Pleckstrin homology (PH) domains and phosphoinositides

Biochemical Society Symposium

Volumn 74, Issue , 2007, Pages 81-93

  Lemmon, Mark A ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PHOSPHATIDYLINOSITOL;

BINDING SITE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; HUMAN; METABOLISM; PROTEIN BINDING; PROTEIN TERTIARY STRUCTURE; REVIEW; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

BINDING SITES; HUMANS; MODELS, MOLECULAR; PHOSPHATIDYLINOSITOLS; PROTEIN BINDING; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

EID: 84872115717     PISSN: 00678694     EISSN: 17441439     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1042/BSS0740081     Document Type: Article

References (84)

1. Haslam, R. J., Koide, H. B. and Hemmings, B. A. (1993) Nature 363, 309-310
2. Mayer, B. J., Ren, R., Clark, K. L. and Baltimore, D. (1993) Cell 73, 629-630
3. Tyers, M., Rachubinski, R. A., Stewart, M. I., Varrichio, A. M., Shorr, R. G. L., Haslam, R. J. and Harley, C. B. (1988) Nature 333, 470-473
4. Yoon, H. S., Hajduk, P. J., Petros, A. M., Olejniczak, E. T., Meadows, R. P. and Fesik, S. W. (1994) Nature 369, 672-675
5. Macias, M. J., Musacchio, A., Ponstingl, H., Nilges, M., Saraste, M. and Oschkinat, H. (1994) Nature 369, 675-677
6. Harlan, J. E., Hajduk, P. J., Yoon, H. S. and Fesik, S. W. (1994) Nature 371, 168-170
7. Lemmon, M. A., Ferguson, K. M., O'Brien, R., Sigler, P. B. and Schlessinger, J. (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 92, 10472-10476
8. Garcia, P., Gupta, R., Shah, S., Morris, A. J., Rudge, S. A., Scarlata, S., Petrova, V., McLaughlin, S. and Rebecchi, M. J. (1995) Biochemistry 34, 16228-16234
9. Ferguson, K. M., Lemmon, M. A., Schlessinger, J. and Sigler, P. B. (1995) Cell 83, 1037-1046
10. Franke, T. F., Kaplan, D. R., Cantley, L. C. and Toker, A. (1997) Science 275, 665-668
11. Fruman, D. A., Rameh, L. E. and Cantley, L. C. (1999) Cell 97, 817-820
12. Baraldi, E., Djinovic Carugo, K., Hyvönen, M., Lo Surdo, P., Riley, A. M., Potter, B. V. L., O'Brien, R., Ladbury, J. E. and Saraste, M. (1999) Structure 7, 449-460
13. Ferguson, K. M., Kavran, J. M., Sankaran, V. G., Fournier, E., Isakoff, S. J., Skolnik, E. Y. and Lemmon, M. A. (2000) Mol. Cell 6, 373-384
14. Lietzke, S. E., Bose, S., Cronin, T., Klarlund, J., Chawla, A., Czech, M. P. and Lambright, D. G. (2000) Mol. Cell 6, 385-394
15. Di Nitto, J. P., Cronin, T. C. and Lambright, D. G. (2003) Sci STKE (213):, re16
16. Lemmon, M. A. (2003) Traffic 4, 201-213
17. Rusten, T. E. and Stenmark, H. (2006) Nature Methods 3, 251-258
18. Letunic, I., Copley, R. R., Pils, B., Pinkert, S., Schultz, J. and Bork, P. (2006) Nucl. Acids Res. 34, D257-D260
19. Kavran, J. M., Klein, D. E., Lee, A., Falasca, M., Isakoff, S. J., Skolnik, E. Y. and Lemmon, M. A. (1998) J. Biol. Chem. 273, 30497-30508
20. Takeuchi, H., Kanematsu, T., Misumi, Y., Sakane, F., Konishi, H., Kikkawa, U., Watanabe, Y., Katan, M. and Hirata, M. (1997) Biochim. Biophys. Acta. 1359, 275-285
21. Lemmon, M. A. and Ferguson, K. M. (2000) Biochem. J. 350, 1-18
22. Van De Mark, A. P., Blanksma, M., Ferris, E., Heroux, A., Hill, C. P. and Formosa, T. (2006) Mol. Cell 22, 363-374
23. Furst, J., Schedlbauer, A., Gandini, R., Garavaglia, M. L., Saino, S., Gschwentner, M., Sarg, B., Lindner, H., Jakab, M., Ritter, M. et al. (2005) J. Biol. Chem. 280, 31276-31282
24. Gervais, V., Lamour, V., Jawhari, A., Frindel, F., Wasielewski, E., Dubaele, S., Egly, J. M., Thierry, J. C., Kieffer, B. and Poterszman, A. (2004) Nat. Struct. Mol. Biol. 11, 616-622
