Sample preparation for mass spectrometric analysis of human serum N-glycans using hydrophilic interaction chromatography-based solid phase extraction

Analyst

Volumn 139, Issue 18, 2014, Pages 4538-4546

  Cao, Liwei ^a   Zhang, Ye ^b   Chen, Linlin ^b   Shen, Aijin ^a   Zhang, Xingwang ^c   Ren, Shifang ^c   Gu, Jianxin ^c   Yu, Long ^a   Liang, Xinmiao ^a  

^a DALIAN INSTITUTE OF CHEMICAL PHYSICS   (China)

^b DALIAN MEDICAL UNIVERSITY   (China)

^c FUDAN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

GLYCOPROTEIN; PLASMA PROTEIN; POLYSACCHARIDE;

BLOOD; CARBOHYDRATE ANALYSIS; CHEMICAL PHENOMENA; CHEMISTRY; HUMAN; ISOLATION AND PURIFICATION; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR GENETICS; PROCEDURES; SOLID PHASE EXTRACTION;

BLOOD PROTEINS; CARBOHYDRATE SEQUENCE; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; GLYCOPROTEINS; HUMANS; HYDROPHOBIC AND HYDROPHILIC INTERACTIONS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; POLYSACCHARIDES; SOLID PHASE EXTRACTION; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 84906089657     PISSN: 00032654     EISSN: 13645528     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c4an00660g     Document Type: Article

References (46)

