SCOPUS 정보 검색 플랫폼

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 9, Issue 5, 2013, Pages 2498-2503

A polarizable force-field for cholesterol and sphingomyelin

(1) Robinson, David a

a UNIVERSITY OF NOTTINGHAM (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 84877728841 PISSN: 15499618 EISSN: 15499626 Source Type: Journal
DOI: 10.1021/ct400103e Document Type: Article

Times cited : (22)

References (46)

1
- 0028020035
- Woolf, T. B.; Roux, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994, 91, 11631-11635
- (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. , vol.91 , pp. 11631-11635
- Woolf, T.B.¹ Roux, B.²

2
- 34547902820
- Arkin, I. T.; Xu, H.; Jensen, M. Ø.; Arbely, E.; Bennett, E. R.; Bowers, K. J.; Chow, E.; Dror, R. O.; Eastwood, M. P.; Flitman-Tene, R.; Gregersen, B. A.; Klepeis, J. L.; Kolossváry, I.; Shan, Y.; Shaw, D. E. Science 2007, 317, 799-803
- (2007) Science , vol.317 , pp. 799-803
- Arkin, I.T.¹ Xu, H.² Jensen M.Ø³ Arbely, E.⁴ Bennett, E.R.⁵ Bowers, K.J.⁶ Chow, E.⁷ Dror, R.O.⁸ Eastwood, M.P.⁹ Flitman-Tene, R.¹⁰ Gregersen, B.A.¹¹ Klepeis, J.L.¹² Kolossváry, I.¹³ Shan, Y.¹⁴ Shaw, D.E.¹⁵

3
- 21744436321
- Hunte, C.; Screpanti, E.; Venturi, M.; Rimon, A.; Padan, E.; Michel, H. Nature 2005, 435, 1197-1202
- (2005) Nature , vol.435 , pp. 1197-1202
- Hunte, C.¹ Screpanti, E.² Venturi, M.³ Rimon, A.⁴ Padan, E.⁵ Michel, H.⁶

4
- 77958066477
- Gurtovenko, A. A.; Anwar, J.; Vattulainen, I. Chem. Rev. 2010, 110, 6077-6103
- (2010) Chem. Rev. , vol.110 , pp. 6077-6103
- Gurtovenko, A.A.¹ Anwar, J.² Vattulainen, I.³

5
- 79959764284
- Robinson, D.; Besley, N. A.; O'Shea, P.; Hirst, J. D. J. Comput. Chem. 2011, 32, 2613-2618
- (2011) J. Comput. Chem. , vol.32 , pp. 2613-2618
- Robinson, D.¹ Besley, N.A.² O'Shea, P.³ Hirst, J.D.⁴

6
- 79953904000
- Mihailescu, M.; Vaswani, R. G.; Jardón-Valadez, E.; Castro-Román, F.; Freites, J. A.; ZWorcester, D. L.; Chamberlin, A. R.; Tobias, D. J.; White, S. H. Biophys. J. 2011, 100, 1455-1462
- (2011) Biophys. J. , vol.100 , pp. 1455-1462
- Mihailescu, M.¹ Vaswani, R.G.² Jardón-Valadez, E.³ Castro-Román, F.⁴ Freites, J.A.⁵ Zworcester, D.L.⁶ Chamberlin, A.R.⁷ Tobias, D.J.⁸ White, S.H.⁹

7
- 79958107508
- O'Connor, J. W.; Klauda, J. B. J. Phys. Chem. B 2011, 115, 6455-6464
- (2011) J. Phys. Chem. B , vol.115 , pp. 6455-6464
- O'Connor, J.W.¹ Klauda, J.B.²

8
- 72149124493
- Zidar, J.; Merzel, F.; Hodoscek, M.; Rebolj, K.; Sepcic, K.; Macek, P.; Janezic, D. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 15795-15802
- (2009) J. Phys. Chem. B , vol.113 , pp. 15795-15802
- Zidar, J.¹ Merzel, F.² Hodoscek, M.³ Rebolj, K.⁴ Sepcic, K.⁵ MacEk, P.⁶ Janezic, D.⁷

