Lipid membranes with a majority of cholesterol: Applications to the ocular lens and aquaporin 0

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 115, Issue 20, 2011, Pages 6455-6464

  O'Connor, Joseph W ^a   Klauda, Jeffery B ^a  

^a UNIVERSITY OF MARYLAND   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DEUTERIUM; DISTRIBUTION FUNCTIONS; GLYCEROL; HYDROGEN; HYDROGEN BONDS; LIPID BILAYERS; LIPIDS; MOLECULAR DYNAMICS; OLIGOMERS; USER INTERFACES;

AQUAPORINS; AROMATIC RESIDUES; BI-LAYER; DIMYRISTOYLPHOSPHATIDYLCHOLINE; HYDROXYL GROUPS; LIPID MEMBRANES; MD SIMULATION; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; NANOSCALE DOMAIN; OCULAR LENS; ORDER PARAMETER; RADIAL DISTRIBUTION FUNCTIONS; STRUCTURE AND DYNAMICS; SURFACE AREA; TETRAMERS;

CHOLESTEROL;

EID: 79958107508     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp108650u     Document Type: Article

References (75)

1. Yappert, M. C.; Borchman, D. Chem. Phys. Lipids 2004, 129, 1.
2. Jacob, R. F.; Cenedella, R. J.; Mason, R. P. J. Biol. Chem. 1999, 274.
3. Zelenka, P. S. Curr. Eye Res. 1984, 3, 1337.
4. van Meer, G.; Voelker, D. R.; Feigenson, G. W. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008, 9, 112.
5. Engelman, D. M.; Rothman, J. E. J. Biol. Chem. 1972, 247, 3694.
6. McMullen, T. P. W.; Lewis, R. N. A. H.; McElhaney, R. N. Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 2004, 8, 459.
7. Vist, M. R.; Davis, J. H. Biochemistry 1990, 29, 451.
8. Feigenson, G. W. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2007, 36, 63.
9. Sankaram, M. B.; Thompson, T. E. Biochemistry 1990, 29, 10676.
10. Mathai, J. C.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, J. F.; Zeidel, M. L. J. Gen. Physiol. 2008, 131, 69.
11. Hung, W. C.; Lee, M. T.; Chen, F. Y.; Huang, H. W. Biophys. J. 2007, 92, 3960.
12. Pan, J.; Mills, T. T.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, J. F. Phys. Rev. Lett. 2008, 100, 198103.
13. McMullen, T. P. W.; McElhaney, R. N. Curr. Opin. Colloid Interface Sci. 1996, 1, 83.
14. Epand, R. M. Biophys. J. 2003, 84, 3102.
15. Jacob, R. F.; Cenedella, R. J.; Mason, P. R. J. Biol. Chem. 2001, 276, 13573.
16. Dai, J.; Alwarawrah, M.; Huang, J. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 840.
17. de Meyer, F. J.-M.; Benjamini, A.; Rodgers, J. M.; Misteli, Y.; Smit, B. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 10451.
18. Radhakrishnan, A.; McConnell, H. M. Biophys. J. 1999, 77, 1507.
19. Huang, J.; Feigenson, G. W. Biophys. J. 1999, 76, 2142.
20. Chong, P. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 10069.
21. Ali, M. R.; Cheng, K. H.; Huang, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 5372.
22. Huang, J.; Buboltz, J. T.; Feigenson, G. W. Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 1999, 1417, 89.
23. Troup, G. M.; Tulenko, T. N.; Lee, S. P.; Wrenn, S. P. Colloids Surf., B 2003, 29, 217.
24. Troup, G. M.; Tulenko, T. N.; Lee, S. P.; Wrenn, S. P. Colloids Surf., B 2004, 33, 57.
25. Bloemendal, H. Science 1977, 197, 127.
26. Gonen, T.; Cheng, T.; Kistler, J.; Walz, T. J. Mol. Biol. 2004, 342, 1337.
27. Zampighi, G. A.; Hall, J. E.; Ehring, G. R.; Simon, S. A. J. Cell Biol. 1989, 108, 2255.
28. Yang, B. X.; Verkman, A. S. J. Biol. Chem. 1997, 272, 16140.
29. Harries, W. E. C.; Akhavan, D.; Miercke, L. J. W.; Khademi, S.; Stroud, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 14045.
30. Nemeth-Cahalan, K. L.; Hall, J. E. J. Biol. Chem. 2000, 275, 6777.
31. Gonen, T.; Cheng, Y.; Sliz, P.; Hiroaki, Y.; Fujiyoshi, Y.; Harrison, S. C.; Walz, T. Nature 2005, 438, 633.
32. Chepelinsky, A. B. J. Exp. Zool., Part A 2003, 300A.
33. Klauda, J. B.; Venable, R. M.; Freites, J. A.; O'Connor, J. W.; Tobias, D. J.; Mondragon-Ramirez, C.; Vorobyov, I.; MacKerell, A. D., Jr.; Pastor, R. W. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 7830.
34. Khare, R. S.; Worthington, C. R. Biochim. Biophys. Acta 1978, 514.
35. Jo, S.; Kim, T.; Iyer, V. G.; Im, W. J. Comput. Chem. 2008, 29, 1859.
36. Jo, S.; Lim, J. B.; Klauda, J. B.; Im, W. Biophys. J. 2009, 97, 50.
