A cyclic dinucleotide containing 2-aminopurine is a general fluorescent sensor for c-di-GMP and 3′,3′-cGAMP

Molecular BioSystems

Volumn 10, Issue 6, 2014, Pages 1568-1575

  Roembke, Benjamin T ^a   Zhou, Jie ^a   Zheng, Yue ^a   Sayre, David ^a   Lizardo, Allan ^a   Bernard, Laurentee ^a   Sintim, Herman O ^a  

^a University of Maryland   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

2 AMINOPURINE; CYCLIC GMP; CYCLIC GUANOSINE MONOPHOSPHATE-ADENOSINE MONOPHOSPHATE; CYCLIC NUCLEOTIDE; MOLECULAR PROBE;

ANALOGS AND DERIVATIVES; BIOFILM; CHEMISTRY; FLUORESCENCE; METABOLISM; MOLECULAR PROBE; SECOND MESSENGER; SIGNAL TRANSDUCTION;

2-AMINOPURINE; BIOFILMS; CYCLIC GMP; FLUORESCENCE; MOLECULAR PROBES; NUCLEOTIDES, CYCLIC; SECOND MESSENGER SYSTEMS; SIGNAL TRANSDUCTION;

EID: 84900346065     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3mb70518h     Document Type: Article

References (48)

