Structural biology of plant sulfur metabolism: From assimilation to biosynthesis

Natural Product Reports

Volumn 29, Issue 10, 2012, Pages 1138-1152

  Ravilious, Geoffrey E ^a   Jez, Joseph M ^a  

^a WASHINGTON UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIA (MICROORGANISMS); EUKARYOTA;

PEPTIDE; SULFUR;

CHEMICAL STRUCTURE; ENZYMOLOGY; METABOLISM; PLANT; PROTEIN CONFORMATION; REVIEW; SYNTHESIS;

MOLECULAR STRUCTURE; PEPTIDES; PLANTS; PROTEIN CONFORMATION; SULFUR;

EID: 84865798179     PISSN: 02650568     EISSN: 14604752     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2np20009k     Document Type: Review

References (110)

1. D. P. Schachtman R. Shin Annu. Rev. Plant Biol. 2007 58 47 69
2. H. Yi A. Galant G. E. Ravilious M. L. Preuss J. M. Jez Mol. Plant 2010 3 269 279
3. H. Yi G. E. Ravilious A. Galant H. B. Krishnan J. M. Jez Amino Acids 2010 39 963 978
4. H. Takahashi S. Kopriva M. Giordano K. Saito R. Hell Annu. Rev. Plant Biol. 2011 62 157 184
5. H. B. Krishnan Crop Sci. 2005 45 454 461
6. Y. Ingenbleek J. Nutr. 2006 136 1641S 1651S
7. J. W. Fahey A. T. Zalcmann P. Talalay Phytochemistry 2001 5 5 51
8. A. Galant M. L. Preuss J. Cameron J. M. Jez Front. Plant Sci. 2011 2 45
9. P. A. Rea O. K. Vatamaniuk D. J. Rigden Plant Physiol. 2004 136 2463 2474
10. N. J. Patron D. G. Durnford S. Kopriva BMC Evol. Biol. 2008 8 39
11. G. A. Marzluf Annu. Rev. Microbiol. 1997 51 73 96
12. A. Sekowska H. F. Kung A. Danchin J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 2000 2 145 177
13. J. A. Bick J. J. Dennis G. J. Zylstra J. Nowack T. Leustek J. Bacteriol. 2000 182 135 142
14. T. Leustek M. N. Martin J. A. Bick J. P. Davies Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 2000 51 141 165
15. A. Meister Methods Enzymol. 1995 252 26 30
16. A. Galant K. A. J. Arkus C. Zubieta R. E. Cahoon J. M. Jez Plant Cell 2009 21 3450 3458
17. A. J. Meyer J. Plant Physiol. 2008 49 249 279
18. C. Cobbett P. Goldsbrough Annu. Rev. Plant Biol. 2002 53 159 182
19. J. D. Mougous R. E. Green S. J. Williams S. E. Brenner C. R. Bertozzi Chem. Biol. 2002 9 767 776
20. A. Sekowska H. F. Kung A. Danchin J. Mol. Microbiol. Biotechnol. 2000 2 145 177
21. P. Bednarek M. Pilewska-Bednarek A. Svato B. Schneider J. Doubsk M. Mansurova M. Humphry C. Consonni R. Panstruga A. Sanchez-Vallet A. Molina P. Schulze-Lefert Science 2009 323 101 106
22. C. Jacob Nat. Prod. Rep. 2006 23 851 863
23. F. Renosto H. C. Patel R. L. Martin C. Thomassian G. Zimmerman I. H. Segel Arch. Biochem. Biophys. 2003 307 272 285
24. P. Phartiyal W. S. Kim R. E. Cahoon J. M. Jez H. B. Krishnan Arch. Biochem. Biophys. 2006 450 20 29
25. T. C. Ullrich M. Blaesse R. Huber EMBO J. 2001 20 316 329
26. I. J. MacRae I. H. Segel A. J. Fisher Biochemistry 2001 40 6795 6804
27. S. Kopriva A. Korpivova J. Exp. Bot. 2004 55 1775 1783
28. P. Phartiyal W. S. Kim R. E. Cahoon J. M. Jez H. B. Krishnan Phytochemistry 2008 69 356 364
29. M. N. Martin M. C. Tarczynski B. Shen T. Leustek Photosynth. Res. 2005 86 309 323
30. T. Saitoh T. Ikegami M. Nakayama K. Teshima H. Akutsu T. Hase J. Biol. Chem. 2006 281 10482 10488
31. E. R. Bonner R. E. Cahoon S. M. Knapke J. M. Jez J. Biol. Chem. 2005 280 33803 33813
32. M. Droux M.-L. Ruffet R. Douce D. Job Eur. J. Biochem. 1998 255 235 245
33. J. R. Dominguez-Solis G. Gutierrez-Alcala J. M. Vega L. C. Romero C. Gotor J. Biol. Chem. 2001 276 9297 9930
34. W. S. Kim D. Chronis M. Juergens A. C. Schroeder S. W. Hyun J. M. Jez H. B. Krishnan Planta 2012 235 13 23
35. C. H. Tai P. F. Cook Acc. Chem. Res. 2001 34 49 59
36. J. A. Francois S. Kumaran J. M. Jez Plant Cell 2006 18 3647 3655
