.
88. Campbell, H. D.; Zerner, B. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1973, 54, 1498-1504.
89. Beck, J. L.; McConachie, L. A.; Summors, A. C.; Arnold, W. N.; de Jersey, J.; Zerner, B. Biochim. Biophys. Acta 1986, 869, 61-68.
90. Sugiura, Y.; Kawabe, H.; Tanaka, H.; Fujimoto, S.; Ohara, A. J. Biol. Chem. 1981, 256, 10664-10670.
91. Hefler, S. K.; Averill, B. A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1987, 146, 1173-1177.
92. Hayman, A. R.; Cox, T. M. J. Biol. Chem. 1994, 269, 1294-1300.
93. Nuttleman, P. R.; Roberts, R. M. J. Biol. Chem. 1990, 265, 12192-12199.
94. Sibille, J.-C.; Doi, K.; Aisen, P. J. Biol. Chem. 1987, 262, 59-62.
95. Davis, J. C.; Averill, B. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 34, 1445-1454.
96. Sinn, E.; O'Connor, C. J.; de Jersey, J.; Zerner, B. Inorg. Chim. Acta 1983, 78, L13-L15.
97. Debrunner, P. G.; Hendrich, M. P.; de Jersey, J.; Keough, D. T.; Sage, J. T.; Zerner, B. Biochim. Biophys. Acta 1983, 745, 103-106.
98. Antanaitlis, B. C.; Strekas, T.; Aisen, P. J. Biol. Chem. 1982, 257, 3766-3770.
99. Averill, B. A.; Davis, J. C.; Burman, S.; Zirino, T.; Sanders-Loehr, J.; Loehr, T. M.; Sage, J. T.; Debrunner, P. G. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 3760-3767.
100. Rodrigues, J. H.; Ok, H. N.; Xia, Y.-M.; Debrunner, P. G.; Hinrichs, B. E.; Meyer, T.; Packard, N. H. J. Phys. Chem. 1986, 100, 6849-6862.
101. Antanaitlis, B. C.; Aisen, P.; Lilenthal, H. R. J. Biol. Chem. 1983, 258, 3166-3172.
102. Lauffer, R. B.; Antanaitlis, B. C.; Aisen, P.; Que, L., Jr. J. Biol. Chem. 1983, 258, 14212-14218.
103. Day, E. P.; David, S. S.; Peterson, J.; Dunham, W. R.; Bonvoisin, J. J.; Sands, R. H.; Que, L., Jr. J. Biol. Chem. 1988, 263, 15561-15567.
104. Ghering, S.; Fleischhauer, P.; Haase, W.; Dietrich, M.; Witzel, H. Biol. Chem. Hoppe-Seyler 1990, 371, 786.
105. Scarrow, R. C.; Pyrz, J. W.; Que, L., Jr. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 657-665.
106. Wang, Z.; Ming, L.-J.; Que, L., Jr.; Vincent, J. B.; Crowder, M. W.; Averill, B. A. Biochemistry 1992, 31, 5263-5268.
107. Holz, R. C.; Que, L., Jr.; Ming, L.-J. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4434-4436.
108. Doi, K.; McCracken, J.; Peisach, J.; Aisen, P. J. Biol. Chem. 1988, 263, 5757-5763.
109. Antanaitlis, B. C.; Peisach, J.; Mims, W. B.; Aisen, P. J. Biol. Chem. 1985, 260, 4572-4574.
110. Kauzlarich, S. M.; Teo, B. K.; Zirino, T.; Burman, S.; Davis, J. C.; Averill, B. A. Inorg. Chem 1986, 25, 2781-2785.
111. True, A. E.; Scarrow, R. C.; Randall, C. R.; Holz, R. C.; Que, L., Jr. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 4246-4255.
112. Priggemeyer, S.; Eggers-Borkenstein, P.; Ahlers, F.; Henkel, G.; Körner, M.; Witzel, H.; Nolting, H.-F.; Hermes, C.; Krebs, B. Inorg. Chem. 1995, 34, 1445-1454.
