Polysialylated N-glycans identified in human serum through combined developments in sample preparation, separations, and electrospray ionization-mass spectrometry

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 17, 2014, Pages 8700-8710

  Kronewitter, Scott R ^a   Marginean, Ioan ^a   Cox, Jonathan T ^a   Zhao, Rui ^a   Hagler, Clay D ^a   Shukla, Anil K ^a   Carlson, Timothy S ^a   Adkins, Joshua N ^a   Camp II, David G ^a   Moore, Ronald J ^a   Rodland, Karin D ^a   Smith, Richard D ^a  

^a PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BODY FLUIDS; DESALINATION; ELECTROSPRAY IONIZATION; IONIZATION; MASS SPECTROMETRY;

DETECTION SENSITIVITY; ELECTROSPRAY IONIZATION MASS SPECTROMETRY; ELECTROSPRAY IONIZATIONMASS SPECTROMETRIES (ESI-MS); GRAPHITIZED CARBON COLUMNS; PRESSURE IONIZATION; QUANTITATIVE YIELDS; SODIUM BORO HYDRIDES; SOLID-PHASE EXTRACTION;

POLYSACCHARIDES;

BORANE DERIVATIVE; GLYCOPEPTIDASE; N ACETYLNEURAMINIC ACID; POLYSACCHARIDE; SODIUM BOROHYDRIDE;

BLOOD; BLOOD ANALYSIS; CHEMISTRY; DEVICES; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; GLYCOBIOLOGY; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; HUMAN; ISOLATION AND PURIFICATION; METABOLISM; NANOTECHNOLOGY; PROCEDURES;

BLOOD CHEMICAL ANALYSIS; BOROHYDRIDES; CHROMATOGRAPHY, HIGH PRESSURE LIQUID; GLYCOMICS; HUMANS; N-ACETYLNEURAMINIC ACID; NANOTECHNOLOGY; PEPTIDE-N4-(N-ACETYL-BETA-GLUCOSAMINYL) ASPARAGINE AMIDASE; POLYSACCHARIDES; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION;

EID: 84906856858     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac501839b     Document Type: Article

References (64)

