DNA-mediated assembly of protein heterodimers on membrane surfaces

Journal of the American Chemical Society

Volumn 135, Issue 13, 2013, Pages 5012-5016

  Coyle, Michael P ^a,b   Xu, Qian ^a,b,c   Chiang, Samantha ^a   Francis, Matthew B ^a,b   Groves, Jay T ^a,b  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b LAWRENCE BERKELEY NATIONAL LABORATORY   (United States)

^c University of Illinois at Urbana Champaign   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FLUORESCENCE CROSS-CORRELATION SPECTROSCOPY; FUNCTIONAL INTERFACE; LATERAL MOBILITY; MEMBRANE SURFACE; RECOGNITION SEQUENCE; SELF-ASSEMBLING; SUPPORTED MEMBRANE; SURFACE DENSITY;

DIMERS; DNA; OLIGONUCLEOTIDES; PROTEINS;

DNA SEQUENCES;

DIMER; DNA; HETERODIMER; MONOMER;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CONTROLLED STUDY; DNA CROSS LINKING; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; MEMBRANE; PROTEIN ASSEMBLY; SURFACE PROPERTY;

CELL LINE, TUMOR; CELL MEMBRANE; DIMERIZATION; DNA; DNA-BINDING PROTEINS; HUMANS; MODELS, BIOLOGICAL; SURFACE PROPERTIES;

EID: 84875796603     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja3101215     Document Type: Article

References (61)

