N-glycan profiling by microchip electrophoresis to differentiate disease states related to esophageal adenocarcinoma

Analytical Chemistry

Volumn 84, Issue 8, 2012, Pages 3621-3627

  Mitra, Indranil ^a   Zhuang, Zexi ^a   Zhang, Yuening ^a   Yu, Chuan Yih ^b   Hammoud, Zane T ^c   Tang, Haixu ^b   Mechref, Yehia ^d   Jacobson, Stephen C ^a  

^a INDIANA UNIVERSITY   (United States)

^b INDIANA UNIVERSITY   (United States)

^c HENRY FORD HOSPITAL   (United States)

^d TEXAS TECH UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BARRETT'S ESOPHAGUS; DISEASE STATE; FLUORESCENT LABELS; LASER INDUCED FLUORESCENCE DETECTION; MICROCHIP ELECTROPHORESIS; MIGRATION TIME; N-GLYCAN; N-GLYCANS; PEAK AREA; PRINCIPAL COMPONENT ANALYSIS (PCA); SERUM SAMPLES; TRISULFONIC ACID;

MICROPROCESSOR CHIPS; PRINCIPAL COMPONENT ANALYSIS;

ELECTROPHORESIS;

POLYSACCHARIDE;

ADENOCARCINOMA; ARTICLE; BARRETT ESOPHAGUS; BLOOD; ESOPHAGUS TUMOR; HUMAN; MICROCHIP ELECTROPHORESIS; STANDARD;

ADENOCARCINOMA; BARRETT ESOPHAGUS; ELECTROPHORESIS, MICROCHIP; ESOPHAGEAL NEOPLASMS; HUMANS; POLYSACCHARIDES; REFERENCE STANDARDS;

EID: 84859885721     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac203431s     Document Type: Article

References (42)