9
- 0030949124
- Simons, K.; Ikonen, E. Nature 1997, 387, 569-572
- (1997) Nature , vol.387 , pp. 569-572
- Simons, K.¹ Ikonen, E.²

10
- 0034304851
- Simons, K.; Toomre, D. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2000, 1, 31-39
- (2000) Nat. Rev. Mol. Cell Biol. , vol.1 , pp. 31-39
- Simons, K.¹ Toomre, D.²

11
- 77953377650
- Klauda, J. B.; Venable, R. M.; Freites, J. A.; O'Connor, J. W.; Tobias, D. J.; Mondragon-Ramirez, C.; Vorobyov, I.; MacKerell, A. D., Jr.; Pastor, R. W. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 7830-7843
- (2010) J. Phys. Chem. B , vol.114 , pp. 7830-7843
- Klauda, J.B.¹ Venable, R.M.² Freites, J.A.³ O'Connor, J.W.⁴ Tobias, D.J.⁵ Mondragon-Ramirez, C.⁶ Vorobyov, I.⁷ Mackerell Jr., A.D.⁸ Pastor, R.W.⁹

12
- 77950865843
- Harder, E.; MacKerell, A. D., Jr.; Roux, B. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 2760-2761
- (2009) J. Am. Chem. Soc. , vol.131 , pp. 2760-2761
- Harder, E.¹ Mackerell Jr., A.D.² Roux, B.³

13
- 77952680504
- Vorobyov, I.; Allen, T. W. J. Chem. Phys. 2010, 132, 185101
- (2010) J. Chem. Phys. , vol.132 , pp. 185101
- Vorobyov, I.¹ Allen, T.W.²

14
- 79956190238
- Bauer, B. A.; Lucas, T. R.; Meninger, D. J.; Patel, S. Chem. Phys. Lett. 2011, 508, 289-294
- (2011) Chem. Phys. Lett. , vol.508 , pp. 289-294
- Bauer, B.A.¹ Lucas, T.R.² Meninger, D.J.³ Patel, S.⁴

15
- 0041694125
- Hyvönen, M.T.; Kovanen, P. T. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9102-9108
- (2003) J. Phys. Chem. B , vol.107 , pp. 9102-9108
- Hyvönen . M, T.¹ Kovanen, P.T.²

16
- 10644227774
- Pitman, M. C.; Suits, F.; MacKerell, A. D., Jr.; Feller, S. E. Biochemistry 2004, 43, 15318-15328
- (2004) Biochemistry , vol.43 , pp. 15318-15328
- Pitman, M.C.¹ Suits, F.² Mackerell Jr., A.D.³ Feller, S.E.⁴

17
- 84855838136
- Lim, J. B.; Rogaski, B.; Klauda, J. B. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 203-210
- (2012) J. Phys. Chem. B , vol.116 , pp. 203-210
- Lim, J.B.¹ Rogaski, B.² Klauda, J.B.³

18
- 67650500988
- Brooks, B. R.; Brooks, C. L., III; MacKerell, A. D., Jr.; Nilsson, L.; Petrella, R. J.; Roux, B.; Won, Y.; Archontis, G.; Bartels, C.; Boresch, S.; Caflisch, A.; Caves, L.; Cui, Q.; Dinner, A. R.; Feig, M.; Fischer, S.; Gao, J.; Hodoscek, M.; Im, W.; Kuczera, K.; Lazaridis, T.; Ma, J.; Ovchinnikov, V.; Paci, E.; Pastor, R. W.; Post, C. B.; Pu, J. Z.; Schaefer, M.; Tidor, B.; Venable, R. M.; Woodcock, H. L.; Wu, X.; Yang, W.; York, D. M.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 1545-1615
- (2009) J. Comput. Chem. , vol.30 , pp. 1545-1615
- Brooks, B.R.¹ Brooks III, C.L.² Mackerell Jr., A.D.³ Nilsson, L.⁴ Petrella, R.J.⁵ Roux, B.⁶ Won, Y.⁷ Archontis, G.⁸ Bartels, C.⁹ Boresch, S.¹⁰ Caflisch, A.¹¹ Caves, L.¹² Cui, Q.¹³ Dinner, A.R.¹⁴ Feig, M.¹⁵ Fischer, S.¹⁶ Gao, J.¹⁷ Hodoscek, M.¹⁸ Im, W.¹⁹ Kuczera, K.²⁰ more..