113. Wang, D. L.; Holz, R. C.; David, S. S.; Que, L., Jr.; Stankovich, M. T. Biochemistry 1991, 30, 8187-8194.
114. Keough, D. T.; Dionysius, D. A.; de Jersey, J.; Zerner, B. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1980, 94, 600-605.
115. Beck, J. L.; Keough, D. T.; de Jersey, J.; Zerner, B. Biochim. Biophys. Acta 1984, 791, 357-363.
116. Sage, J. T.; Xia, Y. M.; Debrunner, P. G.; Keough, D. T.; de Jersey, J.; Zerner, B. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 7239-7247.
117. Beck, J. L.; McArthur, M. J.; de Jersery, J.; Zerner, B. Inorg. Chim. Acta 1988, 153, 39-44.
118. David, S. S.; Que, L., Jr. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 6455-6463.
119. Beck, J. L.; de Jersey, J.; Zerner, B.; Hendrich, M. P.; Debrunner, P. G. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 3317-3318.
120. Sauerbaum, H.; Körner, M.; Witzel, H.; Althaus, E.; Mosel, B.-D.; Müller-Warmuth, W. Eur. J. Biochem. 1993, 214, 313-321.
121. Klabunde, T.; Sträter, N.; Krebs, B.; Witzel, H. FEBS Lett. 1995, 367, 56-60.
122. Vincent, J. B.; Crowder, M. W.; Averill, B. A. Biochemistry 1991, 30, 3025-3034.
123. Keough, D. T.; Beck, J. L.; de Jersey, J.; Zerner, B. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1982, 108, 1643-1648.
124. Burman, S.; Davis, J. C.; Weber, M J.; Averill, B. A. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1986, 136, 490-497.
125. Pyrz, J. W.; Sage, J. T.; Debrunner, P. G.; Que, L., Jr. J. Biol. Chem 1986, 261, 11015-11020.
126. Antanaitlis, B. C.; Aisen, P. J. Biol. Chem. 1985, 260, 751-756.
127. Crowder, M. W.; Vincent, J. B.; Averill, B. A. Biochemistry 1992, 37, 9603-9608.
128. Sträter, N.; Klabunde, T.; Tucker, P.; Witzel, H.; Krebs, B. Science 1995, 268, 1489-1492.
129. Klabunde, T.; Sträter, N.; Fröhlich, R.; Witzel, H.; Krebs, B. J. Mol. Biol. 1996, 259, 737-748.
130. Mueller, E. G.; Crowder, M. W.; Averill, B. A.; Knowles, J. R. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 2974-2975.
131. Wynne, C. J.; Hamilton, S. E.; Dionysius, D. A.; Beck, J. L.; de Jersey, J. Arch. Biochem. Biophys. 1995, 319, 133-141.
132. Dietrich, M.; Münstermann, D.; Suerbaum, H.; Witzel, H. Eur. J. Biochem. 1991, 199, 105-113.
133. Vincent, J. B.; Crowder, M. W.; Averill, B. A. Trends Biochem. Sci. 1992, 17, 105-110.
134. Aquino, M. A.; Lim, J.-S.; Sykes, A. G. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1994, 429-436.
135. McComb, R. B.; Bowers, G. N.; Posen, S. Alkaline Phosphatase; Plenum: New York, 1979.
136. Coleman, J. E.; Gettins, P. In Zinc Enzymes; Spiro, T. G., Ed.; John Wiley and Sons: New York, 1983; pp 153-217.
137. Coleman, J. E. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1992, 21, 441-483.
138. Schwartz, J.; Crestfield, A.; Lipmann, F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1963, 49, 722-729.
139. Jones, S. R.; Kindman, L. A.; Knowles, J. R. Nature 1978, 275, 564-565.
140. Reid, T. W.; Wilson, I. B. In The Enzymes, 3rd ed.; Boyer, P. E., Ed.; Academic: New York, 1971; Vol. 4, pp 373-416, and references therein.