1. N. L. Anderson, N. G. Anderson: Mol. Cell. Proteomics 2002 1, 845-867.
2. N. L. Anderson, M. Polanski, R. Pieper, T. Gatlin, R. S. Tirumalai, T. P. Conrads, T. D. Veenstra, J. N. Adkins, J. G. Pounds, R. Fagan, A. Lobley: Mol. Cell. Proteomics 2004 3, 311-326.
3. C. D. Calvano, C. G. Zambonin, O. N. Jensen: J. Proteomics 2008 71, 304-317.
4. R. P. McEver: Curr. Opin. Cell Biol. 2002 14, 581-586.
5. K. Ebnet, D. Vestweber: Histochem. Cell Biol. 1999 112, 1-23.
6. W. S. Sly: J. Clin. Invest. 2000 105, 563-564.
7. C. I. A. Balog, K. Stavenhagen, W. L. J. Fung, C. A. Koeleman, L. A. McDonnell, A. Verhoeven, W. E. Mesker, R. A. E. M. Tollenaar, A. M. Deelder, M. Wuhrer: Mol. Cell. Proteomics 2012 11, 571-585.
8. Z. Q. Tang, R. S. Varghese, S. Bekesova, C. A. Loffredo, M. A. Hamid, Z. Kyselova, Y. Mechref, M. V. Novotny, R. Goldman, H. W. Ressom: J. Proteome Res. 2010 9, 104-112.
9. M. L. A. de Leoz, L. J. T. Young, H. J. An, S. R. Kronewitter, J. H. Kim, S. Miyamoto, A. D. Borowsky, H. K. Chew, C. B. Lebrilla: Mol. Cell. Proteomics 2011 10. DOI: 10.1074/mcp.m110.002717.
10. J. N. Arnold, R. Saldova, M. C. Galligan, T. B. Murphy, Y. Mimura-Kimura, J. E. Telford, A. K. Godwin, P. M. Rudd: J. Proteome Res. 2011 10, 1755-1764.
11. J. Zaia: OMICS 2010 14, 401-418.
12. M. Wuhrer: Glycoconjugate J. 2013 30, 11-22.
13. Y. Mechref, Y. L. Hu, A. Garcia, A. Hussein: Electrophoresis 2012 33, 1755-1767.
14. A. L. Tarentino, C. M. Gomez, T. H. Plummer: Biochemistry 1985 24, 4665-4671.
15. R. Chen, F. J. Wang, Y. X. Tan, Z. Sun, C. X. Song, M. L. Ye, H. Y. Wang, H. F. Zou: J. Proteomics 2012 75, 1666-1674.
16. K. A. Stumpo, V. N. Reinhold: J. Proteome Res. 2010 9, 4823-4830.
17. L. R. Ruhaak, R. Hennig, C. Huhn, M. Borowiak, R. J. E. M. Dolhain, A. M. Deelder, E. Rapp, M. Wuhrer: J. Proteome Res. 2010 9, 6655-6664.
18. H. J. An, P. Gip, J. Kim, S. Wu, K. W. Park, C. T. McVaugh, D. V. Schaffer, C. R. Bertozzi, C. B. Lebrilla: Mol. Cell. Proteomics 2012 11. DOI: 10.1074/mcp.m111.010660.
19. M. Barboza, J. Pinzon, S. Wickramasinghe, J. W. Froehlich, I. Moeller, J. T. Smilowitz, L. R. Ruhaak, J. C. Huang, B. Lonnerdal, J. B. German, J. F. Medrano, B. C. Weimer, C. B. Lebrilla: Mol. Cell. Proteomics 2012 11. DOI: 10.1074/mcp.m111.015248.
20. S. R. Kronewitter, M. L. A. de Leoz, K. S. Peacock, K. R. McBride, H. J. An, S. Miyamoto, G. S. Leiserowitz, C. B. Lebrilla: J. Proteome Res. 2010 9, 4952-4959.
21. W. R. Alley, J. A. Vasseur, J. A. Goetz, M. Syoboda, B. F. Mann, D. E. Matei, N. Menning, A. Hussein, Y. Mechref, M. V. Novotny: J. Proteome Res. 2012 11, 2282-2300.
22. L. R. Ruhaak, C. Huhn, W. J. Waterreus, A. R. de Boer, C. Neususs, C. H. Hokke, A. M. Deelder, M. Wuhrer: Anal. Chem. 2008 80, 6119-6126.
23. M. H. J. Selman, M. Hemayatkar, A. M. Deelder, M. Wuhrer: Anal. Chem. 2011 83, 2492-2499.
24. Y. Takegawa, K. Deguchi, T. Keira, H. Ito, H. Nakagawa, S. I. Nishimura: J. Chromatogr. A 2006 1113, 177-181.
25. W. Morelle, J. C. Michalski: Nat. Protoc. 2007 2, 1585-1602.
26. P. C. Pang, P. C. N. Chiu, C. L. Lee, L. Y. Chang, M. Panico, H. R. Morris, S. M. Haslam, K. H. Khoo, G. F. Clark, W. S. B. Yeung, A. Dell: Science 2011 333, 1761-1764.
27. G. F. Clark, P. Grassi, P. C. Pang, M. Panico, D. Lafrenz, E. Z. Drobnis, M. R. Baldwin, H. R. Morris, S. M. Haslam, S. Schedin-Weiss, W. Sun, A. Dell: Mol. Cell. Proteomics 2012 11. DOI: 10.1074/mcp.m111.008730.
28. S. Yang, Y. Li, P. Shah, H. Zhang: Anal. Chem. 2013 85, 5555-5561.
29. J. I. Furukawa, Y. Shinohara, H. Kuramoto, Y. Miura, H. Shimaokat, M. Kurogochi, M. Nakano, S. I. Nishimura: Anal. Chem. 2008 80, 1094-1101.
30. N. Fujitani, J. Furukawa, K. Araki, T. Fujioka, Y. Takegawa, J. Piao, T. Nishioka, T. Tamura, T. Nikaido, M. Ito, Y. Nakamura, Y. Shinohara: Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2013 110, 2105-2110.
31. S. J. Yang, H. Zhang: Anal. Chem. 2012 84, 2232-2238.
32. H. Q. Qin, P. Gao, F. J. Wang, L. Zhao, J. Zhu, A. Q. Wang, T. Zhang, R. Wu, H. F. Zou: Angew. Chem., Int. Ed. 2011 50, 12218-12221.
33. W. R. Alley, M. Madera, Y. Mechref, M. V. Novotny: Anal. Chem. 2010 82, 5095-5106.
34. L. W. Cao, L. Yu, Z. M. Guo, A. J. Shen, Y. N. Guo, X. M. Liang: J. Proteome Res. 2014 13, 1485-1493.
35. Y. F. Qian, Y. S. Wang, X. W. Zhang, L. Zhou, Z. J. Zhang, J. J. Xu, Y. Y. Ruan, S. F. Ren, C. J. Xu, J. X. Gu: J. Proteome Res. 2013 12, 4046-4055.
36. P. Kang, Y. Mechref, Z. Kyselova, J. A. Goetz, M. V. Novotny: Anal. Chem. 2007 79, 6064-6073.
37. J. M. Prien, D. J. Ashline, A. J. Lapadula, H. Zhang, V. N. Reinhold: J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2009 20, 539-556.
38. D. Aldredge, H. J. An, N. Tang, K. Waddell, C. B. Lebrilla: J. Proteome Res. 2012 11, 1958-1968.
39. Y. Miura, M. Hato, Y. Shinohara, H. Kuramoto, J. I. Furukawa, M. Kurogochi, H. Shimaoka, M. Tada, K. Nakanishi, M. Ozaki, S. Todo, S. I. Nishimura: Mol. Cell. Proteomics 2008 7, 370-377.
40. B. Ma, J. L. Simala-Grant, D. E. Taylor: Glycobiology 2006 16, 158r-184r.
41. H. Q. Qin, L. Zhao, R. B. Li, R. A. Wu, H. F. Zou: Anal. Chem. 2011 83, 7721-7728.
42. A. J. Shen, Z. M. Guo, L. Yu, L. W. Cao, X. M. Liang: Chem. Commun. 2011 47, 4550-4552.
43. P. L. Hao, T. N. Guo, S. K. Sze: PLoS One 2011 6, e16884.
44. L. W. Cao, L. Yu, Z. M. Guo, X. L. Li, X. Y. Xue, X. M. Liang: J. Chromatogr. A 2013 1299, 18-24.
45. J. Li, X. L. Li, Z. M. Guo, L. Yu, L. J. Zou, X. M. Liang: Analyst 2011 136, 4075-4082.
46. W. Jiang, G. Fischer, Y. Girmay, K. Irgum: J. Chromatogr. A 2006 1127, 82-91.