19
- 0041878923
- Lamoureux, G.; Roux, B. J. Chem. Phys. 2003, 119, 3025-3039
- (2003) J. Chem. Phys. , vol.119 , pp. 3025-3039
- Lamoureux, G.¹ Roux, B.²

20
- 33846185169
- Harder, E.; Anisimov, V. M.; Vorobyov, I. V.; Lopes, P. E. M.; Noskov, S. Y.; MacKerell, A. D., Jr.; Roux, B. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 1587-1597
- (2006) J. Chem. Theory Comput. , vol.2 , pp. 1587-1597
- Harder, E.¹ Anisimov, V.M.² Vorobyov, I.V.³ Lopes, P.E.M.⁴ Noskov, S.Y.⁵ Mackerell Jr., A.D.⁶ Roux, B.⁷

21
- 27344436659
- Phillips, J. C.; Braun, R.; Wang, W.; Gumbart, J.; Tajkhorshid, E.; Villa, E.; Chipot, C.; Skeel, R. D.; Kale, L.; Schulten, K. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781-1802
- (2005) J. Comput. Chem. , vol.26 , pp. 1781-1802
- Phillips, J.C.¹ Braun, R.² Wang, W.³ Gumbart, J.⁴ Tajkhorshid, E.⁵ Villa, E.⁶ Chipot, C.⁷ Skeel, R.D.⁸ Kale, L.⁹ Schulten, K.¹⁰

22
- 78751688849
- Jiang, W.; Hardy, D. J.; Phillips, J. C.; MacKerell, A. D., Jr.; Schulten, K.; Roux, B. J. Phys. Chem. Lett. 2011, 2, 87-92
- (2011) J. Phys. Chem. Lett. , vol.2 , pp. 87-92
- Jiang, W.¹ Hardy, D.J.² Phillips, J.C.³ Mackerell Jr., A.D.⁴ Schulten, K.⁵ Roux, B.⁶

23
- 18744402303
- Anisimov, V. M.; Lamoureux, G.; Vorobyov, I. V.; Huang, N.; Roux, B.; MacKerell, A. D., Jr. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 153-168
- (2005) J. Chem. Theory Comput. , vol.1 , pp. 153-168
- Anisimov, V.M.¹ Lamoureux, G.² Vorobyov, I.V.³ Huang, N.⁴ Roux, B.⁵ Mackerell Jr., A.D.⁶