141. Simpson, R. T.; Vallee, B. L. Biochemistry 1968, 7, 4343-4350.
142. Applebury, M. L.; Johnson, B. P.; Coleman, J. E. J. Biol. Chem. 1970, 245, 4968-4976.
143. Schulz, C.; Bertini, I.; Viezzoli, M. S.; Brown, R. D., III; Koenig, S. H.; Coleman, J. E. Inorg. Chem. 1989, 28, 1490-1496.
144. Gettins, P.; Coleman, J. E. J. Biol. Chem. 1983, 258, 408-416.
145. Sowadski, J. M.; Handschumacher, M. D.; Murthy, H. M. K.; Foster, B. A.; Wykoff, H. W. J. Mol. Biol. 1983, 170, 575-581.
146. Sowadski, J. M.; Handschumacher, M. D.; Murthy, H. M. K.; Foster, B. A.; Wykoff, H. W. J. Mol. Biol. 1985, 186, 417-433.
147. Kim, E. E.; Wyckoff, H. W. J. Mol. Biol. 1991, 218, 449-464.
148. Hull, W. E.; Halford, S. E.; Gutfreund, H.; Sykes, B. D. Biochemistry 1976, 15, 1547-1561.
149. Butler-Ransohoff, J. E.; Rokita, S. E.; Kendall, D. A.; Banzon, J. A.; Carano, K. S.; Kaiser, E. T.; Matlin, A. R. J. Org. Chem. 1992, 57, 142-145.
150. Berridge, M. J.; Irvine, R. F. Nature 1989, 341, 197-205.
151. Atack, J. R.; Broughton, H. B.; Pollack, S. J. FEBS Lett. 1995, 367, 1-7.
152. Hallcher, L. M.; Sherman, W. R. J. Biol. Chem. 1980, 255, 10896-10901.
153. Ganzhorn, A. J.; Chanal, M.-C. Biochemistry 1990, 29, 6065-6071.
154. Bone, R.; Frank, L.; Springer, J. P.; Atack, J. R. Biochemistry 1994, 33, 9468-9476.
155. Pollack, S. J.; Knowles, M. R.; Atack, J. R.; Broughton, H. B.; Ragan, I.; Osborne, S.; McAllister, G. Eur. J. Biochem. 1993, 217, 281-287.
156. Bone, R.; Frank, L.; Springer, J. P.; Pollack, S. J.; Osborne, S. A.; Atack, J. R.; Knowles, M. R.; McAllister, G.; Ragan, C. I.; Broughton, H. B.; Baker, R.; Fletcher, S. R. Biochemistry 1994, 33, 9460-9467.
157. Leech, A. P.; Baker, G. R.; Shute, J. K.; Cohen, M. A. Gani, D. Eur. J. Biochem. 1993, 212, 693-704.
158. Pollack, S. J.; Atack, J. R.; Knowles, M. R.; McAllister, G.; Ragan, I.; Baker, R.; Fletcher, S. R.; Iversen, L. L.; Broughton, H. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 5766-5770.
159. Strasser, F.; Pelton, P. D.; Ganzhorn, A. J. Biochem. J. 1995, 307, 585-593.
160. Inhorn, R. C.; Majerus, P. W. J. Biol. Chem. 1987, 262, 15946-15952.
161. York, J. D.; Ponder, J. W.; Chen, Z.-W.; Mathews, F. S.; Majerus, P. W. Biochemistry 1994, 33, 13164-13171.
162. Benkovic, S. J.; deMaine, M. M. Adv. Enzymol. 1982, 53, 45-82.
163. Benkovic, P. A.; Caperelli, C. A.; deMaine, M. M.; Benkovic, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1978, 75, 2185-2189.
