Architecture based on the integration of intermolecular G-quadruplex structure with sticky-end pairing and colorimetric detection of DNA hybridization

Nanoscale

Volumn 6, Issue 4, 2014, Pages 2218-2227

  Li, Hongbo ^a   Wu, Zai Sheng ^a,b,c   Shen, Zhifa ^b   Shen, Guoli ^a   Yu, Ruqin ^c  

^a HUNAN UNIVERSITY   (China)

^b MCMASTER UNIVERSITY   (Canada)

^c FUZHOU UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AGGREGATION MECHANISM; ANALYTICAL PERFORMANCE; COLORIMETRIC DETECTION; COLORIMETRIC SENSING; G-QUADRUPLEX STRUCTURE; ORDERS OF MAGNITUDE; TRADITIONAL APPROACHES; VISUAL OBSERVATIONS;

COLOR; COLORIMETRY; DNA; OLIGONUCLEOTIDES;

DNA SEQUENCES;

DNA; NANOMATERIAL;

ARTICLE; CALORIMETRY; CHEMISTRY; DNA PROBE; HUMAN; METHODOLOGY; TUMOR SUPPRESSOR GENE;

CALORIMETRY; DNA; DNA PROBES; GENES, P53; HUMANS; NANOSTRUCTURES;

EID: 84893317632     PISSN: 20403364     EISSN: 20403372     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3nr03547f     Document Type: Article

References (49)