24
- 33746563448
- Shao, Y.; Molnar, L. F.; Jung, Y.; Kussmann, J.; Ochsenfeld, C.; Brown, S. T.; Gilbert, A. T. B.; Slipchenko, L. V.; Levchenko, S. V.; O'Neill, D. P.; DiStasio, R. A., Jr.; Lochan, R. C.; Wang, T.; Beran, G. J. O.; Besley, N. A.; Herbert, J. M.; Lin, C. Y.; Van Voorhis, T.; Chien, S. H.; Sodt, A.; Steele, R. P.; Rassolov, V. A.; Maslen, P. E.; Korambath, P. P.; Adamson, R. D.; Austin, B.; Baker, J.; Byrd, E. F. C.; Dachsel, H.; Doerksen, R. J.; Dreuw, A.; Dunietz, B. D.; Dutoi, A. D.; Furlani, T. R.; Gwaltney, S. R.; Heyden, A.; Hirata, S.; Hsu, C.-P.; Kedziora, G.; Khalliulin, R. Z.; Klunzinger, P.; Lee, A. M.; Lee, M. S.; Liang, W.; Lotan, I.; Nair, N.; Peters, B.; Proynov, E. I.; Pieniazek, P. A.; Rhee, Y. M.; Ritchie, J.; Rosta, E.; Sherrill, C. D.; Simmonett, A. C.; Subotnik, J. E.; Woodcock, H. L., III.; Zhang, W.; Bell, A. T.; Chakraborty, A. K.; Chipman, D. M.; Keil, Frerich, J.; Warshel, A.; Hehre, W. J.; Schaefer, H. F., III.; Kong, J.; Krylov, A. I.; Gill, P. M. W.; Head-Gordon, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 3172-3191
- (2006) Phys. Chem. Chem. Phys. , vol.8 , pp. 3172-3191
- Shao, Y.¹ Molnar, L.F.² Jung, Y.³ Kussmann, J.⁴ Ochsenfeld, C.⁵ Brown, S.T.⁶ Gilbert, A.T.B.⁷ Slipchenko, L.V.⁸ Levchenko, S.V.⁹ Oneill, D.P.¹⁰ Distasio Jr., R.A.¹¹ Lochan, R.C.¹² Wang, T.¹³ Beran, G.J.O.¹⁴ Besley, N.A.¹⁵ Herbert, J.M.¹⁶ Lin, C.Y.¹⁷ Van Voorhis, T.¹⁸ Chien, S.H.¹⁹ Sodt, A.²⁰ more..

25
- 0000189651
- Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648-5652
- (1993) J. Chem. Phys. , vol.98 , pp. 5648-5652
- Becke, A.D.¹

26
- 33746614482
- Dunning, T. H. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007-1023
- (1989) J. Chem. Phys. , vol.90 , pp. 1007-1023
- Dunning, T.H.¹

27
- 27144489989
- Vorobyov, I. V.; Anisimov, V. M.; MacKerell, A. D., Jr. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 18988-18999
- (2005) J. Phys. Chem. B , vol.109 , pp. 18988-18999
- Vorobyov, I.V.¹ Anisimov, V.M.² Mackerell Jr., A.D.³

28
- 0141704114
- Lamoureux, G.; MacKerell, A. D., Jr.; Roux, B. J. Chem. Phys. 2003, 119, 5185-5197
- (2003) J. Chem. Phys. , vol.119 , pp. 5185-5197
- Lamoureux, G.¹ Mackerell Jr., A.D.² Roux, B.³

29
- 30344482264
- Lamoureux, G.; Harder, E.; Vorobyov, I. V.; Roux, B.; MacKerell, A. D., Jr. Chem. Phys. Lett. 2006, 418, 245-249
- (2006) Chem. Phys. Lett. , vol.418 , pp. 245-249
- Lamoureux, G.¹ Harder, E.² Vorobyov, I.V.³ Roux, B.⁴ Mackerell Jr., A.D.⁵

30
- 0041694125
- Hyvönen, M. T.; Kovanen, P. T. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9102-9108
- (2003) J. Phys. Chem. B , vol.107 , pp. 9102-9108
- Hyvönen, M.T.¹ Kovanen, P.T.²

31
- 0004016501
- Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935
- (1983) J. Chem. Phys. , vol.79 , pp. 926-935
- Jorgensen, W.L.¹ Chandrasekhar, J.² Madura, D.³ Impey, R.W.⁴ Klein, M.L.⁵

32
- 33645961739
- Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593
- (1995) J. Chem. Phys. , vol.103 , pp. 8577-8593
- Essmann, U.¹ Perera, L.² Berkowitz, M.L.³ Darden, T.⁴ Lee, H.⁵ Pedersen, L.G.⁶

33
- 33646940952
- Ryckaert, J.-P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341
- (1977) J. Comput. Phys. , vol.23 , pp. 327-341
- Ryckaert, J.-P.¹ Ciccotti, G.² Berendsen, H.J.C.³