164. Frey, W. A.; Fishbein, R.; deMaine, M. M.; Benkovic, S. J. Biochemistry 1977, 16, 2479-2484.
165. Ke, H.; Thorpe, C. M.; Seaton, B. A.; Lipscomb, W. N.; Marcus, F. J. Mol. Biol. 1990, 212, 513-539.
166. Ke, H.; Zhang, Y.; Lipscomb, W. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 5243-5247.
167. Ke, H.; Liang, J.-Y.; Zhang, Y.; Lipscomb, W. N. Biochemistry 1991, 30, 4412-4420.
168. Zhang, Y.; Liang, J.-Y.; Huang, S.; Ke, H.; Lipscomb, W. N. Biochemistry 1993, 32, 1844-1857.
169. Domanico, P. L.; Rahil, J. F.; Benkovic, S. L. Biochemistry 1985, 24, 1623-1628.
170. Cohen, P. Annu. Rev. Biochem. 1989, 58, 453-508.
171. Klee, C. B.; Draetta, G. F.; Hubbard, M. J. Adv. Enzymol. 1988, 61, 149-200.
172. King, M. M.; Huang, C. Y. J. Biol. Chem. 1984, 259, 8847-8856.
173. Liu, J.; Farmer, J. D., Jr.; Lane, W. S.; Friedman, J.; Weissman, I.; Schreiber, S. L. Cell 1991, 66, 807-815.
174. O'Keefe, S. J.; Tamura, J.; Kincaid, R. L.; Tocci, M. J.; O'Neill, E. A. Nature 1992, 357, 692-694.
175. Clipstone, N. A.; Crabtree, G. R. Nature 1992, 357, 695-697.
176. Goldberg, J.; Huang, H.-B.; Kwon, Y.-G.; Greengard, P.; Nairn, A. C.; Kuriyan, J. Nature 1995, 376, 745-753.
177. Griffith, J. P.; Kim, J. L.; Kim, E. E.; Sintchak, M. D.; Thomson, J. A.; Fitzgibbon, M. J.; Fleming, M. A.; Caron, P. R.; Hsiao, K.; Navia, M. A. Cell 1995, 82, 507-522.
178. Kissinger, C. R.; Parge, H. E.; Knighton, D. R.; Lewis, C. T.; Pelletier, L. A.; Tempczyk, A.; Kalish, V. J.; Tucker, K. D.; Showalter, R. E.; Moomaw, E. W.; Gastinel, L. N.; Habuka, N.; Chen, X.; Maldonado, F.; Barker, J. E.; Bacquet, R.; Villafranca, E. Nature 1995, 378, 641-644.
179. Zhou, S.; Clemens, J. C.; Stone, R. L.; Dixon, J. E. J. Biol. Chem. 1994, 269, 26234-26238.
180. Yu, L.; Haddy, A.; Rusnak, F. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10147-10148.
181. Martin, B. L.; Graves, D. J. Biochem. Biophys. Acta 1994, 1206, 136-142.
182. Cooperman, B. S.; Baykov, A. A.; Lahti, R. Trends Biochem. Sci. 1992, 17, 262-266.
183. Lahti, R.; Pohjanoksa, K.; Pitkäranta, T.; Heikinheimo, P.; Salminen, T.; Meyer, P.; Heinonen, J. Biochemistry 1990, 29, 5761-5766.
184. Lahti, R.; Salminen, T.; Latonen, S.; Heikinheimo, P.; Pohjanoksa, K.; Heinonen, J. Eur. J. Biochem. 1991, 198, 293-297.
185. Welsh, K. M.; Jacobyansky, A.; Springs, B.; Cooperman, B. S. Biochemistry 1983, 22, 2243-2248.
186. Banerjee, A.; Cooperman, B. S. Inorg. Chim. Acta 1983, 79, 146-148.
187. Knight, W. B.; Dunaway-Mariano, D.; Ransom, S. C.; Villafranca, J. J. J. Biol. Chem. 1984, 259, 2886-2895.
188. Welsh, K. M.; Cooperman, B. S. Biochemistry 1984, 23, 4947-4955.
189. Chirgadze, N. Y.; Kuranova, I. P.; Nevskaya, N. A.; Teplyakov, A. V.; Wilson, K.; Strokopytov, B. V.; Arutyunyan, E. G.; Khene, V. Sov. Phys. Crystallogr. 1991, 36, 72-75.
