Binding motifs of silver in prion octarepeat model peptides: A joint ion mobility, IR and UV spectroscopies, and theoretical approach

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 14, Issue 32, 2012, Pages 11433-11440

  Bellina, Bruno ^a   Compagnon, Isabelle ^a   MacAleese, Luke ^a   Chirot, Fabien ^a   Lemoine, Jérôme ^a   Maître, Philippe ^b   Broyer, Michel ^a   Antoine, Rodolphe ^a   Kulesza, Alexander ^c   Mitrić, Roland ^c   Bonacic Koutecky, Vlasta ^d,e   Dugourd, Philippe ^a  

^a UNIVERSITÉ LYON 1   (France)

^b UNIVERSITÉ PARIS SUD   (France)

^c FREIE UNIVERSITÄT BERLIN   (Germany)

^d HUMBOLDT UNIVERSITY   (Germany)

^e UNIVERSITY OF SPLIT   (Croatia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CATION; PEPTIDE; SILVER;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; BINDING SITE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; INFRARED SPECTROPHOTOMETRY; METABOLISM; PRION; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN MOTIF; ULTRAVIOLET SPECTROPHOTOMETRY;

AMINO ACID MOTIFS; AMINO ACID SEQUENCE; BINDING SITES; CATIONS; MODELS, MOLECULAR; PEPTIDES; PRIONS; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; SILVER; SPECTROPHOTOMETRY, INFRARED; SPECTROPHOTOMETRY, ULTRAVIOLET;

EID: 84864226374     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c2cp40924k     Document Type: Article

References (58)