37. S. Kumaran J. M. Jez Biochemistry 2007 46 5586 5594
38. S. Kumaran H. Yi H. B. Krishnan J. M. Jez J. Biol. Chem. 2009 284 10268 10275
39. R. Hell H. Hillebrand Curr. Opin. Biotechnol. 2001 12 161 168
40. M. Y. Hirai T. Fujiwara M. Awazuhara T. Kimura M. Noji K. Saito Plant J. 2003 33 651 663
41. L. Hopkins S. Parmar A. Blaszczyk H. Hesse R. Höfgen M. J. Hawkesford Plant Physiol. 2005 138 433 440
42. F. Liszewska M. Lewandowska D. Bochocka A. Sirko Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2007 1774 450 455
43. A. Feldman-Salit M. Wirtz R. Hell R. C. Wade J. Mol. Biol. 2009 386 37 50
44. R. Hansch R. R. Mendel Photosynth. Res. 2005 86 337 343
45. D. Randewig D. Hamisch C. Herschbach M. Eiblmeier C. Gehl J. Jurgeleit J. Skerra R. R. Mendel H. Rennenberg R. Hansch Plant Cell Environ. 2012 35 100 115
46. A. P. M. Dittrich H. Pfanz U. Heber Plant Physiol. 1992 98 738 744
47. T. Eilers G. Schwarz H. Brinkmann C. Witt T. Richter J. Nieder B. Koch R. Hille R. Hansch R. R. Mendel J. Biol. Chem. 2001 276 46989 46994
48. C. Kisker H. Schindelin A. Pacheco W. A. Wehbi R. M. Garrett K. V. Rajagopalan J. H. Enemark D. C. Rees Cell 1997 91 973 983
49. N. Schrader K. Fishcer K. Theis R. R. Mendel G. Schwarz C. Kisker Structure 2003 11 1251 1263
50. C. Hemann B. L. Hood M. Fulton R. Hansch G. Schwarz R. R. Mendel M. L. Kirk R. Hille J. Am. Chem. Soc. 2005 127 16567 16577
51. B. Yu C. Xu C. Benning Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 5732 5737
52. A. M. Mullchak M. J. Theisen B. Essigmann C. Benning R. M. Garavito Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 13097 13102
53. J. F. Moran I. Iturbe-Ormaetxe M. A. Matamoros M. C. Rubio M. R. Clemente N. J. Brewin M. Becana Plant Physiol. 2000 124 1381 1392
54. M. A. Matamoros M. R. Clemente S. Sato E. Asamizu S. Tabata J. Ramos J. F. Moran J. Stiller P. M. Gresshoff M. Becana Mol. Plant-Microbe Interact. 2003 16 1039 1046
55. P. Frendo J. Harrison C. Norman M. J. Hernandez-Jimenez G. Van de Sype A. Gilabert A. Puppo Mol. Plant-Microbe Interact. 2005 18 254 259
56. J. Loscos M. A. Matamoros M. Becana Plant Physiol. 2008 146 1282 1292
57. S. Klapheck W. Flieger I. Zimmer Plant Physiol. 1994 104 1325 1332
58. P. Meuwly P. Thibault A. L. Schwan W. E. Rauser Plant J. 1995 7 391 400
59. O. K. Vatamaniuk S. Mari Y. P. Lu P. A. Rea Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 7110 7115
60. S. B. Ha A. P. Smith R. Howden W. M. Dietrich S. Bugg M. J. O'Connell P. B. Goldsbrough C. S. Cobbett Plant Cell 1999 11 1153 1163
61. S. Clemens E. J. Kim D. Neumann J. I. Schroeder EMBO J. 1999 18 3325 3333
62. N. D. Romanyuk D. J. Rigden O. K. Vatamaniuk A. Lang R. E. Cahoon J. M. Jez P. A. Rea Plant Physiol. 2006 141 858 869
63. J. M. Jez R. E. Cahoon S. Chen J. Biol. Chem. 2004 279 33463 33470
64. M. Hothorn A. Wachter R. Gromes T. Stuwe T. Rausch K. Scheffzek J. Biol. Chem. 2006 281 27557 27565
65. L. M. Hicks R. E. Cahoon E. R. Bonner R. S. Rivard J. Sheffield J. M. Jez Plant Cell 2007 19 2653 2661
66. R. Gromes M. Hothorn E. D. Lenherr V. Rybin K. Scheffzek T. Rausch Plant J. 2008 54 1063 1075
67. S. Alvarez B. M. Berla J. Sheffield R. E. Cahoon J. M. Jez L. M. Hicks Proteomics 2009 9 2419 2431
68. S. Alvarez A. Galant J. M. Jez L. M. Hicks Proteomics 2011 11 1346 1350
69. A. Galant R. P. Koester E. A. Ainsworth L. M. Hicks J. M. Jez New Phytologist 2012 194 220 229
70. E. I. Biterova J. J. Barycki J. Biol. Chem. 2009 284 32700 32708
71. C. L. Wang D. J. Oliver Biochem. J. 1997 322 241 244
72. C. L. Wang D. J. Oliver Biochem. J. 1997 326 563 566
73. J. M. Jez R. E. Cahoon J. Biol. Chem. 2004 279 42726 42733