190. Teplyakov, A.; Obmolova, G.; Wilson, K. S.; Ishii, K.; Kaji, H.; Samejima, T.; Kuranova, I. Protein Sci. 1994, 3, 1098-1107.
191. Kankare, J.; Neal, G. S.; Salminen, T.; Glumhoff, T.; Cooperman, B. S.; Lahti, R.; Goldman, A. Protein Eng. 1994, 7, 823-830.
192. Oganessyan, V. Y.; Kurilova, S. A.; Vorobyeva, N. N.; Nazarova, T. I.; Popov, A. N.; Lebedev, A. A.; Avaeva, S. M.; Harutyunyan, E. H. FEBS Lett. 1994, 348, 301-304.
193. Kankare, J.; Salminen, T.; Lahti, R.; Cooperman, B. S.; Baykov, A. A.; Goldman, A. Biochemistry 1996, 35, 4670-4677.
194. Heikinheimo, P.; et al., Structure, submitted for publication.
195. Gonzalez, M. A.; Webb, M. R.; Welsh, K. M.; Cooperman, B. S. Biochemistry 1984, 23, 797-801.
196. Salminen, T.; Jarmo Käpylä, P. H.; Kankare, J.; Goldman, A.; Heinonen, J.; Baykov, A. A.; Cooperman, B. S.; Lahti, R. Biochemistry 1995, 34, 782-791.
197. Heikinheimo, P.; Pohjanjoki, P.; Helminen, A.; Tasanen, M.; Cooperman, B. S.; Goldman, A.; Baykov, A. A.; Lahti, R. Eur. J. Biochem. 1996, 239, 138-143.
198. Little, C. Methods Enzymol. 1981, 71, 725-730.
199. Guddal, P. H.; Johansen, T.; Schulstad, K.; Little, C. J. Bacteriol. 1989, 171, 5702-5706.
200. Little, C.; Otnaess, A.-B. Biochim. Biophys. Acta 1975, 391, 326-333.
201. Hough, E.; Hansen, L. K.; Birknes, B.; Jynge, K.; Hansen, S.; Hordvik, A.; Little, C.; Dodson, E.; Derewenda, Z. Nature 1989, 338, 357-360.
202. Hansen, S.; Hansen, L. K.; Hough, E. J. Mol. Biol. 1992, 225, 543-549.
203. Hansen, S.; Hough, E.; Svensson, L. A.; Wong, Y.-L.; Martin, S. F. J. Mol. Biol. 1993, 234, 179-187.
204. Byberg, J. R.; Jorgensen, F. S.; Hansen, S. Proteins 1992, 12, 331-338.
205. Sundell, S.; Hansen, S.; Hough, E. Protein Eng. 1994, 7, 571-577.
206. McDaniel, C. S.; Harper, L. L.; Wild, J. R. J. Bacteriol. 1988, 170, 2306-2311.
207. Omburo, G. A.; Kuo, J. M.; Mullins, L. S.; Raushel, F. M. J. Biol. Chem. 1992, 267, 13278-13283.
208. Chae, M. Y.; Omburo, G. A.; Lindahl, P. A.; Raushel, F. M. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12173-12174.
209. Benning, M. M.; Kuo, J. M.; Raushel, F. M.; Holden, H. M. Biochemistry 1995, 34, 7973-7978.
210. Vanhooke, J. L.; Benning, M. M.; Raushel, F. M.; Holden, H. M. Biochemistry 1996, 35, 6020-6025.
211. Lewis, V. E.; Donarski, W. J.; Wild, J. R.; Raushel, F. M. Biochemistry 1988, 27, 1591-1597.
212. Dumas, D. P.; Raushel, F. M. J. Biol. Chem. 1990, 265, 21498-21503.
213. Kuo, J. M.; Raushel, F. M. Biochemistry 1994, 33, 4265-4272.
214. Kornberg, A.; Baker, T. A. DNA Replication, 2nd ed.; W. H. Freeman: New York, 1992.
215. Ollis, D. L.; Brick, P.; Hamlin, R.; Xuong, N. G.; Steitz, T. A. Nature 1985, 313, 762-766.
216. Lehman, I. R.; Richardson, C. C. J. Biol. Chem. 1964, 239, 233-241.
217. Gupta, A. P.; Benkovic, S. J. Biochemistry 1984, 23, 5874-5881.
218. Freemont, P. S.; Freidman, J. M.; Beese, L. S.; Sanderson, M. R.; Steitz, T. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 8924-8928.
