Mouse Tet1 protein can oxidize 5mC to 5hmC and 5caC on Single-stranded DNA

Acta Chimica Sinica

Volumn 70, Issue 20, 2012, Pages 2123-2126

  Zhang, Liang ^a   Yu, Miao ^a   He, Chuan ^a  

^a UNIVERSITY OF CHICAGO   (United States)

Author keywords

5 hydroxymethylcytosine(5 hmC); 5 carboxylcytosine (5 caC); 5 formylcytosine(5 fC); 5 methylcytosine(5 mC); Double stranded DNA(dsDNA); Oxidation; Single stranded DNA(ssDNA); Tet

Indexed keywords

EID: 84880822789     PISSN: 05677351     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.6023/A12090619     Document Type: Article

References (24)

1. Law, J. A.; Jacobsen, S. E. Nat. Rev. Genet. 2010, 11, 204.
2. Wu, S. C.; Zhang, Y. Nat. Rev. Mol. Biol. 2010, 11, 607.
3. Bhutani, N.; Burns, D. M.; Blau, H. M. Cell 2011, 146, 866.
4. Deaton, A. M.; Bird, A. Genes Dev. 2011, 25, 1010.
5. Kriaucionis, S.; Heintz, N. Science 2009, 324, 929.
6. Tahiliani, M.; Koh, K. P.; Shen, Y.; Pastor, W. A.; Bandukwala, H.; Brudno, Y.; Agarwal, S.; Iyer, L. M.; Liu, D. R.; Aravind, L.; Rao, A. Science 2009, 324, 930.
7. Song, C. X.; Szulwach, K. E.; Fu, Y.; Dai, Q.; Yi, C.; Li, X.; Li, Y.; Chen, C. H.; Zhang, W.; Jian, X.; Wang, J.; Zhang, L.; Looney, T. J.; Zhang, B.; Godley, L. A.; Hicks, L. M.; Lahn, B. T.; Jin, P.; He, C. Nat. Biotechnol. 2011, 29, 68.
8. Ito, S.; D'Alessio, A. C.; Taranova, O. V.; Hong, K.; Sowers, L. C.; Zhang, Y. Nature 2010, 466, 1129.
9. Delhommeau, F.; Dupont, S.; Della Valle, V.; James, C.; Trannoy, S.; Masse, A.; Kosmider, O.; Le Couedic, J. P.; Robert, F.; Alberdi, A.; Lecluse, Y.; Plo, I.; Dreyfus, F. J.; Marzac, C.; Casadevall, N.; Lacombe, C.; Romana, S. P.; Dessen, P.; Soulier, J.; Viguie, F.; Fontenay, M.; Vainchenker, W.; Bernard, O. A. New Engl. J. Med. 2009, 360, 2289.
10. Ko, M.; Huang, Y.; Jankowska, A. M.; Pape, U. J.; Tahiliani, M.; Bandukwala, H. S.; An, J.; Lamperti, E. D.; Koh, K. P.; Ganetzky, R.; Liu, X. S.; Aravind, L.; Agarwal, S.; Maciejewski, J. P.; Rao, A. Nature 2010, 468, 839.
11. Mullighan, C. G. Nat. Genet. 2009, 41, 766.
12. Bacher, U.; Haferlach, C.; Schnittger, S.; Kohlmann, A.; Kern, W.; Haferlach, T. Ann. Hematol. 2010, 89, 643.
13. Kosmider, O.; Gelsi-Boyer, V.; Cheok, M.; Grabar, S.; Della-Valle, V.; Picard, F.; Viguie, F.; Quesnel, B.; Beyne-Rauzy, O.; Solary, E.; Vey, N.; Hunault-Berger, M.; Fenaux, P.; Mansat-De Mas, V.; Delabesse, E.; Guardiola, P.; Lacombe, C.; Vainchenker, W.; Preudhomme, C.; Dreyfus, F.; Bernard, O. A.; Birnbaum, D.; Fontenay, M. Blood 2009, 114, 3285.
14. Wossidlo, M.; Nakamura, T.; Lepikhov, K.; Marques, C. J.; Zakhartchenko, V.; Boiani, M.; Arand, J.; Nakano, T.; Reik, W.; Walter, J. Nat. Commun. 2011, 2, 241.
15. Iqbal, K.; Jin, S. G.; Pfeifer, G. P.; Szabo, P. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011, 108, 3642.
16. Loenarz, C.; Schofield, C. J. Chem. Biol. 2009, 16, 580.
17. Ito, S.; Shen, L.; Dai, Q.; Wu, S. C.; Collins, L. B.; Swenberg, J. A.; He, C.; Zhang, Y. Science 2011, 333, 1300.
18. He, Y. F.; Li, B. Z.; Li, Z.; Liu, P.; Wang, Y.; Tang, Q.; Ding, J.; Jia, Y.; Chen, Z.; Li, L.; Sun, Y.; Li, X.; Dai, Q.; Song, C.X.; Zhang, K.; He, C.; Xu, G. L. Science 2011, 333, 1303.
19. Zhang, L.; Lu, X.; Lu, J.; Liang, H.; Dai, Q.; Xu, G. L.; Luo, C.; Jiang, H.; He, C. Nat. Chem. Biol. 2012, 8, 328.
20. Maiti, A.; Drohat, A. C. J. Biol. Chem. 2011, 286, 35334.
21. Yi, C.; Yang, C. G.; He, C. Acc. Chem. Res. 2009, 42, 519.
22. Hausinger, R. P. Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2004, 39, 21.
23. Sedgwick, B.; Bates, P. A.; Paik, J.; Jacobs, S. C.; Lindahl, T. DNA Repair 2007, 6, 429.
24. Yu, M.; Hon, G. C.; Szulwach, K. E.; Song, C. X.; Zhang, L.; Kim, A.; Li, X.; Dai, Q.; Shen, Y.; Park, B.; Min, J. H.; Jin, P.; Ren, B.; He, C. Cell 2012, 149, 1368.