1. Watts, T. H.; Gaub, H. E.; McConnell, H. M. Nature 1986, 320, 179-181
2. Monks, C. R.; Freiberg, B. A.; Kupfer, H.; Sciaky, N.; Kupfer, A. Nature 1998, 395, 82-86
3. Dustin, M. L.; Groves, J. T. Annu. Rev. Biophys. 2012, 41, 543-556
4. Irvine, K. D.; Rauskolb, C. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 2001, 17, 189-214
5. Brachmann, R.; Lindquist, P. B.; Nagashima, M.; Kohr, W.; Lipari, T.; Napier, M.; Derynck, R. Cell 1989, 56, 691-700
6. Flanagan, J.; Vanderhaeghen, P. Annu. Rev. Neurosci. 1998, 21, 309-345
7. Wilkinson, D. G. Nat. Rev. Neurosci. 2001, 2, 155-164
8. Anklesaria, P.; Teixidó, J.; Laiho, M.; Pierce, J. H.; Greenberger, J. S.; Massagué, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 3289-3293
9. Pasquale, E. B. Nat. Rev. Cancer 2010, 10, 165-180
10. Grakoui, A.; Bromley, S. K.; Sumen, C.; Davis, M. M.; Shaw, A. S.; Allen, P. M.; Dustin, M. L. Science 1999, 285, 221-227
11. Mossman, K. D.; Campi, G.; Groves, J. T.; Dustin, M. L. Science 2005, 310, 1191-1193
12. Hartman, N. C.; Nye, J. A.; Groves, J. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009, 106, 12729-12734
13. Salaita, K.; Nair, P. M.; Petit, R. S.; Neve, R. M.; Das, D.; Gray, J. W.; Groves, J. T. Science 2010, 327, 1380-1385
14. DeMond, A. L.; Mossman, K. D.; Starr, T.; Dustin, M. L.; Groves, J. T. Biophys. J. 2008, 94, 3286-3292
15. Manz, B. N.; Jackson, B. L.; Petit, R. S.; Dustin, M. L.; Groves, J. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 9089-9094
16. Huppa, J. B.; Axmann, M.; Mörtelmaier, M. A.; Lillemeier, B. F.; Newell, E. W.; Brameshuber, M.; Klein, L. O.; Schütz, G. J.; Davis, M. M. Nature 2010, 463, 963-967
17. Dustin, M. L. J. Struct. Biol. 2009, 168, 152-160
18. Yu, Y.; Fay, N. C.; Smoligovets, A. A.; Wu, H.-J.; Groves, J. T. PloS ONE 2012, 7, e30704
19. Cemerski, S.; Das, J.; Giurisato, E.; Markiewicz, M. A.; Allen, P. M.; Chakraborty, A. K.; Shaw, A. S. Immunity 2008, 29, 414-422
20. Hartman, N. C.; Groves, J. T. Curr. Opin. Cell Biol. 2011, 23, 370-376
21. Li, P.; Banjade, S.; Cheng, H.-C.; Kim, S.; Chen, B.; Guo, L.; Llaguno, M.; Hollingsworth, J. V; King, D. S.; Banani, S. F.; Russo, P. S.; Jiang, Q.-X.; Nixon, B. T.; Rosen, M. K. Nature 2012, 483, 336-340
22. Bethani, I.; SkaÌŠnland, S. S.; Dikic, I.; Acker-Palmer, A. EMBO J. 2010, 29, 2677-2688
23. Freywald, A.; Sharfe, N.; Roifman, C. M. J. Biol. Chem. 2002, 277, 3823-3828
24. Truitt, L.; Freywald, T.; DeCoteau, J.; Sharfe, N.; Freywald, A. Cancer Res. 2010, 70, 1141-1153
25. Janes, P. W.; Griesshaber, B.; Atapattu, L.; Nievergall, E.; Hii, L. L.; Mensinga, A.; Chheang, C.; Day, B. W.; Boyd, A. W.; Bastiaens, P. I.; Jørgensen, C.; Pawson, T.; Lackmann, M. J. Cell Biol. 2011, 195, 1033-1045
26. Janes, P. W.; Nievergall, E.; Lackmann, M. Semin. Cell Dev. Biol. 2012, 23, 43-50
27. Yarden, Y.; Sliwkowski, M. X. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2001, 2, 127-137
28. Lemmon, M. A. Exp. Cell Res. 2009, 315, 638-648
29. Olayioye, M. A.; Neve, R. M.; Lane, H. A.; Hynes, N. E. EMBO J. 2000, 19, 3159-3167
30. Holmes, D. Nat. Rev. Drug Discovery 2011, 10, 798-800
31. Cochran, J. R. Sci. Transl. Med. 2010, 2, 17ps5
32. Saccà, B.; Meyer, R.; Erkelenz, M.; Kiko, K.; Arndt, A.; Schroeder, H.; Rabe, K. S.; Niemeyer, C. M. Angew. Chem., Int. Ed. 2010, 9378-9383
33. Tepper, A. W. J. W. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 6550-6557
34. Niemeyer, C. M.; Koehler, J.; Wuerdemann, C. ChemBioChem 2002, 3, 242-245
35. You, M.; Wang, R.-W.; Zhang, X.; Chen, Y.; Wang, K.; Peng, L.; Tan, W. ACS Nano 2011, 5, 10090-10095
36. Erkelenz, M.; Kuo, C.-H.; Niemeyer, C. M. J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 16111-16118
37. Yan, H.; Park, S. H.; Finkelstein, G.; Reif, J. H.; LaBean, T. H. Science 2003, 301, 1882-1884
38. Stephanopoulos, N.; Liu, M.; Tong, G. J.; Li, Z.; Liu, Y.; Yan, H.; Francis, M. B. Nano Lett. 2010, 10, 2714-2720
39. Yoshina-Ishii, C.; Miller, G. P.; Kraft, M. L.; Kool, E. T.; Boxer, S. G. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1356-1357
40. Selden, N. S.; Todhunter, M. E.; Jee, N. Y.; Liu, J. S.; Broaders, K. E.; Gartner, Z. J. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 765-768
41. Galush, W. J.; Nye, J. A.; Groves, J. T. Biophys. J. 2008, 95, 2512-2519
42. Chen, Y.; Munteanu, A. C.; Huang, Y.-F.; Phillips, J.; Zhu, Z.; Mavros, M.; Tan, W. Chem.-Eur. J. 2009, 15, 5327-5336
43. Swift, J. L.; Godin, A. G.; Doré, K.; Freland, L.; Bouchard, N.; Nimmo, C.; Sergeev, M.; De Koninck, Y.; Wiseman, P. W.; Beaulieu, J.-M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2011, 108, 7016-7021
44. Kempiak, S. J.; Yip, S.-C.; Backer, J. M.; Segall, J. E. J. Cell Biol. 2003, 162, 781-787
45. Plunkett, M.; Springer, T. J. Immunol. 1986, 136, 4181-4187
46. Hsiao, S. C.; Shum, B. J.; Onoe, H.; Douglas, E. S.; Gartner, Z. J.; Mathies, R. A.; Bertozzi, C. R.; Francis, M. B. Langmuir 2009, 25, 6985-6991
47. Twite, A. A.; Hsiao, S. C.; Onoe, H.; Mathies, R. A.; Francis, M. B. Adv. Mater. (Weinheim, Ger.) 2012, 24, 2380-2385
48. Onoe, H.; Hsiao, S. C.; Douglas, E. S.; Gartner, Z. J.; Bertozzi, C. R.; Francis, M. B.; Mathies, R. A. Langmuir 2012, 28, 8120-8126
49. Bacia, K.; Schwille, P. Nat. Protoc. 2007, 2, 2842-2856
50. Müller, B. K.; Zaychikov, E.; Bräuchle, C.; Lamb, D. C. Biophys. J. 2005, 89, 3508-3522
51. Chen, J.; Nag, S.; Vidi, P.-A.; Irudayaraj, J. PloS ONE 2011, 6, e17991
52. Slaughter, B. D.; Schwartz, J. W.; Li, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 20320-20325
53. Kettling, U.; Koltermann, A.; Schwille, P.; Eigen, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 1416-1420
54. Triffo, S. B.; Huang, H. H.; Smith, A. W.; Chou, E. T.; Groves, J. T. J. Am. Chem. Soc. 2012, 134, 10833-10842
55. Weidemann, T.; Wachsmuth, M. Single Mol. 2002, 3, 49-61
56. Chaudri, Z.; Bartlet-Jones, M.; Panayotou, G. FEBS Lett. 1999, 450, 23-26
57. Brennan, M.; Davison, P. F.; Paulus, H. Science 1985, 229, 81-83
58. Xu, Q.; Lin, W.-C.; Petit, R. S.; Groves, J. T. Biophys. J. 2011, 101, 2731-2739
59. Goodman, R. P.; Erben, C. M.; Malo, J.; Ho, W. M.; McKee, M. L.; Kapanidis, A. N.; Turberfield, A. J. ChemBioChem 2009, 10, 1551-1557
60. Nam, J.-M.; Nair, P. M.; Neve, R. M.; Gray, J. W.; Groves, J. T. ChemBioChem 2006, 7, 436-440
61. Jongsma, M. A.; Litjens, R. H. G. M. Proteomics 2006, 6, 2650-2655