219. Mullen, G. P.; Serpersu, E. H.; Ferrin, L. J.; Loeb, L. A.; Mildvan, A. S. J. Biol. Chem. 1990, 265, 14327-14334.
220. Han, H.; Rifkind, J. M.; Mildvan, A. S. Biochemistry 1991, 30, 11104-11108.
221. Beese, L. S.; Steitz, T. A. EMBO J. 1991, 10, 25-33.
222. Derbyshire, V.; Grindley, N. D. F.; Joyce, C. M. EMBO J. 1991, 10, 17-24.
223. Black, C. B.; Cowan, J. A., to be published.
224. Kim, Y.; Eom, S. H.; Wang, J.; Lee, D.-S.; Suh, S. W.; Steitz, T. A. Nature 1995, 376, 612-616.
225. Hostomsky, Z.; Hostomska, Z.; Matthews, D. A. In Nucleases, 2nd ed.; Linn, S. M., Lloyd, R. S., Roberts, R. J., Eds.; Cold Spring Harbor Laboratory Press: Plainview, NY, 1993; pp 341-376.
226. Varmus, H. Science 1988, 240, 1427-1435.
227. Kanaya, S.; Kohara, A.; Miura, Y.; Sekiguchi, A.; Iwai, S.; Inoue, H.; Ohtsuka, E.; Ikehara, M. J. Biol. Chem. 1990, 265, 4615-4621.
228. Yang, W.; Hendrickson, W. A.; Crouch, R. J.; Satow, Y. Science 1990, 249, 1389-1405.
229. Davies, J. F.; Hostomska, Z.; Hostomsky, D.; Jordan, S. R.; Mathews, D. A. Science 1991, 252, 88-95.
230. Dyda, F.; Hickman, A. B.; Jenkins, T. M.; Engelman, A.; Craigie, R.; Davies, D. R. Science 1994, 266, 1981-1986.
231. Katayanagi, K.; Okumura, M.; Morikawa, K. Proteins 1993, 17, 337-346.
232. Huang, H.-W.; Cowan, J. A. Eur. J. Biochem. 1994, 219, 253-260.
233. Black, C. B., Cowan, J. A. Inorg. Chem. 1994, 33, 5805-5808.
234. Jou, R.; Cowan, J. A. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 6685-6686.
235. Fraser, M. J.; Low, R. L. In Nucleases, 2nd ed.; Linn, S. M., Lloyd, R. S., Roberts, R. J., Eds.; Cold Spring Harbor Laboratory Press: Plainview, NY, 1993; pp 171-207.
236. Fujimoto, M.; Kuninaka, A.; Yoshino, H. Agric. Biol. Chem. 1975, 39, 1991-1997.
237. Potter, B. V. L.; Connolly, B. A.; Eckstein, F. Biochemistry 1983, 22, 1369-1377.
238. Volbeda, A.; Lahm, A.; Sakiyama, F.; Suck, D. EMBO J. 1991, 10, 1607-1618.
239. Suck, D.; Dominguez, R.; Lahm, A.; Volbeda, A. J. Cell. Biochem. 1993, (Suppl. 17C), 154.
240. Fujimoto, M.; Kuninaka, A.; Yoshino, H. Agric. Biol. Chem. 1974, 38, 1555-1561.
241. Roberts, R. J.; Halford, S. E. In Nucleases, 2nd ed.; Linn, S. M., Lloyd, R. S., Roberts, R. J., Eds.; Cold Spring Harbor Laboratory Press: Plainview, NY, 1993; pp 35-88.