74. T. Hibi H. Nii T. Nakatsu A. Kimura H. Kato J. Hiratake J. Oda Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2004 101 15052 15057
75. K. Herrera R. E. Cahoon S. Kumaran J. M. Jez J. Biol. Chem. 2007 282 17157 17165
76. G. Polekhina P. G. Board R. R. Gali J. Rossjohn M. W. Parker EMBO J. 1999 18 3204 3213
77. A. Gogos L. Shapiro Structure 2002 10 1669 1676
78. D. Vivares P. Arnoux D. Pignol Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 18848 18853
79. R. Amir Amino Acids 2010 39 917 931
80. C. Steegborn B. Laber A. Messerschmidt R. Huber T. Clausen J. Mol. Biol. 2001 311 789 801
81. U. Breitinger T. Clausen S. Ehlert R. Huber B. Laber F. Schmidt E. Pohl A. Messerschmidt Plant Physiol. 2001 126 631 642
82. R. Percudani A. Peracchi BMC Bioinformatics 2009 10 273 281
83. A. C. Eliot J. F. Kirsch Annu. Rev. Biochem. 2004 73 383 415
84. H. C. Dunathan Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1966 55 712 716
85. M. D. Toney Biochim. Biophys. Acta, Proteins Proteomics 2011 1814 1407 1418
86. A. Messerschmidt M. Worbs C. Steegborn M. C. Wahl R. Huber B. Laber T. Clausen Biol. Chem. 2003 384 373 386
87. G. E. Ravilious A. Nguyen J. A. Francois J. M. Jez Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012 109 309 314
88. M. Klein J. Papenbrock J. Exp. Bot. 2004 55 1809 1820
89. Y. Amano H. Tsubouchi H. Shinohara M. Ogawa Y. Matsubayashi Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 18333 18338
90. U. Wittstock B. A. Halkier Trends Plant Sci. 2002 7 263 270
91. B. A. Halkier J. Gershenzon Annu. Rev. Plant Biol. 2006 57 303 333
92. Y. He T. P. Mawhinney M. L. Preuss A. C. Schroeder B. Chen L. Abraham J. M. Jez S. Chen Plant J. 2009 60 679 690
93. Y. He A. Galant Q. Pang J. M. Strul S. Balogun J. M. Jez S. Chen J. Biol. Chem. 2011 286 28794 28801
94. S. G. Mugford N. Yoshimoto M. Reichelt M. Wirtz L. Hill S. T. Mugford Y. Nakazato M. Noji H. Takahashi R. Kramell T. Gigolashvili U. I. Flügge C. Wasternack J. Gershenzon R. Hell K. Saito S. Kopriva Plant Cell 2009 21 910 927
95. S. Kopriva S. G. Mugford C. Matthewman A. Koprivova Plant Cell Rep. 2009 28 1769 1780
96. S. G. Mugford C. A. Matthewman L. Hill S. Kopriva FEBS Lett. 2010 584 119 123
97. R. Yatusevich S. G. Mugford C. Matthewman T. Gigolashvili H. Frerigmann S. Delaney A. Koprivova U. I. Flügge S. Kopriva Plant J. 2010 62 1 11
98. S. G. Mugford B. R. Lee A. Koprivova C. Matthewman S. Kopriva Plant J. 2011 65 96 105
99. M. Negishi L. G. Pedersen E. Petrotchenko S. Shevtsov A. Gorokhov Y. Kakuta L. C. Pedersen Arch. Biochem. Biophys. 2001 390 149 157
100. I. E. Sonderby F. Geu-flores B. A. Halkier Trends Plant Sci. 2010 15 1360 1385
101. B. Field G. Cardon M. Traka J. Botterman C. Vancanneyt R. Mithren Plant Physiol. 2004 135 828 839
102. J. Schuster T. Knill M. Reichelt J. Gershenzon S. Binder Plant Cell 2006 18 2664 2679
103. W. P. Burmeister S. Cottaz H. Driguez R. Lori S. Palmieri B. Henrissat Structure 1997 5 663 675
104. S. Cottaz B. Henrissat H. Driguez Biochemistry 1996 35 15256 15259
105. W. P. Burmeister S. Cottaz P. Rollin A. Vasella B. Henrissat J. Biol. Chem. 2000 275 39385 39393
106. P. Rose M. Whiteman P. K. Moore Y. Z. Zhu Nat. Prod. Rep. 2005 22 351 368
107. J. E. Lancaster M. L. Shaw Phytochemistry 1989 28 455 460
108. E. B. Kuettner R. Hilgenfeld M. S. Weiss J. Biol. Chem. 2002 277 46402 46407
109. P. M. Dewick, Medicinal Natural Products: A Biosynthetic approach, John Wiley and Sons, Chichester, England, 2nd edn, 2002
110. L. J. W. Shimon A. Rabinkov I. Shin T. Miron D. Mirelman M. Wilchek F. Frolow J. Mol. Biol. 2007 366 611 625