1. J. H. J. Hoeijmakers Nature 2001 411 366 374
2. B. Ren F. Robert J. J. Wyrick O. Aparicio E. G. Jennings I. Simon J. Zeitlinger J. Schreiber N. Hannett E. Kanin T. L. Volkert C. J. Wilson S. P. Bell R. A. Young Science 2000 290 2306 2309
3. A. Aboussekhra M. Biggerstaff M. K. K. Shivji J. A. Vilpo V. Moncollin V. N. Podust M. Protić U. Hübscher J. M. Egly R. D. Wood Cell 1995 80 859 868
4. A. C. Moses A. Schepartz J. Am. Chem. Soc. 1997 119 11591 11597
5. M. M. Garner A. Revzin Nucleic Acids Res. 1981 9 3047 3060
6. B. D. Hames and S. J. Higgins, Gene Probes 1, IRL, New York, 1995
7. L. J. Kricka, Nonisotopic DNA Probe Techniques, Academic, San Diego, 1992
8. J. Hu C. Y. Zhang Anal. Chem. 2010 82 8991 8997
9. J. M. Brockman A. G. Frutos R. M. Corn J. Am. Chem. Soc. 1999 121 8044 8051
10. R. M. Ostroff D. Hopkins A. B. Haeberli W. Baouchi B. Polisky Clin. Chem. 1999 45 1659 1664
11. J. J. Storhoff A. A. Lazarides R. C. Mucic C. A. Mirkin R. L. Letsinger G. C. Schatz J. Am. Chem. Soc. 2000 122 4640 4650
12. W. Xu X. J. Xue T. H. Li H. Q. Zeng X. G. Liu Angew. Chem., Int. Ed. 2009 48 6849 6852
13. R. Elghanian J. J. Storhoff R. C. Mucic R. L. Letsinger C. A. Mirkin Science 1997 277 1078 1081
14. Z. S. Wu H. X. Lu X. P. Liu R. Hu H. Zhou G. L. Shen R. Q. Yu Anal. Chem. 2010 82 3890 3898
15. X. J. Xue F. Wang X. G. Liu J. Am. Chem. Soc. 2008 130 3244 3245
16. D. Li A. Wieckowska I. Willner Angew. Chem. 2008 120 3991 3995
17. J. S. Lee M. S. Han C. A. Mirkin Angew. Chem. 2007 119 4171 4174
18. Y. Jiang H. Zhao N. N. Zhu Y. Q. Lin P. Yu L. Q. Mao Angew. Chem., Int. Ed. 2008 47 8601 8604
19. W. A. Zhao W. Chiuman J. C. F. Lam S. A. McManus W. Chen Y. G. Cui R. Pelton M. A. Brook Y. F. Li J. Am. Chem. Soc. 2008 130 3610 3618
20. C. Guarise L. Pasquato V. De Fillippis P. Scrimm Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006 103 3978 3982
21. J. T. Davis Angew. Chem., Int. Ed. 2004 43 668 698
22. H. X. Li L. Rothberg Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 14036 14039
23. J. W. Liu Y. Lu Nat. Protoc. 2006 1 246 252
24. H. D. Hill C. A. Mirkin Nat. Protoc. 2006 1 324 336
25. Z. S. Wu J. H. Jiang L. Fu G. L. Shen R. Q. Yu Anal. Biochem. 2006 353 22 29
26. Z. Li C. A. Mirkin J. Am. Chem. Soc. 2005 127 11568 11569
27. Z. S. Wu M. M. Guo G. L. Shen R. Q. Yu Anal. Bioanal. Chem. 2007 387 2623 2626
28. H. Zhou Z. S. Wu G. L. Shen R. Q. Yu Biosens. Bioelectron. 2013 41 262 267
29. H. Zhou S. J. Xie Z. S. Wu G. L. Shen Chem. Commun. 2012 48 10760 10762
30. Y. Kato T. Ohyama H. Mita Y. Yamamoto J. Am. Chem. Soc. 2005 127 9980 9981
31. S. Fredriksson M. Gullberg J. Jarvius C. Olsson K. Pietras S. M. Gústafsdóttir A. Östman U. Landegren Nat. Biotechnol. 2002 20 473 477
32. L. Ma M. Iezzi M. S. Kaucher Y. F. Lam J. T. Davis J. Am. Chem. Soc. 2006 128 15269 15277
33. F. He Y. L. Tang S. Wang Y. L. Li D. B. Zhu J. Am. Chem. Soc. 2005 127 12343 12346
34. Y. B. Zu A. L. Ting G. S. Yi Z. Q. Gao Anal. Chem. 2011 83 4090 4094
35. C. S. Thaxton D. G. Georganopoulou C. A. Mirkin Clin. Chim. Acta 2006 363 120 126
36. J. Nam S. I. Stoeva C. A. Mirkin J. Am. Chem. Soc. 2004 126 5932 5933
37. H. Symonds L. Krall L. Remington M. Saenz-Robles S. Lowe T. Jacks T. Van Dyke Cell 1994 78 703 711
38. V. J. N. Bykov N. Issaeva A. Shilov M. Hultcrantz E. Pugacheva P. Chumakov J. Bergman K. G. Wiman G. Selivanova Nat. Med. 2002 8 282 288
39. Y. Cho S. Gorina P. D. Jeffrey N. P. Pavletich Science 1994 265 346 355
40. M. Oren J. Biol. Chem. 1999 274 36031 36034
41. K. Martinez M. C. Estevez Y. R. Wu J. A. Phillips C. D. Medley W. H. Tan Anal. Chem. 2009 81 3448 3454
42. L. Wang C. Y. J. Yang C. D. Medley S. A. Benner W. H. Tan J. Am. Chem. Soc. 2005 127 15664 15665
43. H. Du C. M. Strohsahl J. Camera B. L. Miller T. D. Krauss J. Am. Chem. Soc. 2005 127 7932 7940
44. J. J. Storhoff R. Elghanian R. C. Mucic C. A. Mirkin R. L. Letsinger J. Am. Chem. Soc. 1998 120 1959 1964
45. M. Famulok J. S. Hartig G. Mayer Chem. Rev. 2007 107 3715 3743
46. J. L. He Z. S. Wu H. Zhou H. Q. Wang J. H. Jiang G. L. Shen R. Q. Yu Anal. Chem. 2010 82 1358 1364
47. J. Zheng P. E. Constantinou C. Micheel P. A. Alivisatos R. A. Kiehl N. C. Seeman Nano Lett. 2006 6 1502 1504
48. K. Lund Y. Liu S. Lindsay H. Yan J. Am. Chem. Soc. 2005 127 17606 17607
49. F. A. Aldaye A. L. Palmer H. F. Sleiman Science 2008 321 1795 1799