1. Kronewitter et al. Anal. Chem. 2014, 86, 6268 - 6276
2. Kronewitter, S. R.; Slysz, G. W.; Marginean, I.; Hagler, C. D.; LaMarche, B. L.; Zhao, R.; Harris, M. Y.; Monroe, M. E.; Polyukh, C. A.; Crowell, K. L.; Fillmore, T. L.; Carlson, T. S.; Camp, D. G., 2nd; Moore, R. J.; Payne, S. H.; Anderson, G. A.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2014, 86, 6268-6276
3. Apweiler, R.; Hermjakob, H.; Sharon, N. Biochim. Biophys. Acta: Gen. Subj. 1999, 1473, 4-8
4. Ruhaak, L. R.; Miyamoto, S.; Lebrilla, C. B. Mol. Cell. Proteomics 2013, 12, 846-855
5. Kronewitter, S. R.; De Leoz, M. L.; Strum, J. S.; An, H. J.; Dimapasoc, L. M.; Guerrero, A.; Miyamoto, S.; Lebrilla, C. B.; Leiserowitz, G. S. Proteomics 2012, 12, 2523-2538
6. Hua, S.; Williams, C. C.; Dimapasoc, L. M.; Ro, G. S.; Ozcan, S.; Miyamoto, S.; Lebrilla, C. B.; An, H. J.; Leiserowitz, G. S. J. Chromatogr., A 2013, 1279, 58-67
7. Hua, S.; An, H. J.; Ozcan, S.; Ro, G. S.; Soares, S.; DeVere-White, R.; Lebrilla, C. B. Analyst 2011, 136, 3663-3671
8. Hu, Y.; Desantos-Garcia, J. L.; Mechref, Y. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2013, 27, 865-877
9. Gaye, M. M.; Valentine, S. J.; Hu, Y.; Mirjankar, N.; Hammoud, Z. T.; Mechref, Y.; Lavine, B. K.; Clemmer, D. E. J. Proteome Res. 2012, 11, 6102-6110
10. Mechref, Y.; Hu, Y.; Garcia, A.; Hussein, A. Electrophoresis 2012, 33, 1755-1767
11. Mitra, I.; Zhuang, Z.; Zhang, Y.; Yu, C. Y.; Hammoud, Z. T.; Tang, H.; Mechref, Y.; Jacobson, S. C. Anal. Chem. 2012, 84, 3621-3627
12. Alley, W. R., Jr.; Vasseur, J. A.; Goetz, J. A.; Svoboda, M.; Mann, B. F.; Matei, D. E.; Menning, N.; Hussein, A.; Mechref, Y.; Novotny, M. V. J. Proteome Res. 2012, 11, 2282-2300
13. Kang, P.; Madera, M.; Alley, W. R., Jr.; Goldman, R.; Mechref, Y.; Novotny, M. V. Int. J. Mass Spectrom. 2011, 305, 185-198
14. Alley, W. R., Jr.; Madera, M.; Mechref, Y.; Novotny, M. V. Anal. Chem. 2010, 82, 5095-5106
15. Tousi, F.; Bones, J.; Iliopoulos, O.; Hancock, W. S.; Hincapie, M. J. Chromatogr., A 2012, 1256, 121-128
16. Wu, S. L.; Taylor, A. D.; Lu, Q.; Hanash, S. M.; Im, H.; Snyder, M.; Hancock, W. S. Mol. Cell. Proteomics 2013, 12, 1239-1249
17. Cheng, M. C.; Lin, C. H.; Lin, H. J.; Yu, Y. P.; Wu, S. H. Glycobiology 2004, 14, 147-155
18. Rutishauser, U. Nat. Rev. Neurosci. 2008, 9, 26-35
19. Cunningham, B. A.; Hoffman, S.; Rutishauser, U.; Hemperly, J. J.; Edelman, G. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 3116-3120
20. Sadoul, R.; Hirn, M.; Deagostini-Bazin, H.; Rougon, G.; Goridis, C. Nature 1983, 304, 347-349
21. Kim, D. S.; Lee, D. R.; Kim, H. S.; Yoo, J. E.; Jung, S. J.; Lim, B. Y.; Jang, J.; Kang, H. C.; You, S.; Hwang, D. Y.; Leem, J. W.; Nam, T. S.; Cho, S. R.; Kim, D. W. PLoS One 2012, 7, e39715
22. Raitano, S.; Verfaillie, C. M.; Petryk, A. Front. Physiol. 2013, 4, 49
23. Gascon, E.; Vutskits, L.; Kiss, J. Z. Brain Res. Rev. 2007, 56, 101-118
24. Gomez-Climent, M. A.; Guirado, R.; Castillo-Gomez, E.; Varea, E.; Gutierrez-Mecinas, M.; Gilabert-Juan, J.; Garcia-Mompo, C.; Vidueira, S.; Sanchez-Mataredona, D.; Hernandez, S.; Blasco-Ibanez, J. M.; Crespo, C.; Rutishauser, U.; Schachner, M.; Nacher, J. Cereb. Cortex 2011, 21, 1028-1041
25. Bonfanti, L. Prog. Neurobiol. 2006, 80, 129-164
26. James, W. M.; Agnew, W. S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1987, 148, 817-826
27. Curreli, S.; Arany, Z.; Gerardy-Schahn, R.; Mann, D.; Stamatos, N. M. J. Biol. Chem. 2007, 282, 30346-30356
28. Rey-Gallardo, A.; Escribano, C.; Delgado-Martin, C.; Rodriguez-Fernandez, J. L.; Gerardy-Schahn, R.; Rutishauser, U.; Corbi, A. L.; Vega, M. A. Glycobiology 2010, 20, 1139-1146
29. Moebius, J. M.; Widera, D.; Schmitz, J.; Kaltschmidt, C.; Piechaczek, C. BMC Immunol. 2007, 8, 13
30. Fedorkova, L.; Rutishauser, U.; Prosser, R.; Shen, H.; Glass, J. D. Physiol. Behav. 2002, 77, 361-369
