Boolean logic tree of graphene-based chemical system for molecular computation and intelligent molecular search query

Analytical Chemistry

Volumn 86, Issue 9, 2014, Pages 4494-4500

  Huang, Wei Tao ^a   Luo, Hong Qun ^a   Li, Nian Bing ^a  

^a SOUTHWEST UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

APPLICATION PROGRAMS; CHEMICAL ANALYSIS; COMPLEX NETWORKS; DRUG DELIVERY; FUZZY LOGIC; GRAPHENE; LOGIC PROGRAMMING; QUERY PROCESSING; SEARCH ENGINES;

BASIC LOGIC GATES; CHEMICAL INTERACTIONS; CHEMICAL SYSTEMS; COMBINATORIAL LOGIC; FENTON REACTIONS; MOLECULAR COMPUTATIONS; MOLECULAR COMPUTING DEVICES; MOLECULAR EVENTS;

COMPUTATION THEORY;

GRAPHITE;

CHEMISTRY; FUZZY LOGIC; INFORMATION RETRIEVAL;

FUZZY LOGIC; GRAPHITE; INFORMATION STORAGE AND RETRIEVAL;

EID: 84899867144     PISSN: 00032700     EISSN: 15206882     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac5004008     Document Type: Article

References (87)

1. Benenson, Y.; Gil, B.; Ben-Dor, U.; Adar, R.; Shapiro, E. Nature 2004, 429, 423-429
2. Braich, R. S. Science 2002, 296, 499-502
3. Ausländer, S.; Ausländer, D.; Müller, M.; Wieland, M.; Fussenegger, M. Nature 2012, 487, 123-127
4. Regot, S.; Macia, J.; Conde, N.; Furukawa, K.; Kjellén, J.; Peeters, T.; Hohmann, S.; Nadal, E. de; Posas, F.; Solé, R. Nature 2010, 469, 207-211
5. Tamsir, A.; Tabor, J. J.; Voigt, C. A. Nature 2010, 469, 212-215
6. de Silva, A. P.; Uchiyama, S. Nat. Nanotechnol. 2007, 2, 399-410
7. Benenson, Y.; Paz-Elizur, T.; Adar, R.; Keinan, E.; Livneh, Z.; Shapiro, E. Nature 2001, 414, 430-434
8. Qian, L.; Winfree, E. Science 2011, 332, 1196-1201
9. Benenson, Y. Nat. Rev. Genet. 2012, 13, 455-468
10. de Silva, A. P.; Gunaratne, N. H. Q.; McCoy, C. P. Nature 1993, 364, 42-44
11. Szaciłowski, K. Chem. Rev. 2008, 108, 3481-3548
12. Kou, S.; Lee, H. N.; Van Noort, D.; Swamy, K. M. K.; Kim, S. H.; Soh, J. H.; Lee, K.-M.; Nam, S.-W.; Yoon, J.; Park, S. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 872-876
13. Margulies, D.; Melman, G.; Felder, C. E.; Arad-Yellin, R.; Shanzer, A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 15400-15401
14. de Silva, A. P.; McClenaghan, N. D. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3965-3966
15. Coskun, A.; Deniz, E.; Akkaya, E. U. Org. Lett. 2005, 7, 5187-5189
16. Langford, S. J.; Yann, T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 14951-14951
17. Perez-Inestrosa, E.; Montenegro, J.-M.; Collado, D.; Suau, R. Chem. Commun. 2008, 1085-1087
18. Amelia, M.; Baroncini, M.; Credi, A. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 6240-6243
19. Andréasson, J.; Straight, S. D.; Bandyopadhyay, S.; Mitchell, R. H.; Moore, T. A.; Moore, A. L.; Gust, D. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 958-961
20. Ceroni, P.; Bergamini, G.; Balzani, V. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 8516-8518
21. Andréasson, J.; Straight, S. D.; Moore, T. A.; Moore, A. L.; Gust, D. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 11122-11128
22. Macdonald, J.; Stefanovic, D.; Stojanovic, M. N. Sci. Am. 2008, 299, 84-91
23. Stojanovic, M. N.; Stefanovic, D. Nat. Biotechnol. 2003, 21, 1069-1074
24. de Silva, A. P.; James, M. R.; McKinney, B. O. F.; Pears, D. A.; Weir, S. M. Nat. Mater. 2006, 5, 787-789
25. Bälter, M.; Li, S.; Nilsson, J. R.; Andréasson, J.; Pischel, U. J. Am. Chem. Soc. 2013, 135, 10230-10233
26. Andréasson, J.; Pischel, U. Chem. Soc. Rev. 2009, 39, 174