242. Connolly, B. A.; Eckstein, F.; Pingoud, A. J. Biol. Chem. 1984, 259, 10760-10763.
243. McClarin, J. A.; Frederick, C. A.; Wang, B.-C.; Greene, P.; Boyer, H. W.; Grable, J.; Rosenberg, J. M. Science 1986, 234, 1526-1541.
244. King, K.; Benkovic, S. J.; Modrich, P. J. Biol. Chem. 1989, 264, 11807-11815.
245. Wright, D. J.; King, K.; Modrich, P. J. Biol. Chem. 1989, 264, 11816-11821.
246. Grasby, J. A.; Connolly, B. A. Biochemistry 1992, 31, 7855-7861.
247. Taylor, J. D.; Badcoe, I. G.; Clarke, A. R.; Halford, S. E. Biochemistry 1991, 30, 8743-8753.
248. Thielking, V.; Selent, U.; Köhler, E.; Wolfes, H.; Pieper, U.; Geiger, R.; Urbanke, C.; Winkler, F. K.; Pingoud, A. Biochemistry 1991, 30, 6416-6422.
249. Selent, U.; Rüter, T.; Köhler, E.; Liedtke, M.; Thielking, V.; Alves, J.; Oelgeschläger, T.; Wolfes, H.; Peters, F.; Pingoud, A. Biochemistry 1992, 31, 4808-4815.
250. Winkler, F. K.; Banner, D. W.; Oefner, C.; Tsernoglou, D.; Brown, R. S.; Heathman, S. P.; Bryan, R. K.; Martin, P. D.; Petratos, K.; Wilson, K. S. EMBO J. 1993, 12, 1781-1795.
251. Kostrewa, D.; Winkler, F. K. Biochemistry 1995, 34, 683-696.
252. Baldwin, G. S.; Vipond, I. B.; Halford, S. E. Biochemistry 1995, 34, 705-714.
253. Vipond, I. B.; Baldwin, G. S.; Halford, S. E. Biochemistry 1995, 34, 697-704.
254. Newman, M.; Strzelecka, T.; Dorner, L. F.; Schildkraut, I.; Aggarwal, A. K. Nature 1994, 368, 660-664.
255. Cheng, X.; Balendiran, K.; Schildkraut, I.; Anderson, J. E. EMBO J. 1994, 13, 3927-3935.
256. Cech, T. R. Science 1987, 236, 1532-1539.
257. Pyle, A. M. Science 1993, 261, 709-714.
258. McSwiggen, J. A.; Cech, T. R. Science 1989, 244, 679-683.
259. Steitz, T. A.; Steitz, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 6498-6502.
260. Piccirilli, J. A.; Vyle, J. S.; Caruthers, M. H.; Cech, T. R. Nature 1993, 361, 85-88.
261. Christian, E. L.; Yarus, M. Biochemistry 1993, 32, 4475-4480.
262. Pace, N. R.; Smith, D. J. Biol. Chem. 1990, 265, 3587-3590.
263. Guerrier-Takada, C.; Haydock, K.; Allen, L.; Altman, S. Biochemistry 1986, 25, 1509-1515.
264. Smith, D.; Pace, N. R. Biochemistry 1993, 32, 5273-5281.
265. Kazakov, S.; Altman, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 7939-7943.
266. Jacquier, A.; Rosbash, M. Science 1986, 234, 1099-1104.
267. Zaug, A. J.; Cech, T. R. Biochemistry 1986, 25, 4478-4482.
268. Herschlag, D.; Cech, T. R. Biochemistry 1990, 29, 10159-10171.
269. Pan, T.; Uhlenbeck, O. C. Nature 1992, 358, 560-563.
270. Frick, D. N.; Weber, D. J.; Gillespie, J. R.; Bessman, M. J.; Mildvan, A. S. J. Biol. Chem. 1994, 269, 1794-1803.
271. Mol, C. D.; Kuo, C.-F.; Thayer, M. M.; Cunningham, R. P.; Tainer, J. A. Nature 1995, 374, 381-386.
272. Fothergill, M.; Goodman, M. F.; Petruska, J.; Warshel, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 11619-11627.
273. Cowan, J. A., to be published.