31. Glass, J. D.; Watanabe, M.; Fedorkova, L.; Shen, H.; Ungers, G.; Rutishauser, U. Neuroscience 2003, 117, 203-211
32. Glass, J. D.; Shen, H.; Fedorkova, L.; Chen, L.; Tomasiewicz, H.; Watanabe, M. Neurosci. Lett. 2000, 280, 207-210
33. Jimbo, T.; Nakayama, J.; Akahane, K.; Fukuda, M. Int. J. Cancer 2001, 94, 192-199
34. Suzuki, M.; Suzuki, M.; Nakayama, J.; Suzuki, A.; Angata, K.; Chen, S.; Sakai, K.; Hagihara, K.; Yamaguchi, Y.; Fukuda, M. Glycobiology 2005, 15, 887-894
35. Marginean, I.; Kronewitter, S. R.; Moore, R. J.; Slysz, G. W.; Monroe, M. E.; Anderson, G.; Tang, K.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2012, 84, 9208-9213
36. Inoue, S.; Lin, S. L.; Inoue, Y. J. Biol. Chem. 2000, 275, 29968-29979
37. Hu, Y.; Mechref, Y. Electrophoresis 2012, 33, 1768-1777
38. Aldredge, D.; An, H. J.; Tang, N.; Waddell, K.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2012, 11, 1958-1968
39. von Der Ohe, M.; Wheeler, S. F.; Wuhrer, M.; Harvey, D. J.; Liedtke, S.; Muhlenhoff, M.; Gerardy-Schahn, R.; Geyer, H.; Dwek, R. A.; Geyer, R.; Wing, D. R.; Schachner, M. Glycobiology 2002, 12, 47-63
40. Page, J. S.; Tang, K.; Kelly, R. T.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2008, 80, 1800-1805
41. Cox, J. T. (2014, unpublished work.
42. Maniatis, S.; Zhou, H.; Reinhold, V. Anal. Chem. 2010, 82, 2421-2425
43. Kronewitter, S. R.; de Leoz, M. L.; Peacock, K. S.; McBride, K. R.; An, H. J.; Miyamoto, S.; Leiserowitz, G. S.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2010, 9, 4952-4959
44. Maiolica, A.; Borsotti, D.; Rappsilber, J. Proteomics 2005, 5, 3847-3850
45. Tornkvist, A.; Nilsson, S.; Amirkhani, A.; Nyholm, L. M.; Nyholm, L. J. Mass Spectrom. 2004, 39, 216-222
46. Marginean, I.; Page, J. S.; Tolmachev, A. V.; Tang, K.; Smith, R. D. Anal. Chem. 2010, 82, 9344-9349
47. Varki, A.; Cummings, R. D.; Esko, J. D.; Freeze, H. H.; Stanley, P.; Marth, J. D.; Bertozzi, C. R.; Hart, G. W.; Etzler, M. E. Proteomics 2009, 9, 5398-5399
48. Liedtke, S.; Geyer, H.; Wuhrer, M.; Geyer, R.; Frank, G.; Gerardy-Schahn, R.; Zahringer, U.; Schachner, M. Glycobiology 2001, 11, 373-384
49. Kudo, M.; Kitajima, K.; Inoue, S.; Shiokawa, K.; Morris, H. R.; Dell, A.; Inoue, Y. J. Biol. Chem. 1996, 271, 32667-32677
50. Sato, C.; Kitajima, K. J. Biol. Chem. 2013, 154, 115-136
51. Zhang, Y.; Lee, Y. C. J. Biol. Chem. 1999, 274, 6183-6189
52. Pabst, M.; Grass, J.; Toegel, S.; Liebminger, E.; Strasser, R.; Altmann, F. Glycobiology 2012, 22, 389-399
53. Plummer, T. H., Jr.; Elder, J. H.; Alexander, S.; Phelan, A. W.; Tarentino, A. L. J. Biol. Chem. 1984, 259, 10700-10704
54. Roberts, B. A.; Strauss, C. R. ChemInform 2005, 36, 653-661
55. Otera, J.; Nishikido, J. In Esterification: Methods, Reactions, and Applications, 2 nd ed.; Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA: Weinheim, Germany, 2010; pp 3-157.
56. Maley, F.; Trimble, R. B.; Tarentino, A. L.; Plummer, T. H., Jr. Anal. Biochem. 1989, 180, 195-204
57. Kronewitter, S. R.; de Leoz, M. L. A.; Peacock, K. S.; McBride, K. R.; An, H. J.; Miyamoto, S.; Leiserowitz, G. S.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2010, 9, 4952-4959
58. Bynum, M. A.; Yin, H.; Felts, K.; Lee, Y. M.; Monell, C. R.; Killeen, K. Anal. Chem. 2009, 81, 8818-8825
59. Chakraborty, A. B.; Berger, S. J. J. Biomol. Technol. 2005, 16, 327-335
60. Melmer, M.; Stangler, T.; Premstaller, A.; Lindner, W. J. Chromatogr., A 2011, 1218, 118-123
61. Page, J. S.; Marginean, I.; Baker, E. S.; Kelly, R. T.; Tang, K.; Smith, R. D. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009, 20, 2265-2272
62. Gao, Q.; Leung, K. T. J. Chem. Phys. 2005, 123, 074325
63. Kronewitter, S. R.; An, H. J.; de Leoz, M. L.; Lebrilla, C. B.; Miyamoto, S.; Leiserowitz, G. S. Proteomics 2009, 9, 2986-2994
64. Bones, J.; McLoughlin, N.; Hilliard, M.; Wynne, K.; Karger, B. L.; Rudd, P. M. Anal. Chem. 2011, 83, 4154-4162