An on-chip Cell-SELEX process for automatic selection of high-affinity aptamers specific to different histologically classified ovarian cancer cells

Lab on a Chip

Volumn 14, Issue 20, 2014, Pages 4017-4028

  Hung, Lien Yu ^a   Wang, Chih Hung ^a   Hsu, Keng Fu ^b   Chou, Cheng Yang ^b   Lee, Gwo Bin ^a  

^a NATIONAL TSING HUA UNIVERSITY   (Taiwan)

^b NATIONAL CHENG KUNG UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

APTAMER; BIOLOGICAL MARKER; LIGAND;

ARTICLE; CANCER CELL; CANCER DIAGNOSIS; CANCER PROGNOSIS; CANCER SCREENING; CANCER SURVIVAL; CELL SELECTION; DISSOCIATION CONSTANT; EARLY DIAGNOSIS; FLUORESCENCE; FLUORESCENCE IMAGING; HIGH THROUGHPUT SCREENING; HISTOLOGY; MICROFLUIDICS; MULTIPLE CANCER; ON CHIP CELL SELEX PROCESS; OVARY CANCER; TARGET CELL; 3T3 CELL LINE; ANIMAL; AUTOMATION; CELL CULTURE; CELL SEPARATION; CHEMISTRY; DEVICES; FEMALE; HEPG2 CELL LINE; HUMAN; LAB ON A CHIP; MCF 7 CELL LINE; MICROFLUIDIC ANALYSIS; MOUSE; OVARY TUMOR; PATHOLOGY; PROCEDURES;

ANIMALS; APTAMERS, NUCLEOTIDE; AUTOMATION; CELL SEPARATION; CELLS, CULTURED; FEMALE; HEP G2 CELLS; HUMANS; LAB-ON-A-CHIP DEVICES; LIGANDS; MCF-7 CELLS; MICE; MICROFLUIDIC ANALYTICAL TECHNIQUES; NIH 3T3 CELLS; OVARIAN NEOPLASMS;

EID: 84907821919     PISSN: 14730197     EISSN: 14730189     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4lc00587b     Document Type: Article

References (49)