27. Remón, P.; Hammarson, M.; Li, S.; Kahnt, A.; Pischel, U.; Andréasson, J. Chem.-Eur. J. 2011, 17, 6492-6500
28. Pais, V. F.; Remón, P.; Collado, D.; Andréasson, J.; Pérez-Inestrosa, E.; Pischel, U. Org. Lett. 2011, 13, 5572-5575
29. Remón, P.; Bälter, M.; Li, S.; Andréasson, J.; Pischel, U. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 20742-20745
30. Orbach, R.; Remacle, F.; Levine, R. D.; Willner, I. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012, 109, 21228-21233
31. Gentili, P. L. Chem. Phys. 2007, 336, 64-73
32. Gentili, P. L. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 11992-11997
33. Gentili, P. L. Phys. Chem. Chem. Phys. 2011, 13, 20335-20344
34. Andréasson, J.; Pischel, U.; Straight, S. D.; Moore, T. A.; Moore, A. L.; Gust, D. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 11641-11648
35. Leisner, M.; Bleris, L.; Lohmueller, J.; Xie, Z.; Benenson, Y. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 666-670
36. Privman, V.; Arugula, M. A.; Halámek, J.; Pita, M.; Katz, E. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 5301-5310
37. Arugula, M. A.; Halamek, J.; Katz, E.; Melnikov, D.; Pita, M.; Privman, V.; Strack, G. In 2009 Second International Conference on Advances in Circuits, Electronics and Micro-electronics; IEEE: Piscataway, NJ, 2009; pp 1-7.
38. Strack, G.; Ornatska, M.; Pita, M.; Katz, E. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 4234-4235
39. Privman, V.; Pedrosa, V.; Melnikov, D.; Pita, M.; Simonian, A.; Katz, E. Biosens. Bioelectron. 2009, 25, 695-701
40. Fedichkin, L.; Katz, E.; Privman, V. J. Comput. Theor. Nanosci. 2008, 5, 36-43
41. Zhou, J.; Arugula, M. A.; Halamek, J.; Pita, M.; Katz, E. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 16065-16070
42. Zavalov, O.; Bocharova, V.; Privman, V.; Katz, E. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 9683-9689
43. Halámek, J.; Zavalov, O.; Halámková, L.; Korkmaz, S.; Privman, V.; Katz, E. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 4457-4464
44. MacVittie, K.; Halámek, J.; Katz, E. Chem. Commun. 2012, 48, 11742-11744
45. MacVittie, K.; Halámek, J.; Privman, V.; Katz, E. Chem. Commun. 2013, 49, 6962-6964
46. Bocharova, V.; MacVittie, K.; Chinnapareddy, S.; Halamek, J.; Privman, V.; Katz, E. J. Phys. Chem. Lett. 2012, 3, 1234-1237
47. Qian, L.; Winfree, E.; Bruck, J. Nature 2011, 475, 368-372
48. Xie, Z.; Wroblewska, L.; Prochazka, L.; Weiss, R.; Benenson, Y. Science 2011, 333, 1307-1311
49. Douglas, S. M.; Bachelet, I.; Church, G. M. Science 2012, 335, 831-834
50. Pei, R.; Matamoros, E.; Liu, M.; Stefanovic, D.; Stojanovic, M. N. Nat. Nanotechnol. 2010, 5, 773-777
51. Rinaudo, K.; Bleris, L.; Maddamsetti, R.; Subramanian, S.; Weiss, R.; Benenson, Y. Nat. Biotechnol. 2007, 25, 795-801
52. Wei, B.; Dai, M.; Yin, P. Nature 2012, 485, 623-626
53. Andersen, E. S.; Dong, M.; Nielsen, M. M.; Jahn, K.; Subramani, R.; Mamdouh, W.; Golas, M. M.; Sander, B.; Stark, H.; Oliveira, C. L. P.; Pedersen, J. S.; Birkedal, V.; Besenbacher, F.; Gothelf, K. V.; Kjems, J. Nature 2009, 459, 73-76
54. Bunz, U. H.; Rotello, V. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 3268-3279
55. Yang, W.; Ratinac, K. R.; Ringer, S. P.; Thordarson, P.; Gooding, J. J.; Braet, F. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 2114-2138
56. Yang, R.; Jin, J.; Chen, Y.; Shao, N.; Kang, H.; Xiao, Z.; Tang, Z.; Wu, Y.; Zhu, Z.; Tan, W. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 8351-8358