34
- 0000026966
- Martyna, G. J.; Tuckerman, M. E.; Tobias, D. J.; Klein, M. L. Mol. Phys. 1996, 87, 1117-1157
- (1996) Mol. Phys. , vol.87 , pp. 1117-1157
- Martyna, G.J.¹ Tuckerman, M.E.² Tobias, D.J.³ Klein, M.L.⁴

35
- 48749148224
- Andersen, H. C. J. Comput. Phys. 1983, 52, 24-34
- (1983) J. Comput. Phys. , vol.52 , pp. 24-34
- Andersen, H.C.¹

36
- 0041878923
- Lamoureux, G.; Roux, B. J. Chem. Phys. 2003, 119, 3025-3039
- (2003) J. Chem. Phys. , vol.119 , pp. 3025-3039
- Lamoureux, G.¹ Roux, B.²

37
- 0032867082
- Ramstedt, B.; Slotte, J. P. Biophys. J. 1999, 77, 1498-1506
- (1999) Biophys. J. , vol.77 , pp. 1498-1506
- Ramstedt, B.¹ Slotte, J.P.²

38
- 2942558806
- Khelashvili, G. A.; Scott, H. L. J. Chem. Phys. 2004, 120, 9841-9847
- (2004) J. Chem. Phys. , vol.120 , pp. 9841-9847
- Khelashvili, G.A.¹ Scott, H.L.²

39
- 0026063957
- Maulik, P. R.; Sripada, P. K.; Shipley, G. G. Biochim. Biophys. Acta 1991, 62, 211-219
- (1991) Biochim. Biophys. Acta , vol.62 , pp. 211-219
- Maulik, P.R.¹ Sripada, P.K.² Shipley, G.G.³

40
- 0000951252
- Feller, S. E.; Pastor, R. W.; Rojnuckarin, A.; Bogusz, S.; Brooks, B. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 17011-17020
- (1996) J. Phys. Chem. , vol.100 , pp. 17011-17020
- Feller, S.E.¹ Pastor, R.W.² Rojnuckarin, A.³ Bogusz, S.⁴ Brooks, B.R.⁵

41
- 33744906274
- Starke-Peterkovic, T.; Turner, N.; Vitha, M. F.; Waller, M. P.; Hibbs, D. E.; Clarke, R. J. Biophys. J. 2006, 90, 4060-4070
- (2006) Biophys. J. , vol.90 , pp. 4060-4070
- Starke-Peterkovic, T.¹ Turner, N.² Vitha, M.F.³ Waller, M.P.⁴ Hibbs, D.E.⁵ Clarke, R.J.⁶

42
- 33749999503
- Klauda, J. B.; Brooks, B. R.; Pastor, R. W. J. Chem. Phys. 2006, 125, 144710
- (2006) J. Chem. Phys. , vol.125 , pp. 144710
- Klauda, J.B.¹ Brooks, B.R.² Pastor, R.W.³

43
- 0037962802
- Filippov, A.; Oradd, G.; Lindblom, G. Biophys. J. 2003, 84, 3079-3086
- (2003) Biophys. J. , vol.84 , pp. 3079-3086
- Filippov, A.¹ Oradd, G.² Lindblom, G.³

44
- 33646188485
- Mehnert, T.; Jacob, K.; Bittman, R.; Beyer, K. Biophys. J. 2006, 90, 939-946
- (2006) Biophys. J. , vol.90 , pp. 939-946
- Mehnert, T.¹ Jacob, K.² Bittman, R.³ Beyer, K.⁴

45
- 55549098186
- Bartels, T.; Lankalapalli, R. S.; Bittman, R.; Beyer, K.; Brown, M. F. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 14521-14532
- (2008) J. Am. Chem. Soc. , vol.130 , pp. 14521-14532
- Bartels, T.¹ Lankalapalli, R.S.² Bittman, R.³ Beyer, K.⁴ Brown, M.F.⁵

46
- 7444230581
- Barenholz, Y. Subcell Biochem. 2004, 37, 167-215
- (2004) Subcell Biochem. , vol.37 , pp. 167-215
- Barenholz, Y.¹

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.