1. Jemal, A.; Murray, T.; Samuels, A.; Ghafoor, A.; Ward, E.; Thun, M. J. CA-Cancer J. Clin. 2003, 53, 5-26
2. Fiorica, F.; Di Bona, D.; Schepis, F.; Licata, A.; Shahied, L.; Venturi, A.; Falchi, A. M.; Craxi, A.; Camma, C. Gut 2004, 53, 925-930
3. Hakomori, S. Cancer Res. 1996, 56, 5309-5318
4. Kobata, A. Glycoconjugate J. 1998, 15, 323-331
5. Devesa, S. S.; Blot, W. J.; Fraumeni, J. F. Cancer 1998, 83, 2049-2053
6. Blot, W. J.; Devesa, S. S.; Fraumeni, J. F. JAMA-J. Am. Med. Assoc. 1993, 270, 1320-1320
7. Mechref, Y.; Novotny, M. V. Chem. Rev. 2002, 102, 321-369
8. Mechref, Y.; Novotny, M. V. J. Chromatogr., B 2006, 841, 65-78
9. Kirmiz, C.; Li, B. S.; An, H. J.; Clowers, B. H.; Chew, H. K.; Lam, K. S.; Ferrige, A.; Alecio, R.; Borowsky, A. D.; Sulaimon, S.; Lebrilla, C. B.; Miyamoto, S. Mol. Cell. Proteomics 2007, 6, 43-55
10. Kyselova, Z.; Mechref, Y.; Kang, P.; Goetz, J. A.; Dobrolecki, L. E.; Sledge, G. W.; Schnaper, L.; Hickey, R. J.; Malkas, L. H.; Novotny, M. V. Clin. Chem. 2008, 54, 1166-1175
11. Abd Hamid, U. M.; Royle, L.; Saldova, R.; Radcliffe, C. M.; Harvey, D. J.; Storr, S. J.; Pardo, M.; Antrobus, R.; Chapman, C. J.; Zitzmann, N.; Robertson, J. F.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M. Glycobiology 2008, 18, 1105-1118
12. Goetz, J. A.; Mechref, Y.; Kang, P.; Jeng, M. H.; Novotny, M. V. Glycoconjugate J. 2009, 26, 117-131
13. Pierce, A.; Saldova, R.; Abd Hamid, U. M.; Abrahams, J. L.; McDermott, E. W.; Evoy, D.; Duffy, M. J.; Rudd, P. M. Glycobiology 2010, 20, 1283-1288
14. An, H. J.; Miyamoto, S.; Lancaster, K. S.; Kirmiz, C.; Li, B. S.; Lam, K. S.; Leiserowitz, G. S.; Lebrilla, C. B. J. Proteome Res. 2006, 5, 1626-1635
15. Saldova, R.; Royle, L.; Radcliffe, C. M.; Hamid, U. M. A.; Evans, R.; Arnold, J. N.; Banks, R. E.; Hutson, R.; Harvey, D. J.; Antrobus, R.; Petrescu, S. M.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M. Glycobiology 2007, 17, 1344-1356
16. Tabares, G.; Radcliffe, C. M.; Barrabes, S.; Ramirez, M.; Aleixandre, R. N.; Hoesel, W.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M.; Peracaula, R.; de Llorens, R. Glycobiology 2006, 16, 132-145
17. Kyselova, Z.; Mechref, Y.; Al Bataineh, M. M.; Dobrolecki, L. E.; Hickey, R. J.; Vinson, J.; Sweeney, C. J.; Novotny, M. V. J. Proteome Res. 2007, 6, 1822-1832
18. Goldman, R.; Ressom, H. W.; Varghese, R. S.; Goldman, L.; Bascug, G.; Loffredo, C. A.; Abdel-Hamid, M.; Gouda, I.; Ezzat, S.; Kyselova, Z.; Mechref, Y.; Novotny, M. V. Clin. Cancer Res. 2009, 15, 1808-1813
19. Vercoutter-Edouart, A. S.; Slomianny, M. C.; Dekeyzer-Beseme, O.; Haeuw, J. F.; Michalski, J. C. Proteomics 2008, 8, 3236-3256
20. Zhao, J.; Simeone, D. M.; Heidt, D.; Anderson, M. A.; Lubman, D. M. J. Proteome Res. 2006, 5, 1792-1802
21. Zhao, J.; Qiu, W. L.; Simeone, D. M.; Lubman, D. M. J. Proteome Res. 2007, 6, 1126-1138
22. Mechref, Y.; Hussein, A.; Bekesova, S.; Pungpapong, V.; Zhang, M.; Dobrolecki, L. E.; Hickey, R. J.; Hammoud, Z. T.; Novotny, M. V. J. Proteome Res. 2009, 8, 2656-2666
23. Liu, J. P.; Shirota, O.; Wiesler, D.; Novotny, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991, 88, 2302-2306
24. Nashabeh, W.; El Rassi, Z. J. Chromatogr., A 1992, 600, 279-287
25. Kakehi, K.; Susami, A.; Taga, A.; Suzuki, S.; Honda, S. J. Chromatogr., A 1994, 680, 209-215
26. Archer-Hartmann, S. A.; Sargent, L. M.; Lowry, D. T.; Holland, L. A. Anal. Chem. 2011, 83, 2740-2747
27. Dang, F. Q.; Zhang, L. H.; Jabasini, M.; Kaji, N.; Baba, Y. Anal. Chem. 2003, 75, 2433-2439
28. Callewaert, N.; Contreras, R.; Mitnik-Gankin, L.; Carey, L.; Matsudaira, P.; Ehrlich, D. Electrophoresis 2004, 25, 3128-3131
29. Dang, F. Q.; Kakehi, K.; Nakajima, K.; Shinohara, Y.; Ishikawa, M.; Kaji, N.; Tokeshi, M.; Baba, Y. J. Chromatogr., A 2006, 1109, 138-143
30. Zhuang, Z.; Starkey, J. A.; Mechref, Y.; Novotny, M. V.; Jacobson, S. C. Anal. Chem. 2007, 79, 7170-7175
31. Zhuang, Z.; Mitra, I.; Hussein, A.; Novotny, M. V.; Mechref, Y.; Jacobson, S. C. Electrophoresis 2011, 32, 246-253
32. Vanderschaeghe, D.; Szekrenyes, A.; Wenz, C.; Gassmann, M.; Naik, N.; Bynum, M.; Yin, H. F.; Delanghe, J.; Guttman, A.; Callewaert, N. Anal. Chem. 2010, 82, 7408-7415
33. Mechref, Y.; Novotny, M. V. Anal. Chem. 1998, 70, 455-463
34. Evangelista, R. A.; Liu, M. S.; Chen, F. T. A. Anal. Chem. 1995, 67, 2239-2245
35. Evangelista, R. A.; Chen, F. T. A.; Guttman, A. J. Chromatogr., A 1996, 745, 273-280
36. Hjerten, S. J. Chromatogr. 1985, 347, 191-198
37. Griffiths, S. K.; Nilson, R. H. Anal. Chem. 2001, 73, 272-278
38. Molho, J. I.; Herr, A. E.; Mosier, B. P.; Santiago, J. G.; Kenny, T. W.; Brennen, R. A.; Gordon, G. B.; Mohammadi, B. Anal. Chem. 2001, 73, 1350-1360
39. Ramsey, J. D.; Jacobson, S. C.; Culbertson, C. T.; Ramsey, J. M. Anal. Chem. 2003, 75, 3758-3764
40. Jacobson, S. C.; Hergenröder, R.; Koutny, L. B.; Warmack, R. J.; Ramsey, J. M. Anal. Chem. 1994, 66, 1107-1113
41. Hotelling, H. J. Educ. Psychol. 1933, 24, 417-441
42. Musumarra, G.; Barresi, V.; Condorelli, D. F.; Scire, S. Biol. Chem. 2003, 384, 321-327