25. Prehoda, K. E., Lee, D. J. and Lim, W. A. (1999) Cell 97, 471-480
26. Yu, J. W., Mendrola, J. M., Audhya, A., Singh, S., Keleti, D., De Wald, D. B., Murray, D., Emr, S. D. and Lemmon, M. A. (2004) Mol. Cell 13, 677-688
27. Klarlund, J. K., Guilherme, A., Holik, J. J., Virbasius, A. and Czech, M. P. (1997) Science 275, 1927-1930
28. Salim, K., Bottomley, M. J., Querfurth, E., Zvelebil, M. J., Gout, I., Scaife, R., Margolis, R. L., Gigg, R., Smith, C. I. E., Driscoll, P. C. et al. (1996) EMBO J. 15, 6241-6250
29. Dowler, S., Currie, R. A., Downes, C. P. and Alessi, D. R. (1999) Biochem. J. 342, 7-12
30. Dowler, S., Currie, R. A., Campbell, D. G., Deak, M., Kular, G., Downes, C. P. and Alessi, D. R. (2000) Biochem. J. 351, 19-31
31. Thomas, C. C., Dowler, S., Deak, M., Alessi, D. R. and Van Aalten, D. M. (2001) Biochem. J. 358, 287-294
32. Baumeister, M. A., Martinu, L., Rossman, K. L., Sondek, J., Lemmon, M. A. and Chou, M. M. (2003) J. Biol. Chem. 278, 11457-11464
33. Teo, H., Gill, D. J., Sun, J., Perisic, O., Veprintsev, D. B., Vallis, Y., Emr, S. D. and Williams, R. L. (2006) Cell 125, 99-111
34. Cronin, T. C., Di Nitto, J. P., Czech, M. P. and Lambright, D. G. (2004) EMBO J. 23, 3711-3720
35. Thomas, C., Deak, M., Alessi, D. and Van Aalten, D. (2002) Curr. Biol. 12, 1256-1262
36. Isakoff, S. J., Cardozo, T., Andreev, J., Li, Z., Ferguson, K. M., Abagyan, R., Lemmon, M. A., Aronheim, A. and Skolnik, E. Y. (1998) EMBO J. 17, 5374-5387
37. Corbin, J. A., Dirkx, R. A. and Falke, J. J. (2004) Biochemistry 43, 16161-16173
38. Ellson, C. D., Andrews, S., Stephens, L. R. and Hawkins, P. T. (2002) J. Cell Sci. 115, 1099-1105
39. Gillooly, D. J., Simonsen, A. and Stenmark, H. (2001) Biochem. J. 355, 249-258
40. Yu, J. W. and Lemmon, M. A. (2001) J. Biol. Chem. 276, 44179-44184
41. Kanai, F., Liu, H., Field, S. J., Akbary, H., Matsuo, T., Brown, G. E., Cantley, L. C. and Yaffe, M. B. (2001) Nat. Cell Biol. 3, 675-678
42. Song, X., Xu, W., Zhang, A., Huang, G., Liang, X., Virbasius, J. V., Czech, M. P. and Zhou, G. W. (2001) Biochemistry 40, 8940-8944
43. Lee, J. S., Kim, J. H., Jang, I. H., Kim, H. S., Han, J. M., Kazlauskas, A., Yagisawa, H., Suh, P. G. and Ryu, S. H. (2005) J. Cell Sci. 118, 4405-4413
44. Misra, S. and Hurley, J. H. (1999) Cell 97, 657-666
45. Dumas, J. J., Merithew, E., Sudharshan, E., Rajamani, D., Hayes, S., Lawe, D., Corvera, S. and Lambright, D. G. (2001) Mol. Cell 8, 947-958
46. Sankaran, V. G., Klein, D. E., Sachdeva, M. M. and Lemmon, M. A. (2001) Biochemistry 40, 8581-8587
47. Kutateladze, T. and Overduin, M. (2001) Science 291, 1793-1796
48. Stahelin, R. V., Long, F., Diraviyam, K., Bruzik, K. S., Murray, D. and Cho, W. (2002) J. Biol. Chem. 277, 26379-26388
49. Gillooly, D. J., Morrow, I. C., Lindsay, M., Gould, R., Bryant, N. J., Gaullier, J. M., Parton, R. G. and Stenmark, H. (2000) EMBO J. 19, 4577-4588
50. Stenmark, H., Aasland, R., Toh, B. H. and D'Arrigo, A. (1996) J. Biol. Chem. 271, 24048-24054
51. Bravo, J., Karathanassis, D., Pacold, C. M., Pacold, M. E., Ellson, C. D., Anderson, K. E., Butler, P. J., Lavenir, I., Perisic, O., Hawkins, P. T. et al. (2001) Mol. Cell 8, 829-839
52. Stahelin, R. V., Burian, A., Bruzik, K. S., Murray, D. and Cho, W. (2003) J. Biol. Chem. 278, 14469-14479
53. Cheever, M. L., Sato, T. K., De Beer, T., Kutateladze, T. G., Emr, S. D. and Overduin, M. (2001) Nat. Cell Biol. 3, 613-618