37. Jo, S.; Kim, T.; Im, W. PLoS One 2007, 2, e880.
38. Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187.
39. Brooks, B. R.; Brooks, C. L.; Mackerell, A. D.; Nilsson, L.; Petrella, R. J.; Roux, B.; Won, Y.; Archontis, G.; Bartels, C.; Boresch, S.; Caflisch, A.; Caves, L.; Cui, Q.; Dinner, A. R.; Feig, M.; Fischer, S.; Gao, J.; Hodoscek, M.; Im, W.; Kuczera, K.; Lazaridis, T.; Ma, J.; Ovchinnikov, V.; Paci, E.; Pastor, R. W.; Post, C. B.; Pu, J. Z.; Schaefer, M.; Tidor, B.; Venable, R. M.; Woodcock, H. L.; Wu, X.; Yang, W.; York, D. M.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 1545.
40. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926.
41. Phillips, J. C.; Braun, R.; Wang, W.; Gumbart, J.; Tajkhorshid, E.; Villa, E.; Chipot, C.; Skeel, R. D.; Kale, L.; Schulten, K. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781.
42. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. C. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577.
43. Andersen, H. C. J. Comput. Phys. 1983, 52, 24.
44. Feller, S. E.; Pastor, R. W. J. Chem. Phys. 1999, 111, 1281.
45. Klauda, J. B.; Roberts, M. F.; Redfield, A. G.; Brooks, B. R.; Pastor, R. W. Biophys. J. 2008, 94, 3074.
46. Klauda, J. B.; Eldho, N. V.; Gawrisch, K.; Brooks, B. R.; Pastor, R. W. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 5924.
47. Pastor, R. W.; Venable, R. M.; Feller, S. E. Acc. Chem. Res. 2002, 35, 438.
48. Lipad, G.; Szabo, A. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4546.
49. Pandit, S. A.; Vasudevan, S.; Chiu, S. W.; Mashl, R. J.; Jakobsson, E.; Scott, H. L. Biophys. J. 2004, 87, 1092.
50. Shinoda, W.; Okazaki, S. J. Chem. Phys. 1998, 109, 1517.
51. Nagle, J. F.; Tristram-Nagle, S. Biochim. Biophys. Acta, Rev. Biomembr. 2000, 1469, 159.
52. Ku-cerka, N.; Liu, Y. F.; Chu, N. J.; Petrache, H. I.; Tristram-Nagle, S. T.; Nagle, J. F. Biophys. J. 2005, 88, 2626.
53. Pan, J.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, J. F. Phys. Rev. E: Stat., Nonlinear, Soft Matter Phys. 2009, 80, 021931.
54. Nevzorov, A. A.; Trouard, T. P.; Brown, M. F. Phys. Rev. E 1998, 58, 2259.
55. Douliez, J. P.; Leonard, A.; Dufourc, E. J. Biophys. J. 1995, 68, 1727.
56. Trouard, T. P.; Nevzorov, A. A.; Alam, T. M.; Job, C.; Zajicek, J.; Brown, M. F. J. Chem. Phys. 1999, 110, 8802.
57. Needham, D.; McIntosh, T. J.; Evans, E. Biochemistry 1988, 27, 4668.
58. Hodzic, A.; Rappolt, M.; Amenitsch, H.; Laggner, P.; Pabst, G. Biophys. J. 2008, 94, 3935.
59. Klauda, J. B.; Ku-cerka, N.; Brooks, B. R.; Pastor, R. W.; Nagle, J. F. Biophys. J. 2006, 90, 2796.
60. Hite, R. K.; Li, Z.; Walz, T. EMBO J. 2010, 29, 1652.
61. Bennett, W. F. D.; MacCallum, J. L.; Tieleman, D. P. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1972.
62. Carrillo-Tripp, M.; Feller, S. E. Biochemistry 2005, 44, 10164.
63. Cournia, Z.; Ullmann, G. M.; Smith, J. C. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 1786.
64. Risselada, H. J.; Marrink, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 17367.
65. Zhang, Z.; Lu, L.; Berkowitz, M. L. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 3807.
66. Khelashvili, G.; Pabst, G.; Harries, D. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 7524.
67. Marrink, S. J.; deVries, A. H.; Harroun, T. A.; Katsaras, J.; Wassall, S. R. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 10.
68. Edholm, O.; Nagle, J. F. Biophys. J. 2005, 89, 1827.
69. Lindahl, E.; Edholm, O. Biophys. J. 2000, 79, 426.
70. Feller, S. E.; Venable, R. M.; Pastor, R. W. Langmuir 1997, 13, 6555.
71. Ku-cerka, N.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, J. F. Biophys. J. 2006, 90, L83.
72. Klauda, J. B.; Pastor, R. W.; Brooks, B. R.; Roberts, M. F.; Redfield., A. G. Biophys. J. 2008, 94, 3074.
73. Jensen, M. ø.; Dror, R. O.; Xu, H.; Borhani, D. W.; Arkin, I. T.; Eastwood, M. P.; Shaw, D. E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 14430.
74. Hashido, M.; Ikeguchi, M.; Kidera, A. FEBS Lett. 2005, 579, 5549.
75. Tong, J.; Briggs, M. M.; Mlaver, D.; Vidal, A.; McIntosh, T. J. Biophys. J. 2009, 97, 2493.