Identification of microRNA and bioinformatics target gene analysis in beef cattle intramuscular fat and subcutaneous fat

Molecular BioSystems

Volumn 9, Issue 8, 2013, Pages 2154-2162

  Wang, Haiyang ^a   Zheng, Yue ^a   Wang, Genlin ^a   Li, Huixia ^a  

^a NANJING AGRICULTURAL UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MICRORNA;

ANIMAL; ANTIBODY SPECIFICITY; BIOLOGY; BOVINAE; BROWN ADIPOSE TISSUE; CHEMISTRY; DNA MICROARRAY; GENE EXPRESSION PROFILING; GENE EXPRESSION REGULATION; GENETICS; LIPID METABOLISM; METABOLISM; MOLECULAR GENETICS; SKELETAL MUSCLE; SUBCUTANEOUS FAT; ARTICLE; CATTLE;

ADIPOSE TISSUE, BROWN; ANIMALS; CATTLE; COMPUTATIONAL BIOLOGY; GENE EXPRESSION PROFILING; GENE EXPRESSION REGULATION; LIPID METABOLISM; MICRORNAS; MOLECULAR SEQUENCE ANNOTATION; MUSCLE, SKELETAL; OLIGONUCLEOTIDE ARRAY SEQUENCE ANALYSIS; ORGAN SPECIFICITY; SUBCUTANEOUS FAT;

EID: 84879975414     PISSN: 1742206X     EISSN: 17422051     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c3mb70084d     Document Type: Article

References (46)