1. S. L. Chua S. Y. Tan M. T. Rybtke Y. Chen S. A. Rice S. Kjelleberg T. Tolker-Nielsen L. Yang M. Givskov Antimicrob. Agents Chemother. 2013 57 2066 2075
2. R. Paul S. Weiser N. C. Amiot C. Chan T. Schirmer B. Giese U. Jenal Genes Dev. 2004 18 715 727
3. A. D. Tischler A. Camilli Mol. Microbiol. 2004 53 857 869
4. R. W. McKee M. R. Mangalea E. B. Purcell E. K. Borchardt R. Tamayo J. Bacteriol. 2013 195 5174 5185
5. D. Kalia G. Merey S. Nakayama Y. Zheng J. Zhou Y. Luo M. Guo B. T. Roembke H. O. Sintim Chem. Soc. Rev. 2013 42 305 341
6. K. D. Smith S. V. Lipchock T. D. Ames J. Wang R. R. Breaker S. A. Strobel Nat. Struct. Mol. Biol. 2009 16 1218 1223
7. J. W. Nelson N. Sudarsan K. Furukawa Z. Weinberg J. Wang R. R. Breaker Nat. Chem. Biol. 2013 9 834 839
8. Y. Luo J. Zhou J. Wang T. K. Dayie H. O. Sintim Mol. BioSyst. 2013 9 1535 1539
9. K. D. Smith C. A. Shanahan E. L. Moore A. C. Simon S. A. Strobel Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011 108 7757 7762
10. B. W. Davies R. W. Bogard T. S. Young J. J. Mekalanos Cell 2012 149 358 370
11. Q. Yin Y. Tian V. Kabaleeswaran X. Jiang D. Tu M. J. Eck Z. J. Chen H. Wu Mol. Cell 2012 46 735 745
12. T. S. Xiao K. A. Fitzgerald Mol. Cell 2013 51 135 139
13. P. Gao M. Ascano Y. Wu W. Barchet B. L. Gaffney T. Zillinger A. A. Serganov Y. Liu R. A. Jones G. Hartmann T. Tuschl D. J. Patel Cell 2013 153 1094 1107
14. X. Zhang H. Shi J. Wu X. Zhang L. Sun C. Chen Z. J. Chen Mol. Cell 2013 51 226 235
15. L. Sun J. Wu F. Du X. Chen Z. J. Chen Science 2013 339 786 791
16. D. Gao J. Wu Y.-T. Wu F. Du C. Aroh N. Yan L. Sun Z. J. Chen Science 2013 341 903 906
17. I. Kiburu A. Shurer L. Yan H. O. Sintim Mol. Biosyst. 2008 4 518 520
18. H. C.-Y. Jenny D. Don J. Oger Nucleosides Nucleotides 1985 4 377 389
19. O. Magdenoska J. Martinussen J. Thykaer K. F. Nielsen Anal. Biochem. 2013 440 166 177
20. V. Stelitano A. Brandt S. Fernicola S. Franceschini G. Giardina A. Pica S. Rinaldo F. Sica F. Cutruzzola Nucleic Acids Res. 2013 41 e79
21. S. Nakayama Y. L. Luo J. Zhou T. K. Dayie H. O. Sintim Chem. Commun. 2012 48 9059 9061
22. H. Gu K. Furukawa R. R. Breaker Anal. Chem. 2012 84 4935 4941
23. S. Nakayama I. Kelsey J. Wang K. Roelofs B. Stefane Y. Luo V. T. Lee H. O. Sintim J. Am. Chem. Soc. 2011 133 4856 4864
24. S. Nakayama K. Roelofs V. T. Lee H. O. Sintim Mol. Biosyst. 2012 8 726 729
25. S. Nakayama I. Kelsey J. Wang H. O. Sintim Chem. Commun. 2011 47 4766 4768
26. B. T. Roembke J. X. Wang S. Nakayama J. Zhou H. O. Sintim RSC Adv. 2013 3 6305 6310
27. M. T. Rybtke B. R. Borlee K. Murakami Y. Irie M. Hentzer T. E. Nielsen M. Givskov M. R. Parsek T. Tolker-Nielsen Appl. Environ. Microbiol. 2012 78 5060 5069
28. C. A. Kellenberger S. C. Wilson J. Sales-Lee M. C. Hammond J. Am. Chem. Soc. 2013 135 4906 4909
29. D. Antoniani P. Bocci A. Maciag N. Raffaelli P. Landini Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010 85 1095 1104
30. M. Egli R. V. Gessner L. D. Williams G. J. Quigley G. A. van der Marel J. H. van Boom A. Rich C. A. Frederick Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1990 87 3235 3239
31. S. O. Kelley J. K. Barton Science 1999 283 375 381
32. O. J. G. Somsen V. A. Hoek V. H. Amerongen Chem. Phys. Lett. 2005 402 61 65
33. S. Bharill P. Sarkar J. D. Ballin I. Gryczynski G. M. Wilson Z. Gryczynski Anal. Biochem. 2008 377 141 149
34. J. M. Jean K. B. Hall Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 37 41
35. M. Gentner M. G. Allan F. Zaehringer T. Schirmer S. Grzesiek J. Am. Chem. Soc. 2012 134 1019 1029
36. I. Kelsey S. Nakayama H. O. Sintim Bioorg. Med. Chem. Lett. 2012 22 881 885
37. M. J. J. Blommers C. A. G. Haasnoot J. Walters G. A. van der Marel J. H. van Boom C. W. Hilbers Biochemistry 1988 27 8361 8369
38. B. Christen M. Christen R. Paul F. Schmid M. Folcher P. Jenoe M. Meuwly U. Jenal J. Biol. Chem. 2006 281 32015 32024
39. G. Witte S. Hartung K. Buttner K. P. Hopfner Mol. Cell 2008 30 167 178
40. P. Ross H. Weinhouse Y. Aloni D. Michaeli P. Weinberger-Ohana R. Mayer S. Braun E. de Vroom G. A. van der Marel J. H. van Boom M. Benziman Nature 1987 325 279 281
41. Y. Wang K. Hamasaki R. R. Rando Biochemistry 1997 36 768 779
42. S. S. Al-Saleh S. Khan Prep. Biochem. Biotechnol. 2011 41 262 277
43. D. Amikam M. Benziman J. Bacteriol. 1989 171 6649 6655
44. K. Sambanthamoorthy R. E. Sloup V. Parashar J. M. Smith E. E. Kim M. F. Semmelhack M. B. Neiditch C. M. Waters Antimicrob. Agents Chemother. 2012 56 5202 5211
45. K. Sambanthamoorthy C. Luo N. Pattabiraman X. Feng B. Koestler B. Koestler C. M. Waters T. J. Palys Biofouling 2014 30 17 28
46. J. Wang J. Zhou G. P. Donaldson S. Nakayama L. Yan Y.-F. Lam V. T. Lee H. O. Sintim J. Am. Chem. Soc. 2011 133 9320 9330
47. J. Zhou D. A. Sayre J. X. Wang N. Pahadi H. O. Sintim Molecules 2012 17 13376 13389
48. J. Zhou D. A. Sayre Y. Zheng H. Szmacinski H. O. Sintim Anal. Chem. 2014 86 2412 2420