54. Whitley, P., Reaves, B. J., Hashimoto, M., Riley, A. M., Potter, B. V. and Holman, G. D. (2003) J. Biol. Chem. 278, 38786-38795
55. Eugster, A., Pecheur, E. I., Michel, F., Winsor, B., Letourneur, F. and Friant, S. (2004) Mol. Biol. Cell 15, 3031-3041
56. Friant, S., Pecheur, E. I., Eugster, A., Michel, F., Lefkir, Y., Nourrisson, D. and Letourneur, F. (2003) Dev. Cell 5, 499-511
57. Michell, R. H., Heath, V. L., Lemmon, M. A. and Dove, S. K. (2006) Trends Biochem. Sci. 31, 52-63
58. Narayan, K. and Lemmon, M. A. (2006) Methods 39, 122-133
59. Dove, S. K., Piper, R. C., McEwen, R. K., Yu, J. W., King, M. C., Hughes, D. C., Thuring, J., Holmes, A. B., Cooke, F. T., Michell, R. H. et al. (2004) EMBO J. 23, 1922-1933
60. Stromhaug, P. E., Reggiori, F., Guan, J., Wang, C. W. and Klionsky, D. J. (2004) Mol. Biol. Cell 15, 3553-3566
61. Jeffries, T. R., Dove, S. K., Michell, R. H. and Parker, P. J. (2004) Mol. Biol. Cell 15, 2652-2663
62. Gozani, O., Karuman, P., Jones, D. R., Ivanov, D., Cha, J., Lugovskoy, A. A., Baird, C. L., Zhu, H., Field, S. J., Lessnick, S. L. et al. (2003) Cell 114, 99-111
63. Alvarez-Venegas, R., Sadder, M., Hlavacka, A., Baluska, F., Xia, Y., Lu, G., Firsov, A., Sarath, G., Moriyama, H., Dubrovsky, J. G. and Avramova, Z. (2006) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103, 6049-6054
64. Cho, W. and Stahelin, R. V. (2005) Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 34, 119-151
65. Tuzi, S., Uekama, N., Okada, M., Yamaguchi, S., Saito, H. and Yagisawa, H. (2003) J. Biol. Chem. 278, 28019-28025
66. Varnai, P., Lin, X., Lee, S. B., Tuymetova, G., Bondeva, T., Spat, A., Rhee, S. G., Hajnoczky, G. and Balla, T. (2002) J. Biol. Chem. 277, 27412-27422
67. Flesch, F. M., Yu, J. W., Lemmon, M. A. and Burger, K. N. (2005) Biochem. J. 389, 435-441
68. Levine, T. P. and Munro, S. (2002) Curr. Biol. 12, 695-704
69. Roy, A. and Levine, T. P. (2004) J. Biol. Chem. 279, 44683-44689
70. Levine, T. P. and Munro, S. (1998) Curr. Biol. 8, 729-739
71. Levine, T. P. and Munro, S. (2001) Mol. Biol. Cell. 12, 1633-1644
72. Godi, A., Di Campli, A., Konstantakopoulos, A., Di Tullio, G., Alessi, D. R., Kular, G. S., Daniele, T., Marra, P., Lucocq, J. M. and De Matteis, M. A. (2004) Nat. Cell Biol. 6, 393-404
73. Blomberg, N., Baraldi, E., Nilges, M. and Saraste, M. (1999) Trends Biochem. Sci. 24, 441-445
74. Lodowski, D. T., Pitcher, J. A., Capel, W. D., Lefkowitz, R. J. and Tesmer, J. J. (2003) Science 300, 1256-1262
75. Stolt, P. C., Jeon, H., Song, H. K., Herz, J., Eck, M. J. and Blacklow, S. C. (2003) Structure 11, 569-579
76. Yun, M., Keshvara, L., Park, C. G., Zhang, Y. M., Dickerson, J. B., Zheng, J., Rock, C. O., Curran, T. and Park, H. W. (2003) J. Biol. Chem. 278, 36572-36581
77. Audhya, A., Loewith, R., Parsons, A. B., Gao, L., Tabuchi, M., Zhou, H., Boone, C., Hall, M. N. and Emr, S. D. (2004) EMBO J. 23, 3747-3757
78. Rossman, K. L. and Sondek, J. (2005) Trends Biochem. Sci. 30, 163-165
79. Worthylake, D. K., Rossman, K. L. and Sondek, J. (2004) Structure 12, 1078-1086
80. Zheng, J., Cahill, S. M., Lemmon, M. A., Fushman, D., Schlessinger, J. and Cowburn, D. (1996) J. Mol. Biol. 255, 14-21
81. Klein, D. E., Lee, A., Frank, D. W., Marks, M. S. and Lemmon, M. A. (1998) J. Biol. Chem. 273, 27725-27733
82. Achiriloaie, M., Barylko, B. and Albanesi, J. P. (1999) Mol. Cell. Biol. 19, 1410-1415
83. Lee, A., Frank, D. W., Marks, M. S. and Lemmon, M. A. (1999) Curr. Biol. 9, 261-264
84. Vallis, Y., Wigge, P., Marks, B., Evans, P. R. and McMahon, H. T. (1999) Curr. Biol. 9, 257-260