1. S. D. Dover Nature 1976 262 176
2. F. H. Arnold B. L. Haymore Science 1991 252 1796 1797
3. D. R. Brown K. F. Qin J. W. Herms A. Madlung J. Manson R. Strome P. E. Fraser T. Kruck A. vonBohlen W. SchulzSchaeffer A. Giese D. Westaway H. Kretzschmar Nature 1997 390 684 687
4. M. R. Jensen M. A. S. Hass D. F. Hansen J. J. Led Cell. Mol. Life Sci. 2007 64 1085 1104
5. T. Tsukihara H. Aoyama E. Yamashita T. Tomizaki H. Yamaguchi K. Shinzawaitoh R. Nakashima R. Yaono S. Yoshikawa Science 1995 269 1069 1074
6. U. Ryde Dalton Trans. 2007 607 625
7. S. S. Hasnain K. O. Hodgson J. Synchrotron Radiat. 1999 6 852 864
8. M. M. Harding Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2001 57 401 411
9. H. Sigel R. B. Martin Chem. Rev. 1982 82 385 426
10. T. Wyttenbach G. vonHelden M. T. Bowers J. Am. Chem. Soc. 1996 118 8355 8364
11. C. Kapota J. Lemaire P. Maitre G. Ohanessian J. Am. Chem. Soc. 2004 126 1836 1842
12. M. Citir E. M. S. Stennett J. Oomens J. D. Steill M. T. Rodgers P. B. Armentrout Int. J. Mass Spectrom. 2010 297 9 17
13. N. C. Polfer J. Oomens R. C. Dunbar ChemPhysChem 2008 9 579 589
14. M. Harb F. Rabilloud D. Simon A. Rydlo S. Lecoultre F. Conus V. Rodrigues C. Felix J. Chem. Phys. 2008 129 194108
15. V. W. M. Lee H. B. Li T. C. Lau R. Guevremont K. W. M. Siu J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1998 9 760 766
16. L. Joly R. Antoine F. Albrieux R. Ballivian M. Broyer F. Chirot J. Lemoine P. Dugourd C. Greco R. Mitric V. Bonacic-Koutecky J. Phys. Chem. B 2009 113 11293 11300
17. A. K. Vrkic T. Taverner P. F. James R. A. J. O'Hair Dalton Trans. 2004 197 208
18. R. C. Dunbar N. C. Polfer J. Oomens J. Am. Chem. Soc. 2007 129 14562 14563
19. R. C. Dunbar A. C. Hopkinson J. Oomens C. K. Siu K. W. M. Siu J. D. Steill U. H. Verkerk J. F. Zhao J. Phys. Chem. B 2009 113 10403 10408
20. N. C. Polfer J. Oomens D. T. Moore G. von Helden G. Meijer R. C. Dunbar J. Am. Chem. Soc. 2006 128 517 525
21. J. A. Taraszka J. W. Li D. E. Clemmer J. Phys. Chem. B 2000 104 4545 4551
22. N. C. Polfer J. Oomens R. C. Dunbar Phys. Chem. Chem. Phys. 2006 8 2744 2751
23. M. R. Wasielewski Acc. Chem. Res. 2009 42 1910 1921
24. H. B. Gray J. R. Winkler Chem. Phys. Lett. 2009 483 1 9
25. K. Malek M. Makowski A. Krolikowska J. Bukowska J. Phys. Chem. B 2012 116 1414 1425
26. T. Tabarin A. Kulesza R. Antoine R. Mitric M. Broyer P. Dugourd V. Bonacic-Koutecky Phys. Rev. Lett. 2008 101 213001
27. I. Compagnon T. Tabarin R. Antoine M. Broyer P. Dugourd R. Mitric J. Petersen V. Bonacic-Koutecky J. Chem. Phys. 2006 125 164326
28. R. Antoine T. Tabarin M. Broyer P. Dugourd R. Mitric V. Bonacic-Koutecky ChemPhysChem 2006 7 524 528
29. V. Bonacic-Koutecky A. Kulesza L. Gell R. Mitric R. Antoine F. Bertorelle R. Hamouda D. Rayane M. Broyer T. Tabarin P. Dugourd Phys. Chem. Chem. Phys. 2012 14 9282 9290
30. J. H. Viles F. E. Cohen S. B. Prusiner D. B. Goodin P. E. Wright H. J. Dyson Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999 96 2042 2047
31. E. Aronoff-Spencer C. S. Burns N. I. Avdievich G. J. Gerfen J. Peisach W. E. Antholine H. L. Ball F. E. Cohen S. B. Prusiner G. L. Millhauser Biochemistry 2000 39 13760 13771
32. C. S. Burns E. Aronoff-Spencer C. M. Dunham P. Lario N. I. Avdievich W. E. Antholine M. M. Olmstead A. Vrielink G. J. Gerfen J. Peisach W. G. Scott G. L. Millhauser Biochemistry 2002 41 3991 4001
33. J. T. O'Brien J. S. Prell G. Berden J. Oomens E. R. Williams Int. J. Mass Spectrom. 2010 297 116 123
34. J. C. Poully F. Lecomte N. Nieuwjaer B. Manil J. P. Schermann C. Desfrancois F. Calvo G. Gregoire Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 3606 3615
35. J. C. Poully F. Lecomte N. Nieuwjaer B. Manil J. P. Schermann C. Desfrancois G. Gregoire R. Ballivian F. Chirot J. Lemoine F. Calvo R. Antoine P. Dugourd Int. J. Mass Spectrom. 2010 297 28 35
36. L. Joly R. Antoine F. Albrieux R. Ballivian M. Broyer F. Chirot J. Lemoine P. Dugourd C. Greco R. Mitric V. Bonacic-Koutecky J. Phys. Chem. B 2009 113 11293 11300
37. F. Albrieux F. Calvo F. Chirot A. Vorobyev Y. O. Tsybin V. Lepère R. Antoine J. Lemoine P. Dugourd J. Phys. Chem. A 2010 114 6888 6896
38. B. H. Clowers Y. M. Ibrahim D. C. Prior W. F. Danielson M. E. Belov R. D. Smith Anal. Chem. 2008 80 612 623
39. P. R. Kemper N. F. Dupuis M. T. Bowers Int. J. Mass Spectrom. 2009 287 46 57
40. M. F. Mesleh J. M. Hunter A. A. Shvartsburg G. C. Schatz M. F. Jarrold J. Phys. Chem. 1996 100 16082 16086
41. J. M. Bakker T. Besson J. Lemaire D. Scuderi P. Maitre J. Phys. Chem. A 2007 111 13415 13424
42. J. M. Bakker R. K. Sinha T. Besson M. Brugnara P. Tosi J.-Y. Salpin P. Maitre J. Phys. Chem. A 2008 112 12393 12400
43. R. K. Sinha E. Nicol V. Steinmetz P. Maitre J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2010 21 758 772
44. R. K. Sinha U. Erlekam B. J. Bythell B. Paizs P. Maitre J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2011 22 1645 1650
45. F. O. Talbot T. Tabarin R. Antoine M. Broyer P. Dugourd J. Chem. Phys. 2005 122 074310
46. M. J. S. Dewar E. G. Zoebisch E. F. Healy J. J. P. Stewart J. Am. Chem. Soc. 1985 107 3902 3909
47. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 1372 1377
48. C. T. Lee W. T. Yang R. G. Parr Phys. Rev. B: Condens. Matter Mater. Phys. 1988 37 785 789
49. F. Weigend R. Ahlrichs Phys. Chem. Chem. Phys. 2005 7 3297 3305
50. D. Andrae U. Haussermann M. Dolg H. Stoll H. Preuss Theor. Chim. Acta 1990 77 123 141
51. Y. Bouteiller J. C. Poully C. Desfrancois G. Gregoire J. Phys. Chem. A 2009 113 6301 6307
52. T. Yanai D. P. Tew N. C. Handy Chem. Phys. Lett. 2004 393 51 57
53. H. E. Revercomb E. A. Mason Anal. Chem. 1975 47 970 983
54. C. S. Burns E. Aronoff-Spencer G. Legname S. B. Prusiner W. E. Antholine G. J. Gerfen J. Peisach G. L. Millhauser Biochemistry 2003 42 6794 6803
55. W. K. Mino, Jr. K. Gulyuz D. Wang C. N. Stedwell N. C. Polfer J. Phys. Chem. Lett. 2011 2 299 304
56. A. D. Becke K. E. Edgecombe J. Chem. Phys. 1990 92 5397 5403
57. A. Savin A. D. Becke J. Flad R. Nesper H. Preuss H. G. von Schnering Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1991 30 409 412
58. J. Poater M. Duran M. Sola B. Silvi Chem. Rev. 2005 105 3911 3947