1. R. Siegel J. M. Ma Z. H. Zou A. Jemal Ca-Cancer J. Clin. 2014 64 9 29
2. C. S. Marcus G. L. Maxwell K. M. Darcy C. A. Hamilton W. P. McGuire J. Cancer 2014 5 25 30
3. L. A. G. Ries M. E. Reichman D. R. Lewis B. F. Hankey B. K. Edwards Oncologist 2003 8 541 552
4. R. van de Laar J. IntHout T. Van Gorp S. Verdonschot A. M. van Altena C. G. Gerestein L. F. A. G. Massuger P. L. M. Zusterzeel R. F. P. M. Kruitwagen Br. J. Cancer 2014 110 42 48
5. V. Muller K. Pantel Breast Cancer Res. 2004 6 258 261
6. M. Cristofanilli D. F. Hayes G. T. Budd M. J. Ellis A. Stopeck J. M. Reuben G. V. Doyle J. Matera W. J. Allard M. C. Miller H. A. Fritsche G. N. Hortobagyi L. Terstappen J. Clin. Oncol. 2005 23 1420 1430
7. M. Cristofanilli G. T. Budd M. J. Ellis A. Stopeck J. Matera M. C. Miller J. M. Reuben G. V. Doyle W. J. Allard L. Terstappen D. F. Hayes N. Engl. J. Med. 2004 351 781 791
8. A. A. Adams P. I. Okagbare J. Feng M. L. Hupert D. Patterson J. Gottert R. L. McCarley D. Nikitopoulos M. C. Murphy S. A. Soper J. Am. Chem. Soc. 2008 130 8633 8641
9. S. L. Stott C. H. Hsu D. I. Tsukrov M. Yu D. T. Miyamoto B. A. Waltman S. M. Rothenberg A. M. Shah M. E. Smas G. K. Korir F. P. Floyd A. J. Gilman J. B. Lord D. Winokur S. Springer D. Irimia S. Nagrath L. V. Sequist R. J. Lee K. J. Isselbacher S. Maheswaran D. A. Haber M. Toner Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2010 107 18392 18397
10. S. Nagrath L. V. Sequist S. Maheswaran D. W. Bell D. Irimia L. Ulkus M. R. Smith E. L. Kwak S. Digumarthy A. Muzikansky P. Ryan U. J. Balis R. G. Tompkins D. A. Haber M. Toner Nature 2007 450 1235 1239
11. C. Jin S. M. McFaul S. P. Duffy X. Y. Deng P. Tavassoli P. C. Black H. S. Ma Lab Chip 2014 14 32 44
12. E. Sollier D. E. Go J. Che D. R. Gossett S. O'Byrne W. M. Weaver N. Kummer M. Rettig J. Goldman N. Nickols S. McCloskey R. P. Kulkarni D. Di Carlo Lab Chip 2014 14 63 77
13. M. E. Warkiani G. F. Guan K. B. Luan W. C. Lee A. A. S. Bhagat P. K. Chaudhuri D. S. W. Tan W. T. Lim S. C. Lee P. C. Y. Chen C. T. Lim J. Han Lab Chip 2014 14 128 137
14. S. B. Huang M. H. Wu Y. H. Lin C. H. Hsieh C. L. Yang H. C. Lin C. P. Tseng G. B. Lee Lab Chip 2013 13 1371 1383
15. R. J. Cho M. J. Campbell E. A. Winzeler L. Steinmetz A. Conway L. Wodicka T. G. Wolfsberg A. E. Gabrielian D. Landsman D. J. Lockhart R. W. Davis Mol. Cell 1998 2 65 73
16. D. C. Fingar S. Salama C. Tsou E. Harlow J. Blenis Genes Dev. 2002 16 1472 1487
17. M. Bjorklund M. Taipale M. Varjosalo J. Saharinen J. Lahdenpera J. Taipale Nature 2006 439 1009 1013
18. R. Molina X. Filella J. M. Auge Clin. Biochem. 2004 37 505 511
19. B. D. Cohen D. A. Baker C. Soderstrom G. Tkalcevic A. M. Rossi P. E. Miller M. W. Tengowski F. Wang A. Gualberto J. S. Beebe J. D. Moyer Clin. Cancer Res. 2005 11 2063 2073
20. J. S. de Bono G. Attard A. Adjei M. N. Pollak P. C. Fong P. Haluska L. Roberts C. Melvin M. Repollet D. Chianese M. Connely L. Terstappen A. Gualberto Clin. Cancer Res. 2007 13 3611 3616
21. A. G. Georgas M. E. Brandt Abstr. Pap. Am. Chem. Soc. 2007 233 777
22. C. H. Weng C. J. Huang G. B. Lee Sensors 2012 12 9514 9529
23. K. Y. Lien Y. H. Chuang L. Y. Hung K. F. Hsu W. W. Lai C. L. Ho C. Y. Chou G. B. Lee Lab Chip 2010 10 2875 2886
24. M. G. Mauk B. L. Ziober Z. Y. Chen J. A. Thompson H. H. Bau Ann. N. Y. Acad. Sci. 2007 1098 467 475
25. L. Y. Hung Y. H. Chuang H. T. Kuo C. H. Wang K. F. Hsu C. Y. Chou G. B. Lee Biomed. Microdevices 2013 15 339 352
26. J. R. Kanwar K. Roy R. K. Kanwar Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2011 46 459 477
27. K. Sefah D. Shangguan X. L. Xiong M. B. O'Donoghue W. H. Tan Nat. Protoc. 2010 5 1169 1185
28. D. Van Simaeys D. Lopez-Colon K. Sefah R. Sutphen E. Jimenez W. H. Tan PLoS One 2010 5
29. R. K. Mosing S. D. Mendonsa M. T. Bowser Anal. Chem. 2005 77 6107 6112
30. M. T. Bowser S. D. Mendonsa R. Mosing Abstr. Pap. Am. Chem. Soc. 2005 229 U139
31. S. M. Park J. Y. Ahn M. Jo D. K. Lee J. T. Lis H. G. Craighead S. Kim Lab Chip 2009 9 1206 1212
32. J. R. Qian X. H. Lou Y. T. Zhang Y. Xiao H. T. Soh Anal. Chem. 2009 81 5490 5495
33. K. T. Kotz W. Xiao C. Miller-Graziano W. J. Qian A. Russom E. A. Warner L. L. Moldawer A. De P. E. Bankey B. O. Petritis D. G. Camp 2nd A. E. Rosenbach J. Goverman S. P. Fagan B. H. Brownstein D. Irimia W. Xu J. Wilhelmy M. N. Mindrinos R. D. Smith R. W. Davis R. G. Tompkins M. Toner Nat. Med. 2010 16 1042 1047
34. A. Paul M. Avci-Adali G. Ziemer H. P. Wendel Oligonucleotides 2009 19 243 254
35. C. H. Weng I. S. Hsieh L. Y. Hung H. I. Lin S. C. Shiesh Y. L. Chen G. B. Lee Microfluid. Nanofluid. 2013 14 753 765
36. H. A. Risch L. D. Marrett M. Jain G. R. Howe Am. J. Epidemiol. 1996 144 363 372
37. T. Kaku S. Ogawa Y. Kawano Y. Ohishi H. Kobayashi T. Hirakawa H. Nakano Med. Electron Microsc. 2003 36 9 17
38. A. W. Kurian R. R. Balise V. McGuire A. S. Whittemore Gynecol. Oncol. 2005 96 520 530
39. S. Nishimura H. Tsuda K. Ito T. Jobo N. Yaegashi T. Inoue T. Sudo R. S. Berkowitz S. C. Mok Hum. Pathol. 2007 38 134 139
40. T. Fekete E. Raso I. Pete B. Tegze I. Liko G. Munkacsy N. Sipos J. Rigo Jr. B. Gyorffy Int. J. Cancer 2012 131 95 105
41. E. Erba D. Bergamaschi L. Bassano S. Ronzoni G. Di Liberti I. Muradore S. Vignati G. Faircloth J. Jimeno M. D'Incalci Br. J. Cancer. 2000 82 1732 1739
42. N. Eckstein J. Exp. Clin. Cancer Res. 2011 30
43. C. H. Weng K. Y. Lien S. Y. Yang G. B. Lee Microfluid. Nanofluid. 2011 10 301 310
44. Y. N. Yang S. K. Hsiung G. B. Lee Microfluid. Nanofluid. 2009 6 823 833
45. C. J. Huang H. I. Lin S. C. Shiesh G. B. Lee Biosens. Bioelectron. 2012 35 50 55
46. S. B. Huang M. H. Wu Z. F. Cui Z. Cui G. B. Lee J. Micromech. Microeng. 2008 18
47. A. D. Keefe S. Pai A. Ellington Nat. Rev. Drug Discovery 2010 9 537 550
48. J. P. Wang Y. L. Liu T. Teesalu K. N. Sugahara V. R. Kotamrajua J. D. Adams B. S. Ferguson Q. Gong S. S. Oh A. T. Csordas M. Cho E. Ruoslahti Y. Xiao H. T. Soh Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 6909 6914
49. J. L. Reymond J. Immunol. Methods 2002 269 125 131