1. D. L. Roeber D. R. McKenna P. K. Bates T. B. Schmid K. E. Belk T. G. Field I. A. Scanga J. W. Savell J. B. Morgan T. H. Montgomery G. C. Smith Prof. An. Sci. 2002 18 112 119
2. T. Nishimura A. Hattori K. Takahashi J. Anim. Sci. 1999 77 93 104
3. J. C. Carrington V. Ambros Science 2003 301 336 338
4. D. P. Bartel Cell 2004 116 281 297
5. S. Vasudevan Y. C. Tong J. A. Steitz Science 2007 318 1931 1934
6. P. Xu S. Y. Vernooy M. Guo B. A. Hay Curr. Biol. 2003 13 790 795
7. C. Esau X. Kang E. Peralta E. Hanson E. G. Marcusson L. V. Ravichandran Y. Sun S. Koo R. J. Perera R. Jain N. M. Dean S. M. Freier C. F. Bennett B. Lollo R. Griffey J. Biol. Chem. 2004 279 52361 52365
8. K. Kajimoto H. Naraba N. Iwai RNA 2006 12 1626 1632
9. Q. Wang Y. C. Li J. Wang J. Kong Y. Qi R. J. Quigg X. Li Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008 105 2889 2894
10. H. Xie B. Lim H. F. Lodish Diabetes 2009 58 1050 1057
11. M. Karbiener C. Fischer S. Nowitsch P. Opriessnig C. Papak G. Ailhaud C. Dani E. Z. Amri M. Scheideler Biochem. Biophys. Res. Commun. 2009 390 247 251
12. T. Sun M. Fu A. L. Bookout S. A. Kliewer D. J. Mangelsdorf Mol. Endocrinol. 2009 23 925 931
13. S. Y. Kim A. Y. Kim H. W. Lee Y. H. Son G. Y. Lee J. W. Lee Y. S. Lee J. B. Kim Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010 392 323 328
14. N. Klöting S. Berthold P. Kovacs M. R. Schön M. Fasshauer K. Ruschke M. Stumvoll M. Blüher PLoS One 2009 4 e4699
15. F. J. Ortega J. M. Moreno-Navarrete G. Pardo M. Sabater M. Hummel A. Ferrer J. I. Rodriguez-Hermosa B. Ruiz W. Ricart B. Peral J. M. Fernández-Real PLoS One 2010 5 e9022
16. Z. Gu S. Eleswarapu H. Jiang FEBS Lett. 2007 581 981 988
17. W. Jin M. V. Dodson S. S. Moore J. A. Basarab L. L. Guan BMC Mol. Biol. 2010 11 29
18. D. Gardan I. Louveau F. Gondret Comp. Biochem. Physiol., Part B: Biochem. Mol. Biol. 2007 148 14 19
19. K. Insausti M. J. Beriain M. J. Alzueta T. R. Carr A. Purroy Meat Sci. 2004 66 639 646
20. L. Aass C. G. Fristedt J. D. Gresham Livest. Sci. 2009 125 177 186
21. R. Takanabe K. Ono Y. Abe T. Takaya T. Horie H. Wada T. Kita N. Satoh A. Shimatsu K. Hasegawa Biochem. Biophys. Res. Commun. 2008 376 728 732
22. N. Nakanishi Y. Nakagawa N. Tokushige N. Aoki T. Matsuzaka K. Ishii N. Yahagi K. Kobayashi S. Yatoh A. Takahashi H. Suzuki O. Urayama N. Yamada H. Shimano Biochem. Biophys. Res. Commun. 2009 385 492 496
23. S. Y. Kim A. Y. Kim H. W. Lee Y. H. Son G. Y. Lee J. W. Lee Y. S. Lee J. B. Kim Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010 392 323 328
24. E. A. Glazov K. Kongsuwan W. Assavalapsakul P. F. Horwood N. Mitter T. J. Mahony PLoS One 2009 4 e6349
25. Y. F. Tang Y. Zhang X. Y. Li C. Li W. Tian L. Liu OMICS 2009 13 331 336
26. A. Chawla E. J. Schwarz D. D. Dimaculangan M. A. Lazar Endocrinology 1994 135 798 800
27. W. Jin E. N. Olson S. S. Moore J. A. Basarab U. Basu L. L. Guan J. Anim. Sci. 2012 90 171 183
28. F. Wahid A. Shehzad T. Khan Y. Y. Kim Biochim. Biophys. Acta 2010 1803 1231 1243
29. T. Saito P. N. Saetrom Biotechnology 2010 27 243 249
30. M. Wang J. J. Wang J. Li K. Park X. Qian J. X. Ma S. X. Zhang Am. J. Physiol.: Endocrinol. Metab. 2009 297 E1378 E1387
31. R. R. Bowers M. D. Lane Cell Cycle 2008 7 1191 1196
32. T. C. Prestwich O. A. Macdougald Curr. Opin. Cell Biol. 2007 19 612 617
33. J. A. Kennell O. A. MacDougald J. Biol. Chem. 2005 280 24004 24010
34. H. X. Li X. Luo R. X. Liu Y. J. Yang G. S. Yang Mol. Cell. Endocrinol. 2008 291 116 124
35. X. Luo H. Li G. Yang Shengwu Gongcheng Xuebao 2008 24 746 753
36. Y. J. Kim S. J. Hwang Y. C. Bae J. S. Jung Stem Cells 2009 27 3093 3102
37. X. Gao E. Gulari X. Zhou Biopolymers 2004 73 579 596
38. B. M. Bolstad R. A. Irizarry M. Astrandand T. P. Speed Bioinformatics 2003 19 185 193
39. K. J. Livak T. D. Schmittgen Methods 2001 25 402 408
40. B. P. Lewis I. H. Shih M. W. Jones-Rhoades D. P. Bartel C. B. Burge Cell 2003 115 787 798
41. K. Chen N. Rajewsky Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 2006 71 149 156
42. N. Rajewsky Nat. Genet. 2006 38 Suppl S8 S13
43. G. Dennis, Jr B. T. Sherman D. A. Hosack J. Yang W. Gao H. C. Lane R. A. Lempicki GenomeBiology 2003 4 P3
44. M. A. Harris J. Clark A. Ireland J. Lomax M. Ashburner R. Foulger K. Eilbeck S. Lewis B. Marshall C. Mungall J. Richter G. M. Rubin J. A. Blake C. Bult M. Dolan H. Drabkin J. T. Eppig D. P. Hill L. Ni M. Ringwald R. Balakrishnan J. M. Cherry K. R. Christie M. C. Costanzo S. S. Dwight S. Engel D. G. Fisk J. E. Hirschman E. L. Hong R. S. Nash A. Sethuraman C. L. Theesfeld D. Botstein K. Dolinski B. Feierbach T. Berardini S. Mundodi S. Y. Rhee R. Apweiler D. Barrell E. Camon E. Dimmer V. Lee R. Chisholm P. Gaudet W. Kibbe R. Kishore E. M. Schwarz P. Sternberg M. Gwinn L. Hannick J. Wortman M. Berriman V. Wood N. de la Cruz P. Tonellato P. Jaiswal T. Seigfried R. White Nucleic Acids Res. 2004 32 D258 D261
45. J. Huang Z. Ju Q. Li Q. Hou C. Wang J. Li R. Li L. Wang T. Sun S. Hang Y. Gao M. Hou J. Zhong Int. J. Biol. Sci. 2011 7 7 1016 1026
46. O. Barad E. Meiri A. Avniel R. Aharonov A. Barzilai I. Bentwich U. Einav S. Gilad P. Hurban Y. Karov E. K. Lobenhofer E. Sharon Y. M. Shiboleth M. Shtutman Z. Bentwich P. Einat Genome Res. 2004 14 12 2486 2494