57. Lu, C.-H.; Yang, H.-H.; Zhu, C.-L.; Chen, X.; Chen, G.-N. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 4785-4787
58. He, S.; Song, B.; Li, D.; Zhu, C.; Qi, W.; Wen, Y.; Wang, L.; Song, S.; Fang, H.; Fan, C. Adv. Funct. Mater. 2010, 20, 453-459
59. Jung, J. H.; Cheon, D. S.; Liu, F.; Lee, K. B.; Seo, T. S. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 49, 5708-5711
60. Huang, W. T.; Zhang, J. R.; Xie, W. Y.; Shi, Y.; Luo, H. Q.; Li, N. B. Biosens. Bioelectron. 2014, 57, 117-124
61. Huang, W. T.; Xie, W. Y.; Shi, Y.; Luo, H. Q.; Li, N. B. J. Mater. Chem. 2012, 22, 1477-1481
62. Huang, W. T.; Shi, Y.; Xie, W. Y.; Luo, H. Q.; Li, N. B. Chem. Commun. 2011, 47, 7800-7802
63. Zhang, J. R.; Huang, W. T.; Xie, W. Y.; Wen, T.; Luo, H. Q.; Li, N. B. Analyst 2012, 137, 3300-3305
64. Xie, W. Y.; Huang, W. T.; Li, N. B.; Luo, H. Q. Chem. Commun. 2012, 48, 82-84
65. Shi, Y.; Huang, W. T.; Luo, H. Q.; Li, N. B. Chem. Commun. 2011, 47, 4676-4678
66. Wang, L.; Zhu, J.; Han, L.; Jin, L.; Zhu, C.; Wang, E.; Dong, S. ACS Nano 2012, 6, 6659-6666
67. Liu, X.; Aizen, R.; Freeman, R.; Yehezkeli, O.; Willner, I. ACS Nano 2012, 6, 3553-3563
68. Wang, J.; Katz, E. Anal. Bioanal. Chem. 2010, 398, 1591-1603
69. Windmiller, J. R.; Strack, G.; Chuang, M.-C.; Halámek, J.; Santhosh, P.; Bocharova, V.; Zhou, J.; Katz, E.; Wang, J. Sensors Actuators B: Chem. 2010, 150, 285-290
70. Manesh, K. M.; Halámek, J.; Pita, M.; Zhou, J.; Tam, T. K.; Santhosh, P.; Chuang, M.-C.; Windmiller, J. R.; Abidin, D.; Katz, E. Biosens. Bioelectron. 2009, 24, 3569-3574
71. Melnikov, D.; Strack, G.; Zhou, J.; Windmiller, J. R.; Halámek, J.; Bocharova, V.; Chuang, M.-C.; Santhosh, P.; Privman, V.; Wang, J. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 12166-12174
72. Privman, V. Molecular and Supramolecular Information Processing: From Molecular Switches to Logic Systems; John Wiley & Sons, Ltd: 2012; pp 281-303.
73. Privman, V. Isr. J. Chem. 2011, 51, 118-131
74. Katz, E.; Privman, V. Chem. Soc. Rev. 2010, 39, 1835
75. Halámek, J.; Zhou, J.; Halámková, L.; Bocharova, V.; Privman, V.; Wang, J.; Katz, E. Anal. Chem. 2011, 83, 8383-8386
76. Privman, V.; Zavalov, O.; Simonian, A. Anal. Chem. 2013, 85, 2027-2031
77. Katz, E.; Wang, J.; Privman, M.; Halámek, J. Anal. Chem. 2012, 84, 5463-5469
78. Zavalov, O.; Bocharova, V.; Halámek, J.; Halámková, L.; Korkmaz, S.; Arugula, M. A.; Chinnapareddy, S.; Katz, E.; Privman, V. Int. J. Unconv. Comput. 2013, 8, 347-365
79. Privman, V.; Zavalov, O.; Halámková, L.; Moseley, F.; Halámek, J.; Katz, E. J. Phys. Chem. B 2013, 117, 14928-14939
80. Privman, V.; Strack, G.; Solenov, D.; Pita, M.; Katz, E. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 11777-11784
81. Melnikov, D.; Strack, G.; Pita, M.; Privman, V.; Katz, E. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 10472-10479
82. Szaciłowski, K. Infochemistry: Information Processing at the Nanoscale; John Wiley & Sons, Ltd: 2012.
83. Ran, T.; Kaplan, S.; Shapiro, E. Nat. Nanotechnol. 2009, 4, 642-648
84. Macaya, R. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1993, 90, 3745-3749
85. de Silva, A. P.; Gale, P.; Steed, J. Molecular Logic-Based Computation; Royal Society of Chemistry: Cambridge, U.K., 2012.
86. Andrews, J. D.; Dunnett, S. J. IEEE Trans. Reliab. 2000, 49, 230-238
87. Mendel, J. M. Proc. IEEE 1995, 83, 345-377